Charge separation in a ruthenium-quencher conjugate bound to DNA

Inorganic Chemistry

Volumn 46, Issue 22, 2007, Pages 9337-9350

  Augustyn, Katherine E ^a   Stemp, E D A ^a,b   Barton, Jacqueline K ^a  

^a California Institute of Technology   (United States)

^b Mount St Mary's College   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; RUTHENIUM;

ARTICLE; CHEMISTRY; ELECTRON SPIN RESONANCE; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; KINETICS; MASS SPECTROMETRY;

DNA; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; KINETICS; RUTHENIUM; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 35848964088     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic701276t     Document Type: Article

References (65)

1. Delaney, S.; Barton, J. K. J. Org. Chem. 2003, 68, 6475-6483.
2. Schuster, G. B. Acc. Chem. Res. 2000, 33, 253-260.
3. Giese, B. Annu. Rev. Biochem. 2002, 71, 51-70.
4. Lewis, F. D.; Letsinger, R. L.; Wasielewski, M. R. Acc. Chem. Res. 2001, 34, 159-170.
5. Kawai, K.; Takada, T.; Tojo, S.; Ichinose, N.; Majima, T. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12688-12689.
6. Nuñez, M. E.; Hall, D. B.; Barton, J. K. Chem. Biol. 1999, 6, 85-97.
7. Ly, D.; Sanii, L.; Schuster, G. B. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9400-9410.
8. Kelley, S. O.; Barton, J. K. Radical Metal Ions Biol. 1999, 35, 211-249.
9. Wiseman, H.; Halliwell, B. Biochem. J. 1996, 313, 17-29.
10. Ames, B. N.; Shigenaga, M. K.; Hagen, T. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 7915-7922.
11. Steenken, S.; Jovanovic, S. V. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 617-618.
12. (a) Candeias, L.; Steenken, S. Chem. - Eur. J. 2000, 6, 475-484.
13. (b) Steenken, S. Free Radical Res. Commun. 1992, 16, 349.
14. (c) Shafiovich, V.; Cadet, J.; Gasparutto, D.; Dourandin, A.; Huang, W.; Geacintov, N. E. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 586.
15. Williams, T. T.; Dohno, C.; Stemp, E. D. A.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8148-8158.
16. Kawai, K.; Kimura, T.; Kawabata, K.; Tojo, S.; Majima, T. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 12838-12841.
17. Takada, T.; Kawai, K.; Tojo, S.; Majima, T. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 4052-12057.
18. Lewis, F. D.; Liu, X.; Liu, J.; Miller, S. E.; Hayes, T. R.; Wasielewski, M. R. Nature 2000, 406, 51-53.
19. Nguyen, K. L.; Steryo, M.; Kurbanyan, K.; Nowitzki, K. M.; Butterfield, S. M.; Ward, S. R.; Stemp, E. D. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3585-3594.
20. Augustyn, K. E.; Pierre, V. C.; Barton, J. K. Wiley Encylopedia Chem. Biol. 2007, in press.
21. (a) Erkkila, K. E.; Odom, D. T.; Barton, J. K. Chem. Rev. 1999, 99, 2777-2795.
22. (b) Arkin, M. R.; Stemp, E. D. A.; Pulver, S. C.; Barton, J. K. Chem. Biol. 1997, 4, 389-400.
23. (c) Hall, D. B.; Holmlin, R. E.; Barton, J. K. Nature 1996, 382, 731-735.
24. Shao, F.; Augustyn, K. E.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17445-17452.
25. (a) Nakatani, K.; Dohno, C.; Saito, I. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9681-9682.
26. (b) O'Neill, M. A.; Dohno, C.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1316-1317.
27. Shao, F.; O. Neill, M. A.; Barton, J. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 17914-17919.
28. Musa, O. M.; Horner, J. H.; Shahin, H.; Newcomb, M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3862-3868.
29. Stemp, E. D. A.; Arkin, M. R.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2921-2925.
30. Chang, J. I.; Gray, B. H.; Winkler, J. R. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 7056-7057.
31. Dunn, D. A.; Lin, V. H.; Kochevar, I. E. Biochemistry 1992, 31, 11620-11625.
32. Pascaly, M.; Yoo, J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9083-9092.
33. Yoo, J.; Delaney, S.; Stemp, E. D. A.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6640-6641.
34. Fu, P. K. L.; Bradley, P. M.; van Loyen, D.; Heinz, D.; Bossmann, S. H.; Turro, C. Inorg. Chem. 2002, 41, 3808-3810.
35. Duan, C-Y.; Lu, Z. L.; You, X-Z.; Zhou, Z-Y.; Mak, T. C. W.; Luo, Q.; Zhou, J-Y. Polyhedron 1998, 17, 4131-4138.
36. Opperman, K. A.; Mecklenburg, S. L.; Meyer, T. J. Inorg. Chem. 1994, 33, 5295-5301.
37. Strouse, G. F.; Anderson, P. A.; Schoonover, J. R.; Meyer, T. J.; Keene, F. R. Inorg. Chem. 1992, 31, 2618-2619.
38. Anderson, P. A.; Deacon, G. B.; Haarman, K. H.; Keene, F. R.; Meyer, T. J.; Reitsma, D. A.; Skelton, B. W.; Strouse, G. F.; Thomas, N. C.; Treadway, J. A.; White, A. H. Inorg. Chem. 1995, 34, 6145-6157.
39. Sundberg, R. J.; Gupta, G. Bioinorg. Chem. 1973, 3, 39-48.
40. Yocom, K. Ph.D. Thesis, California Institute of Technology, LOCATION, 1982.
41. Sambrook, J.; Fritsch, E. D.; Maniatis, T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed.; Cold Spring Harbor Laboratory: New York, 1989.
42. The characteristics of the guanine radical signal detected here in aqueous buffers are comparable to that found earlier using a glycerol-based cryoprotectant.
43. Copeland, K. D.; Lueras, A. M.; Stemp, E. D. A.; Barton, J. K. Biochemistry 2002, 41, 12785-12797.
44. Olson, E. J. C.; Hu, D.; Hormann, A.; Jonkman, A. M.; Arkin, M. R.; Stemp, E. D. A.; Barton, J. K.; Barbara, P. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 11458-11467.
45. Friedman, A. E.; Chambron, J. C.; Sauvage, J. P.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4960-4961.
46. Jenkins, Y.; Friedman, A. E.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Biochemistry 1992, 31, 10809-10816.
47. Hartshorn, R. M.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 5919-5925.
48. Dupureur, C. M.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1997, 36, 33-43.
49. Stemp, E. D. A.; Holmlin, R. E.; Barton, J. K. Inorg. Chim. Acta 2000, 297, 88-97.
50. Nakatani, K.; Dohno, C.; Saito, I. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9861-9862.
51. Mei, H.-Y.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 7414-7416.
52. Mei, H.-Y.; Barton, J. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 1339-1343.
53. Clarke, M. J.; Jansen, B.; Marx, K. A.; Kruger, R. Inorg. Chim. Acta. 1986, 124, 13-28.
54. Lu, W.; Vicic, D. A.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 2005, 22, 7970-7980.
55. Schiemann, O.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 7124-7220.
56. Yavin, E.; Boal, A. K.; Stemp, E. D. A.; Boon, E. M.; Livingston, A. L.; O'Shea, V. L.; David, S. S.; Barton, J. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 3546-3551.
57. Berthomieu, C.; Boussac, A. Biochemistry 1995, 34, 1541.
58. Cullis, P. M.; Malone, M. E.; Merson-Davies, L. A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2775-2781.
59. (a) Gould, I. R.; Moser, J. E.; Armitage, B.; Farid, S. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 1917-1919.
60. (b) Marcus, R. A. J. Phys. Chem. 1956, 24, 966-978.
61. D'angelantonio, M.; Mulazzani, Q. G.; Venturi, M.; Ciano, M.; Hoffman, M. Z. J. Phys. Chem. 1991, 95, 5121-5129.
62. Fees, J.; Ketterle, M.; Klein, A.; Fiedler, J.; Kaim, W. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1999, 2595-2599.
63. Fees, J.; Kaim, W.; Moscherosch, M.; Matheis, W.; Klima, J.; Krejcik, M.; Zalis, S. Inorg. Chem. 1993, 32, 166-174.
64. Arkin, M. R.; Stemp, E. D. A.; Turro, C.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2267-2274.
65. Iwunze, M. O. Bull. Electrochem. 2005, 21, 555-560.