Evolutionary cycles for pericyclic reactions-or why we keep mutating mutases

Chimia

Volumn 63, Issue 6, 2009, Pages 313-317

  Kast, Peter ^a   Roderer, Kathrin ^b  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b NONE

Author keywords

Chorismate mutase; Directed evolution; Enzyme structure and function; Isochorismate pyruvate lyase; Selection in vivo

Indexed keywords

EID: 67650529714     PISSN: 00094293     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2533/chimia.2009.313     Document Type: Conference Paper

References (36)

1. P. R. Andrews, E. N. Cain, E. Rizzardo, G. D. Smith, Biochemistry 1977, 16, 4848.
2. S. G. Sogo, T. S. Widlanski, J. H. Hoare, C. E. Grimshaw, G. A. Berchtold, J. R. Knowles, J.Am. Chem. Soc. 1984, 106, 2701.
3. M. S. DeClue, K. K. Baldridge, D. E. Kunzler, P. Kast, D. Hilvert, J. Arm. Chem. Soc. 2005, 127, 15002.
4. D. E. Kunzler, S. Sasso, M. Gamper, D. Hilvert, P. Kast, J. Biol. Chem. 2005, 280, 32827.
5. P. A. Bartlett, C. R. Johnson, J. Am. Chem. Soc. 185, 107, 7792.
6. E. Haslam, 'Shikimic Acid: Metabolism and Metabolites', John Wiley & Sons, New York, 1993.
7. C. R. W. Guimaraes, M. P. Repasky, J. Chandrasekhar, J. Tirado-Rives, W. L. Jorgensen, J. Am. Chrem. Soc. 2003, 125, 6892.
8. Strajbl, A. Shurki, M. Kato, A. Warshel, J Am. Chem. Soc. 2003, 125, 10228.
9. X. Zhang, X. Zhang, T. C. Bruice, Biochemistry 2005, 44, 10443.
10. J. Giraldo, D. Roche, X. Rovira, J. Serra, FEBS Lett. 2006, 580, 2170. [11] P. R. Andrews, G. D. Smith, I. G. Young, Biochemistry 1973, 12, 3492. [12] S. D. Copley, J. R. Knowles, J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 5306.
11. D. J. Gustin, P. Mattei, P. Kast, O. Wiest, L. Lee., W. Cleland, D. Hilvert, J. Am. Chem. Soc. 999, 21, 1756.
12. S. K. Wright, M. S. DeClue, A. Mandal, L. Lee, Wiest, W. W. Cleland, D. Hilvert, J. Am. hem. Soc. 2005, 127, 12957.
13. R. Chen, Trends Biotechnol. 2001, 19, 13.
14. P. Kast, M. Asif-Ullah, N. Jiang, D. Hilvert,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996 93, 5043.
15. P. Kast, J. D. Hartgerink, M. Asif-Ullah, D. ilvert, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3069.
16. P. Kast, C. Grisostomi, I. A. Chen, S. Li, U. rengel, Y. Xue, D. Hilvert, J. Biol. Chem. 2000, 275, 36832.
17. A. Y. Lee, P. A. Karplus, B. Ganem, J. Clardy, J m. Chem. Soc. 1995, 117, 3627.
18. Y. M. Chook, H. Ke, W. N. Lipscomb, Proc. atl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 8600.
19. M. Ökvist, R. Dey, S. Sasso, E. Grahn, P. Kast, U. Krengel, J. Mol. Biol. 2006, 357, 1483.
20. N. Strater, G. Schnappauf, G. Braus, W. N. Lipscomb, Structure 1997, 5, 1437.
21. S. Sasso, M. Okvist, K. Roderer, M. Gamper, G. Codoni, U. Krengel, P. Kast, EMBO J., 2009, in press.
22. G. MacBeath, P. Kast, D. Hilvert, Science 1998, 279, 1958.
23. K. Pervushin, K. Vamvaca, B. Vogeli, D. Hilvert, Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 1202.
24. M. R. Haynes, E. A. Stura, D. Hilvert, I. A. Wilson, Science 1994, 263, 646.
25. D. Hilvert, S. H. Carpenter, K. D. Nared, M.-T. M. Auditor, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988, 85, 4953.
26. D. Hilvert, K. D. Nared, J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 5593.
27. C. Gaille, P. Kast, D. Haas, J. Biol. Chem. 2002, 277, 21768.
28. C. T. Walsh, J. Liu, F. Rusnak, M. Sakaitani, Chem. Rev. 1990, 90, 1105.
29. M. S. DeClue, K. K. Baldridge, P. Kast, D.Hilvert, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 2043.
30. Y. Xue, W. N. Lipscomb, R. Graf, G. Schnappauf, G. Braus, Proc. Nartl. Acrad. Sci. USA 1994, 91, 10814.
31. S. Sasso, C. Ramakrishnan, M. Gamper, D. Hilvert, P. Kast, FEBS J. 2005, 272, 375.
32. D. R. Liu, S. T. Cload, R. M. Pastor, P. G. Schultz, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 1789.
33. S.-K. Kim, S. K. Reddy, B. C. Nelson, G. B. Vasquez, A. Davis, A. J. Howard, S. Patterson,G. L. Gilliland, J. E. Ladner, P. T. Reddy, J Bacteriol. 2006, 188, 8638.
34. G. MacBeath, P. Kast, D. Hilvert, Prot. Sci. 1998, 7, 1757.
35. A. C. Kleeb, M. Hansson Edalat, M. Gamper, J. Haugstetter, L. Giger, M. Neuenschwander, P. Kast, D. Hilvert, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 13907.
36. M. Neuenschwander, M. Butz, C. Heintz, P. Kast, D. Hilvert, Nat. Biotechnol. 2007, 25,1145.