Simultaneous Binding of Ruthenium(II) [(1,10-Phenanthroline) 2dipyridophenazine]2+ and Minor Groove Binder 4′,6-Diamidino-2-Phenylindole to Poly[d(A-T)2] at High Binding Densities: Observation of Fluorescence Resonance Energy Trasfer Across the DNA Stem

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 36, 2003, Pages 9858-9864

  Yun, Byeong Hwa ^a   Kim, Jin Ok ^a   Lee, Bae Wook ^a   Lincoln, Per ^b   Nordén, Bengt ^b   Kim, Jong Moon ^c   Kim, Seog K ^a  

^a Yeungnam University   (South Korea)

^b CHALMERS UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Sweden)

^c Pohang University of Science and Technology (POSTECH)   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION; DNA; ENERGY TRANSFER; FLUORESCENCE; RUTHENIUM;

CIRCULAR DICHROISM (CD);

ORGANOMETALLICS;

EID: 0141903440     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp027828n     Document Type: Article

References (51)

1. Nordén, B.; Lincoln, P.; Åkerman, B.; Tuite, E. In Metal Ions in Biological System; Sigel, A., Sigel, H., Eds.; Marcel Dekker: New York 1996; pp 177-252.
2. Barton, J. K.; Danishefsky, A. T.; Goldberg, J. M. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 2172-2176.
3. Barton, J. K. Science 1986, 233, 727-734.
4. Härd, T.; Hirot, C.; Nordén, B. J. Biomol. Struct. Dynam. 1987, 5, 89-96.
5. Mei, H.-Y.; Barton, J. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 1339-1343.
6. Naing, K.; Takahashi, M.; Taniguchi, M.; Yamagishi, A. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1993, 402-403.
7. Chow, C. S.; Barton, J. K. Methods Enzymol. 1992, 212, 217-242.
8. Feeney, M. M.; Kelly, J. M.; Tossi, A. B.; Kirsch-De Mesmaeker, A.; Lecomte, J.-P. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 1994, 23, 69-78.
9. Sentagne, C.; Chambron, J.-C.; Sauvage, J.-P.; Paillous, N. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 1994, 26, 165-174.
10. Bannwarth, W.; Scimit, D.; Stallard, R. L.; Hornung, C.; Knorr, R.; Müller, F. Helv. Chim. Acta 1988, 71, 2085-2099.
11. Bannwarth, W. Anal. Biochem. 1989, 181, 216-219.
12. Freidman, A. E.; Chambron, J.-C.; Sauvage, J.-P.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4960-4962.
13. Jenkins, Y.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 8736-8738.
14. Xu, X.-H.; Bard, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2627-2631.
15. Barton, J. K.; Kumar, C. V.; Turro, N. J. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 6391-6393.
16. Purugganan, M. D.; Kumar, C. V.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Science 1988, 241, 1645-1649.
17. Kirsch-De Mesmaeker, A.; Orellana, G.; Barton, J. K.; Turro, N. J. Photochem. Photobiol. 1990, 52, 461-472.
18. Orellana, G.; Kirsch-De Mesmaeker, A.; Barton, J. K.; Turro, N. J. Photochem. Photobiol. 1991, 54, 499-509.
19. Lecomte, J.-P.; Kirsch-De Mesmaeker, A.; Kelly, J. M.; Tossi, A.; Görner, H. Photochem. Photobiol. 1992, 55, 681-689.
20. Murphy, C. J.; Arkin, M. R.; Jenkins, Y.; Ghatlia, N. D.; Bossmann, S. H.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Science 1993, 262, 1025-1029.
21. Murphy, C. J.; Arkin, M. R.; Ghatlia, N. D.; Bossmann, S. H.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 5315-5319.
22. Stemp, E. D. A.; Arkin, M. R.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2375-2376
23. Arkin, M. R.; Stemp, E. D. A.; Turro, C.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2267-2274.
24. Dandliker, P. J.; Nunez, M. E.; Barton, J. K. Biochemistry 1988, 27, 6491-6502.
25. Barton, J. K. Pure Appl. Chem. 1998, 70, 873-879.
26. Rehmann, J. P.; Barton, J. K. Biochemistry 1990, 29, 1701-1709.
27. Haworth, I. S.; Elcock, A. H.; Freeman, J.; Rodger, A.; Richards, W. G. J. Biomol. Struct. Dynam. 1987, 5, 89-96.
28. Eriksson, M.; Leijon, M.; Hirot, C.; Nordén, B.; Gräslund, A. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4933-4934.
29. Eriksson, M.; Leijon, M.; Hirot, C.; Nordén, B.; Gräslund, A. Biochemistry 1994, 33, 5031-5040.
30. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1992, 31, 9319-9324.
31. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1992, 32, 2573-2584.
32. Lincoln, P.; Nordén, B. J. Phys. Chem. 1998, 102, 9583-9594.
33. Wilhelmsson, L. M.; Westerlund, F.; Lincoln, P.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 12092-12093.
34. Jenkins, Y.; Freidman, A. E.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Biochemistry 1992, 31, 10809-10816.
35. Hiort, C.; Linclon, P.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 3448-3454.
36. Dupureur, C. M.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10286-10287.
37. Haq, I.; Lincoln, P.; Suh, D.; Norden, B.; Chowdhry, B. Z.; Chaires, J. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4788-4796.
38. Lincoln, P.; Broo, A.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2644-2653.
39. Choi, S.-D.; Kim, M.-S.; Kim, S. K.; Lincoln, P.; Tuite, E.; Nordén, B. Biochemistry 1997, 36, 214-223.
40. Tuite, E.; Lincoln, P.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 239-240.
41. Greguric, A.; Greguric, I. D.; Hambley, T. W.; Aldrich-Wright, J. R.; Collins, J. G. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 2002, 849-855.
42. Collins, J. G.; Aldrich-Wright, J. R.; Greguric, I. D.; Pellegrini, P. A. Inorg. Chem. 1999, 38, 5502-5509.
43. Holmlin, R. E.; Stemp, E. D. A.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1998, 37, 29-34.
44. Eriksson, S.; Kim, S. K.; Kubista, M.; Nordén, B. Biochemistry 1993, 32, 2987-2998.
45. Kim, H.-K.; Kim, J.-M.; Kim, S. K.; Rodger, A.; Nordén, B. Biochemistry 1996, 35, 1187-1194.
46. Nordén, B.; Kubista, M.; Kurucsev, T. Q. Rev. Biophys. 1992, 25, 51-170.
47. Nordén, B.; Kurucsev, T. J. Mol. Recognit. 1994, 7, 141-156.
48. Nordén, B.; Seth, S. Appl. Spectrosc. 1985, 39, 647-655.
49. Le Pecq, J. B.; Paoletti, C. J. Mol. Biol. 1967, 29, 87-106.
50. Sehlstedt, U.; Kim, S. K.; Carter, P.; Goodisman, J.; Vollano, J. F.; Nordén, B.; Dabrowiak, J. C. Biochemistry 1994, 33, 417-416.
51. Hyun, K.-M.; Choi, S.-D.; Lee, S.; Kim, S. K. Biochim. Biophys. Acta 1997, 1334, 312-316.