Structural insights of SIR2rp3 proteins as promising biotargets to fight against Chagas disease and leishmaniasis

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 9, 2013, Pages 2223-2230

  Sacconnay, Lionel ^a   Smirlis, Despina ^b   Queiroz, Emerson Ferreira ^a   Wolfender, Jean L ^a   Soares, Milena Botelho Perreira ^c,d   Carrupt, Pierre Alain ^a   Nurisso, Alessandra ^a  

^a UNIVERSITY OF GENEVA   (Switzerland)

^b HELLENIC PASTEUR INSTITUTE   (Greece)

^c INSTITUTO OSWALDO CRUZ   (Brazil)

^d HOSPITAL SÃO RAFAEL   (Brazil)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTOZOA; TRYPANOSOMA; TRYPANOSOMA CRUZI;

ENZYME INHIBITOR; MITOCHONDRIAL PROTEIN; SIRT5 PROTEIN, HUMAN; SIRTUIN; SIRTUIN 2;

AMINO ACID SEQUENCE; ANTAGONISTS AND INHIBITORS; CHAGAS DISEASE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HUMAN; LEISHMANIASIS; METABOLISM; MOLECULAR DOCKING; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR GENETICS; PROTEIN CONFORMATION; SEQUENCE ALIGNMENT; TRYPANOSOMA CRUZI; ARTICLE; DRUG ANTAGONISM;

AMINO ACID SEQUENCE; CHAGAS DISEASE; ENZYME INHIBITORS; HUMANS; LEISHMANIASIS; MITOCHONDRIAL PROTEINS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR DOCKING SIMULATION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEIN CONFORMATION; SEQUENCE ALIGNMENT; SIRTUIN 2; SIRTUINS; TRYPANOSOMA CRUZI;

EID: 84881106860     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3mb70180h     Document Type: Article

References (54)

1. P. J. Hotez M. E. Bottazzi C. Franco-Paredes S. K. Ault M. R. Periago PLoS Neglected Trop. Dis. 2008 2 e300
2. World Health Organization Report, 2000, 1-109
3. World Health Organization Report, 2010, 1-186
4. S. Kappagoda U. Singh B. G. Blackburn Mayo Clin. Proc. 2011 86 561 583
5. W. Apt Drug Des., Dev. Ther. 2010 4 243 253
6. K. Seifert Open Med. Chem. J. 2011 5 31 39
7. S. R. Wilkinson M. C. Taylor D. Horn J. M. Kelly I. Cheeseman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 5022 5027
8. S. L. Croft K. Seifert V. Yardley Indian J. Med. Res. 2006 123 399 410
9. R. A. Frye Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000 273 793 798
10. A. A. Religa A. P. Waters Mol. Biochem. Parasitol. 2012 185 71 88
11. B. Vergnes D. Sereno N. Madjidian-Sereno J. L. Lemesre A. Ouaissi Gene 2002 296 139 150
12. X. Li N. Kazgan Int. J. Biol. Sci. 2011 7 575 587
13. J. Tavares A. Ouaissi N. Santarem D. Sereno B. Vergnes P. Sampaio A. Cordeiro-Da-Silva Biochem. J. 2008 415 377 386
14. J. Tavares A. Ouaissi P. Kong Thoo Lin I. Loureiro S. Kaur N. Roy A. Cordeiro-Da-Silva ChemMedChem 2010 5 140 147
15. B. Vergnes D. Sereno J. Tavares A. Cordeiro-Da-Silva L. Vanhille N. Madjidian-Sereno D. Depoix A. Monte-Alegre A. Ouaissi Gene 2005 363 85 96
16. S. Kaur A. Shivange N. Roy Mol. Diversity 2010 14 169 178
17. R. U. Kadam V. M. Kiran N. Roy Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006 16 6013 6018
18. R. U. Kadam J. Tavares V. Kiran A. Cordeiro A. Ouaissi N. Roy Chem. Biol. Drug Des. 2008 71 501 506
19. W. Zheng Eur. J. Med. Chem. 2012 132 140
20. J. Du Y. Zhou X. Su J. J. Yu S. Khan H. Jiang J. Kim J. Woo J. H. Kim B. H. Choi B. He W. Chen S. Zhang R. A. Cerione J. Auwerx Q. Hao H. Lin Science 2011 334 806 809
21. C. Peng Z. Lu Z. Xie Z. Cheng Y. Chen M. Tan H. Luo Y. Zhang W. He K. Yang B. M. M. Zwaans D. Tishkoff L. Ho D. Lombard T. C. He J. Dai E. Verdin Y. Ye Y. Zhao Mol. Cell. Proteomics 2011 10 M111.012658
22. J. C. Newman W. He E. Verdin J. Biol. Chem. 2012 287 42436 42443
23. T. Nakagawa D. J. Lomb M. C. Haigis L. Guarente Cell 2009 137 560 570
24. T. Nakagawa L. Guarente Aging 2009 1 578 581
25. W. He J. C. Newman M. Z. Wang L. Ho E. Verdin Trends Endocrinol. Metab. 2012 23 467 476
26. F. Fischer M. Gertz B. Suenkel M. Lakshminarasimhan M. Schutkowski C. Steegborn PLoS One 2012 7 e45098
27. J. A. Garcia-Salcedo P. Gijon D. P. Nolan P. Tebabi E. Pays EMBO J. 2003 22 5851 5862
28. S. Alsford T. Kawahara C. Isamah D. Horn Mol. Microbiol. 2007 63 724 736
29. M. B. P. Soares C. V. Silva T. M. Bastos E. T. Guimaraes C. P. Figueira D. Smirlis W. F. Azevedo Jr Acta Trop. 2012 122 224 229
30. S. B. Needleman C. D. Wunsch J. Mol. Biol. 1970 48 443 453
31. W. Junmei P. Cieplak P. Kollman J. Comput. Chem. 2000 21 1049 1074
32. R. A. Laskowski M. W. MacArthur D. S. Moss J. M. Thornton J. Appl. Crystallogr. 1993 26 283 291
33. M. Clark R. D. Cramer III N. Van Opdenbosch J. Comput. Chem. 1989 10 982 1012
34. J. L. Avalos K. M. Bever C. Wolberger Mol. Cell 2005 17 855 868
35. M. Lawson U. Uciechowska J. Schemies T. Rumpf M. Jung W. Sippl Biochim. Biophys. Acta 2010 1799 726 739
36. B. Maurer T. Rumpf M. Scharfe D. A. Stolfa M. L. Schmitt W. He E. Verdin W. Sippl M. Jung ACS Med. Chem. Lett. 2012 3 1050 1053
37. S. C. Lovell J. M. Word J. S. Richardson D. C. Richardson Proteins: Struct., Funct., Genet. 2000 40 389 408
38. D. A. Case, T. E. Cheatham III, C. L. Simmerling, J. Wang, R. E. Duke, R. Luo, T. A. Darden, W. Zhang, K. M. Merz, B. Roberts, B. Wang, S. Hayik, R. C. Walker, G. Seabra, I. Kolossvary, K. F. Wong, F. Paesani, J. Vanicek, J. Liu, A. Roitberg, S. R. Brozell, T. Steinbrecher, H. Gohlke, Q. Cai, X. Ye, J. Wang, X. Wu, G. Cui, D. R. Roe, D. H. Mathews, M. G. Seetin, C. Sagui, V. Babin, J. J. Hsieh, S. Gusarov, A. Kovalenko, P. A. Kollman and T. Luchko, 2010
39. V. Hornak R. Abel A. Okur B. Strockbine A. Roitberg C. Simmerling Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2006 65 712 725
40. J. M. Wang R. M. Wolf J. W. Caldwell P. A. Kollman D. A. Case J. Comput. Chem. 2004 25 1157 1174
41. D. A. Case T. E. Cheatham T. Darden H. Gohlke R. Luo K. M. Merz A. Onufriev C. Simmerling B. Wang R. J. Woods J. Comput. Chem. 2005 26 1668 1688
42. J. Aqvist J. Phys. Chem. 1990 94 8021 8024
43. T. Darden D. York L. Pedersen J. Chem. Phys. 1993 98 10089 10092
44. J. P. Ryckaert G. Ciccotti H. J. C. Berendsen J. Comp. Physiol. 1977 23 327 341
45. D. A. Case, T. A. Darden, T. E. Cheatham, C. L. Simmerling, J. Wang, R. E. Duke, R. Luo, R. C. Walker, W. Zhang, K. M. Merz, B. Roberts, S. Hayik, A. Roitberg, G. Seabra, J. Swails, A. W. Goetz, I. Kolossvai, K. F. Wong, F. Paesani, J. Vanicek, R. M. Wolf, J. Liu, X. Wu, S. R. Brozell, T. Steinbrecher, H. Gohlke, Q. Cai, X. Ye, J. Wang, M. J. Hsieh, G. Cui, D. R. Roe, D. H. Mathews, M. G. Seetin, R. Salomon-Ferrer, C. Sagui, V. Babin, T. Luchko, S. Gusarov, A. Kovalenko and P. A. Kollman, 2012
46. B. Brooks M. Karplus Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1983 80 6571 6575
47. A. Onufriev D. Bashford D. A. Case Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2004 55 383 394
48. M. L. Connolly Science 1983 221 709 713
49. M. Keil T. E. Exner J. Brickmann J. Comput. Chem. 2004 25 779 789
50. M. S. Finnin J. R. Donigian N. P. Pavletich Nat. Struct. Biol. 2001 8 621 625
51. K. T. Andrews A. Haque M. K. Jones Immunol. Cell Biol. 2012 90 66 77
52. S. Sakkiah M. Chandrasekaran Y. Lee S. Kim K. W. Lee J. Biomol. Struct. Dyn. 2012 30 235 254
53. D. Rotili D. Tarantino A. Nebbioso C. Paolini C. Huidobro E. Lara P. Mellini A. Lenoci R. Pezzi G. Botta M. Lahtela-Kakkonen A. Poso C. Steinkühler P. Gallinari R. De Maria M. Fraga M. Esteller L. Altucci A. Mai J. Med. Chem. 2012 55 10937 10947
54. T. Castrignano P. D'Onorio De Meo D. Cozzetto I. G. Talamo A. Tramontano Nucleic Acids Res. 2006 34 D306 D309