Direct monitoring of protein-protein inhibition using nano electrospray ionization mass spectrometry

Chemical Science

Volumn 5, Issue 7, 2014, Pages 2794-2803

  Cubrilovic, Dragana ^a   Barylyuk, Konstantin ^a   Hofmann, Daniela ^a   Walczak, Michal Jerzy ^a   Gräber, Martin ^b   Berg, Thorsten ^b   Wider, Gerhard ^a   Zenobi, Renato ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b UNIVERSITY OF LEIPZIG   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CELL DEATH; DIMERS; DISSOCIATION; MASS SPECTROMETRY; MOLECULES;

COLLISION-INDUCED DISSOCIATION; HETERODIMER FORMATION; HETERODIMERIZATION; ION MOBILITY SPECTROMETRY; NANO-ELECTROSPRAY IONIZATIONS; PARTIAL DISSOCIATION; PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS; SMALL-MOLECULE INHIBITORS;

PROTEINS;

EID: 84901826827     PISSN: 20416520     EISSN: 20416539     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3sc53360c     Document Type: Article

References (45)

1. M. R. Arkin J. A. Wells Nat. Rev. Drug Discovery 2004 3 301
2. J. A. Wilson Chem. Soc. Rev. 2009 38 3289
3. E. Valkov, T. Sharpe, M. Marsh, S. Greive and M. Hyvönen, in Fragment-Based Drug Discovery and X-Ray Crystallography, Springer Berlin, Heidelberg, 2012, vol. 317
4. N. Gasilova and A. Nazabal, in Chemical Proteomics, ed., G. Drewes, and, M. Bantscheff, Humana Press, 2012, vol. 803
5. L. T. Vassilev B. T. Vu B. Graves D. Carvajal F. Podlaski Z. Filipovic N. Kong U. Kammlott C. Lukacs C. Klein N. Fotouhi E. A. Liu Science 2004 303 844
6. E. N. Kitova A. El-Hawiet P. D. Schnier J. S. Klassen J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2012 23 431
7. H. J. Maple R. A. Garlish L. Rigau-Roca J. Porter I. Whitcombe C. E. Prosser J. Kennedy A. J. Henry R. J. Taylor M. P. Crump J. Crosby J. Med. Chem. 2012 55 837
8. M. A. Cooper Nat. Rev. Drug Discovery 2002 1 515
9. W. F. de Azevedo R. Dias Curr. Drug Targets 2008 9 1071
10. B. Meyer T. Peters Angew. Chem., Int. Ed. 2003 42 864
11. S. A. Hofstadler K. A. Sannes-Lowery Nat. Rev. Drug Discovery 2006 5 585
12. J. M. Daniel G. McCombie S. Wendt R. Zenobi J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2003 14 442
13. A. Tjernberg S. Carno F. Oliv K. Benkestock P. O. Edlund W. J. Griffiths D. Hallen Anal. Chem. 2004 76 4325
14. M. V. Sharon C. Robinson Curr. Proteomics 2011 8 47
15. K. Lorenzen and E. V. Duijn, Curr. Protoc. Protein Sci., John Wiley & Sons, Inc., 2001, pp. 17.12.1-17.12.17
16. K. Breuker F. W. McLafferty Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 18145
17. S. Zhang C. K. Van Pelt W. D. Wilson Anal. Chem. 2003 75 3010
18. J. Zhang G. McCombie C. Guenat R. Knochenmuss Drug Discovery Today 2005 10 635
19. G. J. Deng G. Sanyal J. Pharm. Biomed. Anal. 2006 40 528
20. J. A. Loo Mass Spectrom. Rev. 1997 16 1
21. J. A. Loo P. Hu P. McConnell W. T. Mueller J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1997 8 234
22. C. Atmanene S. Petiot-Bécard D. Zeyer A. Van Dorsselaer V. Vivat Hannah S. Sanglier-Cianfèrani Anal. Chem. 2012 84 4703
23. W. Davidson J. Hopkins D. Jeanfavre K. Barney T. Kelly C. Grygon J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2003 14 8
24. S. Niu J. N. Rabuck B. T. Ruotolo Curr. Opin. Cell Biol. 2013 17 809
25. Z. Hall C. V. Robinson J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2012 23 1161
26. A. Konijnenberg A. Butterer F. Sobott Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2013 1834 1239
27. M. M. He A. S. Smith J. D. Oslob W. M. Flanagan A. C. Braisted A. Whitty M. T. Cancilla J. Wang A. A. Lugovskoy J. C. Yoburn A. D. Fung G. Farrington J. K. Eldredge E. S. Day L. A. Cruz T. G. Cachero S. K. Miller J. E. Friedman I. C. Choong B. C. Cunningham Science 2005 310 1022
28. M. Gräber M. Hell C. Gröst A. Friberg B. Sperl M. Sattler T. Berg Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 4487
29. T. Oltersdorf S. W. Elmore A. R. Shoemaker R. C. Armstrong D. J. Augeri B. A. Belli M. Bruncko T. L. Deckwerth J. Dinges P. J. Hajduk M. K. Joseph S. Kitada S. J. Korsmeyer A. R. Kunzer A. Letai C. Li M. J. Mitten D. G. Nettesheim S. Ng P. M. Nimmer J. M. O'Connor A. Oleksijew A. M. Petros J. C. Reed W. Shen S. K. Tahir C. B. Thompson K. J. Tomaselli B. Wang M. D. Wendt H. Zhang S. W. Fesik S. H. Rosenberg Nature 2005 435 677
30. H. Zhang P. Nimmer S. H. Rosenberg S.-C. Ng M. Joseph Anal. Biochem. 2002 307 70
31. A. M. Petros A. Medek D. G. Nettesheim D. H. Kim H. S. Yoon K. Swift E. D. Matayoshi T. Oltersdorf S. W. Fesik Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 3012
32. M. Sattler H. Liang D. Nettesheim R. P. Meadows J. E. Harlan M. Eberstadt H. S. Yoon S. B. Shuker B. S. Chang A. J. Minn C. B. Thompson S. W. Fesik Science 1997 275 983
33. S. W. Muchmore M. Sattler H. Liang R. P. Meadows J. E. Harlan H. S. Yoon D. Nettesheim B. S. Chang C. B. Thompson S.-L. Wong S.-C. Ng S. W. Fesik Nature 1996 381 335
34. C. Tse A. R. Shoemaker J. Adickes M. G. Anderson J. Chen S. Jin E. F. Johnson K. C. Marsh M. J. Mitten P. Nimmer L. Roberts S. K. Tahir Y. Xiao X. Yang H. Zhang S. Fesik S. H. Rosenberg S. W. Elmore Cancer Res. 2008 68 3421
35. F. Curnis A. Corti Methods Mol. Med. 2004 98 9
36. H. Rogniaux S. Sanglier K. Strupat S. Azza O. Roitel V. Ball D. Tritsch G. Branlant A. Van Dorsselaer Anal. Biochem. 2001 291 48
37. S. K. Chowdhury V. Katta B. T. Chait J. Am. Chem. Soc. 1990 112 9012
38. V. Katta B. T. Chait J. Am. Chem. Soc. 1991 113 8534
39. D. Cubrilovic R. Zenobi Anal. Chem. 2013 85 2724
40. J. L. Benesch C. V. Robinson Curr. Opin. Struct. Biol. 2006 16 245
41. J. D. Bryngelson J. N. Onuchic N. D. Socci P. G. Wolynes Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 1995 21 167
42. L. O. Narhi J. S. Philo T. Li M. Zhang B. Samal T. Arakawa Biochemistry 1996 35 11447
43. M. Jecklin D. Touboul C. D. Bovet A. Wortmann R. Zenobi J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008 19 332
44. A. M. Petros D. G. Nettesheim Y. Wang E. T. Olejniczak R. P. Meadows J. Mack K. Swift E. D. Matayoshi H. Zhang S. W. Fesik C. B. Thompson Protein Sci. 2000 9 2528
45. M. Vogler S. D. Furdas M. Jung T. Kuwana M. J. S. Dyer G. M. Cohen Clin. Cancer Res. 2010 16 4217