Promiscuous domains: Facilitating stability of the yeast protein-protein interaction network

Molecular BioSystems

Volumn 8, Issue 3, 2012, Pages 766-771

  Pang, Erli ^a   Tan, Tao ^a   Lin, Kui ^a  

^a BEIJING NORMAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATASE; SACCHAROMYCES CEREVISIAE PROTEIN;

ARTICLE; CHEMISTRY; FUNGAL GENOME; GENETICS; METABOLISM; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; SACCHAROMYCES CEREVISIAE;

GENOME, FUNGAL; NUCLEOSIDE-TRIPHOSPHATASE; PROTEIN INTERACTION DOMAINS AND MOTIFS; PROTEIN INTERACTION MAPS; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SACCHAROMYCES CEREVISIAE PROTEINS;

EID: 84857218055     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1mb05364g     Document Type: Article

References (55)

1. S. Kumar B. Y. Ma C. J. Tsai et al. Protein Sci. 2000 9 10 19
2. B. Schwikowski P. Uetz S. Fields Nat. Biotechnol. 2000 18 1257 1261
3. G. Butland J. M. Peregrin-Alvarez J. Li et al. Nature 2005 433 531 537
4. J. F. Rual K. Venkatesan T. Hao et al. Nature 2005 437 1173 1178
5. S. M. Li C. M. Armstrong N. Bertin et al. Science 2004 303 540 543
6. A. L. Barabasi E. Bonabeau Sci. Am. 2003 288 60 69
7. A. L. Barabasi Science 2009 325 412 413
8. H. Jeong S. P. Mason A. L. Barabasi et al. Nature 2001 411 41 42
9. D. Ekman S. Light A. K. Bjorklund et al. Genome Biol. 2006 7 R45
10. S. Maslov K. Sneppen Science 2002 296 910 913
11. H. B. Fraser Nat. Genet. 2005 37 351 352
12. I. W. Taylor R. Linding D. Warde-Farley et al. Nat. Biotechnol. 2009 27 199 204
13. C. J. Tsai B. Y. Ma R. Nussinov Trends Biochem. Sci. 2009 34 594 600
14. C. P. Ponting R. R. Russell Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2002 31 45 71
15. A. Bateman E. Birney L. Cerruti et al. Nucleic Acids Res. 2002 30 276 280
16. E. V. Koonin Y. I. Wolf G. P. Karev Nature 2002 420 218 223
17. A. Andreeva D. Howorth J. M. Chandonia et al. Nucleic Acids Res. 2008 36 D419 D425
18. L. H. Greene T. E. Lewis S. Addou et al. Nucleic Acids Res. 2007 35 D291 D297
19. R. D. Finn J. Mistry J. Tate et al. Nucleic Acids Res. 2010 38 D211 D222
20. A. K. Bjorklund D. Ekman S. Light et al. J. Mol. Biol. 2005 353 911 923
21. S. Pasek J. L. Risler P. Brezellec Bioinformatics 2006 22 1418 1423
22. M. Levitt Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 11079 11084
23. G. Apic J. Gough S. A. Teichmann J. Mol. Biol. 2001 310 311 325
24. C. Chothia J. Gough C. Vogel et al. Science 2003 300 1701 1703
25. C. Vogel S. A. Teichmann J. Pereira-Leal J. Mol. Biol. 2005 346 355 365
26. J. H. Han S. Batey A. A. Nickson et al. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2007 8 319 330
27. G. Apic W. Huber S. A. Teichmann J. Struct. Funct. Genomics 2003 4 67 78
28. M. L. Wang G. Caetano-Anolles Mol. Biol. Evol. 2006 23 2444 2454
29. S. Wuchty Mol. Biol. Evol. 2001 18 1694 1702
30. A. Rzhetsky S. M. Gomez Bioinformatics 2001 17 988 996
31. G. Apic J. Gough S. A. Teichmann Bioinformatics 2001 17 suppl 1 S83 S89
32. E. M. Marcotte M. Pellegrini H. L. Ng et al. Science 1999 285 751 753
33. M. K. Basu L. Carmel I. B. Rogozin et al. Genome Res. 2008 18 449 461
34. A. Patil K. Kinoshita H. Nakamura Protein Sci. 2010 19 1461 1468
35. D. Bohning E. Dietz P. Schlattmann Biometrics 1998 54 525 536
36. H. Tordai A. Nagy K. Farkas et al. FEBS J. 2005 272 5064 5078
37. I. Xenarios L. Salwinski X. Q. J. Duan et al. Nucleic Acids Res. 2002 30 303 305
38. A. Ceol A. C. Aryamontri L. Licata et al. Nucleic Acids Res. 2010 38 D532 D539
39. C. Stark B. J. Breitkreutz A. Chatr-Aryamontri et al. Nucleic Acids Res. 2011 39 D698 D704
40. D. Barrell E. Dimmer R. P. Huntley et al. Nucleic Acids Res. 2009 37 D396 D403
41. J. Bandorowicz-Pikula R. Buchet S. Pikula BioEssays 2001 23 170 178
42. G. Manning G. D. Plowman T. Hunter et al. Trends Biochem. Sci. 2002 27 514 520
43. S. B. Ficarro M. L. McCleland P. T. Stukenberg et al. Nat. Biotechnol. 2002 20 301 305
44. J. Ptacek G. Devgan G. Michaud et al. Nature 2005 438 679 684
45. J. Weiner A. D. Moore E. Bornberg-Bauer BMC Evol. Biol. 2008 8 285
46. L. Hakes J. W. Pinney D. L. Robertson et al. Nat. Biotechnol. 2008 26 69 72
47. N. Tuncbag G. Kar O. Keskin et al. Briefings Bioinf. 2009 10 217 232
48. H. Jeong B. Tombor R. Albert et al. Nature 2000 407 651 654
49. R. Apweiler M. J. Martin C. O'Donovan et al. Nucleic Acids Res. 2010 38 D142 D148
50. A. Bairoch B. Boeckmann S. Ferro et al. Briefings Bioinf. 2004 5 39 55
51. B. Boeckmann A. Bairoch R. Apweiler et al. Nucleic Acids Res. 2003 31 365 370
52. M. Kanehisa S. Goto M. Furumichi et al. Nucleic Acids Res. 2010 38 D355 D360
53. R. Albert H. Jeong A. L. Barabasi Nature 2000 406 378 382
54. P. Shannon A. Markiel O. Ozier et al. Genome Res. 2003 13 2498 2504
55. E. I. Boyle S. A. Weng J. Gollub et al. Bioinformatics 2004 20 3710 3715