Oxidation of guanine in double-stranded DNA by [Ru(bpy)2dppz] Cl2 in cationic reverse micelles

Inorganic Chemistry

Volumn 46, Issue 20, 2007, Pages 8349-8361

  Evans, Sarah E ^a   Grigoryan, Armine ^a   Szalai, Veronika A ^a  

^a UNIVERSITY OF MARYLAND BALTIMORE COUNTY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; GUANINE; RUTHENIUM DERIVATIVE;

ARTICLE; CHEMISTRY; CIRCULAR DICHROISM; MICELLE; NUCLEOTIDE SEQUENCE; OXIDATION REDUCTION REACTION; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS;

BASE SEQUENCE; CIRCULAR DICHROISM; DNA; ELECTROPHORESIS, POLYACRYLAMIDE GEL; GUANINE; MICELLES; OXIDATION-REDUCTION; RUTHENIUM COMPOUNDS;

EID: 35348885455     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic0700708     Document Type: Article

References (83)

1. Burrows, C. J.; Muller, J. G. Chem. Rev. 1998, 98, 1109.
2. Armitage, B. Chem. Rev. 1998, 98, 1171.
3. Steenken, S. Chem. Rev. 1989, 89, 503.
4. Steenken, S.; Jovanovic, S. V. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 617.
5. Stemp, E. D.; Arkin, M. R.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2921.
6. Barton, J. K. J. Biomol. Struct. Dyn. 1983, 1, 621.
7. Kumar, C. V.; Barton, J. K.; Turro, N. J. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 5518.
8. Lincoln, P.; Broo, A.; Norden, B. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2644.
9. Ruba, E.; Hart, J. R.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 2004, 43, 4570.
10. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1993, 32, 2573.
11. Friedman, A. E.; Chambron, J.; Sauvage, J.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4960.
12. Friedman, A. E.; Kumar, C. V.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Nucleic Acids Res. 1991, 19, 2595.
13. Haq, I.; Lincoln, P.; Suh, D.; Norden, B.; Chowdhry, B. Z.; Chaires, J. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4788.
14. Chouai, A.; Wicke, S. E.; Turro, C.; Basca, J.; Dunbar, K. R.; Wang, D.; Thummel, R. P. Inorg. Chem. 2005, 44, 5996.
15. Delaney, S.; Pascaly, M.; Bhattacharya, P. K.; Han, K.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 2002, 41, 1966.
16. Cadet, J.; Berger, M.; Buchko, G. W.; Joshi, P. C.; Raoul, S.; Ravanat, J.-L. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7403.
17. Ye, Y.; Muller, J. G.; Luo, W.; Mayne, C. L.; Shallop, A. J.; Jones, R. A.; Burrows, C. J. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13926.
18. McCallum, J. E.; Kuniyoshi, C. Y.; Foote, C. S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16777.
19. Duarte, V.; Muller, J. G.; Burrows, C. J. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 496.
20. Duarte, V.; Gasparutto, D.; Jaquinod, M.; Ravanat, J.; Cadet, J. Chem. Res. Toxicol. 2001, 14, 46.
21. Zimmerman, S. B.; Trach, S. O. J. Mol. Biol. 1991, 222, 599.
22. Watanabe, K.; Iso, K. Biochemistry 1984, 23, 1376.
23. Luger, K.; Mader, A. W.; Richmond, R. K.; Sargent, D. F.; Richmond, T. J. Nature 1997, 389, 251.
24. Imre, V. E.; Luisi, P. L. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1982, 107, 538.
25. Luisi, P. L.; Giomini, M.; Pileni, M. P.; Robinson, B. H. Biochim. Biophys. Acta 1988, 947, 209.
26. Braun, C. S.; Jas, G. S.; Choosakoonkriang, S.; Koe, G. S.; Smith, J. G.; Middaugh, C. R. Biophys. J. 2003, 84, 1114.
27. Budker, V. G.; Slattum, P. M.; Monahan, S. D.; Wolff, J. A. Biophys. J. 2002, 82, 1570.
28. Osfouri, S.; Stano, P.; Luisi, P. L. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 19929.
29. Atik, S. S.; Thomas, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 4367.
30. Atik, S. S.; Thomas, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 3543.
31. Maitra, A. J. Phys. Chem. 1984, 88.
32. Pietrini, A. V.; Luisi, P. L. Biochim. Biophys. Acta 2002, 1562, 57.
33. Atik, S. S.; Thomas, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 7403.
34. Evans, S. E.; Mon, S.; Singh, R.; Ryzhkov, L. R.; Szalai, V. A. Inorg. Chem. 2006, 45, 3124.
35. Amouyal, E.; Homsi, A.; Chambron, J. C.; Sauvage, J. P. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1990, 6, 1841.
36. Sigma-Aldrich, Technical Support.
37. Borer, P. N. Handbook of Biochemistry and Molecular Biology, 3rd ed.; CRC Press: Cleveland, OH, 1975.
38. Kang, S. K.; McManus, H. J. D.; Liang, K.; Kevan, L. J. Phys. Chem. 1994, 98, 1044.
39. Hubig, S. M.; Rodgers, M. A. J. J. Phys. Chem. 1990, 94, 1933.
40. Baglioni, P.; Nakamura, H.; Kevan, L. J. Phys. Chem. 1991, 95, 3856.
41. Nakamura, H.; Baglioni, P.; Kevan, L. J. Phys. Chem. 1991, 95, 1480.
42. Jahn, W.; Strey, R. J. Phys. Chem. 1988, 92, 2294.
43. Maniatis, T.; Fritsch, E. F.; Sambrook, J. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed.; Cold Spring Harbor Press: Plainview, NY, 1989.
44. Szalai, V. A.; Thorp, H. H. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 4524.
45. Sambrook, J.; Russell, D. W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed.; Cold Spring Harbor Laboratory Press: Cold Spring Harbor, New York, 2001; Vol. 2.
46. Plum, G. E. Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry; Wiley & Sons: New York, 2000, p 7.3.1.
47. Hartshorn, R. M.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 5919.
48. Arkin, M. R.; Stemp, E. D.; Holmlin, R. E.; Barton, J. K.; Hormann, A.; Olson, E. J.; Barbara, P. F. Science 1996, 273, 475.
49. Nair, R. B.; Cullum, B. M.; Murphy, C. J. Inorg. Chem. 1997, 36, 962.
50. Yun, B. H.; Kim, J.-O.; Lee, B. W.; Lincoln, P.; Norden, B.; Kim, J.; Kim, S. K. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9858.
51. Ardhammar, M.; Norden, B.; Kurucsev, T. In Circular Dichroism: Principles and Applications, 2nd ed.; Berova, N., Nakanishi, K., Woody, R. W., Eds.; Wiley & Sons: New York, NY, 2000; p 741.
52. Brahms, J.; Mommaerts, W. F. J. Mol. Biol. 1964, 10, 73.
53. Juris, A.; Gandolfi, M. T.; Manfrin, M. F.; Balzani, V. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 1047.
54. Atik, S. S.; Thomas, J. K. J. Phys. Chem. 1981, 85, 3921.
55. Schiemann, O.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 7214.
56. Merkel, P. B.; Kearns, D. R. J. Am. Chem. Soc. 1972, 94, 1029.
57. Merkel, P. B.; Nilsson, R.; Kearns, D. R. J. Am. Chem. Soc. 1971, 94, 1030.
58. Fleisher, M. B.; Waterman, K. C.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1986, 25, 3549.
59. Hasty, N.; Merkel, P. B.; Radlick, P.; Kearns, D. R. Tetrahedron Lett. 1972, 1, 49.
60. Hall, R. D.; Chignell, C. F. Photochem. Photobiol. 1987, 45, 459.
61. Schweitzer, C.; Schmidt, R. Chem. Rev. 2003, 103, 1685.
62. Miyamoto, S.; Martinez, G. R.; Medeiros, M. H. G.; Di Mascio, P. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6172.
63. Douki, T.; Martini, R.; Ravanat, J.; Turesky, R.; Cadet, J. Carcinogenesis 1997, 18, 2385.
64. Luo, W.; Muller, J. G.; Rachlin, E. M.; Burrows, C. J. Org. Lett. 2000, 2, 613.
65. Luo, W.; Muller, J. G.; Rachlin, E. M.; Burrows, C. J. Chem. Res. Toxicol. 2001, 14, 927.
66. Hergueta-Bravo, A.; Jimenez-Hernandez, M. E.; Montero, F.; Oliveros, E.; Orellana, G. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 4010.
67. Spassky, A.; Angelov, D. Biochemistry 1997, 36, 6571.
68. Ravanat, J.-L.; Di Mascio, P.; Martinez, G. R.; Medeiros, M. H. G.; Cadet, J. J. Biol. Chem. 2001, 276, 40601.
69. Muller, J. G.; Duarte, V.; Hickerson, R. P.; Burrows, C. J. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 2247.
70. Ravanat, J.; Saint-Pierre, C.; Cadet, J. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 2030.
71. Sheu, C.; Foote, C. S. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6439.
72. Shaw, G. B.; Papanikolas, J. M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6156.
73. Ikeda, N.; Yoshimura, A.; Tsushima, M.; Ohno, T. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6158.
74. Sykora, M.; Kincaid, J. R.; Dutta, P. K.; Castagnola, N. B. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 309.
75. Murov, S. L.; Carmichael, I.; Hug, G. L. Handbook of Photochemistry, 2nd ed.; Marcel Dekker: New York, 1993.
76. Cadet, J.; Ravanat, J.-L.; Martinez, G. R.; Medeiros, M. H. G.; Di Mascio, P. Photochem. Photobiol. 2006, 1219.
77. Gutierrez, M. I.; Martinez, C. G.; Garcia-Fresnadillo, D.; Castro, A. M.; Orellana, G.; Braun, A. M.; Oliveros, E. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 3397.
78. Kobayashi, K.; Tagawa, S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 10213.
79. Delaney, S.; Barton, J. K. J. Org. Chem. 2003, 68, 6475.
80. Bhattacharya, P. K.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 8649.
81. O'Neill, M. A.; Barton, J. K.; Ruba, E.; Hart, J. R.; Williams, T. T.; Dohno, C.; Stemp, E. D.; Delaney, S.; Boon, E. M.; Kisko, J. L.; Pascaly, M.; Bhattacharya, P. K.; Han, K.; Nunez, M. E.; Kelley, S. O.; Hall, D. B.; Lim, A. C.; Arkin, M. R.; Pulver, S. C.; Holmlin, R. E.; Hormann, A.; Olson, E. J.; Barbara, P. F.; Murphy, C. J.; Jenkins, Y.; Friedman, A. E.; Turro, N. J.; Chow, C. S.; Kirsch-De Mesmaeker, A.; Orellana, G. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 13234.
82. LaMarr, W. A.; Sandman, K. M.; Reeve, J. N.; Dedon, P. C. Chem. Res. Toxicol. 1997, 10, 1118.
83. Liang, Q.; Dedon, P. C. Chem. Res. Toxicol. 2001, 14, 416.