Extensions to in silico bioactivity predictions using pathway annotations and differential pharmacology analysis: Application to xenopus laevis phenotypic readouts

Molecular Informatics

Volumn 32, Issue 11-12, 2013, Pages 1009-1024

  Liggi, Sonia ^a   Drakakis, Georgios ^a   Hendry, Adam E ^b   Hanson, Kimberley M ^b   Brewerton, Suzanne C ^c   Wheeler, Grant N ^b   Bodkin, Michael J ^c   Evans, David A ^c   Bender, Andreas ^a  

^a UNIVERSITY OF CAMBRIDGE   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY OF EAST ANGLIA   (United Kingdom)

^c ELI LILLY AND COMPANY   (United States)

Author keywords

Cheminformatics; In silico bioactivity prediction; Mechanism of action; Pigmentation; Xenopus laevis

Indexed keywords

BIOINFORMATICS; BIOLOGICAL SYSTEMS; COMPLEX NETWORKS; DECISION TREES; FORECASTING; LEARNING ALGORITHMS; LEARNING SYSTEMS; MACHINE LEARNING;

BIOACTIVITY PREDICTION; CHEMICAL AND BIOLOGICALS; CHEMINFORMATICS; COMPUTATIONAL POWER; IN SILICO BIOACTIVITY PREDICTION; IN-SILICO; MECHANISM OF ACTION; PIGMENTATION; TARGET PREDICTION; XENOPUS LAEVIS;

BIOACTIVITY;

EID: 84894539238     PISSN: 18681743     EISSN: 18681751     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/minf.201300102     Document Type: Article

References (174)

1. M. Glick, E. Jacoby, Curr. Opin. Chem. Biol. 2011, 15, 540-546.
2. E. Jacoby, Wiley Interdiscip. Rev.: Comput. Mol. Sci. 2011, 1, 57-67.
3. A. Koutsoukas, B. Simms, J. Kirchmair, P. J. Bond, A. V. Whitmore, S. Zimmer, M. P. Young, J. L. Jenkins, M. Glick, R. C. Glen, et al., J. Proteomics 2011, 74, 2554-2574.
4. L. Mak, S. Liggi, L. Tan, K. Kusonmano, J. M. Rollinger, A. Koutsoukas, R. C. Glen, J. Kirchmair, Curr. Pharm. Des. 2013, 19, 532-577.
5. A. Koutsoukas, R. Lowe, Y. Kalantar-Motamedi, H. Y. Mussa, J. B. O. Mitchell, R. Glen, A. Bender, J. Chem. Inf. Model. 2013, 53, 1957-1966.
6. R. Lowe, H. Y. Mussa, F. Nigsch, R. C. Glen, J. B. Mitchell, J. Cheminf. 2012, 4, 2.
7. J. L. Jenkins, Mol. Inf. 2012, 31, 508-514.
8. M. J. Keiser, V. Setola, J. J. Irwin, C. Laggner, A. I. Abbas, S. J. Hufeisen, N. H. Jensen, M. B. Kuijer, R. C. Matos, T. B. Tran, et al., Nature 2009, 462, 175-181.
9. E. Lounkine, M. J. Keiser, S. Whitebread, D. Mikhailov, J. Hamon, J. L. Jenkins, P. Lavan, E. Weber, A. K. Doak, S. Côté, et al., Nature 2012, 486, 361-367.
10. D. Vidal, J. Mestres, Mol. Inf. 2010, 29, 543-551.
11. T. I. Oprea, A. Tropsha, Drug Discov. Today: Technol. 2006, 3, 357-365.
12. Y. Feng, T. J. Mitchison, A. Bender, D. W. Young, J. A. Tallarico, Nat. Rev. Drug Discov. 2009, 8, 567-578.
13. A. Gaulton, L. J. Bellis, A. P. Bento, J. Chambers, M. Davies, A. Hersey, Y. Light, S. McGlinchey, D. Michalovich, B. Al-Lazikani, et al., Nucleic Acids Res. 2011, 44, 1-8.
14. E. E. Bolton, Y. Wang, P. A. Thiessen, Annu. Rep. Comput. Chem. 2008, 4, 217-241.
15. Y. Wang, J. Xiao, T. O. Suzek, J. Zhang, J. Wang, Z. Zhou, L. Han, K. Karapetyan, S. Dracheva, B. A. Shoemaker, et al., Nucleic Acids Res. 2012, 40, D400-D412.
16. C. Knox, V. Law, T. Jewison, P. Liu, S. Ly, A. Frolkis, A. Pon, K. Banco, C. Mak, V. Neveu, et al., Nucleic Acids Res. 2011, 39, D1035-D1041.
17. H. Pence, A. Williams, J. Chem. Edu. 2010, 87, 1123-1124.
18. J. J. Irwin, T. Sterling, M. M. Mysinger, E. S. Bolstad, R. G. Coleman, J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 1757-1768.
19. M. Olah, R. Rad, L. Ostopovici, A. Bora, N. Hadaruga, D. Hadaruga, R. Moldovan, A. Fulias, M. Mractc, T. Oprea, "WOMBAT and WOMBAT-PK: Bioactivity Databases for Lead and Drug Discovery", in Chemical Biology: From Small Molecules to Systems Biology and Drug Design, Vol. 1-3 (Eds: S. Schreiber, T. Kapoor, G. Wess), Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2008.
20. C. Krejsa, D. Horvath, S. Rogalski, J. Penzotti, B. Mao, F. Barbosa, J. Migeon, Curr. Opin. Drug Discov. Dev. 2003, 6, 470-480.
21. B. L. Roth, E. Lopez, S. Patel, W. K. Kroeze, Neuroscientist 2000, 6, 252-262.
22. A. Bender, J. Scheiber, M. Glick, ChemMedChem 2007, 2, 861-873.
23. J. Drews, Nat. Rev. Drug Discov. 2006, 5, 635-640.
24. J. Drews, Science 2000, 287, 1960-1964.
25. A. L. Hopkins, Nat. Chem. Biol. 2008, 4, 682-690.
26. M. T. Bianchi, E. J. Botzolakis, BMC Pharmacol. 2010, 10, 3.
27. J. Arrowsmith, Nat. Rev. Drug Discov. 2011, 10, 328-329.
28. J. Arrowsmith, Nat. Rev. Drug Discov. 2011, 10, 87.
29. B. Roth, D. Sheffler, W. K. Kroeze, Nat. Rev. Drug Discov. 2004, 3, 353-359.
30. R. Morphy, Z. Rankovic, J. Med. Chem. 2005, 48, 6523-6543.
31. R. Morphy, Z. Rankovic, J. Med. Chem. 2006, 49, 4961-4970.
32. R. Morphy, C. Kay, Z. Rankovic, Drug Discov. Today 2004, 9, 641-651.
33. J. Tiihonen, J. Lönnqvist, K. Wahlbeck, T. Klaukka, L. Niskanen, A. Tanskanen, J. Haukka, Lancet 2009, 374, 620-627.
34. J. Lehár, A. Krueger, G. Zimmermann, A. Borisy, Mol. Syst. Biol. 2008, 4, 1-6.
35. A. A. Borisy, P. J. Elliott, N. W. Hurst, M. S. Lee, J. Lehar, E. R. Price, G. Serbedzija, G. R. Zimmermann, M. A. Foley, B. R. Stockwell, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 7977-7982.
36. J. Aube, ACS Med. Chem. Lett. 2012, 3, 442-444.
37. T. T. Ashburn, K. B. Thor, Nat. Rev. Drug Discov. 2004, 3, 673-683.
38. F. López-Muñoz, C. Alamo, E. Cuenca, W. Shen, P. Clervoy, G. Rubio, Ann. Clin. Psychiatry 2005, 17, 113-135.
39. T. A. Ban, Neuropsychiatric Disease and Treatment 2007, 3, 495-500.
40. J. L. Medina-Franco, M. A. Giulianotti, G. S. Welmaker, R. A. Houghten, Drug Discov. Today 2013, 18, 495-501.
41. S. Ekins, A. J. Williams, M. D. Krasowski, J. S. Freundlich, Drug Discov. Today 2011, 16, 298-310.
42. I. Cortes-Ciriano, A. Koutsoukas, O. Abian, R. C. Glen, A. Velazquez-Campoy, A. Bender, Med. Chem. Commun. 2013, 4, 278-288.
43. Nidhi, M. Glick, J. W. Davies, J. L. Jenkins, J. Chem. Inf. Model. 2006, 46, 1124-1133.
44. J. Scheiber, B. Chen, M. Milik, S. C. K. Sukuru, A. Bender, D. Mikhailov, S. Whitebread, J. Hamon, K. Azzaoui, L. Urban, et al., J. Chem. Inf. Model. 2009, 49, 308-317.
45. M. J. Keiser, B. L. Roth, B. N. Armbruster, P. Ernsberger, J. J. Irwin, B. K. Shoichet, Nat. Biotechnol. 2007, 25, 197-206.
46. L. Peltason, Y. Hu, J. Bajorath, ChemMedChem 2009, 4, 1864-1873.
47. X. Ning, M. Walters, G. Karypis, G. Karypisxy, J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 38-50.
48. H. P. Nguyen, A. Koutsoukas, F. Mohd Fauzi, G. Drakakis, M. Maciejewski, R. C. Glen, A. Bender, Chem. Biol. Drug Des. 2013, 82, 252-266.
49. T. Scior, A. Bender, G. Tresadern, J. L. Medina-Franco, K. Martí- nez-Mayorga, T. Langer, K. Cuanalo-Contreras, D. K. Agrafiotis, J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 867-881.
50. S. Kortagere, S. Ekins, J. Pharmacol. Toxicol. Meth. 2010, 61, 67-75.
51. G. Nicola, T. Liu, M. K. Gilson, J. Med. Chem. 2012, 55, 6987-7002.
52. B. Ganter, R. D. Snyder, D. N. Halbert, D. M. Lee, Pharmacogenomics 2006, 7, 1025-1044.
53. F. López-Vallejo, M. A. Giulianotti, R. A. Houghten, J. L. Medina-Franco, Drug Discov. Today 2012, 17, 718-726.
54. J. Mestres, E. Gregori-Puigjané, S. Valverde, R. V. Solé, Nat. Biotechnol. 2008, 26, 983-984.
55. P. Tiikkainen, L. Franke, J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 319-326.
56. Evolvus, Discov. Informatics, http://www.evolvus.com/, (accessed 30/05/2013).
57. C. Southan, P. Várkonyi, S. Muresan, J. Cheminf. 2009, 1, 10.
58. Y. Zhou, B. Zhou, K. Chen, S. F. Yan, F. J. King, S. Jiang, E. A. Winzeler, J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 1386-94.
59. D. Stumpfe, J. Bajorath, J. Chem. Inf. Model. 2011, 51, 3131-3137.
60. P. Gedeck, C. Kramer, P. Ertl, Prog. Med. Chem. 2010, 49, 113-160.
61. M. Baker, Nat. Rev. Drug Discov. 2006, 5, 707-708.
62. G. Schneider, Mol. Inf. 2011, 30, 759-763.
63. A. J. Williams, S. Ekins, V. Tkachenko, Drug Discov. Today 2012, 17, 685-701.
64. K. Hettne, M. Cases, S. Boyer, J. Mestres, Curr. Top. Med. Chem. 2007, 7, 1530-1536.
65. D. Nishimura, Biotech. Softw. Internet Rep. 2001, 2, 117-120.
66. Cell Signaling Technology, http://www.cellsignal.com, (accessed 30/05/2013).
67. P. Artimo, M. Jonnalagedda, K. Arnold, D. Baratin, G. Csardi, E. de Castro, S. Duvaud, V. Flegel, A. Fortier, E. Gasteiger, et al., Nucleic Acids Res. 2012, 40, W597-W603.
68. N. R. Gough, Ann. N.Y. Acad. Sci. 2002, 971, 585-587.
69. A. Nikitin, S. Egorov, N. Daraselia, I. Mazo, Bioinformatics 2003, 19, 2155-2157.
70. E. Shmelkov, Z. Tang, I. Aifantis, A. Statnikov, Biol. Direct 2011, 6, 15.
71. M. Kanehisa, S. Goto, Nucleic Acids Res. 2000, 28, 27-30.
72. WikiPathways, http://www.wikipathways.org, (accessed 30/05/2013).
73. S. Ekins, Y. Nikolsky, A. Bugrim, E. Kirillov, T. Nikolskaya, Methods Mol. Biol. 2007, 356, 319-350.
74. Ingenuity Pathway Analysis, Ingenuity Systems Inc., www.ingenuity.com, (accessed 30/05/2013).
75. M. Krull, S. Pistor, N. Voss, A. Kel, I. Reuter, D. Kronenberg, H. Michael, K. Schwarzer, A. Potapov, C. Choi, et al., Nucleic Acids Res 2006, 34, D546-D551.
76. V. Matys, O. V. Kel-Margoulis, E. Fricke, I. Liebich, S. Land, A. Barre-Dirrie, I. Reuter, D. Chekmenev, M. Krull, K. Hornischer, et al., Nucleic Acids Res. 2006, 34, D108-D110.
77. GeneSpring, Agilent Technologies, http://www.genomics. agilent.com/CollectionSubpage.aspx?PageType=Product&SubPageType= ProductDetail&PageID=1675, (accessed 30/05/2013).
78. A. J. Williams, S. Ekins, Drug Discov. Today 2011, 16, 747-750.
79. S. Orchard, B. Al-Lazikani, S. Bryant, D. Clark, E. Calder, I. Dix, O. Engkvist, M. Forster, A. Gaulton, M. Gilson, et al., Nat. Rev. Drug Discov. 2011, 10, 661-669.
80. D. Fourches, E. Muratov, A. Tropsha, J. Chem. Inf. Model. 2010, 50, 1189-1204.
81. M. R. Berthold, N. Cebron, F. Dill, T. R. Gabriel, "KNIME: The Konstanz information miner", in Studies in Classification, Data Analysis, and Knowledge Organization (GfKL 2007), Springer, Heidelberg, 2007, pp. 319-326.
82. Standardizer, ChemAxon, http://www.chemaxon.com, (accessed 30/05/2013).
83. SYBYL, Tripos International, 1699 South Hanley Rd., St. Louis, Missouri, 63144, USA.
84. Molecular Operating Environment (MOE), Chemical Computing Group, 1010 Sherbooke St. West, Suite #910, Montreal, QC, Canada, H3A 2R7.
85. Pipeline Pilot, Accelrys, 10188 Telesis Court, Suite 100, San Diego, CA 92121, USA.
86. A. Varnek, I. Baskin, J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 1413-1437.
87. M. Glick, J. L. Jenkins, J. H. Nettles, H. Hitchings, J. W. Davies, J. Chem. Inf. Model. 2006, 46, 193-200.
88. F. Nigsch, A. Bender, J. L. Jenkins, J. B. O. Mitchell, J. Chem Inf Model 2008, 48, 2313-25.
89. B.-H. Su, Y.-S. Tu, E. X. Esposito, Y. J. Tseng, J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 1660-1673.
90. A. Bender, J. L. Jenkins, J. Scheiber, S. C. K. Sukuru, M. Glick, J. W. Davies, J. Chem. Inf. Model. 2009, 49, 108-119.
91. G. Hu, G. Kuang, W. Xiao, W. Li, G. Liu, Y. Tang, J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 1103-1113.
92. J. H. Nettles, J. L. Jenkins, A. Bender, Z. Deng, J. W. Davies, M. Glick, J. Med. Chem. 2006, 49, 6802-6810.
93. J. Kirchmair, A. Howlett, J. E. Peironcely, D. S. Murrell, M. J. Williamson, S. E. Adams, T. Hankemeier, L. van Buren, G. Duchateau, W. Klaffke, et al., J. Chem. Inf. Model. 2013, 53, 354-367.
94. P. Zhao, L. Zhang, J. A. Grillo, Q. Liu, J. M. Bullock, Y. J. Moon, P. Song, S. S. Brar, R. Madabushi, T. C. Wu, et al., Clin. Pharmacol. Ther. 2011, 89, 259-267.
95. D. F. Ortwine, I. Aliagas, Mol. Pharmaceutics 2013, 10, 1153-1161.
96. G. Moroy, V. Y. Martiny, P. Vayer, B. O. Villoutreix, M. A. Miteva, Drug Discov. Today 2012, 17, 44-55.
97. K. H. Grime, P. Barton, D. F. McGinnity, Mol. Pharmaceutics 2013, 10, 1191-1206.
98. D. A. Smith, Mol. Pharmaceutics 2013, 10, 1162-1170.
99. M. Iskar, G. Zeller, X.-M. Zhao, V. van Noort, P. Bork, Curr. Opin. Biotechnol. 2011, 23, 609-616.
100. T. I. Oprea, S. K. Nielsen, O. Ursu, J. J. Yang, O. Taboureau, S. L. Mathias, I. Kouskoumvekaki, L. A. Sklar, C. G. Bologa, Mol. Inf. 2011, 30, 100-111.
101. A. L. Hopkins, J. S. Mason, J. P. Overington, Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 127-136.
102. Y. Yamanishi, M. Kotera, M. Kanehisa, S. Goto, Bioinformatics 2010, 26, 246-254.
103. M. Schenone, V. Dančík, B. K. Wagner, P. A. Clemons, Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 232-240.
104. U. S. Eggert, Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 206-209.
105. J. Besnard, G. F. Ruda, V. Setola, K. Abecassis, R. M. Rodriguiz, X.-P. Huang, S. Norval, M. F. Sassano, A. I. Shin, L. A. Webster, et al., Nature 2012, 492, 215-220.
106. M. L. Tomlinson, A. E. Hendry, G. N. Wheeler, Meth. Mol. Biol. 2012, 917, 155-166.
107. M. L. Tomlinson, M. Rejzek, M. Fidock, R. A. Field, G. N. Wheeler, Mol. BioSyst. 2009, 5, 376-384.
108. Diversity Set Information, NCI Repositories, http://dtp.nci.nih.- gov/branches/dscb/div2-explanation.html, (accessed 30/05/2013).
109. A. Bender, H. Y. Mussa, R. C. Glen, S. Reiling, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 1708-1718.
110. N. M. O'Boyle, M. Banck, C. A. James, C. Morley, T. Vandermeersch, G. R. Hutchison, J. Cheminf. 2011, 3, 33.
111. G. V. Paolini, R. H. B. Shapland, W. P. Van Hoorn, J. S. Mason, A. L. Hopkins, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 805-815.
112. F. Mohd Fauzi, A. Koutsoukas, R. Lowe, K. Joshi, T.-P. Fan, R. C. Glen, A. Bender, J. Chem. Inf. Model. 2013, 53, 661-673.
113. M. Hall, E. Frank, G. Holmes, B. Pfahringer, P. Reutemann, I. Witten, SIGKDD Explor. Newsl. 2009, 11, 10-18.
114. J. R. Quinlan, C4.5: Programs for Machine Learning, Morgan Kaufmann, San Mateo CA, 1993.
115. E. W. Damm, R. Winklbauer, Development 2011, 138, 565-575.
116. C. Betsholtz, L. Karlsson, P. Lindahl, BioEssays 2001, 23, 494-507.
117. P. Soriano, Development 1997, 124, 2691-2700.
118. A. Uong, L. I. Zon, J. Cell. Physiol. 2010, 222, 38-41.
119. D. M. Parichy, J. F. Rawls, S. J. Pratt, T. T. Whitfield, S. L. Johnson, Development 1999, 126, 3425-3436.
120. L. B. Giebel, R. A. Spritz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 8696-8699.
121. E. P. v. Strandmann, S. Senkel, G. Ryffel, U. R. Hengge, Am. J. Pathol. 2001, 158, 2021-2029.
122. L. Zhuang, C. S. Lee, R. A. Scolyer, S. W. McCarthy, X. D. Zhang, J. F. Thompson, P. Hersey, Mod. Pathol. 2007, 20, 416-426.
123. J. Du, H. R. Widlund, M. A. Horstmann, S. Ramaswamy, K. Ross, W. E. Huber, E. K. Nishimura, T. R. Golub, D. E. Fisher, Cancer Cell 2004, 6, 565-576.
124. C. Abdullah, X. Wang, D. Becker, Cell Cycle 2011, 10, 977-988.
125. D. Du Pasquier, A. Dupré, C. Jessus, PloS One 2011, 6, e23672.
126. G. Maurer, B. Tarkowski, M. Baccarini, Oncogene 2011, 30, 3477-3488.
127. M. Longoni, S. Moncini, M. Cisternino, I. M. Morella, S. Ferraiuolo, S. Russo, S. Mannarino, V. Brazzelli, P. Coi, R. Zippel, et al., Am. J. Med. Genet., Part A 2010, 152A, 2176-2184.
128. B. Pandit, A. Sarkozy, L. A. Pennacchio, C. Carta, K. Oishi, S. Martinelli, E. A. Pogna, W. Schackwitz, A. Ustaszewska, A. Landstrom, et al., Nat. Genet. 2007, 39, 1007-1012.
129. S. Lebreton, L. Boissel, N. Iouzalen, J. Moreau, Mech. Dev. 2004, 121, 1481-1494.
130. I. Dominguez, J. Green, Development 2000, 127, 861-868.
131. A. E. Tucker, I. I. Salles, D. E. Voth, W. Ortiz-Leduc, H. Wang, I. Dozmorov, M. Centola, J. D. Ballard, Cell. Microbiol. 2003, 5, 523-532.
132. K. Itoh, T. L. Tang, B. G. Neel, S. Y. Sokol, Development 1995, 121, 3979-3988.
133. S. A. Grando, M. R. Pittelkow, K. U. Schallreuter, J. Invest. Dermatol. 2006, 126, 1948-1965.
134. Z. Wang, Y. Nishimura, Y. Shimada, N. Umemoto, M. Hirano, L. Zang, T. Oka, C. Sakamoto, J. Kuroyanagi, T. Tanaka, Gene 2009, 446, 18-27.
135. J. Xu, F. Xie, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011, 405, 250-255.
136. R. Fujii, Pigm. Cell Res. 2000, 13, 300-319.
137. E. Legius, C. Schrander-Stumpel, E. Schollen, C. Pulles-Heintzberger, M. Gewillig, J.-P. Fryns, J. Med. Genet. 2002, 39, 571-574.
138. D. L. Stirewalt, J. P. Radich, Nat. Rev. Cancer 2003, 3, 650-655.
139. B. J. Dickson, Science 2002, 298, 1959-1964.
140. M. Klagsbrun, A. Eichmann, Cytokine Growth Factor Rev. 2005, 16, 535-548.
141. M. S. Deiner, T. E. Kennedy, A. Fazeli, T. Serafini, M. Tessier-Lavigne, D. W. Sretavan, Neuron 1997, 19, 575-589.
142. T. P. Newsome, B. Asling, B. J. Dickson, Development 2000, 127, 851-860.
143. S. Aspengren, D. Hedberg, M. Wallin, Pigm. Cell Res. 2006, 19, 136-145.
144. F. Riedel, D. Vorkel, S. Eaton, Development 2011, 138, 149-158.
145. B. L. Loeys, J. Chen, E. R. Neptune, D. P. Judge, M. Podowski, T. Holm, J. Meyers, C. C. Leitch, N. Katsanis, N. Sharifi, et al., Nat. Genet. 2005, 37, 275-281.
146. R. M. White, J. Cech, S. Ratanasirintrawoot, C. Y. Lin, P. B. Rahl, C. J. Burke, E. Langdon, M. L. Tomlinson, J. Mosher, C. Kaufman, et al., Nature 2011, 471, 518-522.
147. A. S. Dhillon, S. Hagan, O. Rath, W. Kolch, Oncogene 2007, 26, 3279-3290.
148. C. Nava, N. Hanna, C. Michot, S. Pereira, N. Pouvreau, T. Niihori, Y. Aoki, Y. Matsubara, B. Arveiler, D. Lacombe, et al., J. Med. Genet. 2007, 44, 763-771.
149. R. Buscá, R. Ballotti, Pigm. Cell Res. 2000, 13, 60-69.
150. S. Carreira, J. Goodall, I. Aksan, S. A. La Rocca, Nature 2005, 433, 764-769.
151. B. E. Deverman, P. H. Patterson, Neuron 2009, 64, 61-78.
152. M. Amyere, T. Vogt, J. Hoo, F. Brandrup, A. Bygum, L. Boon, M. Vikkula, J. Invest. Dermatol. 2011, 131, 1234-1239.
153. A. Tanaka, J. E. Lai-Cheong, P. C. van den Akker, N. Nagy, G. Millington, G. F. H. Diercks, P. C. van Voorst Vader, S. E. Clements, N. Almaani, T. Techanukul, et al., Exp. Dermatol. 2010, 19, 416-423.
154. J. M. Dal Porto, S. B. Gauld, K. T. Merrell, D. Mills, A. E. Pugh-Bernard, J. Cambier, Mol. Immunol. 2004, 41, 599-613.
155. A. L. Berlin, A. S. Paller, L. S. Chan, J. Am. Acad. Dermatol. 2002, 47, 169-190.
156. J. Liu, W. Lu, S. Guha, G. C. Baltazar, E. E. Coffey, A. M. Laties, R. C. Rubenstein, W. W. Reenstra, C. H. Mitchell, Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2012, 303, C160-C169.
157. F. Dong, J. An, Chin. J. Ophthalmol. 2007, 43, 1110-1113.
158. S. Merighi, K. Varani, S. Gessi, E. Cattabriga, V. Iannotta, C. Ulouglu, E. Leung, P. A. Borea, Br. J. Pharmacol. 2001, 134, 1215-1226.
159. K. Yoshiura, T. Nakaoka, T. Nishishita, K. Sato, A. Yamamoto, S. Shimada, T. Saida, Y. Kawakami, T. A. Takahashi, H. Fukuda, et al., Clin. Cancer Res. 2005, 11, 8201-8207.
160. G. E. Korte, J. Smith, Experientia 1993, 49, 789-791.
161. M. Nash, T. Flanigan, R. Leslie, N. N. Osborne, Ophthalmic Res. 1999, 31, 1-4.
162. I. Raote, A. Bhattacharya, M. Panicker, "Serotonin 2A (5-HT2A) Receptor Function: Ligand-Dependent Mechanisms and Pathways", in Serotonin Receptors in Neurobiology (Ed: A. Chattopadhyay), CRC Press, Boca Raton, FL, 2007.
163. E. M. Rocha, L. A. Wickham, L. A. da Silveira, K. L. Krenzer, F. S. Yu, I. Toda, B. D. Sullivan, D. A. Sullivan, Br. J. Ophthalmol. 2000, 84, 76-84.
164. M. S. Nash, J. P. Wood, N. N. Osborne, Exp. Eye Res. 1997, 64, 249-255.
165. A. Hirota, J. Jpn. Ophthalmol. Soc. 1992, 96, 1412-1417.
166. D. Sudgen, J. Cell. Biol. 1992, 119, 1515-1521.
167. K. Lashkari, N. Rahimi, A. Kazlauskas, Invest. Ophthalmol. Visual Sci. 1999, 40, 149-156.
168. S. Sakamoto, H. Shichi, J. Ocul. Pharmacol. 1991, 7, 141-145.
169. J. O. Karlsson, R. G. Andersson, N. Grundström, Br. J. Pharmacol. 1989, 97, 222-228.
170. R. Beumer, J. Klock, "Use of Opioid Receptor Antagonists", WO Patent 2007/039058 A2 2007.
171. Y. E. Marín, S. Chen, J. Mol. Med. 2004, 82, 735-749.
172. S.-S. Shin, B. A. Wall, J. S. Goydos, S. Chen, Pigm. Cell Melanoma Res. 2010, 23, 103-111.
173. C. Wellbrock, C. Weisser, E. Geissinger, J. Troppmair, M. Schartl, J. Biol. Chem. 2002, 277, 6443-6454.
174. M. L. Tomlinson, P. Guan, R. J. Morris, M. D. Fidock, M. Rejzek, C. Garcia-Morales, R. A. Field, G. N. Wheeler, Chem. Biol. 2009, 16, 93-104.