Coherent two-dimensional optical spectroscopy

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 27, Issue 12, 2006, Pages 1940-1960

  Cho, Minhaeng ^a  

^a Korea University   (South Korea)

Author keywords

Molecular dynamics; Protein dynamics; Two dimensional spectroscopy

Indexed keywords

AMINO ACIDS; ELECTRIC EXCITATION; ELECTRON TRANSITIONS; ELECTRONIC STRUCTURE; MATHEMATICAL MODELS; MOLECULAR SPECTROSCOPY; MOLECULAR VIBRATIONS; PROTEINS;

ELECTRONIC SPECTROSCOPY; OPTICAL SPECTROSCOPY; PROTEIN DYNAMICS; TWO DIMENSIONAL SPECTROSCOPY;

COHERENT LIGHT;

EID: 33845792857     PISSN: 02532964     EISSN: 12295949     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2006.27.12.1940     Document Type: Article

References (61)

1. Hamm, P.; Lim, M.; DeGrado, W. F.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 2036.
2. Khalil, M.; Demirdöven, N.; Tokmakoff, A. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5258.
3. Woutersen, S.; Hamm, P. J. Phys. Cond. Matt. 2002, 14, R1035.
4. Wright, J. C. Int. Rev. Phys. Chem. 2002, 21, 185.
5. Cho, M. In Advances in Multi-photon Processes and Spectroscopy; Lin, S. H.; Villaeys, A. A.; Fujimura, Y., Eds.; World Scientific: Singapore, 1999; Vol. 12, p 229.
6. Mukamel, S. Annu. Rev. Phys. Chem. 2000, 51, 691.
7. Jonas, D. M. Anna. Rev. Phys. Chem. 2003, 54, 425.
8. Kwac, K.; Cho, M. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5903.
9. Woutersen, S.; Mu, Y; Stock, G.; Hamm, P. Chem. Phys. 2001, 266, 137.
10. Kwac, K.; Lee, H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2004, 120, 1477.
11. Kwac, K.; Cho, M. J. Raman Spectrosc. 2005, 36, 326.
12. Kim, Y S.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 11185.
13. Zheng, J.; Kwak, K.; Asbury, J.; Chen, X.; Piletic, I. R.; Fayer, M. D. Science 2005, 309, 1338.
14. Brixner, T.; Stenger, J.; Vaswami, H.; Cho, M.; Blankenship, E.; Fleming, G. R. Nature 2005, 434, 625.
15. Wuthrich, K. NMR of Proteins and Nucleic Acids; Wiley-Interscience: New York, 1986.
16. Ernst, R.; Bodenhausen, G; Wokaun, A. Principles of Nuclear Magnetic Resonance in One and Two Dimensions; Clarendon: Oxford, 1987.
17. Sanders, J. K. M.; Hunter, B. K. Modern NMR Spectroscopy, Oxford University Press: New York, 1994.
18. Cho, M.; Vaswani, H. M.; Brixner, T.; Stenger, J.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10542.
19. Cho, M.; Brixner, T.; Stiopkin, I.; Vaswani, H.; Fleming, G. R. J. Chinese Chem. Soc. 2006, 53, 15.
20. Cho, M. PhysChemComm. 2002, 5, 40.
21. Cho, M. J. Chem. Phys. 2002, 116, 1562.
22. Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 7003.
23. Cheon, S.; Cho, M. Phys. Rev. A 2005, 71, 013808.
24. Fleming, G. R.; Cho, M. Annu. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 103.
25. Wiersma, D. A.; de Boeij, W. P.; Pshenichnikov, M. S. Annu. Rev. Phys. Chem. 1998, 49, 99.
26. Mukamel, S. Principles of Nonlinear Optical Spectroscopy; Oxford University Press: New York, 1995.
27. Sung, J.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2000, 113, 7072.
28. Sung, J.; Silbey, R. J.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 1422.
29. Cho, M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 4424.
30. Zhang, W. M.; Meier, T.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 1998, 108, 7763.
31. (a) Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1999, 110, 2983.
32. (b) Agarwal, R.; Prall, B. S.; Rizvi, A. H.; Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2002, 116, 6243.
33. (c) Prall, B. S.; Parkinson, D. Y.; Fleming, G. R.; Yang, M.; Ishikawa, N. J. Chem. Phys. 2004, 120, 2537.
34. Kobayashi, T. J-aggregates; World Scientific: Singapore, 1996.
35. Cho, M.; Yu, J.-Y; Joo, T.; Nagasawa, Y.; Passino, S. A.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11944.
36. Cho, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2005, 123, 114506.
37. Ham, S.; Kim, J.-H.; Lee, H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 3491.
38. Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 3480.
39. Eaton, G.; Symons, M. C. R. J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1989, 85, 3257.
40. Kwac, K.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2247.
41. Woutersen, S.; Pfister, R.; Hamm, P.; Mu, Y. G.; Kosov, D. S.; Stock, G. J. Chem. Phys. 2002, 117, 6833.
42. Zanni, M. T.; Asplund, M. C.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 2001, 114, 4579.
43. DeCamp, M. F.; DeFlores, L.; McCracken, J. M.; Tokmakoff, A.; Kwac, K.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 11016.
44. Kwac, K.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2256.
45. Infrared Spectroscopy of Biomolecules; Manisch, H. H.; Chapman, D., Eds.; Wiley-Liss: New York, 1996.
46. Infrared and Raman Spectroscopy of Biological Materials; Gremlich, H.-U.; Yan, B., Eds.; Marcel Dekker: New York, 2000.
47. Circular Dichroism: Principles and Applications; Berova, N.; Nakanishi, K.; Woody, R. W., Eds.; Wiley-Liss: New York, 2000.
48. Eker, F.; Griebenow, K.; Schweitzer-Stenner, R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8178.
49. Han, W.-G.; Jalkanen, K. J.; Elstner, M.; Suhai, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2587.
50. Drozdov, A. N.; Grossfield, A.; Pappu, R. V. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2574.
51. Zanni, M. T.; Gnanakaran, S.; Stenger, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6520.
52. Ge, N.-H.; Zanni, M. T.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 962.
53. Rubtsov, I. V.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 9165.
54. Hahn, S.; Lee, H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2004, 121, 1849.
55. Lee, K.-K.; Hahn, S.; Oh, K.-I.; Choi, J. S.; Joo, C.; Lee, H.; Han, H.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2006, in press.
56. Ham, S.; Hahn, S.; Lee, C.; Kim, T.-K.; Kwak, K.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 9333.
57. Woutersen, S.; Hamm, P. J. Chem. Phys. 2001, 115, 7737.
58. Choi, J. H.; Hahn, S.; Cho, M. Int. J. Quantum Chem. 2005, 104, 616.
59. Hahn, S.; Ham, S.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 11789.
60. Lee, C.; Cho, M. J. Phys. Chem. B2004, 108, 20397.
61. Hahn, S.; Kim, S.-S.; Lee, C.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2005, 123, 084905.