Intramolecular folding in three tandem guanine repeats of human telomeric DNA

Chemical Communications

Volumn 48, Issue 14, 2012, Pages 2006-2008

  Koirala, Deepak ^a   Mashimo, Tomoko ^b   Sannohe, Yuta ^b   Yu, Zhongbo ^a   Mao, Hanbin ^a   Sugiyama, Hiroshi ^b,c,d  

^a KENT STATE UNIVERSITY   (United States)

^b KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

^c KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

^d JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; GUANINE QUADRUPLEX;

ARTICLE; CIRCULAR DICHROISM; DNA CONFORMATION; DNA DETERMINATION; DNA SEQUENCE; HUMAN; MOLECULAR DYNAMICS; TANDEM REPEAT; THERMODYNAMICS;

EID: 84856446581     PISSN: 13597345     EISSN: 1364548X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cc16752b     Document Type: Article

References (25)

1. E. H. Blackburn, C. W. Greider, J. W. Szostak, Nat. Med., 2006, 12, 1133-1138
2. K. Masutomi, E. Y. Yu, S. Khurts, I. Ben-Porath, J. L. Currier, G. B. Metz, M. W. Brooks, S. Kaneko, S. Murakami, J. A. DeCaprio, R. A. Weinberg, S. A. Stewart, W. C. Hahn, Cell (Cambridge, Mass.), 2003, 114, 241-253
3. N. Kim, M. Piatyszek, K. Prowse, C. Harley, M. West, P. Ho, G. Coviello, W. Wright, S. Weinrich, J. Shay, Science, 1994, 266, 2011-2015
4. E. Henderson, C. C. Hardin, S. K. Walk, I. Tinoco, Jr., E. H. Blackburn, Cell (Cambridge, Mass.), 1987, 51, 899-908
5. M. Gellert, M. N. Lipsett, D. R. Davies, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1962, 48, 2013-2018
6. J. R. Williamson, M. K. Raghuraman, T. R. Cech, Cell (Cambridge, Mass.), 1989, 59, 871-880
7. M.-Y. Kim, H. Vankayalapati, K. Shin-ya, K. A. Wierzba, L. H. Hurley, J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 2098-2099
8. M.-Y. Kim, W. Duan, M. Gleason-Guzman, L. H. Hurley, J. Med. Chem., 2003, 46, 571-583
9. R. Rodriguez, S. Müller, J. A. Yeoman, C. Trentesaux, J.-F. O. Riou, S. Balasubramanian, J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 15758-15759
10. D. Koirala, S. Dhakal, B. Ashbridge, Y. Sannohe, R. Rodriguez, H. Sugiyama, S. Balasubramanian, H. Mao, Nat. Chem., 2011, 3, 782-787
11. S. Burge, G. N. Parkinson, P. Hazel, A. K. Todd, S. Neidle, Nucleic Acids Res., 2006, 34, 5402-5415
12. P. S. Shirude, B. Okumus, L. Ying, T. Ha, S. Balasubramanian, J. Am. Chem. Soc., 2007, 129, 7484-7485
13. J. Y. Lee, B. Okumus, D. S. Kim, T. Ha, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2005, 102, 18938-18943
14. Z. Zhang, J. Dai, E. Veliath, R. A. Jones, D. Yang, Nucleic Acids Res., 2010, 38, 1009-1021
15. T. Mashimo, H. Yagi, Y. Sannohe, A. Rajendran, H. Sugiyama, J. Am. Chem. Soc., 2010, 132, 14910-14918
16. R. D. Gray, J. B. Chaires, Nucleic Acids Res., 2008, 36, 4191-4203
17. R. D. Gray, J. Li, J. B. Chaires, J. Phys. Chem. B, 2009, 113, 2676-2683
18. N. Zhang, A. T. Phan, D. J. Patel, J. Am. Chem. Soc., 2005, 127, 17277-17285
19. I. N. Rujan, J. C. Meleney, P. H. Bolton, Nucleic Acids Res., 2005, 33, 2022-2031
20. I. M. Pedroso, L. F. Duarte, G. Yanez, K. Burkewitz, T. M. Fletcher, Biopolymers, 2007, 87, 74-84
21. C. R. Cantor, M. M. Warshaw, H. Shapiro, Biopolymers, 1970, 9, 1059-1077
22. M. T. Woodside, W. M. Behnke-Parks, K. Larizadeh, K. Travers, D. Herschlag, S. M. Block, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2006, 103, 6190-6195
23. D. Koirala, Z. Yu, S. Dhakal, H. Mao, J. Am. Chem. Soc., 2011, 133, 9988-9991
24. Y. Wang, D. J. Patel, Structure, 1993, 1, 263-282
25. A. N. Lane, J. B. Chaires, R. D. Gray, J. O. Trent, Nucleic Acids Res., 2008, 36, 5482-5515