SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 23, 2010, Pages 7797-7807

Role of Glycolipids in Lipid Rafts: A View through Atomistic Molecular Dynamics Simulations with Galactosylceramide

(4) Hall, Anette a Róg, Tomasz a Karttunen, Mikko b Vattulainen, Ilpo a,c,d

a TAMPERE UNIVERSITY OF TECHNOLOGY (Finland)

b UNIVERSITY OF WESTERN ONTARIO (Canada)

c AALTO UNIVERSITY (Finland)

d UNIVERSITY OF SOUTHERN DENMARK (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHOLESTEROL; MOLECULAR DYNAMICS;

ATOMISTIC MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; CELLULAR FUNCTION; CONFORMATIONAL ORDER; GLYCOLIPIDS; GLYCOSPHINGOLIPIDS; INTEGRAL PART; INTERDIGITATIONS; LATERAL DIFFUSION; LIPID RAFT; SPHINGOMYELIN; WATER PHASE;

LIPIDS;

EID: 77953368751 PISSN: 15206106 EISSN: 15205207 Source Type: Journal
DOI: 10.1021/jp912175d Document Type: Article

Times cited : (53)

References (59)

1
- 6044236885
- Hakomori, S. Glycoconjugate J. 2004, 21, 125-137
- (2004) Glycoconjugate J. , vol.21 , pp. 125-137
- Hakomori, S.¹

2
- 1642354334
- Pike, L. J. Biochem. J. 2004, 387, 281-292
- (2004) Biochem. J. , vol.387 , pp. 281-292
- Pike, L.J.¹

3
- 0030949124
- Simons, K.; Ikonen, E. Nature 1997, 387, 569-572
- (1997) Nature , vol.387 , pp. 569-572
- Simons, K.¹ Ikonen, E.²

4
- 84906399561
- Degroote, S.; Wolthoorn, J.; van Meer, G. Semin. Cell Dev. Biol. 2004, 15, 357-387
- (2004) Semin. Cell Dev. Biol. , vol.15 , pp. 357-387
- Degroote, S.¹ Wolthoorn, J.² Van Meer, G.³

5
- 58149201160
- Niemela, P.; Hyvonen, M. T.; Vattulainen, I. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 122-135
- (2009) Biochim. Biophys. Acta , vol.1788 , pp. 122-135
- Niemela, P.¹ Hyvonen, M.T.² Vattulainen, I.³

6
- 58149195246
- Westerlund, B.; Slotte, J. P. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1788, 194-201
- (2009) Biochim. Biophys. Acta , vol.1788 , pp. 194-201
- Westerlund, B.¹ Slotte, J.P.²

7
- 33845349236
- Ramstedt, B.; Slotte, J. P. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1758, 1945-1956
- (2006) Biochim. Biophys. Acta , vol.1758 , pp. 1945-1956
- Ramstedt, B.¹ Slotte, J.P.²

8
- 61349094652
- Eggeling, C.; Ringemann, C.; Medda, R.; Schwarzmann, G.; Sandhoff, K.; Polyakova, S.; Belov, V. N.; Hein, B.; von Middendorff, C.; Schonle, A.; Hell, S. W. Nature 2009, 457, 1159-1163
- (2009) Nature , vol.457 , pp. 1159-1163
- Eggeling, C.¹ Ringemann, C.² Medda, R.³ Schwarzmann, G.⁴ Sandhoff, K.⁵ Polyakova, S.⁶ Belov, V.N.⁷ Hein, B.⁸ Von Middendorff, C.⁹ Schonle, A.¹⁰ Hell, S.W.¹¹

9
- 0029610195
- Haas, N. S.; Shipley, G. G. Biochim. Biophys. Acta 1995, 1240, 133-141
- (1995) Biochim. Biophys. Acta , vol.1240 , pp. 133-141
- Haas, N.S.¹ Shipley, G.G.²

10
- 33750529276
- Christie, W. W. The Lipid Library, 2007. http://www.lipidlibrary.co.uk.
- (2007) The Lipid Library
- Christie, W.W.¹

11
- 33845326747
- Maggio, B.; Fanani, M. L.; Rosetti, C. M.; Wilke, N. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1758, 1922-1944
- (2006) Biochim. Biophys. Acta , vol.1758 , pp. 1922-1944
- Maggio, B.¹ Fanani, M.L.² Rosetti, C.M.³ Wilke, N.⁴

12
- 33846354894
- Maunula, S.; Björkvist, Y. J. E.; Slotte, J. P.; Ramstedt, B. Biochim. Biophys. Acta 2007, 1768, 336-345
- (2007) Biochim. Biophys. Acta , vol.1768 , pp. 336-345
- Maunula, S.¹ Björkvist, Y.J.E.² Slotte, J.P.³ Ramstedt, B.⁴

13
- 22244441444
- Björkvist, Y. J. E.; Nyholm, T. K. M.; Slotte, J. P.; Ramstedt, B. Biophys. J. 2005, 88, 4054-4063
- (2005) Biophys. J. , vol.88 , pp. 4054-4063
- Björkvist, Y.J.E.¹ Nyholm, T.K.M.² Slotte, J.P.³ Ramstedt, B.⁴

14
- 0034907678
- Lins, R. D.; Straatsma, T. P. Biophys. J. 2001, 81, 1037-1046
- (2001) Biophys. J. , vol.81 , pp. 1037-1046
- Lins, R.D.¹ Straatsma, T.P.²

15
- 0037339491
- Shroll, R. M.; Straatsma, T. P. Biophys. J. 2003, 84, 1765-1772
- (2003) Biophys. J. , vol.84 , pp. 1765-1772
- Shroll, R.M.¹ Straatsma, T.P.²

16
- 52649180511
- Mondal, S.; Mukhopadhyay, C. Langmuir 2008, 24, 10298-10305
- (2008) Langmuir , vol.24 , pp. 10298-10305
- Mondal, S.¹ Mukhopadhyay, C.²

17
- 22244486627
- Zaraiskaya, T.; Jeffrey, K. R. Biophys. J. 2005, 88, 4017-4031
- (2005) Biophys. J. , vol.88 , pp. 4017-4031
- Zaraiskaya, T.¹ Jeffrey, K.R.²

18
- 31544474041
- Róg, T.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. Cell. Mol. Biol. Lett. 2005, 10, 625-630
- (2005) Cell. Mol. Biol. Lett. , vol.10 , pp. 625-630
- Róg, T.¹ Vattulainen, I.² Karttunen, M.³

19
- 34548590509
- Róg, T.; Vattulainen, I.; Bunker, A.; Karttunen, M. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 10146-10154
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 10146-10154
- Róg, T.¹ Vattulainen, I.² Bunker, A.³ Karttunen, M.⁴

20
- 33645522789
- Chong, T. T.; Hashim, R.; Bryce, R. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 4978-4984
- (2006) J. Phys. Chem. B , vol.110 , pp. 4978-4984
- Chong, T.T.¹ Hashim, R.² Bryce, R.A.³

21
- 34548019746
- Liu, P.; Izvekov, S.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 11566-11575
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 11566-11575
- Liu, P.¹ Izvekov, S.² Voth, G.A.³

22
- 73949130043
- Lopez, C. A.; Rzepiela, A. J.; de Vries, A.; Dijkhuizen, L.; Hunenberger, P. H.; Marrink, S. J. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 3195-3210
- (2009) J. Chem. Theory Comput. , vol.5 , pp. 3195-3210
- Lopez, C.A.¹ Rzepiela, A.J.² De Vries, A.³ Dijkhuizen, L.⁴ Hunenberger, P.H.⁵ Marrink, S.J.⁶

23
- 33847249878
- Niemelä, P.; Ollila, S.; Hyvonen, M. T.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. PLoS Comput. Biol. 2007, 3, 304-312
- (2007) PLoS Comput. Biol. , vol.3 , pp. 304-312
- Niemelä, P.¹ Ollila, S.² Hyvonen, M.T.³ Karttunen, M.⁴ Vattulainen, I.⁵

24
- 70350223830
- Apajalahti, T.; Niemela, P.; Govindan, P. N.; Miettinen, M. S.; Salonen, E.; Marrink, S. J.; Vattulainen, I. Faraday Discuss. 2009, 144, 411-430
- (2009) Faraday Discuss. , vol.144 , pp. 411-430
- Apajalahti, T.¹ Niemela, P.² Govindan, P.N.³ Miettinen, M.S.⁴ Salonen, E.⁵ Marrink, S.J.⁶ Vattulainen, I.⁷

25
- 56249119219
- Risselada, H. J.; Marrink, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 17367-17372
- (2008) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , vol.105 , pp. 17367-17372
- Risselada, H.J.¹ Marrink, S.J.²

26
- 4143120994
- Pandit, S. A.; Vasudevan, S.; Chiu, S. W.; Mashl, R. J.; Jakobsson, E.; Scott, H. L. Biophys. J. 2004, 87, 1092-1100
- (2004) Biophys. J. , vol.87 , pp. 1092-1100
- Pandit, S.A.¹ Vasudevan, S.² Chiu, S.W.³ Mashl, R.J.⁴ Jakobsson, E.⁵ Scott, H.L.⁶

27
- 17944391445
- Martinez, J. M.; Martinez, L. J. Comput. Chem. 2003, 24, 819-825
- (2003) J. Comput. Chem. , vol.24 , pp. 819-825
- Martinez, J.M.¹ Martinez, L.²

28
- 2942715138
- Bachar, M.; Brunelle, P.; Tieleman, D. P.; Rauk, A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 7170-7179
- (2004) J. Phys. Chem. B , vol.108 , pp. 7170-7179
- Bachar, M.¹ Brunelle, P.² Tieleman, D.P.³ Rauk, A.⁴

29
- 51749093934
- Martinez-Seara, H.; Róg, T.; Karttunen, M.; Reigada, R.; Vattulainen, I. J. Chem. Phys. 2008, 129, 105103
- (2008) J. Chem. Phys. , vol.129 , pp. 105103
- Martinez-Seara, H.¹ Róg, T.² Karttunen, M.³ Reigada, R.⁴ Vattulainen, I.⁵

30
- 55949123440
- Martinez-Seara, H.; Róg, T.; Pasenkiewicz-Gierula, M.; Vattulainen, I.; Karttunen, M.; Reigada, R. Biophys. J. 2008, 95, 3295-3305
- (2008) Biophys. J. , vol.95 , pp. 3295-3305
- Martinez-Seara, H.¹ Róg, T.² Pasenkiewicz-Gierula, M.³ Vattulainen, I.⁴ Karttunen, M.⁵ Reigada, R.⁶

31
- 0029633168
- Berendsen, H. J. C.; van der Spoel, D.; van Drunen, R. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 43-56
- (1995) Comput. Phys. Commun. , vol.91 , pp. 43-56
- Berendsen, H.J.C.¹ Van Der Spoel, D.² Van Drunen, R.³

32
- 0035789518
- Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306-317
- (2001) J. Mol. Model. , vol.7 , pp. 306-317
- Lindahl, E.¹ Hess, B.² Van Der Spoel, D.³

33
- 27344454932
- van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701-1718
- (2005) J. Comput. Chem. , vol.26 , pp. 1701-1718
- Van Der Spoel, D.¹ Lindahl, E.² Hess, B.³ Groenhof, G.⁴ Mark, A.E.⁵ Berendsen, H.J.C.⁶

34
- 33750587438
- Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690
- (1984) J. Chem. Phys. , vol.81 , pp. 3684-3690
- Berendsen, H.J.C.¹ Postma, J.P.M.² Van Gunsteren, W.F.³ Dinola, A.⁴ Haak, J.R.⁵

35
- 84943502952
- Nose, S. Mol. Phys. 1984, 52, 255-268
- (1984) Mol. Phys. , vol.52 , pp. 255-268
- Nose, S.¹

36
- 0001538909
- Hoover, W. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695-1697
- (1985) Phys. Rev. A , vol.31 , pp. 1695-1697
- Hoover, W.¹

37
- 0000388705
- Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463-1472
- (1997) J. Comput. Chem. , vol.18 , pp. 1463-1472
- Hess, B.¹ Bekker, H.² Berendsen, H.J.C.³

38
- 77953447488
- In;, Ed.; Elsevier: Amsterdam,; pp-89
- Karttunen, M.; Roettler, J.; Vattulainen, I.; Sagui, C. In Current Topics in Membranes: Computational Modeling of Membrane Bilayers; Feller, S. E., Ed.; Elsevier: Amsterdam, 2008; pp 44-89.
- (2008) Current Topics in Membranes: Computational Modeling of Membrane Bilayers , pp. 44
- Karttunen, M.¹ Roettler, J.² Vattulainen, I.³ Sagui, C.⁴ Feller, S.E.⁵

39
- 33751552165
- Patra, M.; Hyvonen, M.; Falck, E.; Sabouri-Ghomi, M.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. Comput. Phys. Commun. 2007, 176, 14-22
- (2007) Comput. Phys. Commun. , vol.176 , pp. 14-22
- Patra, M.¹ Hyvonen, M.² Falck, E.³ Sabouri-Ghomi, M.⁴ Vattulainen, I.⁵ Karttunen, M.⁶

40
- 0038440700
- Patra, M.; Karttunen, M.; Hyvonen, M. T.; Falck, E.; Lindqvist, P.; Vattulainen, I. Biophys. J. 2003, 84, 3636-3645
- (2003) Biophys. J. , vol.84 , pp. 3636-3645
- Patra, M.¹ Karttunen, M.² Hyvonen, M.T.³ Falck, E.⁴ Lindqvist, P.⁵ Vattulainen, I.⁶

41
- 2342422492
- Patra, M.; Karttunen, M.; Hyvonen, M. T.; Falck, E.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 4485-4494
- (2004) J. Phys. Chem. B , vol.108 , pp. 4485-4494
- Patra, M.¹ Karttunen, M.² Hyvonen, M.T.³ Falck, E.⁴ Vattulainen, I.⁵

42
- 0000112789
- Tieleman, D. P.; Berendsen, H. J. C. J. Chem. Phys. 1996, 105, 4871-4880
- (1996) J. Chem. Phys. , vol.105 , pp. 4871-4880
- Tieleman, D.P.¹ Berendsen, H.J.C.²

43
- 0343067147
- Pasenkiewicz-Gierula, M.; Róg, T.; Kitamura, K.; Kusumi, A. Biophys. J. 2000, 78, 1376-1389
- (2000) Biophys. J. , vol.78 , pp. 1376-1389
- Pasenkiewicz-Gierula, M.¹ Róg, T.² Kitamura, K.³ Kusumi, A.⁴

44
- 44449167975
- Zhang, W.; Róg, T.; Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, I.; Karttunen, M. Biochimie 2008, 90, 930-938
- (2008) Biochimie , vol.90 , pp. 930-938
- Zhang, W.¹ Róg, T.² Gurtovenko, A.A.³ Vattulainen, I.⁴ Karttunen, M.⁵

45
- 33646174198
- Niemela, P.; Hyvonen, M. T.; Vattulainen, I. Biophys. J. 2006, 90, 851-863
- (2006) Biophys. J. , vol.90 , pp. 851-863
- Niemela, P.¹ Hyvonen, M.T.² Vattulainen, I.³

46
- 77953411637
- Ph.D. Thesis, Helsinki Institute of Physics
- Niemelä, P. Computational Modelling of Lipid Bilayers with Sphingomyelin and Sterols. Ph.D. Thesis, Helsinki Institute of Physics, 2007.
- (2007) Computational Modelling of Lipid Bilayers with Sphingomyelin and Sterols
- Niemelä, P.¹

47
- 0033065591
- Huang, J. Y.; Feigenson, G. W. Biophys. J. 1999, 76, 2142-2157
- (1999) Biophys. J. , vol.76 , pp. 2142-2157
- Huang, J.Y.¹ Feigenson, G.W.²

48
- 33846826956
- Aittoniemi, J.; Niemelä, P.; Hyvönen, M. T.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. Biophys. J. 2007, 92, 1125-1137
- (2007) Biophys. J. , vol.92 , pp. 1125-1137
- Aittoniemi, J.¹ Niemelä, P.² Hyvönen, M.T.³ Karttunen, M.⁴ Vattulainen, I.⁵

49
- 33751237380
- Róg, T.; Pasenkiewicz-Gierula, M. Biophys. J. 2006, 91, 3756-3767
- (2006) Biophys. J. , vol.91 , pp. 3756-3767
- Róg, T.¹ Pasenkiewicz-Gierula, M.²

50
- 36249027008
- Zhang, Z.; Bhide, S. Y.; Berkowitz, M. L. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 12888-12897
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 12888-12897
- Zhang, Z.¹ Bhide, S.Y.² Berkowitz, M.L.³

51
- 16344378112
- Pandit, S. A.; Jakobsson, E.; Scott, H. L. Biophys. J. 2004, 87, 3312-3322
- (2004) Biophys. J. , vol.87 , pp. 3312-3322
- Pandit, S.A.¹ Jakobsson, E.² Scott, H.L.³

52
- 23744505376
- Khelashvili, G. A.; Pandit, S. A.; Scott, H. L. J. Chem. Phys. 2005, 123, 34910
- (2005) J. Chem. Phys. , vol.123 , pp. 34910
- Khelashvili, G.A.¹ Pandit, S.A.² Scott, H.L.³

53
- 34247893965
- Róg, T.; Vattulainen, I.; Pasenkiewicz-Gierula, M.; Karttunen, M. Biophys. J. 2007, 92, 3346-3357
- (2007) Biophys. J. , vol.92 , pp. 3346-3357
- Róg, T.¹ Vattulainen, I.² Pasenkiewicz-Gierula, M.³ Karttunen, M.⁴

54
- 54849403535
- Róg, T.; Karttunen, M.; Vattulainen, I.; Jansen, M.; Ikonen, E. J. Chem. Phys. 2008, 129, 154508
- (2008) J. Chem. Phys. , vol.129 , pp. 154508
- Róg, T.¹ Karttunen, M.² Vattulainen, I.³ Jansen, M.⁴ Ikonen, E.⁵

55
- 55549135378
- Pinto, S.; Silva, L.; de Almeida, R.; Prieto, M. Biophys. J. 2008, 95, 2867-2879
- (2008) Biophys. J. , vol.95 , pp. 2867-2879
- Pinto, S.¹ Silva, L.² De Almeida, R.³ Prieto, M.⁴

56
- 34147092095
- Ollila, S.; Hyvö; nen, M. T.; Vattulainen, I. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 3139-3150
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 3139-3150
- Ollila, S.¹ Hyvö, I.² Nen, M.T.³ Vattulainen, I.⁴

57
- 84906357381
- Ollila, S.; Róg, T.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. J. Struct. Biol. 2007, 311, 311-323
- (2007) J. Struct. Biol. , vol.311 , pp. 311-323
- Ollila, S.¹ Róg, T.² Karttunen, M.³ Vattulainen, I.⁴

58
- 0038386467
- Fantini, J. Cell. Mol. Life Sci. 2003, 60, 1027-1032
- (2003) Cell. Mol. Life Sci. , vol.60 , pp. 1027-1032
- Fantini, J.¹

59
- 74849118341
- Lingwood, D.; Simons, K. Science 2010, 327, 46-50
- (2010) Science , vol.327 , pp. 46-50
- Lingwood, D.¹ Simons, K.²

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.