Exploration of sialic acid diversity and biology using sialoglycan microarrays

Biopolymers

Volumn 99, Issue 10, 2013, Pages 650-665

  Deng, Lingquan ^a   Chen, Xi ^b   Varki, Ajit ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

diversity; sialic acids; sialoglycan microarrays

Indexed keywords

BIOLOGICAL FUNCTIONS; DIVERSITY; GLYCANS; GLYCOSIDIC LINKAGES; KETO ACIDS; NATURAL SOURCES; SIALIC ACIDS; SPATIAL ORGANIZATION;

POLYSACCHARIDES;

CARBOXYLIC ACIDS;

N ACETYLNEURAMINIC ACID; N GLYCOLOYLNEURAMINIC ACID; POLYSIALIC ACID; SIALIC ACID DERIVATIVE; SIALOGLYCOPROTEIN; POLYSACCHARIDE;

CAMPYLOBACTER JEJUNI; CARBOHYDRATE SYNTHESIS; DNA MICROARRAY; NONHUMAN; PROTEIN IMMOBILIZATION; PROTEIN MICROARRAY; REVIEW;

N-ACETYLNEURAMINIC ACID; POLYSACCHARIDES; SIALIC ACIDS;

EID: 84881142028     PISSN: 00063525     EISSN: 10970282     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/bip.22314     Document Type: Review

References (232)

1. Marth, J. D., Nat Cell Biol 2008, 10, 1015-1016.
2. Varki, A., Cold Spring Harb Perspect Biol 2011, 3, 1-14; doi:pii: a005462. 10.1101/cshperspect.a005462.
3. Varki, A.; Cummings, R. D.; Esko, J. D.; Freeze, H. H.; Stanley, P.; Bertozzi, C. R.; Hart, G. W.; Etzler, M. E., Essentials of Glycobiology; Cold Spring Harbor Laboratory Press: Plainview, NY, 2009.
4. Hart, G. W.; Copeland, R. J., Cell 2010, 143, 672-676.
5. National Research Council, Transforming Glycoscience: A Roadmap for the Future; The National Academies Press: Washington, DC, 2012.
6. Schauer, R., Adv Carbohydr Chem Biochem 1982, 40, 131-234.
7. Troy, F. A., Glycobiology 1992, 2, 5-23.
8. Varki, A., Glycobiology 1992, 2, 25-40.
9. Kelm, S.; Schauer, R., Int Rev Cytol 1997, 175, 137-240.
10. Zanetta, J. P.; Pons, A.; Iwersen, M.; Mariller, C.; Leroy, Y.; Timmerman, P.; Schauer, R., Glycobiology 2001, 11, 663-676.
11. Schauer, R., Glycoconjugate J 2000, 17, 485-499.
12. Angata, T.; Varki, A., Chem Rev 2002, 102, 439-469.
13. Varki, A.; Schauer, R., Essentials of Glycobiology, 2009; pp 199-218.
14. Varki, A., Cell 2006, 126, 841-845.
15. Bishop, J. R.; Gagneux, P., Glycobiology 2007, 17, 23R-34R.
16. Springer, S. A.; Gagneux, P., J Biol Chem 2013, 288, 6904-6911.
17. Vimr, E. R.; Kalivoda, K. A.; Deszo, E. L.; Steenbergen, S. M., Microbiol Mol Biol Rev 2004, 68, 132-153.
18. Knirel, Y. A.; Shashkov, A. S.; Tsvetkov, Y. E.; Jansson, P. E.; Zahringer, U., Adv Carbohydr Chem Biochem 2003, 58, 371-417.
19. Lewis, A. L.; Desa, N.; Hansen, E. E.; Knirel, Y. A.; Gordon, J. I.; Gagneux, P.; Nizet, V.; Varki, A., Proc Natl Acad Sci USA 2009, 106, 13552-13557.
20. Watson, D. C.; Leclerc, S.; Wakarchuk, W. W.; Young, N. M., Glycobiology 2011, 21, 99-108.
21. Lukowsky, W. A.; Painter, R. H., Can J Biochem 1972, 50, 909-917.
22. Schauer, R., Trends Biochem Sci 1985, 10, 357-360.
23. Varki, A.; Gagneux, P., Ann N Y Acad Sci 2012, 1253, 16-36.
24. Varki, A.; Angata, T., Glycobiology 2006, 16, 1R-27R.
25. Schauer, R.; Srinivasan, G. V.; Wipfler, D.; Kniep, B.; Schwartz-Albiez, R., Adv Exp Med Biol 2011, 705, 525-548.
26. Schauer, R., Curr Opin Struct Biol 2009, 19, 507-514.
27. Suzuki, Y., Biol Pharm Bull 2005, 28, 399-408.
28. de Groot, R. J., Glycoconj J 2006, 23, 59-72.
29. Weiman, S.; Dahesh, S.; Carlin, A. F.; Varki, A.; Nizet, V.; Lewis, A. L., Glycobiology 2009, 19, 1204-1213.
30. Weiman, S.; Uchiyama, S.; Lin, F. Y.; Chaffin, D.; Varki, A.; Nizet, V.; Lewis, A. L., Biochem J 2010, 428, 163-168.
31. Kelm, A.; Shaw, L.; Schauer, R.; Reuter, G., Eur J Biochem 1998, 251, 874-884.
32. Varki, A., Proc Natl Acad Sci USA 2010, 107 (Suppl 2), 8939-8946.
33. Irie, A.; Koyama, S.; Kozutsumi, Y.; Kawasaki, T.; Suzuki, A., J Biol Chem 1998, 273, 15866-15871.
34. Chou, H. H.; Takematsu, H.; Diaz, S.; Iber, J.; Nickerson, E.; Wright, K. L.; Muchmore, E. A.; Nelson, D. L.; Warren, S. T.; Varki, A., Proc Natl Acad Sci USA 1998, 95, 11751-11756.
35. Chou, H. H.; Hayakawa, T.; Diaz, S.; Krings, M.; Indriati, E.; Leakey, M.; Paabo, S.; Satta, Y.; Takahata, N.; Varki, A., Proc Natl Acad Sci USA 2002, 99, 11736-11741.
36. Tangvoranuntakul, P.; Gagneux, P.; Diaz, S.; Bardor, M.; Varki, N.; Varki, A.; Muchmore, E., Proc Natl Acad Sci USA 2003, 100, 12045-12050.
37. Banda, K.; Gregg, C. J.; Chow, R.; Varki, N. M.; Varki, A., J Biol Chem 2012, 287, 28852-28864.
38. Padler-Karavani, V.; Yu, H.; Cao, H.; Chokhawala, H.; Karp, F.; Varki, N.; Chen, X.; Varki, A., Glycobiology 2008, 18, 818-830.
39. Taylor, R. E.; Gregg, C. J.; Padler-Karavani, V.; Ghaderi, D.; Yu, H.; Huang, S.; Sorensen, R. U.; Chen, X.; Inostroza, J.; Nizet, V.; Varki, A., J Exp Med 2010, 207, 1637-1646.
40. Malykh, Y. N.; Schauer, R.; Shaw, L., Biochimie 2001, 83, 623-634.
41. Nguyen, D. H.; Tangvoranuntakul, P.; Varki, A., J Immunol 2005, 175, 228-236.
42. Hedlund, M.; Tangvoranuntakul, P.; Takematsu, H.; Long, J. M.; Housley, G. D.; Kozutsumi, Y.; Suzuki, A.; Wynshaw-Boris, A.; Ryan, A. F.; Gallo, R. L.; Varki, N.; Varki, A., Mol Cell Biol 2007, 27, 4340-4346.
43. Hedlund, M.; Padler-Karavani, V.; Varki, N. M.; Varki, A., Proc Natl Acad Sci USA 2008, 105, 18936-18941.
44. Pham, T.; Gregg, C. J.; Karp, F.; Chow, R.; Padler-Karavani, V.; Cao, H.; Chen, X.; Witztum, J. L.; Varki, N. M.; Varki, A., Blood 2009, 114, 5225-5235.
45. Ghaderi, D.; Taylor, R. E.; Padler-Karavani, V.; Diaz, S.; Varki, A., Nat Biotechnol 2010, 28, 863-867.
46. Padler-Karavani, V.; Hurtado-Ziola, N.; Pu, M.; Yu, H.; Huang, S.; Muthana, S.; Chokhawala, H. A.; Cao, H.; Secrest, P.; Friedmann-Morvinski, D.; Singer, O.; Ghaderi, D.; Verma, I. M.; Liu, Y. T.; Messer, K.; Chen, X.; Varki, A.; Schwab, R., Cancer Res 2011, 71, 3352-3363.
47. Park, J. Y.; Park, M. R.; Bui, H. T.; Kwon, D. N.; Kang, M. H.; Oh, M.; Han, J. W.; Cho, S. G.; Park, C.; Shim, H.; Kim, H. M.; Kang, M. J.; Park, J. K.; Lee, J. W.; Lee, K. K.; Kim, J. H., Cell Reprogram 2012, 14, 353-363.
48. Padler-Karavani, V.; Varki, A., Xenotransplantation 2011, 18, 1-5.
49. Yeh, P.; Ezzelarab, M.; Bovin, N.; Hara, H.; Long, C.; Tomiyama, K.; Sun, F.; Ayares, D.; Awwad, M.; Cooper, D. K., Xenotransplantation 2010, 17, 197-206.
50. Basnet, N. B.; Ide, K.; Tahara, H.; Tanaka, Y.; Ohdan, H., Xenotransplantation 2010, 17, 440-448.
51. Ezzelarab, M.; Ayares, D.; Cooper, D. K., Immunol Cell Biol 2005, 83, 396-404.
52. Miwa, Y.; Kobayashi, T.; Nagasaka, T.; Liu, D.; Yu, M.; Yokoyama, I.; Suzuki, A.; Nakao, A., Xenotransplantation 2004, 11, 247-253.
53. Byres, E.; Paton, A. W.; Paton, J. C.; Lofling, J. C.; Smith, D. F.; Wilce, M. C.; Talbot, U. M.; Chong, D. C.; Yu, H.; Huang, S.; Chen, X.; Varki, N. M.; Varki, A.; Rossjohn, J.; Beddoe, T., Nature 2008, 456, 648-652.
54. Paulson, J. C.; Sadler, J. E.; Hill, R. L., J Biol Chem 1979, 254, 2120-2124.
55. Daniels, P. S.; Jeffries, S.; Yates, P.; Schild, G. C.; Rogers, G. N.; Paulson, J. C.; Wharton, S. A.; Douglas, A. R.; Skehel, J. J.; Wiley, D. C., EMBO J 1987, 6, 1459-1465.
56. Chandrasekaran, A.; Srinivasan, A.; Raman, R.; Viswanathan, K.; Raguram, S.; Tumpey, T. M.; Sasisekharan, V.; Sasisekharan, R., Nat Biotechnol 2008, 26, 107-113.
57. Nicholls, J. M.; Chan, R. W.; Russell, R. J.; Air, G. M.; Peiris, J. S., Trends Microbiol 2008, 16, 149-157.
58. Imai, M.; Kawaoka, Y., Curr Opin Virol 2012, 2, 160-167.
59. Gagneux, P.; Cheriyan, M.; Hurtado-Ziola, N.; Brinkman Van Der Linden, E. C.; Anderson, D.; McClure, H.; Varki, A.; Varki, N. M., J Biol Chem 2003, 278, 48245-48250.
60. Powell, L. D.; Sgroi, D.; Sjoberg, E. R.; Stamenkovic, I.; Varki, A., J Biol Chem 1993, 268, 7019-7027.
61. Kelm, S.; Schauer, R.; Manuguerra, J.-C.; Gross, H.-J.; Crocker, P. R., Glycoconjugate J 1994, 11, 576-585.
62. Seales, E. C.; Shaikh, F. M.; Woodard-Grice, A. V.; Aggarwal, P.; McBrayer, A. C.; Hennessy, K. M.; Bellis, S. L., J Biol Chem 2005, 280, 37610-37615.
63. Seales, E. C.; Jurado, G. A.; Brunson, B. A.; Wakefield, J. K.; Frost, A. R.; Bellis, S. L., Cancer Res 2005, 65, 4645-4652.
64. Zhuo, Y.; Chammas, R.; Bellis, S. L., J Biol Chem 2008, 283, 22177-22185.
65. Hedlund, M.; Ng, E.; Varki, A.; Varki, N. M., Cancer Res 2008, 68, 388-394.
66. Schultz, M. J.; Swindall, A. F.; Bellis, S. L., Cancer Metastasis Rev 2012, 31, 501-518.
67. Varki, A., Proc Natl Acad Sci USA 1994, 91, 7390-7397.
68. McEver, R. P.; Moore, K. L.; Cummings, R. D., J Biol Chem 1995, 270, 11025-11028.
69. Rosen, S. D.; Bertozzi, C. R., Curr Biol 1996, 6, 261-264.
70. McEver, R. P.; Cummings, R. D., J Clin Invest 1997, 100, S97-103.
71. Powell, L. D.; Jain, R. K.; Matta, K. L.; Sabesan, S.; Varki, A., J Biol Chem 1995, 270, 7523-7532.
72. Troy, F., Annu Rev Microbiol 1979, 33, 519-560.
73. Finne, J.; Finne, U.; Deagostini-Bazin, H.; Goridis, C., Biochem Biophys Res Commun 1983, 112, 482-487.
74. Muhlenhoff, M.; Eckhardt, M.; Gerardy-Schahn, R., Curr Opin Struct Biol 1998, 8, 558-564.
75. Inoue, Y.; Inoue, S., Pure Appl Chem 1999, 71, 789-800.
76. Rutishauser, U., Nat Rev Neurosci 2008, 9, 26-35.
77. Claus, H.; Stummeyer, K.; Batzilla, J.; Muhlenhoff, M.; Vogel, U., Mol Microbiol 2009, 71, 960-971.
78. Lewis, A. L.; Nizet, V.; Varki, A., Proc Natl Acad Sci USA 2004, 101, 11123-11128.
79. Li, Y.; Chen, X., Appl Microbiol Biotechnol 2012, 94, 887-905.
80. Kakehi, K.; Kinoshita, M.; Kitano, K.; Morita, M.; Oda, Y., Electrophoresis 2001, 22, 3466-3470.
81. Zhang, Y.; Lee, Y. C., J Biol Chem 1999, 274, 6183-6189.
82. Cohen, M.; Varki, A., Int Rev Cell Mol Biol, in press.
83. Leppanen, A.; Parviainen, V.; Ahola-Iivarinen, E.; Kalkkinen, N.; Cummings, R. D., Glycobiology 2010, 20, 1170-1185.
84. Wang, J.; Shiratori, I.; Satoh, T.; Lanier, L. L.; Arase, H., J Immunol 2008, 180, 1686-1693.
85. Sun, Y.; Senger, K.; Baginski, T. K.; Mazloom, A.; Chinn, Y.; Pantua, H.; Hamidzadeh, K.; Ramani, S. R.; Luis, E.; Tom, I.; Sebrell, A.; Quinones, G.; Ma, Y.; Mukhyala, K.; Sai, T.; Ding, J.; Haley, B.; Shadnia, H.; Kapadia, S. B.; Gonzalez, L. C.; Hass, P. E.; Zarrin, A. A., J Biol Chem 2012, 287, 15837-15850.
86. Cohen, M.; Varki, A., OMICS 2010, 14, 455-464.
87. Kaida, K.; Kanzaki, M.; Morita, D.; Kamakura, K.; Motoyoshi, K.; Hirakawa, M.; Kusunoki, S., J Neurol Neurosurg Psychiatry 2006, 77, 1043-1046.
88. Kusunoki, S.; Kaida, K., J Neurochem 2011, 116, 828-832.
89. Hakomori Si, S. I., Proc Natl Acad Sci USA 2002, 99, 225-232.
90. Cohen, M.; Hurtado-Ziola, N.; Varki, A., Blood 2009, 114, 3668-3676.
91. Carlin, A. F.; Lewis, A. L.; Varki, A.; Nizet, V., J Bacteriol 2007, 89, 1231-1237.
92. Pincus, S. H.; Moran, E.; Maresh, G.; Jennings, H. J.; Pritchard, D. G.; Egan, M. L.; Blixt, O., Vaccine 2012, 30, 4849-4858.
93. Esko, J. D.; Sharon, N., 2009, Essentials of Glycobiology, 489-500.
94. Cummings, R. D.; Esko, J. D., 2009, Essentials of Glycobiology, 387-402.
95. Varki, A.; Etzler, M. E.; Cummings, R. D.; Esko, J. D., Essentials of Glycobiology, 2009; pp 375-386.
96. Hakomori, S., Glycoconj J 2004, 21, 125-137.
97. Bucior, I.; Burger, M. M., Glycoconj J 2004, 21, 111-123.
98. Mandal, C., Experientia 1990, 46, 433-441.
99. Varki, A., FASEB J 1997, 11, 248-255.
100. Lehmann, F.; Tiralongo, E.; Tiralongo, J., Cell Mol Life Sci 2006, 63, 1331-1354.
101. Varki, A., Nature 2007, 446, 1023-1029.
102. Chen, X.; Varki, A., ACS Chem Biol 2010, 5, 163-176.
103. Crocker, P. R.; Paulson, J. C.; Varki, A., Nat Rev Immunol 2007, 7, 255-266.
104. Varki, A., Trends Mol Med 2008, 14, 351-360.
105. Tian, Y.; Esteva, F. J.; Song, J.; Zhang, H., Mol Cell Proteomics 2012, 11, M111.011403.
106. Blixt, O.; Boos, I.; Mandel, U., Anticarbohydrate Antibodies., From Molecular Basis to Clinical Application; Springer, Vienna: Wien, 2012; pp 283-306.
107. Yu, H.; Chen, X., Org Biomol Chem 2007, 5, 865-872.
108. Shaw, L.; Schauer, R., Biol Chem Hoppe Seyler 1988, 369, 477-486.
109. Kozutsumi, Y.; Kawano, T.; Yamakawa, T.; Suzuki, A., J Biochem (Tokyo) 1990, 108, 704-706.
110. Muchmore, E. A.; Milewski, M.; Varki, A.; Diaz, S., J Biol Chem 1989, 264, 20216-20223.
111. Lewis, A. L.; Cao, H.; Patel, S. K.; Diaz, S.; Ryan, W.; Carlin, A. F.; Thon, V.; Lewis, W. G.; Varki, A.; Chen, X.; Nizet, V., J Biol Chem 2007, 282, 27562-27571.
112. Lrhorfi, L. A.; Srinivasan, G. V.; Schauer, R., Biol Chem 2007, 388, 297-306.
113. Houliston, R. S.; Endtz, H. P.; Yuki, N.; Li, J.; Jarrell, H. C.; Koga, M.; van Belkum, A.; Karwaski, M. F.; Wakarchuk, W. W.; Gilbert, M., J Biol Chem 2006, 281, 11480-11486.
114. Claus, H.; Borrow, R.; Achtman, M.; Morelli, G.; Kantelberg, C.; Longworth, E.; Frosch, M.; Vogel, U., Mol Microbiol 2004, 51, 227-239.
115. Arming, S.; Wipfler, D.; Mayr, J.; Merling, A.; Vilas, U.; Schauer, R.; Schwartz-Albiez, R.; Vlasak, R., Glycobiology 2011, 21, 553-564.
116. Yu, H.; Chokhawala, H. A.; Huang, S.; Chen, X., Nat Protoc 2006, 1, 2485-2492.
117. Yu, H.; Chokhawala, H.; Karpel, R.; Yu, H.; Wu, B.; Zhang, J.; Zhang, Y.; Jia, Q.; Chen, X., J Am Chem Soc 2005, 127, 17618-17619.
118. Yu, H.; Huang, S.; Chokhawala, H.; Sun, M.; Zheng, H.; Chen, X., Angew Chem Int Ed Engl 2006, 45, 3938-3944.
119. Yu, H.; Cheng, J.; Ding, L.; Khedri, Z.; Chen, Y.; Chin, S.; Lau, K.; Tiwari, V. K.; Chen, X., J Am Chem Soc 2009, 131, 18467-18477.
120. Ding, L.; Yu, H.; Lau, K.; Li, Y.; Muthana, S.; Wang, J.; Chen, X., Chem Commun (Camb) 2011, 47, 8691-8693.
121. Yu, H.; Cao, H.; Tiwari, V. K.; Li, Y.; Chen, X., Bioorg Med Chem Lett 2011, 21, 5037-5040.
122. Yu, H.; Yu, H.; Karpel, R.; Chen, X., Bioorg Med Chem 2004, 12, 6427-6435.
123. Li, Y.; Yu, H.; Cao, H.; Lau, K.; Muthana, S.; Tiwari, V. K.; Son, B.; Chen, X., Appl Microbiol Biotechnol 2008, 79, 963-970.
124. Li, Y.; Yu, H.; Cao, H.; Muthana, S.; Chen, X., Appl Microbiol Biotechnol 2012, 93, 2411-2423.
125. Sugiarto, G.; Lau, K.; Li, Y.; Khedri, Z.; Yu, H.; Le, D. T.; Chen, X., Mol Biosyst 2011, 7, 3021-3027.
126. Sugiarto, G.; Lau, K.; Qu, J.; Li, Y.; Lim, S.; Mu, S.; Ames, J. B.; Fisher, A. J.; Chen, X., ACS Chem Biol 2012, 7, 1232-1240.
127. Wang, D.; Liu, S.; Trummer, B. J.; Deng, C.; Wang, A., Nat Biotechnol 2002, 20, 275-281.
128. Fukui, S.; Feizi, T.; Galustian, C.; Lawson, A. M.; Chai, W., Nat Biotechnol 2002, 20, 1011-1017.
129. Laurent, N.; Voglmeir, J.; Flitsch, S. L., Chem Commun (Camb) 2008, 4400-4412.
130. Horlacher, T.; Seeberger, P. H., Chem Soc Rev 2008, 37, 1414-1422.
131. Wu, C. Y.; Liang, P. H.; Wong, C. H., Org Biomol Chem 2009, 7, 2247-2254.
132. Song, E. H.; Pohl, N. L., Curr Opin Chem Biol 2009, 13, 626-632.
133. Taylor, M. E.; Drickamer, K., Glycobiology 2009, 19, 1155-1162.
134. Rillahan, C. D.; Paulson, J. C., Annu Rev Biochem 2011, 80, 797-823.
135. Park, S.; Gildersleeve, J. C.; Blixt, O.; Shin, I., Chem Soc Rev 2013, 42, 4310-4326.
136. Smith, D. F.; Cummings, R. D., Mol Cell Proteomics 2013, 12, 902-912.
137. Chevolot, Y., Carbohydrate Microarrays: Methods and Protocols; Humana Press, Springer Science+Business Media, LLC, 2012; pp 1-427.
138. Stevens, J.; Blixt, O.; Tumpey, T. M.; Taubenberger, J. K.; Paulson, J. C.; Wilson, I. A., Science 2006, 312, 404-410.
139. Stevens, J.; Blixt, O.; Chen, L. M.; Donis, R. O.; Paulson, J. C.; Wilson, I. A., J Mol Biol 2008, 381, 1382-1394.
140. Xu, R.; McBride, R.; Paulson, J. C.; Basler, C. F.; Wilson, I. A., J Virol 2010, 84, 1715-1721.
141. Maines, T. R.; Chen, L. M.; Van Hoeven, N.; Tumpey, T. M.; Blixt, O.; Belser, J. A.; Gustin, K. M.; Pearce, M. B.; Pappas, C.; Stevens, J.; Cox, N. J.; Paulson, J. C.; Raman, R.; Sasisekharan, R.; Katz, J. M.; Donis, R. O., Virology 2011, 413, 139-147.
142. Rademacher, C.; Bru, T.; McBride, R.; Robison, E.; Nycholat, C. M.; Kremer, E. J.; Paulson, J. C., Glycobiology 2012, 22, 1086-1091.
143. Xu, R.; Krause, J. C.; McBride, R.; Paulson, J. C.; Crowe, J. E. J.; Wilson, I. A., Nat Struct Mol Biol 2013, 20, 363-370.
144. Blixt, O.; Han, S.; Liao, L.; Zeng, Y.; Hoffmann, J.; Futakawa, S.; Paulson, J. C., J Am Chem Soc 2008, 130, 6680-6681.
145. Rillahan, C. D.; Schwartz, E.; McBride, R.; Fokin, V. V.; Paulson, J. C., Angew Chem Int Ed Engl 2012, 51, 11014-11018.
146. Rillahan, C. D.; Schwartz, E.; Rademacher, C.; McBride, R.; Rangarajan, J.; Fokin, V. V.; Paulson, J. C., ACS Chem Biol 2013
147. Liu, Y.; Childs, R. A.; Palma, A. S.; Campanero-Rhodes, M. A.; Stoll, M. S.; Chai, W.; Feizi, T., Methods Mol Biol 2012, 808, 117-136.
148. Childs, R. A.; Palma, A. S.; Wharton, S.; Matrosovich, T.; Liu, Y.; Chai, W.; Campanero-Rhodes, M. A.; Zhang, Y.; Eickmann, M.; Kiso, M.; Hay, A.; Matrosovich, M.; Feizi, T., Nat Biotechnol 2009, 27, 797-799.
149. Redelinghuys, P.; Antonopoulos, A.; Liu, Y.; Campanero-Rhodes, M. A.; McKenzie, E.; Haslam, S. M.; Dell, A.; Feizi, T.; Crocker, P. R., J Biol Chem 2011, 286, 34522-34532.
150. Lai, L.; Bumstead, J.; Liu, Y.; Garnett, J.; Campanero-Rhodes, M. A.; Blake, D. P.; Palma, A. S.; Chai, W.; Ferguson, D. J.; Simpson, P.; Feizi, T.; Tomley, F. M.; Matthews, S., PLoS Pathog 2011, 7, e1002296.
151. Reiss, K.; Stencel, J. E.; Liu, Y.; Blaum, B. S.; Reiter, D. M.; Feizi, T.; Dermody, T. S.; Stehle, T., PLoS Pathog 2012, 8, e1003078.
152. Chen, H. Y.; Challa, A. K.; Varki, A., J Biol Chem 2006, 281, 7825-7833.
153. Martin, L. T.; Marth, J. D.; Varki, A.; Varki, N. M., J Biol Chem 2002, 277, 32930-32938.
154. Krishna, M.; Varki, A., J Exp Med 1997, 185, 1997-2013.
155. Sjoberg, E. R.; Powell, L. D.; Klein, A.; Varki, A., J Cell Biol 1994, 126, 549-562.
156. Cheresh, D. A.; Reisfeld, R. A.; Varki, A. P., Science 1984, 225, 844-846.
157. Chokhawala, H. A.; Huang, S.; Lau, K.; Yu, H.; Cheng, J.; Thon, V.; Hurtado-Ziola, N.; Guerrero, J. A.; Varki, A.; Chen, X., ACS Chem Biol 2008, 3, 567-576.
158. Padler-Karavani, V.; Song, X.; Yu, H.; Hurtado-Ziola, N.; Huang, S.; Muthana, S.; Chokhawala, H. A.; Cheng, J.; Verhagen, A.; Langereis, M. A.; Kleene, R.; Schachner, M.; de Groot, R. J.; Lasanajak, Y.; Matsuda, H.; Schwab, R.; Chen, X.; Smith, D. F.; Cummings, R. D.; Varki, A., J Biol Chem 2012, 287, 22593-22608.
159. Lu, Q.; Padler-Karavani, V.; Yu, H.; Chen, X.; Wu, S. L.; Varki, A.; Hancock, W. S., Anal Chem 2012, 84, 2761-2768.
160. Padler-Karavani, V.; Tremoulet, A. H.; Yu, H.; Chen, X.; Burns, J. C.; Varki, A., PLoS One 2013, 8, e58443.
161. Song, X.; Yu, H.; Chen, X.; Lasanajak, Y.; Tappert, M. M.; Air, G. M.; Tiwari, V. K.; Cao, H.; Chokhawala, H. A.; Zheng, H.; Cummings, R. D.; Smith, D. F., J Biol Chem 2011, 286, 31610-31622.
162. Bradley, K. C.; Galloway, S. E.; Lasanajak, Y.; Song, X.; Heimburg-Molinaro, J.; Yu, H.; Chen, X.; Talekar, G. R.; Smith, D. F.; Cummings, R. D.; Steinhauer, D. A., J Virol 2011, 85, 12387-12398.
163. Jacob, F.; Goldstein, D. R.; Bovin, N. V.; Pochechueva, T.; Spengler, M.; Caduff, R.; Fink, D.; Vuskovic, M. I.; Huflejt, M. E.; Heinzelmann-Schwarz, V., Int J Cancer 2012, 130, 138-146.
164. Liao, H. Y.; Hsu, C. H.; Wang, S. C.; Liang, C. H.; Yen, H. Y.; Su, C. Y.; Chen, C. H.; Jan, J. T.; Ren, C. T.; Chen, C. H.; Cheng, T. J.; Wu, C. Y.; Wong, C. H., J Am Chem Soc 2010, 132, 14849-14856.
165. Yen, H. L.; Liang, C. H.; Wu, C. Y.; Forrest, H. L.; Ferguson, A.; Choy, K. T.; Jones, J.; Wong, D. D.; Cheung, P. P.; Hsu, C. H.; Li, O. T.; Yuen, K. M.; Chan, R. W.; Poon, L. L.; Chan, M. C.; Nicholls, J. M.; Krauss, S.; Wong, C. H.; Guan, Y.; Webster, R. G.; Webby, R. J.; Peiris, M., Proc Natl Acad Sci USA 2011, 108, 14264-14269.
166. Wang, C. C.; Chen, J. R.; Tseng, Y. C.; Hsu, C. H.; Hung, Y. F.; Chen, S. W.; Chen, C. M.; Khoo, K. H.; Cheng, T. J.; Cheng, Y. S.; Jan, J. T.; Wu, C. Y.; Ma, C.; Wong, C. H., Proc Natl Acad Sci USA 2009, 106, 18137-18142.
167. Arndt, N. X.; Tiralongo, J.; Madge, P. D.; von Itzstein, M.; Day, C. J., J Cell Biochem 2011, 112, 2230-2240.
168. Bochner, B. S.; Alvarez, R. A.; Mehta, P.; Bovin, N. V.; Blixt, O.; White, J. R.; Schnaar, R. L., J Biol Chem 2005, 280, 4307-4312.
169. Gambaryan, A. S.; Matrosovich, T. Y.; Philipp, J.; Munster, V. J.; Fouchier, R. A.; Cattoli, G.; Capua, I.; Krauss, S. L.; Webster, R. G.; Banks, J.; Bovin, N. V.; Klenk, H. D.; Matrosovich, M. N., J Virol 2012, 86, 4370-4379.
170. Linman, M. J.; Taylor, J. D.; Yu, H.; Chen, X.; Cheng, Q., Anal Chem 2008, 80, 4007-4013.
171. Linman, M. J.; Yu, H.; Chen, X.; Cheng, Q., ACS Appl Mater Interfaces 2009, 1, 1755-1762.
172. Sardzik, R.; Sharma, R.; Kaloo, S.; Voglmeir, J.; Crocker, P. R.; Flitsch, S. L., Chem Commun (Camb) 2011, 47, 5425-5427.
173. Pourceau, G.; Chevolot, Y.; Goudot, A.; Giroux, F.; Meyer, A.; Moules, V.; Lina, B.; Cecioni, S.; Vidal, S.; Yu, H.; Chen, X.; Ferraris, O.; Praly, J. P.; Souteyrand, E.; Vasseur, J. J.; Morvan, F., Chembiochem 2011, 12, 2071-2080.
174. Narla, S. N.; Sun, X. L., Biomacromolecules 2012, 13, 1675-1682.
175. Ma, Y.; Sobkiv, I.; Gruzdys, V.; Zhang, H.; Sun, X. L., Anal Bioanal Chem 2012, 404, 51-58.
176. Xu, R.; Zhu, X.; McBride, R.; Nycholat, C. M.; Yu, W.; Paulson, J. C.; Wilson, I. A., J Virol 2012, 86, 9221-9232.
177. Xu, R.; McBride, R.; Nycholat, C. M.; Paulson, J. C.; Wilson, I. A., J Virol 2012, 86, 982-990.
178. Zhu, X.; Yu, W.; McBride, R.; Li, Y.; Chen, L. M.; Donis, R. O.; Tong, S.; Paulson, J. C.; Wilson, I. A., Proc Natl Acad Sci USA 2013, 110, 1458-1463.
179. Zhu, X.; Yang, H.; Guo, Z.; Yu, W.; Carney, P. J.; Li, Y.; Chen, L. M.; Paulson, J. C.; Donis, R. O.; Tong, S.; Stevens, J.; Wilson, I. A., Proc Natl Acad Sci USA 2012, 109, 18903-18908.
180. Zhu, X.; McBride, R.; Nycholat, C. M.; Yu, W.; Paulson, J. C.; Wilson, I. A., J Virol 2012, 86, 13371-13383.
181. Neu, U.; Maginnis, M. S.; Palma, A. S.; Stroh, L. J.; Nelson, C. D.; Feizi, T.; Atwood, W. J.; Stehle, T., Cell Host Microbe 2010, 8, 309-319.
182. Blumenschein, T. M.; Friedrich, N.; Childs, R. A.; Saouros, S.; Carpenter, E. P.; Campanero-Rhodes, M. A.; Simpson, P.; Chai, W.; Koutroukides, T.; Blackman, M. J.; Feizi, T.; Soldati-Favre, D.; Matthews, S., EMBO J 2007, 26, 2808-2820.
183. Cao, H.; Crocker, P. R., Immunology 2011, 132, 18-26.
184. Varki, A., Glycobiology 2009, 19, 810-812.
185. Kelm, S.; Madge, P.; Islam, T.; Bennett, R.; Koliwer-Brandl, H.; Waespy, M.; von Itzstein, M.; Haselhorst, T., Angew Chem Int Ed Engl 2013, 52, 3616-3620.
186. Edwards, A. D.; Chaussabel, D.; Tomlinson, S.; Schulz, O.; Sher, A.; Reis e Sousa, C., J Immunol 2003, 171, 47-60.
187. Wen, T.; Mingler, M. K.; Blanchard, C.; Wahl, B.; Pabst, O.; Rothenberg, M. E., J Immunol 2012, 188, 1075-1082.
188. Huflejt, M. E.; Vuskovic, M.; Vasiliu, D.; Xu, H.; Obukhova, P.; Shilova, N.; Tuzikov, A.; Galanina, O.; Arun, B.; Lu, K.; Bovin, N., Mol Immunol 2009, 46, 3037-3049.
189. Wu, C. S.; Yen, C. J.; Chou, R. H.; Li, S. T.; Huang, W. C.; Ren, C. T.; Wu, C. Y.; Yu, Y. L., PLoS One 2012, 7, e39466.
190. von Gunten, S.; Smith, D. F.; Cummings, R. D.; Riedel, S.; Miescher, S.; Schaub, A.; Hamilton, R. G.; Bochner, B. S., J Allergy Clin Immunol 2009, 123, 1268-76.e15.
191. Campbell, C. T.; Gulley, J. L.; Oyelaran, O.; Hodge, J. W.; Schlom, J.; Gildersleeve, J. C., Clin Cancer Res 2013, 19, 1290-1299.
192. Parker, R. B.; McCombs, J. E.; Kohler, J. J., ACS Chem Biol 2012, 7, 1509-1514.
193. Blixt, O.; Allin, K.; Bohorov, O.; Liu, X.; Andersson-Sand, H.; Hoffmann, J.; Razi, N., Glycoconj J 2007, 25, 59-68.
194. Belser, J. A.; Blixt, O.; Chen, L. M.; Pappas, C.; Maines, T. R.; Van Hoeven, N.; Donis, R.; Busch, J.; McBride, R.; Paulson, J. C.; Katz, J. M.; Tumpey, T. M., Proc Natl Acad Sci USA 2008, 105, 7558-7563.
195. Wan, H.; Sorrell, E. M.; Song, H.; Hossain, M. J.; Ramirez-Nieto, G.; Monne, I.; Stevens, J.; Cattoli, G.; Capua, I.; Chen, L. M.; Donis, R. O.; Busch, J.; Paulson, J. C.; Brockwell, C.; Webby, R.; Blanco, J.; Al-Natour, M. Q.; Perez, D. R., PLoS One 2008, 3, e2923.
196. Stevens, J.; Chen, L. M.; Carney, P. J.; Garten, R.; Foust, A.; Le, J.; Pokorny, B. A.; Manojkumar, R.; Silverman, J.; Devis, R.; Rhea, K.; Xu, X.; Bucher, D. J.; Paulson, J.; Cox, N. J.; Klimov, A.; Donis, R. O., J Virol 2010, 84, 8287-8299.
197. Chen, L. M.; Rivailler, P.; Hossain, J.; Carney, P.; Balish, A.; Perry, I.; Davis, C. T.; Garten, R.; Shu, B.; Xu, X.; Klimov, A.; Paulson, J. C.; Cox, N. J.; Swenson, S.; Stevens, J.; Vincent, A.; Gramer, M.; Donis, R. O., Virology 2011, 412, 401-410.
198. Chen, L. M.; Blixt, O.; Stevens, J.; Lipatov, A. S.; Davis, C. T.; Collins, B. E.; Cox, N. J.; Paulson, J. C.; Donis, R. O., Virology 2012, 422, 105-113.
199. Heimburg-Molinaro, J.; Tappert, M.; Song, X.; Lasanajak, Y.; Air, G.; Smith, D. F.; Cummings, R. D., Methods Mol Biol 2012, 808, 251-267.
200. Campanero-Rhodes, M. A.; Smith, A.; Chai, W.; Sonnino, S.; Mauri, L.; Childs, R. A.; Zhang, Y.; Ewers, H.; Helenius, A.; Imberty, A.; Feizi, T., J Virol 2007, 81, 12846-12858.
201. Yu, X.; Coulson, B. S.; Fleming, F. E.; Dyason, J. C.; von Itzstein, M.; Blanchard, H., J Mol Biol 2011, 413, 929-939.
202. Yu, X.; Dang, V. T.; Fleming, F. E.; von Itzstein, M.; Coulson, B. S.; Blanchard, H., J Virol 2012, 86, 13456-13466.
203. Lofling, J.; Michael Lyi, S.; Parrish, C. R.; Varki, A., Virology 2013, 440, 89-96.
204. Disney, M. D.; Seeberger, P. H., Chem Biol 2004, 11, 1701-1707.
205. Mader, A.; Gruber, K.; Castelli, R.; Hermann, B. A.; Seeberger, P. H.; Radler, J. O.; Leisner, M., Nano Lett 2012, 12, 420-423.
206. Nimrichter, L.; Gargir, A.; Gortler, M.; Altstock, R. T.; Shtevi, A.; Weisshaus, O.; Fire, E.; Dotan, N.; Schnaar, R. L., Glycobiology 2004, 14, 197-203.
207. Grabosch, C.; Kolbe, K.; Lindhorst, T. K., Chembiochem 2012, 13, 1874-1879.
208. Otto, D. M.; Campanero-Rhodes, M. A.; Karamanska, R.; Powell, A. K.; Bovin, N.; Turnbull, J. E.; Field, R. A.; Blackburn, J.; Feizi, T.; Crocker, P. R., Anal Biochem 2011, 411, 261-270.
209. Jimenez Blanco, J. L.; Ortiz Mellet, C.; Garcia Fernandez, J. M., Chem Soc Rev 2013, 42, 4518-4531.
210. Liang, C. H.; Wang, S. K.; Lin, C. W.; Wang, C. C.; Wong, C. H.; Wu, C. Y., Angew Chem Int Ed Engl 2011, 50, 1608-1612.
211. Rinaldi, S.; Brennan, K. M.; Goodyear, C. S.; O'Leary, C.; Schiavo, G.; Crocker, P. R.; Willison, H. J., Glycobiology 2009, 19, 789-796.
212. Rinaldi, S.; Brennan, K. M.; Willison, H. J., Methods Mol Biol 2012, 808, 413-423.
213. Deng, Y.; Wang, Y.; Holtz, B.; Li, J.; Traaseth, N.; Veglia, G.; Stottrup, B. J.; Elde, R.; Pei, D.; Guo, A.; Zhu, X. Y., J Am Chem Soc 2008, 130, 6267-6271.
214. Zhu, X. Y.; Holtz, B.; Wang, Y.; Wang, L. X.; Orndorff, P. E.; Guo, A., J Am Chem Soc 2009, 131, 13646-13650.
215. Shi, L.; Reid, L. H.; Jones, W. D.; Shippy, R.; Warrington, J. A.; Baker, S. C.; Collins, P. J.; de Longueville, F.; Kawasaki, E. S.; Lee, K. Y.; Luo, Y.; Sun, Y. A.; Willey, J. C.; Setterquist, R. A.; Fischer, G. M.; Tong, W.; Dragan, Y. P.; Dix, D. J.; Frueh, F. W.; Goodsaid, F. M.; Herman, D.; Jensen, R. V.; Johnson, C. D.; Lobenhofer, E. K.; Puri, R. K.; Schrf, U.; Thierry-Mieg, J.; Wang, C.; Wilson, M.; Wolber, P. K.; Zhang, L.; Amur, S.; Bao, W.; Barbacioru, C. C.; Lucas, A. B.; Bertholet, V.; Boysen, C.; Bromley, B.; Brown, D.; Brunner, A.; Canales, R.; Cao, X. M.; Cebula, T. A.; Chen, J. J.; Cheng, J.; Chu, T. M.; Chudin, E.; Corson, J.; Corton, J. C.; Croner, L. J.; Davies, C.; Davison, T. S.; Delenstarr, G.; Deng, X.; Dorris, D.; Eklund, A. C.; Fan, X. H.; Fang, H.; Fulmer-Smentek, S.; Fuscoe, J. C.; Gallagher, K.; Ge, W.; Guo, L.; Guo, X.; Hager, J.; Haje, P. K.; Han, J.; Han, T.; Harbottle, H. C.; Harris, S. C.; Hatchwell, E.; Hauser, C. A.; Hester, S.; Hong, H.; Hurban, P.; Jackson, S. A.; Ji, H.; Knight, C. R.; Kuo, W. P.; LeClerc, J. E.; Levy, S.; Li, Q. Z.; Liu, C.; Liu, Y.; Lombardi, M. J.; Ma, Y.; Magnuson, S. R.; Maqsodi, B.; McDaniel, T.; Mei, N.; Myklebost, O.; Ning, B.; Novoradovskaya, N.; Orr, M. S.; Osborn, T. W.; Papallo, A.; Patterson, T. A.; Perkins, R. G.; Peters, E. H.; Peterson, R.; Philips, K. L.; Pine, P. S.; Pusztai, L.; Qian, F.; Ren, H.; Rosen, M.; Rosenzweig, B. A.; Samaha, R. R.; Schena, M.; Schroth, G. P.; Shchegrova, S.; Smith, D. D.; Staedtler, F.; Su, Z.; Sun, H.; Szallasi, Z.; Tezak, Z.; Thierry-Mieg, D.; Thompson, K. L.; Tikhonova, I.; Turpaz, Y.; Vallanat, B.; Van, C.; Walker, S. J.; Wang, S. J.; Wang, Y.; Wolfinger, R.; Wong, A.; Wu, J.; Xiao, C.; Xie, Q.; Xu, J.; Yang, W.; Zhang, L.; Zhong, S.; Zong, Y.; Slikker, W. J., Nat Biotechnol 2006, 24, 1151-1161.
216. Brazma, A.; Hingamp, P.; Quackenbush, J.; Sherlock, G.; Spellman, P.; Stoeckert, C.; Aach, J.; Ansorge, W.; Ball, C. A.; Causton, H. C.; Gaasterland, T.; Glenisson, P.; Holstege, F. C.; Kim, I. F.; Markowitz, V.; Matese, J. C.; Parkinson, H.; Robinson, A.; Sarkans, U.; Schulze-Kremer, S.; Stewart, J.; Taylor, R.; Vilo, J.; Vingron, M., Nat Genet 2001, 29, 365-371.
217. Liu, Y.; Feizi, T.; Campanero-Rhodes, M. A.; Childs, R. A.; Zhang, Y.; Mulloy, B.; Evans, P. G.; Osborn, H. M.; Otto, D.; Crocker, P. R.; Chai, W., Chem Biol 2007, 14, 847-859.
218. Bovin, N.; Obukhova, P.; Shilova, N.; Rapoport, E.; Popova, I.; Navakouski, M.; Unverzagt, C.; Vuskovic, M.; Huflejt, M., Biochim Biophys Acta 2012, 1820, 1373-1382.
219. Carroll, G. T.; Wang, D.; Turro, N. J.; Koberstein, J. T., Glycoconj J 2008, 25, 5-10.
220. Deng, L.; Norberg, O.; Uppalapati, S.; Yan, M.; Ramstrom, O., Org Biomol Chem 2011, 9, 3188-3198.
221. Tyagi, A.; Wang, X.; Deng, L.; Ramstrom, O.; Yan, M., Biosens Bioelectron 2010, 26, 344-350.
222. Norberg, O.; Deng, L.; Aastrup, T.; Yan, M.; Ramstrom, O., Anal Chem 2011, 83, 1000-1007.
223. Wang, D.; Carroll, G. T.; Turro, N. J.; Koberstein, J. T.; Kovac, P.; Saksena, R.; Adamo, R.; Herzenberg, L. A.; Herzenberg, L. A.; Steinman, L., Proteomics 2007, 7, 180-184.
224. Shilova, N.; Navakouski, M.; Khasbiullina, N.; Blixt, O.; Bovin, N., Glycoconj J 2012, 29, 87-91.
225. Kletter, D.; Singh, S.; Bern, M.; Haab, B. B., Mol Cell Proteomics 2013, 12, 1026-1035.
226. Norberg, O.; Deng, L.; Yan, M.; Ramstrom, O., Bioconjug Chem 2009, 20, 2364-2370.
227. Deng, L.; Wang, X.; Uppalapati, S.; Norberg, O.; Dong, H.; Joliton, A.; Yan, M.; Ramstrom, O., Pure Appl Chem 2013; ASAP article, published online: http://dx.doi.org/10.1351/PAC-CON-12-08-13.
228. Madwar, C.; Kwan, W. C.; Deng, L.; Ramstrom, O.; Schmidt, R.; Zou, S.; Cuccia, L. A., Langmuir 2010, 26, 16677-16680.
229. Wang, X.; Matei, E.; Deng, L.; Koharudin, L.; Gronenborn, A. M.; Ramstrom, O.; Yan, M., Biosens Bioelectron 2013, 47, 258-264.
230. Gao, J.; Liu, D.; Wang, Z., Anal Chem 2008, 80, 8822-8827.
231. Pochechueva, T.; Jacob, F.; Goldstein, D. R.; Huflejt, M. E.; Chinarev, A.; Caduff, R.; Fink, D.; Hacker, N.; Bovin, N. V.; Heinzelmann-Schwarz, V., Glycoconj J 2011, 28, 507-517.
232. Walz, A.; Odenbreit, S.; Mahdavi, J.; Boren, T.; Ruhl, S., Glycobiology 2005, 15, 700-708.