A quantitative comparison of the photophysical properties of selected quantum dots and organic fluorophores

Zeitschrift fur Physikalische Chemie

Volumn 222, Issue 5-6, 2008, Pages 833-849

  Gould, Travis J ^a   Bewersdorf, Joerg ^b   Hess, Samuel T ^a  

^a University of Maine ^*  (United States)

^b JACKSON LABORATORY   (United States)

Author keywords

Autocorrelation; Fluorescence intermittency; Nanocrystals; Quantum dots; Two photon excitation cross sections

Indexed keywords

AUTOCORRELATION; CADMIUM COMPOUNDS; FLUORESCENCE IMAGING; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; GRAPHENE QUANTUM DOTS; II-VI SEMICONDUCTORS; MOLECULES; NANOCRYSTALS; PHOTOBLEACHING; PHOTONS; PROBES; SEMICONDUCTOR QUANTUM DOTS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

BIOLOGICAL APPLICATIONS; FLUORESCENCE CORRELATION SPECTROSCOPY; FLUORESCENCE INTERMITTENCY; LASER SCANNING CONFOCAL MICROSCOPES; PHOTOPHYSICAL PROPERTIES; QUANTITATIVE CHARACTERIZATION; QUANTITATIVE COMPARISON; TWO-PHOTON EXCITATIONS;

FLUOROPHORES;

EID: 47649124588     PISSN: 09429352     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1524/zpch.2008.6011     Document Type: Conference Paper

References (70)

1. X. Gao, L. Yang, Petros J. A., F. F. Marshall, J. W. Simons, and S. Nie, Curr. Opin. Biotechnol. 16(1) 2005 63-72.
2. M. A. Hines, and P. Guyot-Sionnest, Journal of Physical Chemistry 100(2) (1996) 468-471.
3. V. I. Klimov, C. J. Schwarz, D. W. McBranch, C. A. Leatherdale, and M. G. Bawendi, Physical Review B 60(4) (1999) R2177-R2180.
4. M. Kuno, D. P. Fromm, H. F. Hamann, A. Gallagher, and D. J. Nesbitt, Journal of Chemical Physics 115(2) (2001) 1028-1040.
5. W. C. Chan, D. J. Maxwell, X. Gao, R. E. Bailey, M. Han, and S. Nie, Curr. Opin. Biotechnol. 13(1) (2002) 40-46.
6. B. O. Dabbousi, J. RodriguezViejo, F. V. Mikulec, J. R. Heine, H. Mattoussi, R. Ober, K. F. Jensen, and M. G. Bawendi, Journal of Physical Chemistry B 101(46) (1997) 9463-9475.
7. M. Han, X. Gao, J. Z. Su, and S. Nie, Nat. Biotechnol. 19(7) (2001) 631-635.
8. X. Y. Wu, H. J. Liu, J. Q. Liu, K. N. Haley, J. A. Treadway, J. P. Larson, N. F. Ge, F. Peale, and M. P. Bruchez, Nature Biotechnology 21(1) (2003) 41-46.
9. A. M. Smith, X. Gao, and S. Nie, Photochem. Photobiol. 80 (2004) 377-385.
10. M. Bruchez, M. Moronne, P. Gin, S. Weiss, and A. P. Alivisatos, Science 281(5385) (1998) 2013-2016.
11. W. C. Chan, and S. Nie, Science 281(5385) (1998) 2016-2018.
12. S. Matsuyama, J. Llopis, Q. L. Deveraux, R. Y. Tsien, and J. C. Reed, Nature Cell Biology 2(6) (2000) 318-325.
13. J. K. Jaiswal, H. Mattoussi, J. M. Mauro, and S. M. Simon, Nature Biotechnology 21(1) (2003) 47-51.
14. E. Betzig, G. H. Patterson, R. Sougrat, O. W. Lindwasser, S. Olenych, J. S. Bonifacino, M. W. Davidson, J. Lippincott-Schwartz, and H. F. Hess, Science 313(5793) (2006) 1642-1645.
15. S. W. Hell, Science 316(5828) (2007) 1153-1158.
16. S. T. Hess, T. P. Girirajan, and M. D. Mason, Biophys. J. (2006) in press.
17. X. Michalet, and S. Weiss, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103(13) (2006) 4797-4798.
18. M. J. Rust, M. Bates, and X. Zhuang, Nat. Methods 3(10) (2006) 793-796.
19. S. Weiss, Science 283(5408) (1999) 1676-1683.
20. R. E. Thompson, D. R. Larson, and W. W. Webb, Biophysical Journal 82(5) (2002) 2775-2783.
21. S. T. Hess, S. Huang, A. A. Heikal, and W. W. Webb, Biochemistry 41(3) (2002) 697-705.
22. D. R. Sandison, D. W. Piston, R. M. Williams, and W. W. Webb, Applied Optics 34(19) (1995) 3576-3588.
23. D. R. Sandison, and W. W. Webb, Applied Optics 33(4) (1994) 603-615.
24. M. Nirmal, B. O. Dabbousi, M. G. Bawendi, J. J. Macklin, J. K. Trautman, T. D. Harris, and L. E. Brus, Nature 383(6603) (1996) 802-804.
25. U. Banin, M. Bruchez, A. P. Alivisatos, T. Ha, S. Weiss, and D. S. Chemla, Journal of Chemical Physics 110(2) (1999) 1195-1201.
26. A. Javier, and G. F. Strouse, Chemical Physics Letters 391(1-3) (2004) 60-63.
27. J. A. Rochira, M. V. Gudheti, T. J. Gould, R. R. Laughlin, J. L. Nadeau, and S. T. Hess, J. Phys. Chem. C 111(4) (2007) 1695-1708.
28. E. L. Elson, and D. Madge, Biopolymers 13 (1974) 1-27.
29. D. Madge, E. L. Elson, and W. W. Webb, Biopolymers 13 (1974) 29-61.
30. D. Magde, E. L. Elson, and W. W. Webb, Physical Review Letters R-29 (1972) 705-708.
31. W. E. Moerner, Journal of Chemical Physics 117(24) (2002) 10925-10937.
32. W. E. Moerner, Journal of Physical Chemistry B 106 (2002) 910-927.
33. A. A. Heikal, S. T. Hess, G. S. Baird, R. Y. Tsien, and W. W. Webb, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97(26) (2000) 14831-14831.
34. M. Dahan, S. Levi, C. Luccardini, P. Rostaing, B. Riveau, and A. Triller, Science 302(5644) (2003) 442-445.
35. B. Dubertret, P. Skourides, D. J. Noms, V. Noireaux, A. H. Brivanlou, and A. Libchaber, Science 298(5599) (2002) 1759-1762.
36. D. S. Lidke, P. Nagy, R. Heintzmann, D. J. Arndt-Jovin, J. N. Post, H. E. Grecco, E. A. Jares-Erijman, and T. M. Jovin, Nat. Biotechnol 22(2) (2004) 198-203.
37. T. D. Lacoste, X. Michalet, F. Pinaud, D. S. Chemla, A. P. Alivisatos, and S. Weiss, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97(17) (2000) 9461-9466.
38. B. C. Lagerholm, L. Averett, G. E. Weinreb, K. Jacobson, and N. L. Thompson, Biophys. J. 91(8) (2006) 3050-3060.
39. H. H. Chen, and K. W. Leong, Nanomedicine 1(1) (2006) 119-122.
40. A. R. Clapp, I. L. Medintz, J. M. Mauro, B. R. Fisher, M. G. Bawendi, and H. Mattoussi, J. Am. Chem. Soc. 126(1) (2004) 301-310.
41. I. L. Medintz, A. R. Clapp, H. Mattoussi, E. R. Goldman, B. Fisher, and J. M. Mauro, Nat. Mater. 2(9) (2003) 630-638.
42. H. Yao, Y. Zhang, F. Xiao, Z. Xia, and J. Rao, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 46(23) (2007) 4346-4349.
43. W. Denk, J. H. Strickler, and W. W. Webb, Science 248(4951) (1990) 73-76.
44. X. Gao, Y. Cui, R. M. Levenson, L. W. Chung, and S. Nie, Nat. Biotechnol. 22(8) (2004) 969-976.
45. D. R. Larson, W. R. Zipfel, R. M. Williams, S. W. Clark, M. P. Bruchez, F. W. Wise, and W. W. Webb, Science 300(5624) (2003) 1434-1436.
46. M. Albota, D. Beljonne, J. L. Bredas, J. E. Ehrlich, J. Y. Fu, A. A. Heikal, S. E. Hess, T. Kogej, M. D. Levin, S. R. Marder, D. McCord-Maughon, J. W. Perry, H. Rockel, M. Rumi, C. Subramaniam, W. W. Webb, X. L. Wu, and C. Xu, Science 281(5383) (1998) 1653-1656.
47. M. A. Albota, C. Xu, and W. W. Webb, Appl. Opt. 37(31) (1998) 7352-7356.
48. A. A. Heikal, S. T. Hess, G. S. Baird, R. Y. Tsien, and W. W. Webb, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97(22) (2000) 11996-12001.
49. A. A. Heikal, S. T. Hess, and W. W. Webb, Chemical Physics 274(1) (2001) 37-55.
50. C. Xu, and W. W. Webb, Journal of the Optical Society of America B-Optical Physics 13(3) (1996) 481-491.
51. R. Medda, S. Jakobs, S. W. Hell, and J. Bewersdorf, J. Struct. Biol. 156(3) (2006) 517-523.
52. A. P. Alivisatos, Science 271(5251) (1996) 933-937.
53. S. Doose, J. M. Tsay, F. Pinaud, and S. Weiss, Analytical Chemistry 77(7) (2005) 2235-2242.
54. R. F. Heuff, J. L. Swift, and Cramb, D. T., Phys. Chem. Chem. Phys. 9(16) (2007) 1870-1880.
55. J. Yao, D. R. Larson, H. D. Vishwasrao, W. R. Zipfel, and W. W. Webb, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102(40) (2005) 14284-14289.
56. J. R. Lakowicz, Principles of fluorescence spectroscopy. 3 ed., Springer Science, New York (2006).
57. W. Denk, D. W. Piston, and W. W. Webb, Multi-Photon Molecular Excitation in Laser-Scanning Microscopy, in Handbook of Biological Confocal Microscopy. J. B. Pawley (Ed.), Springer Science, New York (2006) p. 535-549.
58. U. Haupts, S. Maiti, P. Schwille, and W. W. Webb, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95(23) (1998) 13573-13578.
59. S. T. Hess, A. A. Heikal, and W. W. Webb, Journal of Physical Chemistry B 108 (2004) 10138-10148.
60. M. Kuno, D. P. Fromm, H. F. Hamann, A. Gallagher, and D. J. Nesbitt, Journal of Chemical Physics 112(7) (2000) 3117-3120.
61. F. Pinaud, X. Michalet, L. A. Bentolila, J. M. Tsay, S. Doose, J. J. Li, G. Iyer, and S. Weiss, Biomaterials 27(9) (2006) 1679-1687.
62. C. Kirchner, T. Liedl, S. Kudera, T. Pellegrino, A. Munoz Javier, H. E. Gaub, S. Stolzle, N. Fertig, and W. J. Parak, Nano. Lett. 5(2) (2005) 331-338.
63. D. J. Milliron, S. M. Hughes, Y. Cui, L. Manna, J. Li, L. W. Wang, and A. P. Alivisatos, Nature 430(6996) (2004) 190-195.
64. C. Thelander, T. Martensson, M. T. Bjork, B. J. Ohlsson, M. W. Larsson, L. R. Wallenberg, and L. Samuelson, Applied Physics Letters 83(10) (2003) 2052-2054.
65. M. Kazes, D. Y. Lewis, Y. Ebenstein, T. Mokari, and U. Banin, Advanced Materials, 14(4) (2002) 317.
66. A. Issac, C. von Borczyskowski, and F. Cichos, Physical Review B 71(16) (2005) 161302.
67. A. M. Derfus, W. C. W. Chan, and S. N. Bhatia, Nano. Lett. 4(1) (2004) 11-18.
68. A. Shiohara, A. Hoshino, K. Hanaki, K. Suzuki, and K. Yamamoto, Microbiol. Immunol. 48(9) (2004) 669-675.
69. A. Hoshino, K. Fujioka, T. Oku, M. Suga, Y. F. Sasaki, T. Ohta, M. Yashuhara, K. Suzuki, and K. Yamamoto, Nano. Lett. 4(11) (2004) 2163-2169.
70. S. J. Clarke, C. A. Hollmann, Z. Zhang, D. Suffern, S. E. Bradforth, N. M. Dimitrijevic, W. G. Minarik, and J. L. Nadeau, Nat. Mater. 5(5) (2006) 409-417.