The shape of the messenger: Using protein structure information to design novel cytokine-based therapeutics

Current Pharmaceutical Design

Volumn 8, Issue 24, 2002, Pages 2113-2129

  Schein, Catherine H ^a  

^a University of Texas Medical Branch School of Medicine   (United States)

Author keywords

Cytokine signaling; Cytokine receptor interactions; Four helix bundle; GP130; Interleukins

Indexed keywords

COLONY STIMULATING FACTOR; CYTOKINE; CYTOKINE RECEPTOR; ERYTHROPOIETIN; FIBROBLAST GROWTH FACTOR; GROWTH HORMONE; HEMOPOIETIC GROWTH FACTOR; INTERFERON; INTERLEUKIN 1; INTERLEUKIN 10; INTERLEUKIN 11; INTERLEUKIN 12; INTERLEUKIN 13; INTERLEUKIN 14; INTERLEUKIN 15; INTERLEUKIN 16; INTERLEUKIN 17; INTERLEUKIN 18; INTERLEUKIN 2; INTERLEUKIN 3; INTERLEUKIN 4; INTERLEUKIN 5; INTERLEUKIN 6; INTERLEUKIN 7; INTERLEUKIN 8; INTERLEUKIN 9; LYMPHOTOXIN; RECOMBINANT PROTEIN; TUMOR NECROSIS FACTOR; UNINDEXED DRUG;

ANIMAL CELL; ANIMAL EXPERIMENT; CELL POPULATION; CONTROLLED STUDY; CYTOKINE PRODUCTION; DATA BASE; DRUG CLASSIFICATION; DRUG DESIGN; DRUG HALF LIFE; DRUG INFORMATION; DRUG STRUCTURE; DRUG TARGETING; HUMAN; HUMAN CELL; INFLAMMATION; MACROPHAGE MIGRATION; MOLECULAR CLONING; MOUSE; NEUTROPHIL CHEMOTAXIS; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; RECEPTOR BINDING; REVIEW; SERUM FACTOR; SIDE EFFECT; STRUCTURE ACTIVITY RELATION;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; CYTOKINES; DRUG THERAPY; HUMANS; LIGANDS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEIN CONFORMATION; PROTEINS; TERMINOLOGY;

EID: 0036400903     PISSN: 13816128     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/1381612023393161     Document Type: Review

References (139)

1. Schein, C. H. Pharm. Acta Helv., 1994, 69, 119-126.
2. Schellekens, H.; deReus, A.; Bolhuis, R.; Fountoulakis, M.; Schein, C. H.; Ecsödi, J.; Nagata, S.; Weissmann, C. Nature, 1981, 292, 775-776.
3. Schein, C. H. Bio. Technology, 1989, 7, 1141-1149.
4. Schein, C. H. In The Encyclopedia of Bioprocess Technology: Fermentation, Biocatalysis and Bioseparation; J. Wiley and Sons: New York, 1999, pp. 2134-2155.
5. Schein, C. H. In The Encyclopedia of Bioprocess Technology: Fermentation, Biocatalysis and Bioseparation.; J. Wiley and Sons: New York, 1999, pp. 2156-2169.
6. Fairlie, W. D.; Zhang, H.; Brown, P. K.; Russell, P. K.; Bauskin, A. R.; Breit, S. N. Gene, 2000, 254, 67-76.
7. Park, K.; Shimizu, N. J. Ferment. Bioeng., 1996, 82, 585-588.
8. Zhan, H.; Liu, B.; Reid, S. W.; Aoki, K. H.; Li, C.; Syed, R. S.; Karkaria, C.; Koe, G.; Sitney, K.; Hayenga, K.; Mistry, F.; Savel, L.; Dreyer, M.; Katz, B. A.; Schreurs, J.; Matthews, D. J.; Cheetham, J. C.; Egrie, J.; Giebel, L. B.; Stroud, R. M. Protein Eng., 1999, 12, 505-513.
9. Maes, M.; Bonaccorso, S.; Marino, V.; Puzella, A.; Pasquini, M.; Biondi, M.; Artini, M.; Almerighi, C.; Meltzer, H. Mol. Psychiatr., 2001, 6, 475-480.
10. Fisher, J. W. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol., 1998, 38, 1-20.
11. Lindenmann, J.; Burke, D. C.; Isaacs, A. Brit. J. Exper. Path., 1957, 38, 551-562.
12. Weissmann, C.; Nagata, S.; Boll, W.; Fountoulakis, M.; Fujisawa, A.; Fujisawa, J.; Haynes, J.; Henco, K.; Mantei, N.; Ragg, H.; Schein, C.; Schmid, J.; Shaw, G.; Streuli, M.; Taira, H.; Todokoro, K.; Weidle, U. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci., 1982, 299, 7-28.
13. Mattson, M. P. Trends Neurosci., 2001, 24, 441-442.
14. Fruhbeck, G. Proc. Nutr. Soc., 2001, 60, 301-318.
15. Rajarathnam, K. Curr. Pharm. Des., 2002, 8, 2159-2169.
16. Kumar, S.; McDonnell, P. C.; Lehr, R.; Tierney, L.; Tzimas, M. N.; Griswold, D. E.; Capper, E. A.; Tal-Singer, R.; Wells, G. I.; Doyle, M. L.; Young, P. R. J. Biol. Chem., 2000, 275, 10308-10314.
17. Blumberg, H.; Conklin, D.; Xu, W. F.; Grossmann, A.; Brender, T.; Carollo, S.; Eagan, M.; Foster, D.; Haldeman, B. A.; Hammond, A.; Haugen, H.; Jelinek, L.; Kelly, J. D.; Madden, K.; Maurer, M. F.; Parrish-Novak, J.; Prunkard, D.; Sexson, S.; Sprecher, C.; Waggie, K.; West, J.; Whitmore, T. E.; Yao, L.; Kuechle, M. K.; Dale, B. A.; Chandrasekher, Y. A. Cell, 2001, 104, 9-19.
18. Zdanov, A.; Schalk-Hihi, C.; Gustchina, A. E.; Tsang, M.; Weatherbee, J.; Wlodawer, A. Structure, 1995, 3, 591-601.
19. Rich, B. E.; Kupper, T. S. Curr. Biol., 2001, 11, R531-R534.
20. Hymowitz, S. G.; Filvaroff, E. H.; Yin, J. P.; Lee, J.; Cai, L.; Risser, P.; Maruoka, M.; Mao, W.; Foster, J.; Kelley, R. F.; Pan, G.; Gurney, A. L.; de Vos, A. M.; Starovasnik, M. A. EMBO J., 2001, 20, 5332-5341.
21. Dumoutier, L.; Leemans, C.; Lejeune, D.; Kotenko, S. V.; Renauld, J. C. J. Immunol., 2001, 167, 3545-3549.
22. Dumoutier, L.; Van Roost, E.; Ameye, G.; Michaux, L.; Renauld, J. C. Genes Immun., 2000, 1, 488-494.
23. Graham-Lorence, S. E.; Peterson, J. A. Methods in Enzymology, 1996, 272, 315-326.
24. Shtrichman, R.; Samuel, C. E. Cur. Opin. Microbiol., 2001, 4, 251-259.
25. Cassell, D. J.; Choudhri, S.; Humphrey, R.; Martell, R. E.; Reynolds, T.; Shanafelt, A. B. Curr. Pharm. Des., 2002, 8, 2171-2183.
26. Forster, A.; Michel, B. A. Z. Rheumatol., 2001, 60, 319-325.
27. Kelleher, K.; Bean, K.; Clark, S. C.; Leung, W. Y.; Yang-Feng, T. L.; Chen, J. W.; Lin, P. F.; Luo, W.; Yang, Y. C. Blood, 1991, 77, 1436-1441.
28. Wills-Karp, M. Respir. Res., 2000, 1, 19-23.
29. Lonjou, C.; Barnes, K.; Chen, H.; Cookson, W. O.; Deichmann, K. A.; Hall, I. P.; Holloway, J. W.; Laitinen, T.; Palmer, L. J.; Wjst, M.; Morton, N. E. Proc. Natl. Acad. Sci., 2000, 97, 10942-10947.
30. Deonarain, R.; Chan, D. C. M.; Platanias, L. C.; Fish, E. N. Curr. Pharm. Des., 2002, 8, 2131-2137.
31. Saragovi, H. U.; Zaccaro, M. C. Curr. Pharm. Des., 2002, 8, 2201-2216.
32. Monfardini, C.; Canziani, G.; Plugariu, C.; Thomas, K.-E.; Godillot, A. P.; Kwah, J.; Bajgier, J.; Chaiken, I.; Williams, W. V. Curr. Pharm. Des., 2002, 8, 2185-2199.
33. Bensen, J. T.; Dawson, P. A.; Mychaleckyj, J. C.; Bowden, D. W. J. Interferon Cytokine Res., 2001, 21, 899-904.
34. Carter, P. H.; Scherle, P. A.; Muckelbauer, J. A.; Voss, M. E.; Liu, R. Q.; Thompson, L. A.; Tebben, A. J.; Solomon, K. A.; Lo, Y. C.; Li, Z.; Strzemienski, P.; Yang, G.; Falahatpisheh, N.; Xu, M.; Wu, Z.; Farrow, N. A.; Ramnarayan, K.; Wang, J.; Rideout, D.; Yalamoori, V.; Domaille, P.; Underwood, D. J.; Trzaskos, J. M.; Friedman, S. M.; Newton, R. C.; Decicco, C. P. Proc. Natl. Acad. Sci., 2001, 98, 11879-11884.
35. Rutherford, M. N.; Kumar, S.; Coulombe, B.; Skup, D.; Carver, D. H.; Williams, B. R. G. J. Interferon Cytokine Res., 1996, 16, 507-510.
36. Kelso, A. Ther. Drug Monit., 2000, 22, 40-43.
37. Youngster, S.; Wang, Y.-S.; Grace, M.; Bausch, J.; Bordens, R.; Wyss, D. F. Curr. Pharm. Des., 2002, 8, 2139-2157.
38. Der, S. D.; Zhou, A.; Williams, B. R.; Silverman, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci., 1998, 95, 15623-15628.
39. Zhou, A.; Paranjape, J. M.; Der, S. D.; Williams, B. R. G.; Silverman, R. H. Virology, 1999, 258, 435-440.
40. Walter, M. R.; Bordens, R.; Nagabhushan, T. L.; Williams, B. R.; Herberman, R.-B.; Dinarello, C. A.; Borden, E. C.; Trotta, P. P.; Pestka, S.; Pfeffer, L. M. Cancer Biother. Radiopharm., 1998, 13, 143-154.
41. Frank, S. J. Endocrinology, 2002, 143, 2-10.
42. Aritomi, M.; Kunishima, N.; Okamoto, T.; Kuroki, R.; Ota, Y.; Morikawa, K. Nature, 1999, 401, 713-717.
43. Syed, R. S.; Reid, S. W.; Li, C.; Cheetham, J. C.; Aoki, K. H.; Liu, B.; Zhan, H.; Osslund, T. D.; Chirino, A. J.; Zhang, J.; Finer-Moore, J.; Elliott, S.; Sitney, K.; Katz, B. A.; Matthews, D. J.; Wendoloski, J. J.; Egrie, J.; Stroud, R. M. Nature, 1998, 395, 511-516.
44. Chow, D.; He, X.; Snow, A. L.; Rose-John, S.; Garcia, K. C. Science, 2001, 291, 2150-2155.
45. Simpson, R. J.; Hammacher, A.; Smith, D. K.; Matthews, J. M.; Ward, L. D. Protein Sci., 1997, 6, 929-955.
46. Peters, M.; Blinn, G.; Jostock, T.; Schirmacher, P.; Meyer, z.; Buschenfelde, K. H.; Galle, P. R.; Rose-John, S. Gastroenterology, 2000, 119, 1663-1671.
47. Gotze, K. S.; Keller, U.; Rose-John, S.; Peschel, C. Exp. Hematol., 2001, 29, 822-832.
48. Zhao, C. H.; Tang, P. H.; Mao, N.; Zhang, S. X.; Fan, E. L.; Dong, B.; Li, Q.; Du, D. L. Exper. Hematol., 1996, 24, 54-58.
49. Lipsky, P. E.; van der Heijde, D. M.; St. Clair, E. W.; Furst, D. E.; Breedveld, F. C.; Kalden, J. R.; Smolen, J. S.; Weisman, M.; Emery, P.; Feldmann, M.; Harriman, G. R.; Maini, R. N. N. Engl. J. Med., 2000, 343, 1594-1602.
50. Weinblatt, M. E.; Kremer, J. M.; Bankhurst, A. D.; Bulpitt, K. J.; Fleischmann, R. M.; Fox, R. I.; Jackson, C. G.; Lange, M.; Burge, D. J. N. Engl. J. Med., 1999, 340, 253-259.
51. Pisetsky, D. S.; St. Clair, E. W. J. Amer. Med. Assoc., 2001, 286, 2787-2790.
52. Demoulin, J. B.; Renauld, J. C. Int. Rev. Immunol., 1998, 16, 345-364.
53. Lander, E.S.; Linton, L.M.; Birren, B.; Nusbaum, C.; Zody, M.C.; Baldwin, J.; Devon, K.; Dewar, K.; Doyle, M.; FitzHugh, W.; Funke, R.; Gage, D.; Harris, K.; Heaford, A.; Howland, J.; Kann, L.; Lehoczky, J.; LeVine, R.; McEwan, P.; McKernan, K.; Meldrim, J.; Mesirov, J.P.; Miranda, C.; Morris, W.; Naylor, J.; Raymond, C.; Rosetti, M.; Santos, R.; Sheridan, A.; Sougnez, C.; Stange-Thomann, N.; Stojanovic, N.; Subramanian, A.; Wyman, D.; Rogers, J.; Sulston, J.; Ainscough, R.; Beck, S.; Bentley, D.; Burton, J.; Clee, C.; Carter, N.; Coulson, A.; Deadman, R.; Deloukas, P.; Dunham, A.; Dunham, I.; Durbin, R.; French, L.; Grafham, D.; Gregory, S.; Hubbard, T.; Humphray, S.; Hunt, A.; Jones, M.; Lloyd, C.; McMurray, A.; Matthews, L.; Mercer, S.; Milne, S.; Mullikin, JC.; Mungall, A.; Plumb, R.; Ross, M.; Shownkeen, R.; Sims, S.; Waterston, R.H.; Wilson, R.K.; Hillier, L.W.; McPherson, J.D.; Marra, M.A.; Mardis, E.R.; Fulton, L.A.; Chinwalla, A.T.; Pepin, K.H.; Gish, W.R.; Chissoe, SL.; Wendl, M.C.; Delehaunty, K.D.; Miner, T.L.; Delehaunty, A.; Kramer, J.B.; Cook, L.L.; Fulton, R.S.; Johnson, D.L.; Minx, PJ.; Clifton, S.W.; Hawkins, T.; Branscomb, E.; Predki, P.; Richardson, P.; Wenning, S.; Slezak, T.; Doggett, N.; Cheng, J.F.; Olsen, A.; Lucas, S.; Elkin, C.; Uberbacher, E.; Frazier, M.; Gibbs, R.A.; Muzny, D.M.; Scherer, S.E.; Bouck, J.B.; Sodergren, E.J.; Worley, K.C.; Rives, C.M.; Gorrell, J.H.; Metzker, M.L.; Naylor, S.L.; Kucherlapati, R.S.; Nelson, D.L.; Weinstock, G.M.; Sakaki, Y.; Fujiyama, A.; Hattori, M.; Yada, T.; Toyoda, A.; Itoh, T.; Kawagoe, C.; Watanabe, H.; Totoki, Y.; Taylor, T.; Weissenbach, J.; Heilig, R.; Saurin, W.; Artiguenave, F.; Brottier, P.; Bruls, T.; Pelletier, E.; Robert, C.; Wincker, P.; Smith, D.R.; Doucette-Stamm, L.; Rubenfield, M.; Weinstock, K.; Lee, H.M.; Dubois, J.; Rosenthal, A.; Platzer, M.; Nyakatura, G.; Taudien, S.; Rump, A.; Yang, H.; Yu, J.; Wang, J.; Huang, G.; Gu, J.; Hood, L.; Rowen, L.; Madan, A.; Qin, S.; Davis, R.W.; Federspiel, N.A.; Abola, A.P.; Proctor, M.J.; Myers, R.M.; Schmutz, J.; Dickson, M.; Grimwood, J.; Cox, D.R.; Olson, M.V.; Kaul, R.; Raymond, C.; Shimizu, N.; Kawasaki, K.; Minoshima, S.; Evans, G.A.; Athanasiou, M.; Schultz, R.; Roe, B.A.; Chen, F.; Pan, H.; Ramser, J.; Lehrach, H.; Reinhardt, R.; McCombie, W.R.; de la Bastide, M.; Dedhia, N.; Blocker, H.; Hornischer, K.; Nordsiek, G.; Agarwala, R.; Aravind, L.; Bailey, J.A.; Bateman, A.; Batzoglou, S.; Birney, E.; Bork, P.; Brown, D.G.; Burge, C.B.; Cerutti, L.; Chen, H.C.; Church, D.; Clamp, M.; Copley, R.R.; Doerks, T.; Eddy, S.R.; Eichler, E.E.; Furey, T.S.; Galagan, J.; Gilbert, J.G.; Harmon, C.; Hayashizaki, Y.; Haussler, D.; Hermjakob, H.; Hokamp, K.; Jang, W.; Johnson, L.S.; Jones, T.A.; Kasif, S.; Kaspryzk, A.; Kennedy, S.; Kent, W.J.; Kitts, P.; Koonin, E.V.; Korf, I.; Kulp, D.; Lancet, D.; Lowe, T.M.; McLysaght, A.; Mikkelsen, T.; Moran, J.V.; Mulder, N.; Pollara, V.J.; Ponting, C.P.; Schuler, G.; Schultz, J.; Slater, G.; Smit, A.F.; Stupka, E.; Szustakowski, J.; Thierry-Mieg, D.; Thierry-Mieg, J.; Wagner, L.; Wallis, J.; Wheeler, R.; Williams, A.; Wolf, YI.; Wolfe, K.H.; Yang, S.P.; Yeh, R.F.; Collins, F.; Guyer, M.S.; Peterson, J.; Felsenfeld, A.; Wetterstrand, K.A.; Patrinos, A.; Morgan, M.J.; Szustakowki, J.; de Jong, P.; Catanese, J.J.; Osoegawa, K.; Shizuya, H.; Choi, S.; Chen. Y.J. Nature, 2001, 409, 860-921.
54. Vallesi, A.; Giuli, G.; Ghiara, P.; Scapigliati, G.; Luporini, P. Exp. Cell Res., 1998, 241, 253-259.
55. Schein, C. H.; Nagle, G. T.; Page, J.; Sweedler, J. V.; Xu, Y.; Painter, S. D.; Braun, W. Biophys. J., 2001, 81, 463-472.
56. Guo, F. H.; Uetani, K.; Haque, S. J.; Williams, B. R.; Dweik, R. A.; Thunissen, F. B.; Calhoun, W.; Erzurum, S. C. J. Clin. Invest., 1997, 100, 829-838.
57. Schein, C. H. Toxicol. In vitro, 1997, 10, 275-285.
58. Schein, C. H.; Haugg, M.; Benner, S. A. FEBS Lett., 1990, 270, 229-232.
59. Schein, C. H.; Haugg, M. Biochem. J., 1995, 307, 123-127.
60. Condino-Neto, A.; Newburger, P. E. Blood, 2000, 95, 3548-3554.
61. Zhang, J.; Dyer, K. D.; Rosenberg, H. F. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, 97, 4701-4706.
62. Sugimoto, H.; Taniguchi, M.; Nakagawa, A.; Tanaka, I.; Suzuki, M.; Nishihira, J. Biochemistry, 1999, 38, 3268-3279.
63. Jackson, R. M.; Russell, R. B. Comput. Chem., 2001, 26, 31-39.
64. Kim, Y.; Shin, J.; Li, R.; Cheong, C.; Kim, K.; Kim, S. J. Biol. Chem., 2000, 275, 27062-27068.
65. Wang, Y. X.; Jiang, C. L.; Lu, C. L.; Song, L. X.; You, Z. D.; Shao, X. Y.; Cui, R. Y.; Liu, X. Y. J. Neuroimmunol., 2000, 108, 64-67.
66. Schein, C. H. Curr. Opin. Biotechnol., 1993, 4, 456-461.
67. Kontsek, P.; Waschutza, G.; Kontsekova, E.; Otto, B. Cytokine, 2000, 12, 708-710.
68. Camacho, N. P.; Smith, D. R.; Goldman, A.; Schneider, B.; Green, D.; Young, P. R.; Berman, H. M. Biochemisty, 1993, 32, 8749-8757.
69. Watterson, D. M.; Mirzoeva, S.; Guo, L.; Whyte, A.; Bourguignon, J. J.; Hibert, M.; Haiech, J.; Van Eldik, L. J.; Indelicato, S. R. Neurochem. Int., 2001, 39, 459-468.
70. Iyer, S.; Lahana, R.; Buelow, R. Curr. Pharm. Des., 2002, 8, 2217-2229.
71. Holm, L.; Sander, C. Science, 1996, 273, 595-602.
72. Wang, X. M.; Wilkin, J. M.; Boisteau, O.; Harmegnies, D.; Blanc, C.; Vandenbussche, P.; Montero-Julian, F. A.; Jacques, Y.; Content, J. Eur. J. Biochem., 2002, 269, 61-68.
73. Ambrus, J. L.; Chadha, K. C.; Anthone, S.; Anthone, R.; Sayyid, S. Surg. Gynecol. Obstet., 1993, 176, 588-590.
74. Muhlhahn, P.; Zweckstetter, M.; Georgescu, J.; Ciosto, C.; Renner, C.; Lanzendorfer, M.; Lang, K.; Ambrosius, D.; Baier, M.; Kurth, R.; Holak, T. A. Nature Struct. Biol., 1998, 5, 682-686.
75. Kim, S. H.; Azam, T.; Novick, D.; Yoon, D. Y.; Reznikov, L. L.; Bufler, P.; Rubinstein, M.; Dinarello, C. A. J. Biol. Chem., 2002, 277, 10998-11003.
76. Gallagher, G.; Dickensheets, H.; Eskdale, J.; Izotova, L. S.; Mirochnitchenko, O. V.; Peat, J. D.; Vazquez, N.; Pestka, S.; Donnelly, R. P.; Kotenko, S. V. Genes Immun., 2000, 1, 442-450.
77. Parrish-Novak, J.; Dillon, S. R.; Nelson, A.; Hammond, A.; Sprecher, C.; Gross, J. A.; Johnston, J.; Madden, K.; Xu, W.; West, J.; Schrader, S.; Burkhead, S.; Heipel, M.; Brandt, C.; Kuijper, J. L.; Kramer, J.; Conklin, D.; Presnell, S. R.; Berry, J.; Shiota, F.; Bort, S.; Hambly, K.; Mudri, S.; Clegg, C.; Moore, M.; Grant, F. J.; Lofton-Day, C.; Gilbert, T.; Rayond, F.; Ching, A.; Yao, L.; Smith, D.; Webster, P.; Whitmore, T.; Maurer, M.; Kaushansky, K.; Holly, R. D.; Foster, D. Nature, 2000, 408, 57-63.
78. Xie, M. H.; Aggarwal, S.; Ho, W. H.; Foster, J.; Zhang, Z.; Stinson, J.; Wood, W. I.; Goddard, A. D.; Gurney, A. L. J. Biol. Chem., 2000, 275, 31335-31339.
79. Cooper, A. M.; Kipnis, A.; Turner, J.; Magram, J. F., J.; Orme, I. M. J. Immunol., 2002, 168, 1322-1327.
80. Lovejoy, B.; Cascuim, D.; Eisenberg, D. J. Mol. Biol., 1993, 234, 640-653.
81. Pandit, J.; Bohm, A.; Jancarik, J.; Halenbeck, R.; Koths, K.; Kim, S. H. Science, 1992, 258, 1358-1362.
82. Hinds, M. G.; Maurer, T.; Zhang, J. G.; Nicola, N. A.; Norton, R. S. J. Biol. Chem., 1998, 273, 13738-13745.
83. Cheetham, J. C.; Smith, D. M.; Aoki, K. H.; Stevenson, J. L.; Hoeffel, T. J.; Syed, R. S.; Egrie, H.; Harvey, T. S. Nature Struct. Biol., 1998, 5, 861-866.
84. Walter, M. R.; Cook, W. J.; Ealick, S. E.; Nagabhushan, T. L.; Trotta, P. P.; Bugg, C. E. J. Mol. Biol., 1992, 224, 1075-1085.
85. Zhang, Z.; Zhang, R.; Joachimiak, A.; Schlessinger, J.; Kong, X. Proc. Natl. Acad. Sci., 2000, 97, 7732-7737.
86. Deller, M. C.; Hudson, K. R.; Ikemizu, S.; Bravo, J.; Jones, E. Y.; Heath, J. K. Struct. Fold. Des., 2000, 8, 863-874.
87. Ultsch, M. H.; Somers, W.; Kossiakoff, A. A.; de Vos, A. M. J. Mol. Biol., 1994, 236, 286-299.
88. Mott, H. R.; Baines, B. S.; Hall, R. M.; Cooke, R. M.; Driscoll, P. C.; Weir, M. P.; Campbell, I. D. J. Mol. Biol., 1995, 247, 979-994.
89. Feng, Y.; Klein, B. K.; McWherter, C. A. J. Mol. Biol., 1996, 258, 524-541.
90. Powers, R.; Garrett, D. S.; March, C. J.; Friden, E. A.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Science, 1992, 256, 1673-1677.
91. Muller, T.; Oehlenschlager, F.; Buehner, M. J. Mol. Biol., 1995, 247, 360-372.
92. Milburn, M. V.; Hassell, A. M.; Lambert, M. H.; Jordan, S. R.; Proudfoot, A. E.; Graber, P.; Wells, T. N. Nature, 1993, 363, 172-176.
93. Somers, W.; Stahl, M.; Seehra, J. S. EMBO J., 1997, 16, 989-997.
94. Xu, G. Y.; Yu, H. A.; Hong, J.; Stahl, M.; McDonagh, T.; Kay, L. E.; Cumming, D. A. J. Mol. Biol., 1997, 268, 468-481.
95. Zdanov, A.; Schalk-Hihi, C.; Menon, S.; Moore, K. W.; Wlodawer, A. J. Mol. Biol., 1997, 268, 460-467.
96. Yoon, C.; Johnston, S. C.; Tang, J.; Stahl, M.; Tobin, J. F.; Somers, W. S. EMBO J., 2000, 19, 3530-3541.
97. Eisenmesser, E. Z.; Horita, D. A.; Altieri, A. S.; Byrd, R. A. J. Mol. Biol., 2001, 310, 231-241.
98. Radhakrishnan, R.; Walter, L. J.; Hruza, A.; Reichert, P.; Trotta, P. P.; Nagabhushan, T. L.; Walter, M. R. Structure, 1996, 2, 1453-1463.
99. Klaus, W.; Gsell, B.; Labhardt, A. M.; Wipf, B.; Senn, H. J. Mol. Biol., 1997, 274, 661-675.
100. Senda, T.; Saitoh, S.; Mitsui, Y. J. Mol. Biol., 1995, 253, 187-207.
101. Landar, A.; Curry, B.; Parker, M. H.; Digiacomo, R.; Indelicato, S. R.; Nagabhushan, T. L.; Rizzi, G.; Walter, M. R. J. Mol. Biol., 2000, 299, 169-179.
102. Ealick, S. E.; Cook, W. J.; Vijay-Kumar, S.; Carson, M.; Nagabhushan, T. L.; Trotta, P. P.; Bugg, C. E. Science, 1991, 252, 698-702.
103. Randal, M.; Kossiakoff, A. A. Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 2000, 56, 14-24.
104. Samudzi, C. T.; Burton, L. E.; Rubin, J. R. J. Biol. Chem., 1991, 266, 2179-2197.
105. Eck, M. J.; Sprang, S. R. J. Biol. Chem., 1989, 264, 17595-17605.
106. Cha, S. S.; Kim, M. S.; Choi, Y. H.; Sung, B. J.; Shin, N. K.; Shin, H. C.; Sung, Y. C.; Oh, B. H. Immunity, 1999, 11, 253-261.
107. Graves, B. J.; Hatada, M. H.; Hendrickson, W. A.; Miller, J. K.; Madison, V. S.; Satow, Y. Biochemistry, 1990, 29, 2679-2684.
108. Priestle, J. P.; Schar, H. P.; Grutter, M. G. Proc. Natl. Acad. Sci., 1989, 86, 9667-9671.
109. Stockman, B. J.; Scahill, T. A.; Strakallaitis, N. A.; Brunner, D. P.; Yem, A. W.; Deibel, M. R., Jr. FEBS Lett., 1994, 349, 79-83.
110. Habazettl, J.; Gondol, D.; Wiltscheck, R.; Otlewski, J.; Schleicher, M.; Holak, T. A. Nature, 1992, 359, 855-858.
111. Zhang, J. D.; Cousens, L. S.; Barr, P. J.; Sprang, S. R. Proc. Natl. Acad. Sci., 1991, 88, 3446-3450.
112. Blaber, M.; Disalvo, J.; Thomas, K. A. Biochemistry, 1996, 35, 2086-2094.
113. Bellosta, P.; Iwahori, A.; Plotnikov, A. N.; Eliseenkova, A. V.; Basilico, C.; Mohammadi, M. Mol. Cell Biol., 2001, 21, 5946-5957.
114. Hecht, H. J.; Adar, R.; Hofman, B.; Bogin, O.; Weich, H.; Yayon, A. Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 2001, 87, 406-412.
115. Ye, S.; Luo, Y.; Lu, W.; Jones, R. B.; Linhardt, R. J.; Capila, I.; Toida, T.; Kan, M.; Pelletier, H.; McKeehan, W. L. Biochemistry, 2001, 40, 14429-14439.
116. Malkowski, M. G.; Lazar, J. B.; Johnson, P. H.; Edwards, B. F. J. Mol. Biol., 1997, 266, 367-380.
117. Ohnishi, Y.; Senda, T.; Nandhagopal, N.; Sugimoto, K.; Shioda, T.; Nagai, Y.; Mitsui, Y. J. Interferon Cytokine Res., 2000, 20, 691-670.
118. Crump, M. P.; Gong, J. H.; Leotscher, P.; Rajarathnam, K.; Amara, A.; Arenzana-Seisdedos, F.; Virelizier, J. L.; Baggiolini, M.; Sykes, B. D.; Clark-Lewis, I. EMBO J., 1997, 16, 6996-7007.
119. Clore, G. M.; Appella, E.; Yamada, M.; Matsushima, K.; Gronenborn, A. M. Biochemistry, 1990, 29, 1689-1696.
120. Lubkowski, J.; Bujacz, G.; Boque, L.; Domaille, P. J.; Handel, T. M.; Wlodawer, A. Nature Struct. Biol., 1997, 4, 64-69.
121. Mayer, K. L.; Stone, M. J. Biochemistry, 2000, 39, 8382-8395.
122. Blaszczyk, J.; Van Coillie, E.; Proost, P.; Van Damme, J.; Opdenakker, G.; Bujacz, G. D.; Wang, J.-M.; Ji, X. Biochemistry, 2000, 39, 14075-14081.
123. Hoover, D. M.; Shaw, J.; Gryczynski, Z.; Proudfoot, A. E. I.; Wells, T.; Lubkowski, J. Prot. Pep. Lett., 2000, 7, 73-82.
124. Rajarathnam, K.; Li, Y.; Rohrer, R.; Gentz, R. J. Biol. Chem., 2001, 276, 4909-4916.
125. Meunier, S.; Bernassau, J. M.; Guillemot, J. C.; Ferrara, P.; Darbon, H. Biochemistry, 1997, 36, 4412-4422.
126. Rajarathnam, K.; Clark-Lewis, I.; Sykes, B. D. Biochemistry, 1995, 34, 12983-12990.
127. Sticht, H.; Auer, M.; Schmitt, B.; Besemer, J.; Horcher, M.; Kirsch, T.; Lindley, I. J.; Rosch, P. Eur. J. Biochem., 1996, 235, 26-35.
128. Hoover, D. M.; Mizoue, L. S.; Handel, T. M.; Lubkowski, J. J. Biol. Chem., 2000, 275, 23187-23193.
129. Carfi, A.; Smith, C. A.; Smolak, P. J.; Mcgrew, J.; Wiley, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci., 1999, 96, 12379-12383.
130. Sun, H. W.; Bernhagen, J.; Bucala, R.; Lolis, E. Proc. Natl. Acad. Sci., 1996, 93, 5191-5196.
131. Kim, K. S.; Clark-Lewis, I.; Sykes, B. D. J. Biol. Chem., 1994, 269, 32909-32915.
132. Bravo, J.; Staunton, D.; Heath, J. K.; Jones, E. Y. EMBO J., 1998, 17, 1665-1674.
133. Mulhern, T. D.; Lopez, A. F.; D'Andrea, R. H.; Gaunt, C.; Vandeleur, L.; Vadas, M. A.; Booker, G. W.; Bagley, C. J. J. Mol. Biol., 2000, 297, 989-1001.
134. Xu, Y.; Tao, X.; Shen, B.; Horng, T.; Medzhitov, R.; Manley, J. L.; Tong, L. Nature, 2000, 408, 111-115.
135. Vigers, G. P.; Caffes, P.; Evans, R. J.; Thompson, R. C.; Eisenberg, S. P.; Brandhuber, B. J. J. Biol. Chem., 1994, 269, 12874-12879.
136. Hage, T.; Sebald, W.; Reinemer, P. Cell, 1999, 97, 271-281.
137. Josephson, K.; Logsdon, N. J.; Walter, M. R. Immunity, 2001, 15, 35-46.
138. Mongkolsapaya, J.; Grimes, J. M.; Stuart, D. I.; Jones, E. Y.; Screaton, G. R.; Chen, N.; Nu, X.-N. Nature Struct. Biol., 1999, 6, 1048-1053.
139. Thiel, D. J.; Le Du, M.-H.; Walter, R. L.; D'Arcy, A.; Chene, C.; Fountoulakis, M.; Garotto, G.; Winkler, F. K.; Ealick, S. E. Struct. Fold. Des., 2000, 8, 927-936.