Two-dimensional nonlinear optical activity spectroscopy of coupled multi-chromophore system

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 10, Issue 26, 2008, Pages 3839-3856

  Choi, Jun Ho ^a   Cheon, Sangheon ^a   Lee, Hochan ^a   Cho, Minhaeng ^a,b  

^a Korea University   (South Korea)

^b Korea Basic Science Institute (KBSI)   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PEPTIDE;

CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; ELECTRON; MAGNETISM; METHODOLOGY; NONLINEAR SYSTEM; REVIEW; SPECTROSCOPY;

COMPUTER SIMULATION; ELECTRONS; MAGNETICS; NONLINEAR DYNAMICS; PEPTIDES; SPECTRUM ANALYSIS;

EID: 46149111931     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b719263k     Document Type: Review

References (119)

1. P. Hamm M. Lim R. M. Hochstrasser J. Phys. Chem. B 1998 102 6123 6138
2. C. Fang J. Wang Y. S. Kim A. K. Charnley W. Barber-Armstrong A. B. Smith III S. M. Decatur R. M. Hochstrasser J. Phys. Chem. B 2004 108 10415 10427
3. P. Hamm M. Lim W. F. DeGrado R. M. Hochstrasser Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 2036 2041
4. N. Demirdoven C. M. Cheatum H. S. Chung M. Khalil J. Knoester A. Tokmakoff J. Am. Chem. Soc. 2004 126 7981 7990
5. C. Kolano J. Helbing M. Kozinski W. Sander P. Hamm Nature 2006 444 469
6. A. T. Krummel P. Mukherjee M. T. Zanni J. Phys. Chem. B 2003 107 9165 9169
7. A. T. Krummel M. T. Zanni J. Phys. Chem. B 2006 110 13991 14000
8. H. Maekawa C. Toniolo A. Moretto Q. B. Broxterman N.-H. Ge J. Phys. Chem. B 2006 110 5834 5837
9. P. Mukherjee I. Kass I. T. Arkin M. T. Zanni J. Phys. Chem. B 2006 110 24740 24749
10. S. Woutersen P. Hamm J. Chem. Phys. 2001 115 7737 7743
11. M. L. Cowan B. D. Bruner N. Huse J. R. Dwyer B. Chugh E. T. J. Nibbering T. Elsaesser R. J. D. Miller Nature 2005 434 199 202
12. J. D. Eaves J. J. Loparo C. J. Fecko S. T. Roberts A. Tokmakoff P. L. Geissler Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 13019 13022
13. Y. S. Kim R. M. Hochstrasser Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 11185 11190
14. J. Zheng K. Kwak J. B. Asbury X. Chen I. Piletic M. D. Fayer Science 2005 309 1338 1343
15. J. Zheng K. Kwak X. Chen J. B. Asbury M. D. Fayer J. Am. Chem. Soc. 2006 128 2977 2987
16. N. Huse B. D. Bruner M. L. Cowan J. Dreyer E. T. J. Nibbering R. J. D. Miller T. Elsaesser Phys. Rev. Lett. 2005 95 147402
17. T. Brixner J. Stenger H. M. Vaswani M. Cho R. E. Blankenship G. R. Fleming Nature 2005 434 625 628
18. M. Cho H. M. Vaswani T. Brixner J. Stenger G. R. Fleming J. Phys. Chem. B 2005 109 10542 10556
19. X. Li T. Zhang C. N. Borca S. T. Cundiff Phys. Rev. Lett. 2006 96 057406
20. T. Zhang C. N. Borca X. Li S. T. Cundiff Opt. Express 2005 13 7432 7441
21. M. Cho Nature 2006 444 431
22. M. Cho Bull. Korean Chem. Soc. 2006 27 1940 1960
23. M. Cho J. Chem. Phys. 2002 116 1562 1570
24. S. Cheon M. Cho Phys. Rev. A 2005 71 013808
25. S. Cheon H. Lee J.-H. Choi M. Cho J. Chem. Phys. 2007 126 054505
26. J.-H. Choi S. Cheon M. Cho Chem. Phys. 2007 337 81 92
27. M. Cho J. Chem. Phys. 2003 119 7003 7016
28. J.-H. Choi M. Cho J. Chem. Phys. 2007 127 024507
29. J.-H. Choi M. Cho Chem. Phys. 2007 341 57 70
30. J.-H. Choi M. Cho J. Phys. Chem. A 2007 111 5176 5184
31. Y. R. Shen, The Principle of Nonlinear Optics, Wiley, New York, 1984
32. G. L. Richmond Chem. Rev. 2002 102 2693 2724
33. K. B. Eisenthal Chem. Rev. 1996 96 1343 1360
34. Z. Chen Y. R. Shen G. A. Somorjai Annu. Rev. Phys. Chem. 2002 53 437 465
35. P. Guyot-Sionnest J. H. Hunt Y. R. Shen Phys. Rev. Lett. 1987 59 1597
36. Y. R. Shen Nature 1989 337 519 525
37. M. A. Belkin S. H. Han X. Wei Y. R. Shen Phys. Rev. Lett. 2001 87 113001
38. M. A. Belkin T. A. Kulakov K.-H. Ernst L. Yan Y. R. Shen Phys. Rev. Lett. 2000 85 4474
39. M. A. Belkin Y. R. Shen Phys. Rev. Lett. 2003 91 213907
40. M. A. Belkin Y.-R. Shen R. A. Harris J. Chem. Phys. 2004 120 10118 10126
41. N. Ji V. Ostroverkhov F. Lagugne-Labarthet Y.-R. Shen J. Am. Chem. Soc. 2003 125 14218 14219
42. N. Ji Y. R. Shen J. Am. Chem. Soc. 2004 126 15008 15009
43. N. Ji K. Zhang H. Yang Y.-R. Shen J. Am. Chem. Soc. 2006 128 3482 3483
44. J. A. Giordmaine Phys. Rev. 1965 138 1599
45. F.-C. Liu A. D. Buckingham Chem. Phys. Lett. 1993 207 325 331
46. P. Fischer D. S. Wiersma R. Righini B. Champagne A. D. Buckingham Phys. Rev. Lett. 2000 85 4253
47. P. Fischer F. Hache Chirality 2005 17 421 437
48. D. K. Hore D. K. Beaman D. H. Parks G. L. Richmond J. Phys. Chem. B 2005 109 16846 16851
49. X. Chen J. Wang J. J. Sniadecki M. A. Even Z. Chen Langmuir 2005 21 2662 2664
50. X. Chen J. Wang A. P. Boughton C. B. Kristalyn Z. Chen J. Am. Chem. Soc. 2007 129 1420 1427
51. J. Wang M. A. Even X. Chen A. H. Schmaier J. H. Waite Z. Chen J. Am. Chem. Soc. 2003 125 9914 9915
52. J. Liu J. C. Conboy J. Phys. Chem. C 2007 111 8988 8999
53. J. Liu J. C. Conboy J. Am. Chem. Soc. 2004 126 8894 8895
54. A. N. Bordenyuk C. Weeraman A. Yatawara H. D. Jayathilake I. Stiopkin Y. Liu A. V. Benderskii J. Phys. Chem. C 2007 111 8925 8933
55. C. Weeraman A. K. Yatawara A. N. Bordenyuk A. V. Benderskii J. Am. Chem. Soc. 2006 128 14244 14245
56. J. A. McGuire Y. R. Shen Science 2006 313 1945 1948
57. M. Smits A. Ghosh M. Sterrer M. Muller M. Bonn Phys. Rev. Lett. 2007 98 098302
58. A. Ghosh M. Smits J. Bredenbeck M. Bonn J. Am. Chem. Soc. 2007 129 9608 9609
59. M. Cho J. Chem. Phys. 2000 112 9978 9985
60. A. Camara-Artigas R. E. Blankenship J. P. Allen Photosynth. Res. 2003 75 49 55
61. R. E. Fenna B. W. Matthews Nature 1975 258 573 577
62. Y.-F. Li W. Zhou R. E. Blankenship J. P. Allen J. Mol. Biol. 1997 271 456 471
63. B. W. Matthews R. E. Fenna Acc. Chem. Res. 1980 13 309 317
64. B. W. Matthews R. E. Fenna M. C. Bolognesi M. F. Schmid J. M. Olson J. Mol. Biol. 1979 131 259 285
65. D. E. Tronrud M. F. Schmid B. W. Matthews J. Mol. Biol. 1986 188 443 454
66. J. Sung R. J. Silbey M. Cho J. Chem. Phys. 2001 115 1422 1428
67. S. Mukamel, Principles of Nonlinear Optical Spectroscopy, Oxford University Press, Oxford, 1995
68. D. P. Craig and T. Thirunamachandran, Molecular Quantum Electrodyanmics: An Introduction to Radiation Molecule Interactions, Dover Publications, Inc., New York, 1998
69. D. L. Andrews T. Thirunamachandran J. Chem. Phys. 1977 67 5026 5033
70. R. Loudon, The quantum theory of light, Clarendon Press, Oxford, 1983
71. T. Brixner I. V. Stiopkin G. R. Fleming Opt. Lett. 2004 29 884 886
72. D. M. Jonas Annu. Rev. Phys. Chem. 2003 54 425 463
73. M. T. Zanni N.-H. Ge Y. S. Kim R. M. Hochstrasser Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 11265 11270
74. D. Abramavicius S. Mukamel J. Chem. Phys. 2005 122 134305
75. D. Abramavicius S. Mukamel J. Chem. Phys. 2006 124 034113
76. E. Chen Y. Wen J. W. Lewis R. A. Goldbeck D. S. Kliger C. E. M. Strauss Rev. Sci. Instrum. 2005 76 083120
77. R. A. Goldbeck D. B. Kim-Shapiro D. S. Kliger Annu. Rev. Phys. Chem. 1997 48 453 479
78. D. B. Shapiro R. A. Goldbeck D. Che R. M. Esquerra S. J. Paquette D. S. Kliger Biophys. J. 1995 68 326 334
79. X. Xie J. D. Simon J. Opt. Soc. Am. B 1990 7 1673 1684
80. S. Hahn S. Ham M. Cho J. Phys. Chem. B 2005 109 11789 11801
81. S. Ham S. Hahn C. Lee T. K. Kim K. Kwak M. Cho J. Phys. Chem. B 2004 108 9333 9345
82. J.-H. Choi S. Hahn M. Cho Biopolymers 2006 83 519 536
83. J.-H. Choi S. Hahn M. Cho Int. J. Quantum Chem. 2005 104 616 634
84. J.-H. Choi H. Lee K.-K. Lee S. Hahn M. Cho J. Chem. Phys. 2007 126 045102
85. G. R. Fleming M. Cho Annu. Rev. Phys. Chem. 1996 47 109 134
86. W. P. de Boeij M. S. Pshenichnikov D. A. Wiersma Annu. Rev. Phys. Chem. 1998 49 99 123
87. M. Cho G. R. Fleming J. Chem. Phys. 1993 98 2848 2859
88. P. Vohringer D. C. Arnett R. A. Westervelt M. J. Feldstein N. F. Scherer J. Chem. Phys. 1995 102 4027 4036
89. W. M. Zhang T. Meier V. Chernyak S. Mukamel J. Chem. Phys. 1998 108 7763 7774
90. P. W. Higgs Proc. R. Soc. London, Ser. A 1953 220 472
91. T. Miyazawa J. Chem. Phys. 1960 32 1647 1652
92. J. Wang R. M. Hochstrasser Chem. Phys. 2004 297 195 219
93. D. Marsh M. Muller F.-J. Schmitt Biophys. J. 2000 78 2499 2510
94. S.-H. Lee S. Krimm Biopolymers 1998 46 283 317
95. S.-H. Lee S. Krimm J. Raman Spectrosc. 1998 29 73 80
96. R. A. Gangani D. Silva S. C. Yasui J. Kubelka F. Formaggio M. Crisma C. Toniolo T. A. Keiderling Biopolymers 2002 65 229 243
97. S. Hahn K. Kwak M. Cho J. Chem. Phys. 2000 112 4553 4556
98. C. Paul J. Wang W. C. Wimley R. M. Hochstrasser P. H. Axelsen J. Am. Chem. Soc. 2004 126 5843 5850
99. J. J. Balbach Y. Ishii O. N. Antzutkin R. D. Leapman N. W. Rizzo F. Dyda J. Reed R. Tycko Biochemistry 2000 39 13748 13759
100. S. A. Petty S. M. Decatur J. Am. Chem. Soc. 2005 127 13488 13489
101. S. M. Decatur Acc. Chem. Res. 2006 39 169 175
102. K. Tenidis M. Waldner J. Bernhagen W. Fischle M. Bergmann M. Weber M.-L. Merkle W. Voelter H. Brunner A. Kapurniotu J. Mol. Biol. 2000 295 1055 1071
103. C. Lee M. Cho J. Phys. Chem. B 2004 108 20397 20407
104. S. Hahn S.-S. Kim C. Lee M. Cho J. Chem. Phys. 2005 123 084905
105. W. K. Surewicz H. H. Mantsch D. Chapman Biochemistry 1993 32 389 394
106. P. I. Haris D. Chapman Biopolymers 1995 37 251 263
107. C. M. Cheatum A. Tokmakoff J. Knoester J. Chem. Phys. 2004 120 8201 8215
108. J. Kubelka T. A. Keiderling J. Am. Chem. Soc. 2001 123 12048 12058
109. J. Kubelka T. A. Keiderling J. Am. Chem. Soc. 2001 123 6142 6150
110. S. Krimm Y. Abe Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1972 69 2788 2792
111. S. Krimm J. Bandekar Adv. Protein Chem. 1986 38 181 364
112. J.-H. Choi M. Cho J. Chem. Phys. 2004 120 4383 4392
113. J.-H. Choi J.-S. Kim M. Cho J. Chem. Phys. 2005 122 174903
114. R. Huang J. Kubelka W. Barber-Armstrong R. A. G. D. Silva S. M. Decatur T. A. Keiderling J. Am. Chem. Soc. 2004 126 2346 2354
115. K. A. Bolin G. L. Millhauser Acc. Chem. Res. 1999 32 1027 1033
116. R. N. De Guzman Z. R. Wu C. C. Stalling L. Pappalardo P. N. Borer M. F. Summers Science 1998 279 384 388
117. Y. Hashimoto K. Kohri Y. Kaneko H. Morisaki T. Kato K. Ikeda M. Nakanishi J. Biol. Chem. 1998 273 16544 16550
118. J.-E. Shea C. L. Brooks III Annu. Rev. Phys. Chem. 2001 52 499 535
119. G. S. Engel T. R. Calhoun E. L. Read T.-K. Ahn T. Mancal Y.-C. Cheng R. E. Blankenship G. R. Fleming Nature 2007 446 782 786