SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 8, Issue 8, 2012, Pages 2938-2948

An extension and further validation of an all-atomistic force field for biological membranes

(2) Jämbeck, Joakim P M a Lyubartsev, Alexander P a

a STOCKHOLM UNIVERSITY (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84865101970 PISSN: 15499618 EISSN: 15499626 Source Type: Journal
DOI: 10.1021/ct300342n Document Type: Article

Times cited : (387)

References (138)

1
- 41149127245
- Wu, N. A. N.; Palczewski, K.; Mu, D. J. Pharmacol. Rev. 2008, 60, 43-78
- (2008) Pharmacol. Rev. , vol.60 , pp. 43-78
- Wu, N.A.N.¹ Palczewski, K.² Mu, D.J.³

2
- 0014322977
- Tattrie, N. H.; Bennet, J. R.; Cyr, R. Can. J. Biochem. 1968, 46, 819-824
- (1968) Can. J. Biochem. , vol.46 , pp. 819-824
- Tattrie, N.H.¹ Bennet, J.R.² Cyr, R.³

3
- 0029073048
- van der Rest, M. E.; Kamminga, A. H.; Nakano, A.; Anraku, Y.; Poolman, B.; Konings, W. N. Microbiol. Rev. 1995, 59, 304-322
- (1995) Microbiol. Rev. , vol.59 , pp. 304-322
- Van Der Rest, M.E.¹ Kamminga, A.H.² Nakano, A.³ Anraku, Y.⁴ Poolman, B.⁵ Konings, W.N.⁶

4
- 0034634708
- Nagle, J. F.; Tristram-Nagle, S. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1469, 159-195
- (2000) Biochim. Biophys. Acta , vol.1469 , pp. 159-195
- Nagle, J.F.¹ Tristram-Nagle, S.²

5
- 26444532286
- Vigh, L.; Escribá, P.; Sonnleitner, A.; Sonnleitner, M.; Piotto, S.; Maresca, B.; Horváth, I.; Harwood, J. L. Prog. Lipid Res. 2005, 44, 303-344
- (2005) Prog. Lipid Res. , vol.44 , pp. 303-344
- Vigh, L.¹ Escribá, P.² Sonnleitner, A.³ Sonnleitner, M.⁴ Piotto, S.⁵ Maresca, B.⁶ Horváth, I.⁷ Harwood, J.L.⁸

6
- 0033944486
- Nagle, J. F.; Tristam-Nagle, S. Curr. Opin. Struct. Biol. 2000, 10, 474-480
- (2000) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.10 , pp. 474-480
- Nagle, J.F.¹ Tristam-Nagle, S.²

7
- 0000112789
- Tieleman, D. P.; Berendsen, H. J. C. J. Chem. Phys. 1996, 105, 4871-4880
- (1996) J. Chem. Phys. , vol.105 , pp. 4871-4880
- Tieleman, D.P.¹ Berendsen, H.J.C.²

8
- 0031438285
- Tieleman, D. P.; Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. C. Biochim. Biophys. Acta 1997, 1331, 235-270
- (1997) Biochim. Biophys. Acta , vol.1331 , pp. 235-270
- Tieleman, D.P.¹ Marrink, S.J.² Berendsen, H.J.C.³

9
- 22144486884
- Kučerka, N.; Liu, Y.; Chu, N.; Petrache, H. I.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. F. Biophys. J. 2005, 88, 2626-2637
- (2005) Biophys. J. , vol.88 , pp. 2626-2637
- Kučerka, N.¹ Liu, Y.² Chu, N.³ Petrache, H.I.⁴ Tristram-Nagle, S.⁵ Nagle, J.F.⁶

10
- 33751158845
- Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. C. J. Phys. Chem. 1994, 98, 4155-4168
- (1994) J. Phys. Chem. , vol.98 , pp. 4155-4168
- Marrink, S.J.¹ Berendsen, H.J.C.²

11
- 0030999097
- Berger, O.; Edholm, O.; Jähnig, F. Biophys. J. 1997, 72, 2002-2013
- (1997) Biophys. J. , vol.72 , pp. 2002-2013
- Berger, O.¹ Edholm, O.² Jähnig, F.³

12
- 0033932839
- Lindahl, E.; Edholm, O. Biophys. J. 2000, 79, 426-433
- (2000) Biophys. J. , vol.79 , pp. 426-433
- Lindahl, E.¹ Edholm, O.²

13
- 4143051192
- Falck, E.; Patra, M.; Kartunnen, M.; Hyvönen, M.; Vattulainen, I. Biophys. J. 2004, 87, 1076-1091
- (2004) Biophys. J. , vol.87 , pp. 1076-1091
- Falck, E.¹ Patra, M.² Kartunnen, M.³ Hyvönen, M.⁴ Vattulainen, I.⁵

14
- 21644455058
- de Vries, A. H.; Chandrasekhar, I.; van Gunsteren, W. F.; Hünenberger, P. H. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 11643-11652
- (2005) J. Phys. Chem. B , vol.109 , pp. 11643-11652
- De Vries, A.H.¹ Chandrasekhar, I.² Van Gunsteren, W.F.³ Hünenberger, P.H.⁴

15
- 52649147983
- Högberg, C.-J.; Nikitiin, A. M.; Lyubartsev, A. P. J. Comput. Chem. 2008, 29, 2359-2369
- (2008) J. Comput. Chem. , vol.29 , pp. 2359-2369
- Högberg, C.-J.¹ Nikitiin, A.M.² Lyubartsev, A.P.³

16
- 67949120080
- Ulmschneider, J. P.; Ulmschneider, M. B. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 1803-1813
- (2009) J. Chem. Theory Comput. , vol.5 , pp. 1803-1813
- Ulmschneider, J.P.¹ Ulmschneider, M.B.²

17
- 78650384605
- Lyubartsev, A. P.; Rabinovich, A. L. Soft Matter 2011, 7, 25-39
- (2011) Soft Matter , vol.7 , pp. 25-39
- Lyubartsev, A.P.¹ Rabinovich, A.L.²

18
- 84865076867
- Niemelä, P. S.; Hyvönen, M. T.; Kartunnen, M.; Vattulainen, I. PLoS ONE 2007, 3, e34
- (2007) PLoS ONE , vol.3 , pp. 34
- Niemelä, P.S.¹ Hyvönen, M.T.² Kartunnen, M.³ Vattulainen, I.⁴

19
- 58149202333
- Berkowitz, M. L. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 86-96
- (2009) Biochim. Biophys. Acta , vol.1788 , pp. 86-96
- Berkowitz, M.L.¹

20
- 77953368751
- Hall, A.; Róg, T.; Kartunnen, M.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 7797-7807
- (2010) J. Phys. Chem. B , vol.114 , pp. 7797-7807
- Hall, A.¹ Róg, T.² Kartunnen, M.³ Vattulainen, I.⁴

21
- 79952585687
- de Joannis, J.; Coppock, P. S.; Yin, F.; Mori, M.; Zamorano, A.; Kindt, J. T. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 3625-3634
- (2011) J. Am. Chem. Soc. , vol.133 , pp. 3625-3634
- De Joannis, J.¹ Coppock, P.S.² Yin, F.³ Mori, M.⁴ Zamorano, A.⁵ Kindt, J.T.⁶

22
- 79955451530
- Perlmutter, J. D.; Sachs, J. N. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 6563-6577
- (2011) J. Am. Chem. Soc. , vol.133 , pp. 6563-6577
- Perlmutter, J.D.¹ Sachs, J.N.²

23
- 23044476985
- Gumbart, J.; Wang, Y.; Aksimebtiev, A.; Tajkhorshid, E.; Schulten, K. Curr. Opin. Struct. Biol. 2005, 15, 423-431
- (2005) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.15 , pp. 423-431
- Gumbart, J.¹ Wang, Y.² Aksimebtiev, A.³ Tajkhorshid, E.⁴ Schulten, K.⁵

24
- 49549083949
- Lindahl, E.; Sansom, M. S. P. Curr. Opin. Struct. Biol. 2008, 18, 425-431
- (2008) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.18 , pp. 425-431
- Lindahl, E.¹ Sansom, M.S.P.²

25
- 61449172924
- Bjelkmar, P.; Niemelä, P. S.; Vattulainen, I.; Lindahl, E. PLoS ONE 2009, 5, e1000289
- (2009) PLoS ONE , vol.5 , pp. 1000289
- Bjelkmar, P.¹ Niemelä, P.S.² Vattulainen, I.³ Lindahl, E.⁴

26
- 80053306385
- Ulmschneider, J. P.; Smith, J. C.; White, S. H.; Ulmschneider, M. B. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 15487-15495
- (2011) J. Am. Chem. Soc. , vol.133 , pp. 15487-15495
- Ulmschneider, J.P.¹ Smith, J.C.² White, S.H.³ Ulmschneider, M.B.⁴

27
- 84857333669
- Gumbart, J.; Roux, B. Biophys. J. 2012, 102, 795-801
- (2012) Biophys. J. , vol.102 , pp. 795-801
- Gumbart, J.¹ Roux, B.²

28
- 21244446197
- Hyvönen, M. T.; Kovanen, P. T. Eur. Biophys. J. 2005, 34, 294-305
- (2005) Eur. Biophys. J. , vol.34 , pp. 294-305
- Hyvönen, M.T.¹ Kovanen, P.T.²

29
- 34250372191
- Sonne, J.; Jensen, M. O.; Hansen, F. Y.; Hemmingsen, L.; Peters, G. Biophys. J. 2007, 92, 4157-4167
- (2007) Biophys. J. , vol.92 , pp. 4157-4167
- Sonne, J.¹ Jensen, M.O.² Hansen, F.Y.³ Hemmingsen, L.⁴ Peters, G.⁵

30
- 41549149586
- Siu, S. W. I.; Vácha, R.; Jungwirth, P.; Böckmann, R. A. J. Chem. Phys. 2008, 128, 125103
- (2008) J. Chem. Phys. , vol.128 , pp. 125103
- Siu, S.W.I.¹ Vácha, R.² Jungwirth, P.³ Böckmann, R.A.⁴

31
- 15744368593
- Klauda, J. B.; Brooks, B. R.; MacKerell, J. A. D.; Venable, R. M.; Pastor, R. W. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 5300-5311
- (2005) J. Phys. Chem. B , vol.109 , pp. 5300-5311
- Klauda, J.B.¹ Brooks, B.R.² MacKerell, J.A.D.³ Venable, R.M.⁴ Pastor, R.W.⁵

32
- 77953377650
- Klauda, J. B.; Venable, R. M.; Freites, J. A.; O'Connor, J. W. O.; Tobias, D. J.; Mondragon-Ramirez, C.; Vorobyov, I.; MacKerell, A. D., Jr.; Pastor, R. W. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 7830-7843
- (2010) J. Phys. Chem. B , vol.114 , pp. 7830-7843
- Klauda, J.B.¹ Venable, R.M.² Freites, J.A.³ O'Connor, J.W.O.⁴ Tobias, D.J.⁵ Mondragon-Ramirez, C.⁶ Vorobyov, I.⁷ Mackerell Jr., A.D.⁸ Pastor, R.W.⁹

33
- 2942532422
- Wang, J.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157-1174
- (2004) J. Comput. Chem. , vol.25 , pp. 1157-1174
- Wang, J.¹ Wolf, R.M.² Caldwell, J.W.³ Kollman, P.A.⁴ Case, D.A.⁵

34
- 46049113872
- Tessier, M. B.; DeMarco, M. L.; Yongye, A. B.; Woods, R. J. Mol. Simul. 2008, 34, 349-363
- (2008) Mol. Simul. , vol.34 , pp. 349-363
- Tessier, M.B.¹ Demarco, M.L.² Yongye, A.B.³ Woods, R.J.⁴

35
- 34547372334
- Jójart, B.; Martinek, T. A. J. Comput. Chem. 2007, 28, 2051-2058
- (2007) J. Comput. Chem. , vol.28 , pp. 2051-2058
- Jójart, B.¹ Martinek, T.A.²

36
- 37649004863
- Rosso, L.; Gould, I. R. J. Comput. Chem. 2008, 29, 24-37
- (2008) J. Comput. Chem. , vol.29 , pp. 24-37
- Rosso, L.¹ Gould, I.R.²

37
- 0029737564
- Jähnig, F. Biophys. J. 1996, 71, 1348-1349
- (1996) Biophys. J. , vol.71 , pp. 1348-1349
- Jähnig, F.¹

38
- 0035812110
- Marrink, S. J.; Mark, A. E. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6122-6172
- (2001) J. Phys. Chem. B , vol.105 , pp. 6122-6172
- Marrink, S.J.¹ Mark, A.E.²

39
- 65249111085
- Chiu, S.-W.; Pandit, S. A.; Scott, H. L.; Jakobsson, E. J. Phys. Chem. B. 2009, 113, 2748-2763
- (2009) J. Phys. Chem. B. , vol.113 , pp. 2748-2763
- Chiu, S.-W.¹ Pandit, S.A.² Scott, H.L.³ Jakobsson, E.⁴

40
- 65249151900
- Kukol, A. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 615-626
- (2009) J. Chem. Theory Comput. , vol.5 , pp. 615-626
- Kukol, A.¹

41
- 77950590441
- Poger, W. F.; van Gunsteren, D.; Mark, A. E. J. Comput. Chem. 2010, 31, 1117-1125
- (2010) J. Comput. Chem. , vol.31 , pp. 1117-1125
- Poger, W.F.¹ Van Gunsteren, D.² Mark, A.E.³

42
- 84858321169
- Jämbeck, J. P. M.; Lyubartsev, A. P. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 3164-3179
- (2012) J. Phys. Chem. B , vol.116 , pp. 3164-3179
- Jämbeck, J.P.M.¹ Lyubartsev, A.P.²

43
- 80052268628
- Kučerka, N.; Nieh, M.-P.; Katsaras, J. Biochim. Biophys. Acta 2011, 1808, 2761-2771
- (2011) Biochim. Biophys. Acta , vol.1808 , pp. 2761-2771
- Kučerka, N.¹ Nieh, M.-P.² Katsaras, J.³

44
- 35748967575
- Vermeer, L. S.; de Groot, B. L.; Reat, V.; Milon, A.; Czaplicki, J. Eur. Biophys. J. 2007, 36, 919-931
- (2007) Eur. Biophys. J. , vol.36 , pp. 919-931
- Vermeer, L.S.¹ De Groot, B.L.² Reat, V.³ Milon, A.⁴ Czaplicki, J.⁵

45
- 4143138518
- Anézo, C.; de Vries, A. H.; Höltje, H. D.; Tieleman, D. P.; Marrink, S. J. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9424-9433
- (2003) J. Phys. Chem. B , vol.107 , pp. 9424-9433
- Anézo, C.¹ De Vries, A.H.² Höltje, H.D.³ Tieleman, D.P.⁴ Marrink, S.J.⁵

46
- 77950101403
- Poger, D.; Mark, A. E. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 325-336
- (2010) J. Chem. Theory Comput. , vol.6 , pp. 325-336
- Poger, D.¹ Mark, A.E.²

47
- 35048848016
- Martinez-Seara, H.; Róg, T.; Pasenkiewicz-Gierula, M.; Vattulainen, I.; Karttunen, M.; Reigada, R. J. Chem. Phys. B 2007, 111, 11162-11168
- (2007) J. Chem. Phys. B , vol.111 , pp. 11162-11168
- Martinez-Seara, H.¹ Róg, T.² Pasenkiewicz-Gierula, M.³ Vattulainen, I.⁴ Karttunen, M.⁵ Reigada, R.⁶

48
- 0024282304
- Lewis, R. N. A.; Sykes, B. D.; McElhaney, R. N. Biochemistry 1988, 27, 880-887
- (1988) Biochemistry , vol.27 , pp. 880-887
- Lewis, R.N.A.¹ Sykes, B.D.² McElhaney, R.N.³

49
- 0000055690
- Huang, C. H.; Lapides, J. R.; Levin, I. W. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 5926-5930
- (1982) J. Am. Chem. Soc. , vol.104 , pp. 5926-5930
- Huang, C.H.¹ Lapides, J.R.² Levin, I.W.³

50
- 25144486270
- Warschawski, D. E.; Devaux, P. F. Eur. Biophys. J. 2005, 34, 987-996
- (2005) Eur. Biophys. J. , vol.34 , pp. 987-996
- Warschawski, D.E.¹ Devaux, P.F.²

51
- 0017808625
- Seelig, J.; Waespe-Sarcevic, N. Biochemistry 1978, 17, 3310-3315
- (1978) Biochemistry , vol.17 , pp. 3310-3315
- Seelig, J.¹ Waespe-Sarcevic, N.²

52
- 0022423878
- Perly, B.; Smith, I. C. P.; Jarrell, H. C. Biochemistry 1985, 24, 1055-1063
- (1985) Biochemistry , vol.24 , pp. 1055-1063
- Perly, B.¹ Smith, I.C.P.² Jarrell, H.C.³

53
- 0037183498
- Raza Shaikh, S.; Brzustowicz, M. R.; Gustafson, N.; Stillwell, W.; Wassall, S. R. Biochemistry 2002, 41, 10593-10602
- (2002) Biochemistry , vol.41 , pp. 10593-10602
- Raza Shaikh, S.¹ Brzustowicz, M.R.² Gustafson, N.³ Stillwell, W.⁴ Wassall, S.R.⁵

54
- 37749032412
- Pan, J.; Tristam-Nagle, S.; Kučerka, N.; Nagle, J. F. Biophys. J. 2008, 94, 117-124
- (2008) Biophys. J. , vol.94 , pp. 117-124
- Pan, J.¹ Tristam-Nagle, S.² Kučerka, N.³ Nagle, J.F.⁴

55
- 51649129838
- Kučerka, N.; Nagle, J. F.; Sachs, J. N.; Feller, S. E.; Pencer, J.; Jackson, A.; Katsaras, J. Biophys. J. 2008, 95, 2356-2367
- (2008) Biophys. J. , vol.95 , pp. 2356-2367
- Kučerka, N.¹ Nagle, J.F.² Sachs, J.N.³ Feller, S.E.⁴ Pencer, J.⁵ Jackson, A.⁶ Katsaras, J.⁷

56
- 84858311167
- Cordomí, A.; Caltabiano, G.; Pardo, L. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 948-958
- (2012) J. Chem. Theory Comput. , vol.8 , pp. 948-958
- Cordomí, A.¹ Caltabiano, G.² Pardo, L.³

57
- 33748518255
- Hornak, V.; Abel, R.; Okur, A.; Strockbine, B.; Roitberg, A.; Simmerling, C. Proteins 2006, 65, 712-725
- (2006) Proteins , vol.65 , pp. 712-725
- Hornak, V.¹ Abel, R.² Okur, A.³ Strockbine, B.⁴ Roitberg, A.⁵ Simmerling, C.⁶

58
- 76149102555
- Prakash, P.; Sankararamakrishnan, R. J. Comput. Chem. 2010, 31, 266-277
- (2010) J. Comput. Chem. , vol.31 , pp. 266-277
- Prakash, P.¹ Sankararamakrishnan, R.²

59
- 0025779595
- Akutsu, H.; Nagamori, T. Biochemistry 1991, 30, 4510-4516
- (1991) Biochemistry , vol.30 , pp. 4510-4516
- Akutsu, H.¹ Nagamori, T.²

60
- 7044224837
- Ash, W. L.; Zlomislic, M. R.; Oloo, E. O.; Tieleman, D. P. Biochim. Biophys. Acta 2004, 1666, 158-189
- (2004) Biochim. Biophys. Acta , vol.1666 , pp. 158-189
- Ash, W.L.¹ Zlomislic, M.R.² Oloo, E.O.³ Tieleman, D.P.⁴

61
- 0000189651
- Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652
- (1993) J. Chem. Phys. , vol.98 , pp. 5648-5652
- Becke, A.D.¹

62
- 0345491105
- Lee, C.; Wang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789
- (1988) Phys. Rev. B , vol.37 , pp. 785-789
- Lee, C.¹ Wang, W.² Parr, R.G.³

63
- 0000216001
- Vosko, S. H.; Wilk, L.; Nusair, M. Can. J. Phys. 1980, 58, 1200-1211
- (1980) Can. J. Phys. , vol.58 , pp. 1200-1211
- Vosko, S.H.¹ Wilk, L.² Nusair, M.³

64
- 33751157732
- Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623-11627
- (1994) J. Phys. Chem. , vol.98 , pp. 11623-11627
- Stephens, P.J.¹ Devlin, F.J.² Chabalowski, C.F.³ Frisch, M.J.⁴

65
- 4143095330
- Kendall, R. A.; Dunning, T. H.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 1992, 96, 6796-6806
- (1992) J. Chem. Phys. , vol.96 , pp. 6796-6806
- Kendall, R.A.¹ Dunning, T.H.² Harrison, R.J.³

66
- 84962428823
- Tomasi, J.; Mennucci, B.; Cancés THEOCHEM 1999, 464, 211-226
- (1999) THEOCHEM , vol.464 , pp. 211-226
- Tomasi, J.¹ Mennucci, B.² Cancés³

67
- 84962428782
- Pomelli, C. S.; Tomasi, J.; Barone, V. Theor. Chem. Acc. 2001, 105, 446-451
- (2001) Theor. Chem. Acc. , vol.105 , pp. 446-451
- Pomelli, C.S.¹ Tomasi, J.² Barone, V.³

68
- 3042524904
- Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell, W.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269-10280
- (1993) J. Phys. Chem. , vol.97 , pp. 10269-10280
- Bayly, C.I.¹ Cieplak, P.² Cornell, W.³ Kollman, P.A.⁴

69
- 6944251055
- M, C.; Plesset, M. S. Phys. Rev. 1934, 46, 0618-0622
- (1934) Phys. Rev. , vol.46 , pp. 0618-0622
- C, M.¹ Plesset, M.S.²

70
- 70450206724
- Revision A.02; Gaussian Inc. Wallingford, CT
- Frisch, M. J. Gaussian 09, Revision A.02; Gaussian Inc.: Wallingford, CT, 2009.
- (2009) Gaussian 09
- Frisch, M.J.¹

71
- 77954566051
- Dupradeau, F. Y.; Pigache, A.; Zaffran, T.; Savineau, C.; Lelong, R.; Grivel, N.; Lelong, D.; Rosanski, W.; Cieplak, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 7821-7839
- (2010) Phys. Chem. Chem. Phys. , vol.12 , pp. 7821-7839
- Dupradeau, F.Y.¹ Pigache, A.² Zaffran, T.³ Savineau, C.⁴ Lelong, R.⁵ Grivel, N.⁶ Lelong, D.⁷ Rosanski, W.⁸ Cieplak, P.⁹

72
- 0000388705
- Hess, H.; Bekker, B.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463-1472
- (1997) J. Comput. Chem. , vol.18 , pp. 1463-1472
- Hess, H.¹ Bekker, B.² Berendsen, H.J.C.³ Fraaije, J.G.E.M.⁴

73
- 84986440341
- Miyamoto, S.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 952-962
- (1992) J. Comput. Chem. , vol.13 , pp. 952-962
- Miyamoto, S.¹ Kollman, P.A.²

74
- 0019707626
- Parrinello, M.; Rahman, A. J. Appl. Phys. 1981, 52, 7182-7190
- (1981) J. Appl. Phys. , vol.52 , pp. 7182-7190
- Parrinello, M.¹ Rahman, A.²

75
- 34547809547
- Nosé, S. J. Chem. Phys. 1984, 81, 511-519
- (1984) J. Chem. Phys. , vol.81 , pp. 511-519
- Nosé, S.¹

76
- 0001538909
- Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695-1697
- (1985) Phys. Rev. A , vol.31 , pp. 1695-1697
- Hoover, W.G.¹

77
- 33846823909
- Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092
- (1993) J. Chem. Phys. , vol.98 , pp. 10089-10092
- Darden, T.¹ York, D.² Pedersen, L.³

78
- 33645961739
- Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, T.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593
- (1995) J. Chem. Phys. , vol.103 , pp. 8577-8593
- Essmann, U.¹ Perera, L.² Berkowitz, T.³ Pedersen, L.G.⁴

79
- 0004016501
- Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
- (1983) J. Chem. Phys. , vol.79 , pp. 926-935
- Jorgensen, W.L.¹ Chandrasekhar, J.² Madura, J.D.³ Impey, R.W.⁴ Klein, M.L.⁵

80
- 77953513118
- Lindorff-Larsen, K.; Piana, S.; Palmo, K.; Maragakis, P.; Klepis, J. L.; Dror, R. O.; Shaw, D. E. Proteins 2010, 78, 1950-1958
- (2010) Proteins , vol.78 , pp. 1950-1958
- Lindorff-Larsen, K.¹ Piana, S.² Palmo, K.³ Maragakis, P.⁴ Klepis, J.L.⁵ Dror, R.O.⁶ Shaw, D.E.⁷

81
- 0242663237
- Duan, Y.; Wu, C.; Chowdhury, S.; Lee, M. C.; Xiong, G.; Zhang, W.; Yang, R.; Cieplak, P.; Luo, R.; Lee, T.; Caldwell, J.; Wang, J.; Kollman, P. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1999-2012
- (2003) J. Comput. Chem. , vol.24 , pp. 1999-2012
- Duan, Y.¹ Wu, C.² Chowdhury, S.³ Lee, M.C.⁴ Xiong, G.⁵ Zhang, W.⁶ Yang, R.⁷ Cieplak, P.⁸ Luo, R.⁹ Lee, T.¹⁰ Caldwell, J.¹¹ Wang, J.¹² Kollman, P.¹³

82
- 0029878720
- Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33-38
- (1996) J. Mol. Graphics , vol.14 , pp. 33-38
- Humphrey, W.¹ Dalke, A.² Schulten, K.³

83
- 46249092554
- Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spool, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435-447
- (2008) J. Chem. Theory Comput. , vol.4 , pp. 435-447
- Hess, B.¹ Kutzner, C.² Van Der Spool, D.³ Lindahl, E.⁴

84
- 0034206682
- Lyubartsev, A. P.; Laaksonen, A. Comput. Phys. Commun. 2000, 565-589
- (2000) Comput. Phys. Commun. , pp. 565-589
- Lyubartsev, A.P.¹ Laaksonen, A.²

85
- 77952125598
- Kučerka, N.; Katsaras, J.; Nagle, J. F. J. Membr. Biol. 2010, 235, 43-50
- (2010) J. Membr. Biol. , vol.235 , pp. 43-50
- Kučerka, N.¹ Katsaras, J.² Nagle, J.F.³

86
- 0003998388
- 90 th ed. CRC Press: Boca Raton, FL, Chapter 3
- Lide, D. R. CRC Handbook of Chemistry and Physics, 90 th ed.; CRC Press: Boca Raton, FL, 2010; Chapter 3, p 136.
- (2010) CRC Handbook of Chemistry and Physics , pp. 136
- Lide, D.R.¹

87
- 84865072794
- Chickos, J. S.; Acree, W. E., Jr. J. Phys. Chem. Ref. Data 2003, 32, 1880-2002
- (2003) J. Phys. Chem. Ref. Data , vol.32 , pp. 1880-2002
- Chickos, J.S.¹ Acree Jr., W.E.²

88
- 16644389728
- Wohlert, J.; Edholm, O. Biophys. J. 2004, 87, 2433-2445
- (2004) Biophys. J. , vol.87 , pp. 2433-2445
- Wohlert, J.¹ Edholm, O.²

89
- 0031824356
- Tristam-Nagle, S.; Petrache, H. I.; Nagle, J. F. Biophys. J. 1998, 75, 917-925
- (1998) Biophys. J. , vol.75 , pp. 917-925
- Tristam-Nagle, S.¹ Petrache, H.I.² Nagle, J.F.³

90
- 0033932837
- Rawicz, W.; Olbrich, K. C.; McIntosh, T.; Needham, D.; Evans, E. Biophys. J. 2000, 79, 328-339
- (2000) Biophys. J. , vol.79 , pp. 328-339
- Rawicz, W.¹ Olbrich, K.C.² McIntosh, T.³ Needham, D.⁴ Evans, E.⁵

91
- 0034257990
- Pabst, G.; Rappolt, M.; Amenitsch, H.; Laggner, P. Phys. Rev. E 2000, 62, 4000-4009
- (2000) Phys. Rev. e , vol.62 , pp. 4000-4009
- Pabst, G.¹ Rappolt, M.² Amenitsch, H.³ Laggner, P.⁴

92
- 0035857205
- Binder, H.; Gawrisch, K. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 12378-12390
- (2001) J. Phys. Chem. B , vol.105 , pp. 12378-12390
- Binder, H.¹ Gawrisch, K.²

93
- 33646446451
- Kučerka, N.; Tristam-Nagle, S.; Nagle, J. F. J. Membr. Biol. 2005, 208, 193-202
- (2005) J. Membr. Biol. , vol.208 , pp. 193-202
- Kučerka, N.¹ Tristam-Nagle, S.² Nagle, J.F.³

94
- 45849089169
- Rawicz, W.; Smith, B. A.; McIntosh, T. J.; Simon, S. A.; Evans, E. Biophys. J. 2008, 94, 4725-4736
- (2008) Biophys. J. , vol.94 , pp. 4725-4736
- Rawicz, W.¹ Smith, B.A.² McIntosh, T.J.³ Simon, S.A.⁴ Evans, E.⁵

95
- 0024378918
- Rand, R. P.; Parsegian, V. A. Biochim. Biophys. Acta 1989, 988, 351-376
- (1989) Biochim. Biophys. Acta , vol.988 , pp. 351-376
- Rand, R.P.¹ Parsegian, V.A.²

96
- 0024280716
- Nagle, J. F.; Wiener, M. C. Biochim. Biophys. Acta 1988, 942, 1-10
- (1988) Biochim. Biophys. Acta , vol.942 , pp. 1-10
- Nagle, J.F.¹ Wiener, M.C.²

97
- 0033637460
- Petrache, H. I.; Dodd, S. W.; Brown, M. F. Biophys. J. 2000, 79, 3172-3192
- (2000) Biophys. J. , vol.79 , pp. 3172-3192
- Petrache, H.I.¹ Dodd, S.W.² Brown, M.F.³

98
- 0026088959
- Thurmond, R. L.; Dodd, S. W.; Brown, M. F. Biophys. J. 1991, 59, 108-113
- (1991) Biophys. J. , vol.59 , pp. 108-113
- Thurmond, R.L.¹ Dodd, S.W.² Brown, M.F.³

99
- 0026535431
- Gawrisch, K.; Parsegian, V. A.; Hajduk, D. A.; Tate, M. W.; Gruner, S. M.; Fuller, N. L.; Rand, R. P. Biochemistry 1992, 31, 2856-2864
- (1992) Biochemistry , vol.31 , pp. 2856-2864
- Gawrisch, K.¹ Parsegian, V.A.² Hajduk, D.A.³ Tate, M.W.⁴ Gruner, S.M.⁵ Fuller, N.L.⁶ Rand, R.P.⁷

100
- 72149118772
- Waheed, Q.; Edholm, O. Biophys. J. 2009, 97, 2754-2760
- (2009) Biophys. J. , vol.97 , pp. 2754-2760
- Waheed, Q.¹ Edholm, O.²

101
- 70350035650
- Kučerka, N.; Gallová, J.; Uhríková, D.; Balgavý, P.; Baluca, M.; Marrink, S. J.; Katsaras, J. Biophys. J. 2009, 97, 1926-1932
- (2009) Biophys. J. , vol.97 , pp. 1926-1932
- Kučerka, N.¹ Gallová, J.² Uhríková, D.³ Balgavý, P.⁴ Baluca, M.⁵ Marrink, S.J.⁶ Katsaras, J.⁷

102
- 0032988823
- Harroun, T. A.; Heller, W. T.; Wiess, T. M.; Yang, I.; Huang, H. W. Biophys. J. 1999, 76, 937-945
- (1999) Biophys. J. , vol.76 , pp. 937-945
- Harroun, T.A.¹ Heller, W.T.² Wiess, T.M.³ Yang, I.⁴ Huang, H.W.⁵

103
- 0031740415
- Killian, J. A. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1376, 401-415
- (1998) Biochim. Biophys. Acta , vol.1376 , pp. 401-415
- Killian, J.A.¹

104
- 0021474573
- Mouritsen, O. G.; Bloom, M. Biophys. J. 1984, 46, 141-153
- (1984) Biophys. J. , vol.46 , pp. 141-153
- Mouritsen, O.G.¹ Bloom, M.²

105
- 84865065353
- Dumas, F.; Lebrun, M. C.; Tocanne, J. F. FEBS Lett. 2010, 99, 271-277
- (2010) FEBS Lett. , vol.99 , pp. 271-277
- Dumas, F.¹ Lebrun, M.C.² Tocanne, J.F.³

106
- 37649031391
- Liu, Y.; Nagle, J. F. Phys. Rev. E 2004, 69, 040901
- (2004) Phys. Rev. e , vol.69 , pp. 040901
- Liu, Y.¹ Nagle, J.F.²

107
- 70349153375
- Pan, J.; Tristam-Nagle, S.; Nagle, J. F. Phys. Rev. E 2008, 80, 021931
- (2008) Phys. Rev. e , vol.80 , pp. 021931
- Pan, J.¹ Tristam-Nagle, S.² Nagle, J.F.³

108
- 0023057572
- McIntosh, T. J.; Simon, S. A. Biochemistry 1986, 25, 4948-4952
- (1986) Biochemistry , vol.25 , pp. 4948-4952
- McIntosh, T.J.¹ Simon, S.A.²

109
- 60649103257
- Taylor, J.; Whiteford, N. E.; Bradley, G.; Watson, G. W. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 638-649
- (2009) Biochim. Biophys. Acta , vol.1788 , pp. 638-649
- Taylor, J.¹ Whiteford, N.E.² Bradley, G.³ Watson, G.W.⁴

110
- 48549102871
- Hénin, J.; Shinoda, W.; Klein, M. L. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 7008-7015
- (2008) J. Phys. Chem. B , vol.112 , pp. 7008-7015
- Hénin, J.¹ Shinoda, W.² Klein, M.L.³

111
- 0000048078
- Hitchcook, P. B.; Mason, R.; Thomas, K. M.; Shipley, G. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1974, 71, 3036-3040
- (1974) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.71 , pp. 3036-3040
- Hitchcook, P.B.¹ Mason, R.² Thomas, K.M.³ Shipley, G.G.⁴

112
- 0016804330
- Seelig, A.; Seelig, J. Biochim. Biophys. Acta 1975, 406, 1-5
- (1975) Biochim. Biophys. Acta , vol.406 , pp. 1-5
- Seelig, A.¹ Seelig, J.²

113
- 0001603906
- Wong, P. T. T.; Mantsch, H. H. Chem. Phys. Lipids 1988, 46, 213-224
- (1988) Chem. Phys. Lipids , vol.46 , pp. 213-224
- Wong, P.T.T.¹ Mantsch, H.H.²

114
- 0032211896
- Hübner, W.; Blume, A. Chem. Phys. Lipids 1998, 123, 99-123
- (1998) Chem. Phys. Lipids , vol.123 , pp. 99-123
- Hübner, W.¹ Blume, A.²

115
- 33646446451
- Kučerka, N.; Tristam-Nagle, S.; Nagle, J. F. J. Membr. Biol. 2006, 208, 193-202
- (2006) J. Membr. Biol. , vol.208 , pp. 193-202
- Kučerka, N.¹ Tristam-Nagle, S.² Nagle, J.F.³

116
- 43849089443
- Pan, J.; Mills, T. T.; Tristam-Nagle, S.; Nagle, J. F. Phys. Rev. Lett. 2008, 100, 198103
- (2008) Phys. Rev. Lett. , vol.100 , pp. 198103
- Pan, J.¹ Mills, T.T.² Tristam-Nagle, S.³ Nagle, J.F.⁴

117
- 0035828364
- Lindahl, E.; Edholm, O. J. Chem. Phys. 2001, 115, 4938-4950
- (2001) J. Chem. Phys. , vol.115 , pp. 4938-4950
- Lindahl, E.¹ Edholm, O.²

118
- 33746897341
- Högberg, C. J.; Lyubartsev, A. P. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 14326-14336
- (2006) J. Phys. Chem. B , vol.110 , pp. 14326-14336
- Högberg, C.J.¹ Lyubartsev, A.P.²

119
- 38349011110
- Falck, E.; Róg, T.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 44-45
- (2008) J. Am. Chem. Soc. , vol.130 , pp. 44-45
- Falck, E.¹ Róg, T.² Karttunen, M.³ Vattulainen, I.⁴

120
- 70349687548
- Roark, M.; Feller, S. E. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 13229-13234
- (2009) J. Phys. Chem. B , vol.113 , pp. 13229-13234
- Roark, M.¹ Feller, S.E.²

121
- 70350223830
- Apajalahti, T.; Niemelä, P.; Nedumpully Govindan, P.; Miettinen, M. S.; Salonen, E.; Marrink, S. J.; Vattulainen, I. Faraday Discuss. 2010, 144, 411-430
- (2010) Faraday Discuss. , vol.144 , pp. 411-430
- Apajalahti, T.¹ Niemelä, P.² Nedumpully Govindan, P.³ Miettinen, M.S.⁴ Salonen, E.⁵ Marrink, S.J.⁶ Vattulainen, I.⁷

122
- 77950467364
- Busch, S.; Smuda, C.; Pardo, L. C.; Unruh, T. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 3232-3233
- (2010) J. Am. Chem. Soc. , vol.132 , pp. 3232-3233
- Busch, S.¹ Smuda, C.² Pardo, L.C.³ Unruh, T.⁴

123
- 6444220229
- Yeh, I. C.; Hummer, G. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 15873-15879
- (2004) J. Phys. Chem. B , vol.108 , pp. 15873-15879
- Yeh, I.C.¹ Hummer, G.²

124
- 33751556346
- Wohlert, J.; Edholm, O. J. Chem. Phys. 2006, 125, 204703
- (2006) J. Chem. Phys. , vol.125 , pp. 204703
- Wohlert, J.¹ Edholm, O.²

125
- 59449089082
- Flenner, E.; Das, J.; Rheinstädter; Koztin, I. Phys. Rev. E 2009, 79, 011907
- (2009) Phys. Rev. e , vol.79 , pp. 011907
- Flenner, E.¹ Das, J.² Rheinstädter Koztin, I.³

126
- 0041569752
- Filippov, A.; Öradd, G.; Lindblom, G. Langmuir 2003, 19, 6397-6400
- (2003) Langmuir , vol.19 , pp. 6397-6400
- Filippov, A.¹ Öradd, G.² Lindblom, G.³

127
- 36048945480
- Filippov, A.; Öradd, G.; Lindblom, G. Biophys. J. 2007, 93, 3182-3190
- (2007) Biophys. J. , vol.93 , pp. 3182-3190
- Filippov, A.¹ Öradd, G.² Lindblom, G.³

128
- 67649405180
- Strandberg, E.; Esteban-Martn, S.; Salgado, S.; Ulrich, A. S. Biophys. J. 2009, 96, 3223-3232
- (2009) Biophys. J. , vol.96 , pp. 3223-3232
- Strandberg, E.¹ Esteban-Martn, S.² Salgado, S.³ Ulrich, A.S.⁴

129
- 73149084196
- Esteban-Martn, S.; Giménez, D.; Fuertes, G.; Salgado, J. Biochemistry 2009, 48, 11441-11448
- (2009) Biochemistry , vol.48 , pp. 11441-11448
- Esteban-Martn, S.¹ Giménez, D.² Fuertes, G.³ Salgado, J.⁴

130
- 77954371031
- Kim, T.; Im, W. Biophys. J. 2010, 99, 175-183
- (2010) Biophys. J. , vol.99 , pp. 175-183
- Kim, T.¹ Im, W.²

131
- 77956586675
- Monticelli, L.; Tieleman, D. P.; Fuchs, P. F. J. Biophys. J. 2010, 99, 1455-1464
- (2010) Biophys. J. , vol.99 , pp. 1455-1464
- Monticelli, L.¹ Tieleman, D.P.² Fuchs, P.F.J.³

132
- 84862929076
- Wan, C. K.; Han, W.; Wu, Y. D. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 300-313
- (2012) J. Chem. Theory Comput. , vol.8 , pp. 300-313
- Wan, C.K.¹ Han, W.² Wu, Y.D.³

133
- 84857737028
- Strandberg, E.; Esteban-Martn, S.; Ulrich, A. S.; Salgado, J. Biochim. Biophys. Acta 2012, 1818, 1242-1249
- (2012) Biochim. Biophys. Acta , vol.1818 , pp. 1242-1249
- Strandberg, E.¹ Esteban-Martn, S.² Ulrich, A.S.³ Salgado, J.⁴

134
- 79953010701
- Sapay, N.; Tieleman, D. P. J. Comput. Chem. 2011, 32, 1400-1410
- (2011) J. Comput. Chem. , vol.32 , pp. 1400-1410
- Sapay, N.¹ Tieleman, D.P.²

135
- 33745630723
- Tieleman, D. P.; MacCallum, J. L.; Ash, W. L.; Kandt, C.; Xu, Z.; Monticelli, L. J. Phys.: Condens. Matter 2006, 18, S1221-S1234
- (2006) J. Phys.: Condens. Matter , vol.18
- Tieleman, D.P.¹ MacCallum, J.L.² Ash, W.L.³ Kandt, C.⁴ Xu, Z.⁵ Monticelli, L.⁶

136
- 83455177932
- Neale, C.; Bennett, W. F. D.; Tieleman, D. P.; Pomès, R. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 4175-4188
- (2011) J. Chem. Theory Comput. , vol.7 , pp. 4175-4188
- Neale, C.¹ Bennett, W.F.D.² Tieleman, D.P.³ Pomès, R.⁴

137
- 67649458222
- König, G.; Boresch, S. J. Phys. Chem. B. 2009, 113, 8967-8974
- (2009) J. Phys. Chem. B. , vol.113 , pp. 8967-8974
- König, G.¹ Boresch, S.²

138
- 27944495588
- Lyubartsev, A. L. Eur. Biophys. J. 2005, 35, 53-61
- (2005) Eur. Biophys. J. , vol.35 , pp. 53-61
- Lyubartsev, A.L.¹

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.