-
1
-
-
0024707204
-
-
Marqusee, S.; Robbins, V. H.; Baldwin, R. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1989, 86, 5286
-
(1989)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.86
, pp. 5286
-
-
Marqusee, S.1
Robbins, V.H.2
Baldwin, R.L.3
-
5
-
-
0030046906
-
-
Williams, S.; Causgrove, T. P.; Gilmanshin, R.; Fang, K. S.; Callender, R. H.; Woodruff, W. H.; Dyer, R. B. Biochemistry 1996, 35, 691
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 691
-
-
Williams, S.1
Causgrove, T.P.2
Gilmanshin, R.3
Fang, K.S.4
Callender, R.H.5
Woodruff, W.H.6
Dyer, R.B.7
-
6
-
-
0029973119
-
-
Ballew, R. M.; Sabelko, J.; Grubele, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996, 93, 5759
-
(1996)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.93
, pp. 5759
-
-
Ballew, R.M.1
Sabelko, J.2
Grubele, M.3
-
7
-
-
0001261542
-
-
Ballew, R. M.; Sabelko, J.; Reiner, C.; Grubele, M. Rev. Sci. Instrum. 1996, 67, 3694
-
(1996)
Rev. Sci. Instrum.
, vol.67
, pp. 3694
-
-
Ballew, R.M.1
Sabelko, J.2
Reiner, C.3
Grubele, M.4
-
8
-
-
0344597492
-
-
Marshak D.R Ed.; Academic Press: San Diego, CA, U.S
-
Thompson, P. A. In Techniques in Protein Chemistry; Marshak, D. R., Ed.; Academic Press: San Diego, CA, U.S., 1997; pp 735 - 743.
-
(1997)
Techniques in Protein Chemistry
, pp. 735-743
-
-
Thompson, P.A.1
-
9
-
-
0030789351
-
-
Thompson, P. A.; Eaton, W. A.; Hofrichter, J. Biochemistry 1997, 36, 9200
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 9200
-
-
Thompson, P.A.1
Eaton, W.A.2
Hofrichter, J.3
-
10
-
-
0000137407
-
-
Thompson, P. A.; Munoz, V.; Jas, G. S.; Henry, E. R.; Eaton, W. A.; Hofrichter, J. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 378
-
(2000)
J. Phys. Chem. B
, vol.104
, pp. 378
-
-
Thompson, P.A.1
Munoz, V.2
Jas, G.S.3
Henry, E.R.4
Eaton, W.A.5
Hofrichter, J.6
-
11
-
-
0035128362
-
-
Jas, G. S.; Eaton, W. A.; Hofrichter, J. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 261
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, pp. 261
-
-
Jas, G.S.1
Eaton, W.A.2
Hofrichter, J.3
-
13
-
-
0037397987
-
-
Gnanakaran, S.; Nymeyer, H.; Portman, J.; Sanbonmatsu, K. Y.; Garcia, A. E. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 168
-
(2003)
Curr. Opin. Struct. Biol.
, vol.13
, pp. 168
-
-
Gnanakaran, S.1
Nymeyer, H.2
Portman, J.3
Sanbonmatsu, K.Y.4
Garcia, A.E.5
-
14
-
-
33646908786
-
-
Shi, Z. K.; Chen, Z.; Liu, N. R.; Kallenbach, N. R. Chem. Rev. 2006, 106, 1877
-
(2006)
Chem. Rev.
, vol.106
, pp. 1877
-
-
Shi, Z.K.1
Chen, Z.2
Liu, N.R.3
Kallenbach, N.R.4
-
15
-
-
32444434361
-
-
Makowska, J.; Rodziewicz-Motowidlo, S.; Baginska, K.; Vila, J. A.; Liwo, A.; Chmurzynski, L.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 1744
-
(2006)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.103
, pp. 1744
-
-
Makowska, J.1
Rodziewicz-Motowidlo, S.2
Baginska, K.3
Vila, J.A.4
Liwo, A.5
Chmurzynski, L.6
Scheraga, H.A.7
-
18
-
-
0037126425
-
-
Margulis, C. J.; Stern, H. A.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 10748
-
(2002)
J. Phys. Chem. B
, vol.106
, pp. 10748
-
-
Margulis, C.J.1
Stern, H.A.2
Berne, B.J.3
-
20
-
-
25144490502
-
-
Zagrovic, B.; Jayachandran, G.; Millet, I. S.; Doniach, S.; Pande, V. S. J. Mol. Biol. 2005, 353, 232
-
(2005)
J. Mol. Biol.
, vol.353
, pp. 232
-
-
Zagrovic, B.1
Jayachandran, G.2
Millet, I.S.3
Doniach, S.4
Pande, V.S.5
-
21
-
-
33846783019
-
-
Graf, P.; Nguyen, H.; Stock, G.; Schwalbe, H. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1179
-
(2007)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.129
, pp. 1179
-
-
Graf, P.1
Nguyen, H.2
Stock, G.3
Schwalbe, H.4
-
22
-
-
0034683242
-
-
Hummer, G.; García, A. E.; Garde, S. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 2637
-
(2000)
Phys. Rev. Lett.
, vol.85
, pp. 2637
-
-
Hummer, G.1
García, A.E.2
Garde, S.3
-
25
-
-
78649569200
-
-
5a
-
5a.
-
-
-
-
27
-
-
0000137407
-
-
Thompson, P. A.; Munoz, V.; Jas, G. S.; Henry, E. R.; Eaton, W. A.; Hofrichter, J. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 378
-
(2000)
J. Phys. Chem. B
, vol.104
, pp. 378
-
-
Thompson, P.A.1
Munoz, V.2
Jas, G.S.3
Henry, E.R.4
Eaton, W.A.5
Hofrichter, J.6
-
28
-
-
0035128362
-
-
Jas, G. S.; Eaton, W. A.; Hofrichter, J. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 261
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, pp. 261
-
-
Jas, G.S.1
Eaton, W.A.2
Hofrichter, J.3
-
30
-
-
0029400480
-
-
Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pheifer, J.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1995, 6, 277
-
(1995)
J. Biomol. NMR
, vol.6
, pp. 277
-
-
Delaglio, F.1
Grzesiek, S.2
Vuister, G.W.3
Zhu, G.4
Pheifer, J.5
Bax, A.6
-
31
-
-
0004265485
-
-
University of California: San Fransisco, CA, U.S.
-
Goddard, T. D.; Kneller, D. G. SPARKY3; University of California: San Fransisco, CA, U.S.
-
SPARKY3
-
-
Goddard, T.D.1
Kneller, D.G.2
-
33
-
-
0242663237
-
-
Duan, Y.; Wu, C.; Chowdhury, S.; Lee, M. C.; Xiong, G. M.; Zhang, W.; Yang, R.; Cieplak, P.; Luo, R.; Lee, T.; Caldwell, J.; Wang, J. M.; Kollman, P. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1999
-
(2003)
J. Comput. Chem.
, vol.24
, pp. 1999
-
-
Duan, Y.1
Wu, C.2
Chowdhury, S.3
Lee, M.C.4
Xiong, G.M.5
Zhang, W.6
Yang, R.7
Cieplak, P.8
Luo, R.9
Lee, T.10
Caldwell, J.11
Wang, J.M.12
Kollman, P.13
-
37
-
-
4444282928
-
-
Oostenbrink, C.; Villa, A.; Mark, A. E.; Van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1656
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1656
-
-
Oostenbrink, C.1
Villa, A.2
Mark, A.E.3
Van Gunsteren, W.F.4
-
38
-
-
0035913529
-
-
Kaminski, G. A.; Friesner, R. A.; Tirado-Rives, J.; Jorgensen, W. L. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6474
-
(2001)
J. Phys. Chem. B
, vol.105
, pp. 6474
-
-
Kaminski, G.A.1
Friesner, R.A.2
Tirado-Rives, J.3
Jorgensen, W.L.4
-
39
-
-
46249092554
-
-
Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435
-
(2008)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.4
, pp. 435
-
-
Hess, B.1
Kutzner, C.2
Van Der Spoel, D.3
Lindahl, E.4
-
40
-
-
0002775934
-
-
Pullmann, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, The Netherlands
-
Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. In Intermolecular Forces; Pullmann, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1981; p 331.
-
(1981)
Intermolecular Forces
, pp. 331
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Postma, J.P.M.2
Van Gunsteren, W.F.3
Hermans, J.4
-
43
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
44
-
-
67650500988
-
-
Brooks, B. R.; Brooks, C. L.; Mackerell, A. D.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1545
-
(2009)
J. Comput. Chem.
, vol.30
, pp. 1545
-
-
Brooks, B.R.1
Brooks, C.L.2
MacKerell, A.D.3
Nilsson, L.4
Petrella, R.J.5
Roux, B.6
Won, Y.7
Archontis, G.8
Bartels, C.9
Boresch, S.10
Caflisch, A.11
Caves, L.12
Cui, Q.13
Dinner, A.R.14
Feig, M.15
Fischer, S.16
Gao, J.17
Hodoscek, M.18
Im, W.19
Kuczera, K.20
Lazaridis, T.21
Ma, J.22
Ovchinnikov, V.23
Paci, E.24
Pastor, R.W.25
Post, C.B.26
Pu, J.Z.27
Schaefer, M.28
Tidor, B.29
Venable, R.M.30
Woodcock, H.L.31
Wu, X.32
Yang, W.33
York, D.M.34
Karplus, M.35
more..
-
45
-
-
3142714765
-
-
Mackerell, A. D.; Feig, M.; Brooks, C. L. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1400
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1400
-
-
MacKerell, A.D.1
Feig, M.2
Brooks, C.L.3
-
47
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327
-
(1977)
J. Comput. Phys.
, vol.23
, pp. 327
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
48
-
-
24944574310
-
-
Fodor, E.; Mack, J. W.; Maeng, J.-S.; Ju, J.-H.; Lee, H. S.; Gruschus, J. M.; Ferretti, J. A.; Ginsburg, A. Biochemistry 2005, 44, 12480
-
(2005)
Biochemistry
, vol.44
, pp. 12480
-
-
Fodor, E.1
MacK, J.W.2
Maeng, J.-S.3
Ju, J.-H.4
Lee, H.S.5
Gruschus, J.M.6
Ferretti, J.A.7
Ginsburg, A.8
-
49
-
-
63149100950
-
-
Sadqi, M.; de Alba E, P-J. R.; Sanchez-Ruiz, J. M.; Muñoz, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106, 4127
-
(2009)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.106
, pp. 4127
-
-
Sadqi, M.1
De Alba, E.P.-J.R.2
Sanchez-Ruiz, J.M.3
Muñoz, V.4
-
50
-
-
0037073934
-
-
Garcia-Mira, M. M.; Sadqi, M.; Fischer, N.; Sanchez-Ruiz, J. M.; Muñoz, V. Science 2002, 298, 2191
-
(2002)
Science
, vol.298
, pp. 2191
-
-
Garcia-Mira, M.M.1
Sadqi, M.2
Fischer, N.3
Sanchez-Ruiz, J.M.4
Muñoz, V.5
-
52
-
-
0021764813
-
-
Pardi, A.; Billeter, M.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1984, 180, 741
-
(1984)
J. Mol. Biol.
, vol.180
, pp. 741
-
-
Pardi, A.1
Billeter, M.2
Wüthrich, K.3
-
54
-
-
0030167996
-
-
Millhauser, G. L.; Stenland, C. J.; Bolin, K. A.; van de Ven, F. J. M. J. Biomol. NMR 1996, 7, 331
-
(1996)
J. Biomol. NMR
, vol.7
, pp. 331
-
-
Millhauser, G.L.1
Stenland, C.J.2
Bolin, K.A.3
Van De Ven, F.J.M.4
-
55
-
-
34147162150
-
-
Makowska, J.; Rodziewicz-Motowidlo, S.; Baginska, K.; Makowski, M.; Vila, J. A.; Liwo, A.; Chmurzynski, L.; Scheraga, H. A. Biophys. J. 2007, 92, 2904
-
(2007)
Biophys. J.
, vol.92
, pp. 2904
-
-
Makowska, J.1
Rodziewicz-Motowidlo, S.2
Baginska, K.3
Makowski, M.4
Vila, J.A.5
Liwo, A.6
Chmurzynski, L.7
Scheraga, H.A.8
-
56
-
-
70349918273
-
-
Mohammed, O. F.; Jas, G. S.; Lin, M.; Zewail, A. H. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2009, 48, 5628
-
(2009)
Angew. Chem., Int. Ed. Engl.
, vol.48
, pp. 5628
-
-
Mohammed, O.F.1
Jas, G.S.2
Lin, M.3
Zewail, A.H.4
-
57
-
-
2942622288
-
-
Horn, H. W.; Swope, W. C.; Pitera, J. W.; Madura, J. D.; Dick, T. J.; Hura, G. L.; Head-Gordon, T. J. Chem. Phys. 2004, 120, 9665
-
(2004)
J. Chem. Phys.
, vol.120
, pp. 9665
-
-
Horn, H.W.1
Swope, W.C.2
Pitera, J.W.3
Madura, J.D.4
Dick, T.J.5
Hura, G.L.6
Head-Gordon, T.7
-
59
-
-
36849086603
-
-
Chen, K.; Liu, Z.; Zhou, C.; Bracken, W. C.; Kallenbach, N. R. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2007, 46, 9036
-
(2007)
Angew. Chem., Int. Ed. Engl.
, vol.46
, pp. 9036
-
-
Chen, K.1
Liu, Z.2
Zhou, C.3
Bracken, W.C.4
Kallenbach, N.R.5
-
60
-
-
0032509102
-
-
Nilsson, I. M.; Saè aÈ f1, A.; Whitley, P.; Gafvelin, G.; Waller, C.; von Heijne, G. J. Mol. Biol. 1998, 284, 1165
-
(1998)
J. Mol. Biol.
, vol.284
, pp. 1165
-
-
Nilsson, I.M.1
Saèa, È.F.2
Whitley, P.3
Gafvelin, G.4
Waller, C.5
Von Heijne, G.6
-
61
-
-
78649531124
-
-
Jas et al. (unpublished results)
-
Jas et al. (unpublished results).
-
-
-
|