Small molecule binding to a G-hairpin and a G-triplex: A new insight into anticancer drug design targeting G-rich regions

Chemical Communications

Volumn 51, Issue 44, 2015, Pages 9181-9184

  Rajendran, Arivazhagan ^a   Endo, Masayuki ^b,c   Hidaka, Kumi ^a   Teulade Fichou, Marie Paule ^d   Mergny, Jean Louis ^e   Sugiyama, Hiroshi ^a,b,c  

^a KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

^b KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

^c JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY   (Japan)

^d CNRS   (France)

^e UNIVERSITÉ DE BORDEAUX   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTINEOPLASTIC AGENT; DNA; DOUBLE STRANDED DNA; GUANINE HAIRPIN; GUANINE QUADRUPLEX; GUANINE TRIPLEX; UNCLASSIFIED DRUG; BIOTIN; GUANINE; PYRIDINE DERIVATIVE;

ARTICLE; DNA HAIRPIN; DNA SEQUENCE; DRUG BINDING; DRUG DNA INTERACTION; DRUG TARGETING; LIGAND BINDING; CHEMISTRY; CONFORMATION; DRUG DESIGN;

ANTINEOPLASTIC AGENTS; BIOTIN; DNA; DRUG DESIGN; GUANINE; NUCLEIC ACID CONFORMATION; PYRIDINES;

EID: 84930678240     PISSN: 13597345     EISSN: 1364548X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5cc01678a     Document Type: Article

References (40)

1. V. L. Makarov Y. Hirose J. P. Langmore Cell 1997 88 657 666
2. T. d. Lange Genes Dev. 2005 19 2100 2110
3. S. Muller D. A. Sanders M. D. Antonio S. Matsis J.-F. Riou R. Rodriguez S. Balasubramanian Org. Biomol. Chem. 2012 10 6537 6546
4. M. Franceschin L. Rossetti A. D'Ambrosio S. Schirripa A. Bianco G. Ortaggi M. Savino C. Schultes S. Neidle Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006 16 1707 1711
5. L. Guittat P. Alberti F. Rosu S. V. Miert E. Thetiot L. Pieters V. Gabelica E. D. Pauw A. Ottaviani J. F. Riou J.-L. Mergny Biochimie 2003 85 535 547
6. M. Y. Kim H. Vankayalapati S. Kazuo K. Wierzba L. H. Hurley J. Am. Chem. Soc. 2002 124 2098 2099
7. D. Y. Sun B. Thompson B. E. Cathers M. Salazar S. M. Kerwin J. O. Trent T. C. Jenkins S. Neidle L. H. Hurley J. Med. Chem. 1997 40 2113 2116
8. F. X. G. Han R. T. Wheelhouse L. H. Hurley J. Am. Chem. Soc. 1999 121 3561 3570
9. S. M. Gowan R. Heald M. F. G. Stevens L. R. Kelland Mol. Pharmacol. 2001 60 981 988
10. J. T. Kern S. M. Kerwin Bioorg. Med. Chem. Lett. 2002 12 3395 3398
11. S. N. Georgiades N. H. A. Karim K. Suntharalingam R. Vilar Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 4020 4034
12. D. Koirala T. Mashimo Y. Sannohe Z. Yu H. Mao H. Sugiyama Chem. Commun. 2012 48 2006 2008
13. M. Boncina J. Lah I. Prislan G. Vesnaver J. Am. Chem. Soc. 2012 134 9657 9663
14. R. D. Gray R. Buscaglia J. B. Chaires J. Am. Chem. Soc. 2012 134 16834 16844
15. A. Y. Q. Zhang S. Balasubramanian J. Am. Chem. Soc. 2012 134 19297 19308
16. W. Li X.-M. Hou P.-Y. Wang X.-G. Xi M. Li J. Am. Chem. Soc. 2013 135 6423 6426
17. V. Limongelli S. D. Tito L. Cerofolini M. Fragai B. Pagano R. Trotta S. Cosconati L. Marinelli E. Novellino I. Bertini A. Randazzo C. Luchinat M. Parrinello Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 2269 2273
18. N. An A. M. Fleming C. J. Burrows J. Am. Chem. Soc. 2013 135 8562 8570
19. P. M. Yangyuoru A. Y. Q. Zhang Z. Shi D. Koirala S. Balasubramanian H. Mao ChemBioChem 2013 14 1931 1935
20. A. Rajendran M. Endo K. Hidaka H. Sugiyama Angew. Chem., Int. Ed. 2014 53 4107 4112
21. R. Stefl T. E. Cheatham III N. Spackova E. Fadrna I. Berger J. Koca J. Sponer Biophys. J. 2003 85 1787 1804
22. T. Mashimo H. Yagi Y. Sannohe A. Rajendran H. Sugiyama J. Am. Chem. Soc. 2010 132 14910 14918
23. P. Stadlbauer M. Krepl T. E. Cheatham III J. Koca J. Sponer Nucleic Acids Res. 2013 41 7128 7143
24. V. Gabelica Biochimie 2014 105 1 3
25. P. Stadlbauer L. Trantirek T. E. Cheatham III J. Koca J. Sponer Biochimie 2014 105 22 35
26. P. W. K. Rothemund Nature 2006 440 297 302
27. A. Rajendran M. Endo H. Sugiyama Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 874 890
28. M. Endo Y. Katsuda K. Hidaka H. Sugiyama J. Am. Chem. Soc. 2010 132 1592 1597
29. M. Endo Y. Katsuda K. Hidaka H. Sugiyama Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 9412 9416
30. A. Rajendran M. Endo H. Sugiyama Curr. Protoc. Nucleic Acid Chem. 2012 48 12.9.1
31. A. Rajendran M. Endo Y. Katsuda K. Hidaka H. Sugiyama ACS Nano 2011 5 665 671
32. A. Rajendran M. Endo H. Sugiyama Chem. Rev. 2014 114 1493 1520
33. A. Rajendran M. Endo K. Hidaka P. L. T. Tran J.-L. Mergny R. J. Gorelick H. Sugiyama J. Am. Chem. Soc. 2013 135 18575 18585
34. A. Rajendran M. Endo K. Hidaka H. Sugiyama J. Am. Chem. Soc. 2013 135 1117 1123
35. M. Endo H. Sugiyama Acc. Chem. Res. 2014 47 1645 1653
36. T. Ando T. Uchihashi S. Scheuring Chem. Rev. 2014 114 3120 3188
37. A. Renaud de la Faverie F. Hamon C. D. Primo E. Largy E. Dausse L. Delauriere C. Landras-Guetta J.-J. Toulme M.-P. Teulade-Fichou J.-L. Mergny Biochimie 2011 93 1357 1367
38. A. Rajendran M. Endo K. Hidaka P. L. T. Tran J.-L. Mergny H. Sugiyama Nucleic Acids Res. 2013 41 8738 8747
39. A. Rajendran M. Endo K. Hidaka P. L. T. Tran M.-P. Teulade-Fichou J.-L. Mergny H. Sugiyama RSC Adv. 2014 4 6346 6355
40. K. Numajiri M. Kimura A. Kuzuya M. Komiyama Chem. Commun. 2010 46 5127 5129