-
1
-
-
27944493925
-
-
Albert, R., J. Cell. Sci. 2005, 118, 4947-4957.
-
(2005)
J. Cell. Sci
, vol.118
, pp. 4947-4957
-
-
Albert, R.1
-
2
-
-
9444239213
-
-
Lee, I., Date, S., Adai, A., Marcotte, E., Science 2004, 306, 1555-1558.
-
(2004)
Science
, vol.306
, pp. 1555-1558
-
-
Lee, I.1
Date, S.2
Adai, A.3
Marcotte, E.4
-
3
-
-
33644527950
-
-
Joyce, A. R., Palsson, B. O., Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2006, 7, 198-210.
-
(2006)
Nat. Rev. Mol. Cell. Biol
, vol.7
, pp. 198-210
-
-
Joyce, A.R.1
Palsson, B.O.2
-
4
-
-
0141593601
-
-
Kelley, B. P., Sharan, R., Karp, R., Sittler, E. T. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 11394-11399.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.100
, pp. 11394-11399
-
-
Kelley, B.P.1
Sharan, R.2
Karp, R.3
Sittler, E.T.4
-
5
-
-
33750016109
-
-
Wang, Y., Joshi, T., Xu, D., Zhang, X.-S., Chen, L., Bioinfor matics 2006, 22, 2413-2420.
-
(2006)
Bioinfor matics
, vol.22
, pp. 2413-2420
-
-
Wang, Y.1
Joshi, T.2
Xu, D.3
Zhang, X.-S.4
Chen, L.5
-
6
-
-
25144498379
-
-
Stelzl, U., Worm, U., Lalowski, M., Haenig, C. et al., Cell 2005, 122, 957-968.
-
(2005)
Cell
, vol.122
, pp. 957-968
-
-
Stelzl, U.1
Worm, U.2
Lalowski, M.3
Haenig, C.4
-
7
-
-
1242264487
-
-
Yu, H., Zhu, X., Greenbaum, D., Karro, J., Gerstein, M., Nucleic. Acids Res. 2004, 32, 328-337.
-
(2004)
Nucleic. Acids Res
, vol.32
, pp. 328-337
-
-
Yu, H.1
Zhu, X.2
Greenbaum, D.3
Karro, J.4
Gerstein, M.5
-
8
-
-
0742305866
-
-
Barabasi, A., Oltvai, Z., Nat. Rev. Genet. 2004, 5, 101-113.
-
(2004)
Nat. Rev. Genet
, vol.5
, pp. 101-113
-
-
Barabasi, A.1
Oltvai, Z.2
-
9
-
-
1842580761
-
-
Yook, S. H., Oltvai, Z. N., Barabasi, A. L., Proteomics 2004, 4, 928-942.
-
(2004)
Proteomics
, vol.4
, pp. 928-942
-
-
Yook, S.H.1
Oltvai, Z.N.2
Barabasi, A.L.3
-
10
-
-
32144441867
-
-
Li, D., Li, J., Ouyang, S., Wang, J. et al., Proteomics 2006, 6, 456-461.
-
(2006)
Proteomics
, vol.6
, pp. 456-461
-
-
Li, D.1
Li, J.2
Ouyang, S.3
Wang, J.4
-
11
-
-
13244265564
-
-
Zhu, D., Qin, Z. S., BMC Bioinformatics 2005, 6, 8.
-
(2005)
BMC Bioinformatics
, vol.6
, pp. 8
-
-
Zhu, D.1
Qin, Z.S.2
-
12
-
-
19344374050
-
-
Bergmann, S., Ihmels, J., Barkai, N., PLoS Biol. 2004, 2, E9.
-
(2004)
PLoS Biol
, vol.2
-
-
Bergmann, S.1
Ihmels, J.2
Barkai, N.3
-
13
-
-
17444407091
-
-
Wuchty, S., Almaas, E., BMC Evol. Biol. 2005, 5, 24.
-
(2005)
BMC Evol. Biol
, vol.5
, pp. 24
-
-
Wuchty, S.1
Almaas, E.2
-
14
-
-
24944565272
-
-
Tanaka, R., Yi, T.-M., Doyle, J., FEBS Lett. 2005, 579, 5140-5144.
-
(2005)
FEBS Lett
, vol.579
, pp. 5140-5144
-
-
Tanaka, R.1
Yi, T.-M.2
Doyle, J.3
-
15
-
-
24944442468
-
-
Han, J.-D. J., Dupuy, D., Benin, N., Cusick, M. E., Vidal, M., Nat. Biotechnol. 2005, 23, 839-844.
-
(2005)
Nat. Biotechnol
, vol.23
, pp. 839-844
-
-
Han, J.-D.J.1
Dupuy, D.2
Benin, N.3
Cusick, M.E.4
Vidal, M.5
-
16
-
-
33744822763
-
-
Valente, A. X., Cusick, M. E., Nucleic Acids Res. 2006, 34, 2812-2819.
-
(2006)
Nucleic Acids Res
, vol.34
, pp. 2812-2819
-
-
Valente, A.X.1
Cusick, M.E.2
-
17
-
-
0033764169
-
-
Fell, D. A., Wagner, A., Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1121-1122.
-
(2000)
Nat. Biotechnol
, vol.18
, pp. 1121-1122
-
-
Fell, D.A.1
Wagner, A.2
-
18
-
-
0035799707
-
-
Jeong, H., Mason, S. P., Barabási, A. L., Oltvai, Z. N., Nature 2001, 411, 41-42.
-
(2001)
Nature
, vol.411
, pp. 41-42
-
-
Jeong, H.1
Mason, S.P.2
Barabási, A.L.3
Oltvai, Z.N.4
-
20
-
-
33746674977
-
-
Junker, B. H., Koschützki, D., Schreiber, F., BMC Bioinformatics 2006, 7, 219.
-
(2006)
BMC Bioinformatics
, vol.7
, pp. 219
-
-
Junker, B.H.1
Koschützki, D.2
Schreiber, F.3
-
21
-
-
3543099834
-
-
Wuchty, S., Genome Res. 2004, 14, 1310-1314.
-
(2004)
Genome Res
, vol.14
, pp. 1310-1314
-
-
Wuchty, S.1
-
22
-
-
0037012880
-
-
Maslov, S., Sneppen, K., Science 2002, 296, 910-913.
-
(2002)
Science
, vol.296
, pp. 910-913
-
-
Maslov, S.1
Sneppen, K.2
-
23
-
-
33746631391
-
-
Batada, N. N., Hurst, L. D., Tyers, M., PLoS Comput. Biol. 2006, 2, e88.
-
(2006)
PLoS Comput. Biol
, vol.2
-
-
Batada, N.N.1
Hurst, L.D.2
Tyers, M.3
-
25
-
-
3042848952
-
-
Han, J.-D. J., Bertin, N., Hao, T., Goldberg, D. S. et al., Nature 2004, 430, 88-93.
-
(2004)
Nature
, vol.430
, pp. 88-93
-
-
Han, J.-D.J.1
Bertin, N.2
Hao, T.3
Goldberg, D.S.4
-
26
-
-
33750238153
-
-
Batada, N. N., Hurst, L. D., Tyers, M., PLoS Biol. 2006, 4, e317.
-
(2006)
PLoS Biol
, vol.4
-
-
Batada, N.N.1
Hurst, L.D.2
Tyers, M.3
-
27
-
-
33745686603
-
-
Ekman, D., Light, S., Björklund, Å. K., Elofsson, A., Genome Biol. 2006, 7, R45.
-
(2006)
Genome Biol
, vol.7
-
-
Ekman, D.1
Light, S.2
Björklund, A.K.3
Elofsson, A.4
-
28
-
-
33845875196
-
-
Kim, P. M., Lu, L. J., Xia, Y., Gerstein, M. B., Science 2006, 314, 1938-1941.
-
(2006)
Science
, vol.314
, pp. 1938-1941
-
-
Kim, P.M.1
Lu, L.J.2
Xia, Y.3
Gerstein, M.B.4
-
29
-
-
85032751721
-
-
Li, C., Chen, L., Aihara, K., IEEE Signal Processing Magazine 2007, 24, 136-147.
-
(2007)
IEEE Signal Processing Magazine
, vol.24
, pp. 136-147
-
-
Li, C.1
Chen, L.2
Aihara, K.3
-
30
-
-
4444268694
-
-
Kashtan, N., Itzkovitz, S., Milo, R., Bioinformatics 2004, 20, 1746-1758.
-
(2004)
Bioinformatics
, vol.20
, pp. 1746-1758
-
-
Kashtan, N.1
Itzkovitz, S.2
Milo, R.3
-
31
-
-
24144495559
-
-
Schreiber, F., Schwobbermeyer, H., Bioinformatics 2005, 21, 3572-3574.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 3572-3574
-
-
Schreiber, F.1
Schwobbermeyer, H.2
-
32
-
-
33646153295
-
-
Wernicke, S., Rasche, F., Bioinformatics 2006, 22, 1152-1153.
-
(2006)
Bioinformatics
, vol.22
, pp. 1152-1153
-
-
Wernicke, S.1
Rasche, F.2
-
33
-
-
33746101149
-
-
Lee, W. P., Jeng, B. C., Pai, T. W., Tsai, C. P. et al., BMC Genomics 2006, 7, 89.
-
(2006)
BMC Genomics
, vol.7
, pp. 89
-
-
Lee, W.P.1
Jeng, B.C.2
Pai, T.W.3
Tsai, C.P.4
-
34
-
-
4644326931
-
-
Luscombe, N. M., Babu, M. M., Yu, H., Snyder, M. et al., Nature 2004, 431, 308-312.
-
(2004)
Nature
, vol.431
, pp. 308-312
-
-
Luscombe, N.M.1
Babu, M.M.2
Yu, H.3
Snyder, M.4
-
35
-
-
33646948892
-
-
Zhang, Z., Liu, C., Skogerbo, G., Zhu, X. et al., PLoS Comput. Biol. 2006, 2, e47.
-
(2006)
PLoS Comput. Biol
, vol.2
-
-
Zhang, Z.1
Liu, C.2
Skogerbo, G.3
Zhu, X.4
-
36
-
-
2442477788
-
-
Yu, H., Greenbaum, D., Xin Lu, H., Zhu, X., Gerstein, M., Trends Genet. 2004, 20, 227-231.
-
(2004)
Trends Genet
, vol.20
, pp. 227-231
-
-
Yu, H.1
Greenbaum, D.2
Xin Lu, H.3
Zhu, X.4
Gerstein, M.5
-
37
-
-
12344273375
-
-
Przulj, N., Corneil, D. G., Jurisica, I., Bioinformatics 2004, 20, 3508-3515.
-
(2004)
Bioinformatics
, vol.20
, pp. 3508-3515
-
-
Przulj, N.1
Corneil, D.G.2
Jurisica, I.3
-
38
-
-
33645803834
-
-
Przulj, N., Corneil, D. G., Jurisica, I., Bioinformatics 2006, 22, 974-980.
-
(2006)
Bioinformatics
, vol.22
, pp. 974-980
-
-
Przulj, N.1
Corneil, D.G.2
Jurisica, I.3
-
39
-
-
11144248635
-
-
Vazquez, A., Dobrin, R., Sergi, D., Eckmann, J.-P. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 17940-17945.
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.101
, pp. 17940-17945
-
-
Vazquez, A.1
Dobrin, R.2
Sergi, D.3
Eckmann, J.-P.4
-
40
-
-
0033518234
-
-
Hartwell, L. H., Hopfield, J. J., Leibler, S., Murray, A. W., Nature 1999, 402, C47-C52.
-
(1999)
Nature
, vol.402
-
-
Hartwell, L.H.1
Hopfield, J.J.2
Leibler, S.3
Murray, A.W.4
-
42
-
-
26244464025
-
-
Danon, L., Duch, J., Diaz-Guilera, A., Arenas, A., J. Stat. Mech. 2005, P09008.
-
(2005)
J. Stat. Mech
-
-
Danon, L.1
Duch, J.2
Diaz-Guilera, A.3
Arenas, A.4
-
43
-
-
0037199968
-
-
Ravasz, E., Somera, A. L., Mongru, D. A., Oltvai, Z. N., Barabási, A. L., Science 2002, 297, 1551-1555.
-
(2002)
Science
, vol.297
, pp. 1551-1555
-
-
Ravasz, E.1
Somera, A.L.2
Mongru, D.A.3
Oltvai, Z.N.4
Barabási, A.L.5
-
44
-
-
1442329655
-
-
Brun, C., Chevenet, F., Martin, D., Wojcik, J. et al., Genome Biol. 2003, 5, R6.
-
(2003)
Genome Biol
, vol.5
-
-
Brun, C.1
Chevenet, F.2
Martin, D.3
Wojcik, J.4
-
45
-
-
0037417817
-
-
Rives, A. W., Galitski, T., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2003, 100, 1128-1133.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.100
, pp. 1128-1133
-
-
Rives, A.W.1
Galitski, T.2
-
46
-
-
0242268461
-
-
Samanta, M. P., Liang, S., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2003, 100, 12579-12583.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.100
, pp. 12579-12583
-
-
Samanta, M.P.1
Liang, S.2
-
47
-
-
4444281384
-
-
Lu, H., Zhu, X., Liu, H., Skogerbo, G. et al., Nucleic Acids Res. 2004, 32, 4804-4811.
-
(2004)
Nucleic Acids Res
, vol.32
, pp. 4804-4811
-
-
Lu, H.1
Zhu, X.2
Liu, H.3
Skogerbo, G.4
-
48
-
-
13844264514
-
-
Arnau, V., Mars, S., Marín, I., Bioinformatics 2005, 21, 364-378.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 364-378
-
-
Arnau, V.1
Mars, S.2
Marín, I.3
-
49
-
-
0036081347
-
-
Mewes, H. W., Frishman, D., Guldener, U., Mannhaupt, G. et al., Nucleic Acids Res. 2002, 30, 31-34.
-
(2002)
Nucleic Acids Res
, vol.30
, pp. 31-34
-
-
Mewes, H.W.1
Frishman, D.2
Guldener, U.3
Mannhaupt, G.4
-
50
-
-
2942552459
-
-
Bader, G. D., Hogue, C. W., BMC Bioinformatics 2003, 4, 2.
-
(2003)
BMC Bioinformatics
, vol.4
, pp. 2
-
-
Bader, G.D.1
Hogue, C.W.2
-
51
-
-
0038074373
-
-
Bu, D., Zhao, Y., Cai, L., Xue, H. et al., Nucleic Acids Res. 2003, 31, 2443-2450.
-
(2003)
Nucleic Acids Res
, vol.31
, pp. 2443-2450
-
-
Bu, D.1
Zhao, Y.2
Cai, L.3
Xue, H.4
-
52
-
-
0142059836
-
-
Spirin, V., Mirny, L. A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2003, 100, 12123-12126.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.100
, pp. 12123-12126
-
-
Spirin, V.1
Mirny, L.A.2
-
53
-
-
10244264813
-
-
King, A. D., Pr·zulj, N., Jurisica, I., Bioinformatics 2004, 20, 3013-3020.
-
(2004)
Bioinformatics
, vol.20
, pp. 3013-3020
-
-
King, A.D.1
Pr·zulj, N.2
Jurisica, I.3
-
54
-
-
25444490121
-
-
Dunn, R., Dudbridge, F., Sanderson, C. M., BMC Bioinformatics 2005, 6, 39.
-
(2005)
BMC Bioinformatics
, vol.6
, pp. 39
-
-
Dunn, R.1
Dudbridge, F.2
Sanderson, C.M.3
-
55
-
-
0346156102
-
-
Pereira-Leal, J. B., Enright, A. J., Ouzounis, C. A., Proteins 2004, 54, 49-57.
-
(2004)
Proteins
, vol.54
, pp. 49-57
-
-
Pereira-Leal, J.B.1
Enright, A.J.2
Ouzounis, C.A.3
-
56
-
-
33751255087
-
-
Brohée, S., van Helden, J., BMC Bioinformatics 2006, 7, 488.
-
(2006)
BMC Bioinformatics
, vol.7
, pp. 488
-
-
Brohée, S.1
van Helden, J.2
-
57
-
-
34548426978
-
-
Ph.D. Thesis, University of Utrecht, The Netherlands
-
Van Dongen, S., Ph.D. Thesis, University of Utrecht, The Netherlands 2002.
-
(2002)
-
-
Van Dongen, S.1
-
58
-
-
33744805096
-
-
Altaf-Ul-Amin, M., Shinbo, Y., Mihara, K., Kurokawa, K., Kanaya, S., BMC Bioinformatics 2006, 7, 207.
-
(2006)
BMC Bioinformatics
, vol.7
, pp. 207
-
-
Altaf-Ul-Amin, M.1
Shinbo, Y.2
Mihara, K.3
Kurokawa, K.4
Kanaya, S.5
-
59
-
-
33748701649
-
-
Chen, J., Yuan, B., Bioinformatics 2006, 22, 2283-2290.
-
(2006)
Bioinformatics
, vol.22
, pp. 2283-2290
-
-
Chen, J.1
Yuan, B.2
-
60
-
-
33846681448
-
-
Luo, F., Yang, Y., Chen, C. F., Chang, R. et al., Bioinformatics 2007, 23, 207-214.
-
(2007)
Bioinformatics
, vol.23
, pp. 207-214
-
-
Luo, F.1
Yang, Y.2
Chen, C.F.3
Chang, R.4
-
61
-
-
78449273244
-
-
Zhang, S., Liu, H. W., Ning, X. M., Zhang, X. S., Proceeding of Sixth IEEE International Conference on Data Mining-Workshops 2006, 130-135.
-
(2006)
Proceeding of Sixth IEEE International Conference on Data Mining-Workshops
, pp. 130-135
-
-
Zhang, S.1
Liu, H.W.2
Ning, X.M.3
Zhang, X.S.4
-
62
-
-
20444504323
-
-
Palla, G., Derényi, I., Farkas, I., Vicsek, T., Nature 2005, 435, 814-818.
-
(2005)
Nature
, vol.435
, pp. 814-818
-
-
Palla, G.1
Derényi, I.2
Farkas, I.3
Vicsek, T.4
-
63
-
-
37649031573
-
-
Reichardt, J., Bornholdt, S., Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 218701.
-
(2004)
Phys. Rev. Lett
, vol.93
, pp. 218701
-
-
Reichardt, J.1
Bornholdt, S.2
-
64
-
-
33751166180
-
-
Zhang, S., Wang, R. S., Zhang, X. S., Physica A 2007, 374, 483-490.
-
(2007)
Physica A
, vol.374
, pp. 483-490
-
-
Zhang, S.1
Wang, R.S.2
Zhang, X.S.3
-
65
-
-
33646857469
-
-
Zhang, S., Ning, X. M., Zhang, X. S., Comput. Biol. Chem. 2006, 30, 445-451.
-
(2006)
Comput. Biol. Chem
, vol.30
, pp. 445-451
-
-
Zhang, S.1
Ning, X.M.2
Zhang, X.S.3
-
67
-
-
0033669189
-
-
Schwikowski, B., Uetz, P., Fields, S., Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1257-1261.
-
(2000)
Nat. Biotechnol
, vol.18
, pp. 1257-1261
-
-
Schwikowski, B.1
Uetz, P.2
Fields, S.3
-
68
-
-
0035044077
-
-
Hishigaki, H., Nakai, K., Ono, T., Tanigami, A., Takagi, T., Yeast 2001, 18, 523-531.
-
(2001)
Yeast
, vol.18
, pp. 523-531
-
-
Hishigaki, H.1
Nakai, K.2
Ono, T.3
Tanigami, A.4
Takagi, T.5
-
70
-
-
0742304254
-
-
Deng, M., Zhang, K., Mehta, S., Chen, T., Sun, F., J. Comput. Biol. 2003, 10, 947-960.
-
(2003)
J. Comput. Biol
, vol.10
, pp. 947-960
-
-
Deng, M.1
Zhang, K.2
Mehta, S.3
Chen, T.4
Sun, F.5
-
71
-
-
0038699587
-
-
Vazquez, A., Flammini, A., Maritan, A., Vespignani, A., Nat. Biotechnol. 2003, 21, 697-700.
-
(2003)
Nat. Biotechnol
, vol.21
, pp. 697-700
-
-
Vazquez, A.1
Flammini, A.2
Maritan, A.3
Vespignani, A.4
-
72
-
-
2442674422
-
-
Lanckriet, G. R., Deng, M., Cristianini, N., Jordan, M. I., Noble, W. S., Pac. Symp. Biocomput. 2004, 300-311.
-
(2004)
Pac. Symp. Biocomput
, pp. 300-311
-
-
Lanckriet, G.R.1
Deng, M.2
Cristianini, N.3
Jordan, M.I.4
Noble, W.S.5
-
73
-
-
29144442904
-
-
Nabieva, E., Jim, K., Agarwal, A., Chazelle, B., Singh, M., Bioinformatics 2005, 21, i302-i310.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
-
-
Nabieva, E.1
Jim, K.2
Agarwal, A.3
Chazelle, B.4
Singh, M.5
-
74
-
-
33644895409
-
-
Sun, S., Zhao, Y., Jiao, Y., Yin, Y. et al., FEBS Lett. 2006, 580, 1891-1896.
-
(2006)
FEBS Lett
, vol.580
, pp. 1891-1896
-
-
Sun, S.1
Zhao, Y.2
Jiao, Y.3
Yin, Y.4
-
75
-
-
33745619564
-
-
Chua, H. N., Sung, W. K., Wong, L., Bioinformatics 2006, 22, 1623-1630.
-
(2006)
Bioinformatics
, vol.22
, pp. 1623-1630
-
-
Chua, H.N.1
Sung, W.K.2
Wong, L.3
-
76
-
-
23844447959
-
-
Sharan, R., Ideker, T., Kelley, B., Shamir, R., Karp, R. M., J. Comput. Biol. 2005, 12, 835-846.
-
(2005)
Comput. Biol
, vol.12
, pp. 835-846
-
-
Sharan, R.1
Ideker, T.2
Kelley, B.3
Shamir, R.4
Karp, R.M.J.5
-
77
-
-
13844314048
-
-
Sharan, R., Suthram, S., Kelley, R. M., Kuhn, T. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 1974-1979.
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.102
, pp. 1974-1979
-
-
Sharan, R.1
Suthram, S.2
Kelley, R.M.3
Kuhn, T.4
-
78
-
-
24044488288
-
-
Pinter, R. Y., Rokhlenko, O., Yeger-Lotem, E., Ziv-Ukelson, M., Bioinformatics 2005, 21, 3401-3408.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 3401-3408
-
-
Pinter, R.Y.1
Rokhlenko, O.2
Yeger-Lotem, E.3
Ziv-Ukelson, M.4
-
79
-
-
84872222974
-
-
Trusina, A., Sneppen, K., Dodd, I. B., Shearwin, K. E., Egan, J. B., Plos Comput. Biol. 2005, 1, e74.
-
(2005)
Plos Comput. Biol
, vol.1
-
-
Trusina, A.1
Sneppen, K.2
Dodd, I.B.3
Shearwin, K.E.4
Egan, J.B.5
-
80
-
-
33645732240
-
-
Sharan, R., Ideker, T., Nat. Biotechnol. 2006, 24, 427-433.
-
(2006)
Nat. Biotechnol
, vol.24
, pp. 427-433
-
-
Sharan, R.1
Ideker, T.2
-
81
-
-
3442886313
-
-
Kelley, P. B., Yuan, B., Lewitter, F., Sharan, R. et al., Nucleic Acids Res. 2004, 32, 83-88.
-
(2004)
Nucleic Acids Res
, vol.32
, pp. 83-88
-
-
Kelley, P.B.1
Yuan, B.2
Lewitter, F.3
Sharan, R.4
-
82
-
-
6944240088
-
-
Berg, J., Läsig, M., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 14689-14694.
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.101
, pp. 14689-14694
-
-
Berg, J.1
Läsig, M.2
-
83
-
-
26444593028
-
-
Koyutürk, M., Grama, A., Szpankowski, W., RECOM, LNBI, 2005 3500, 48-65.
-
(2005)
RECOM, LNBI
, vol.3500
, pp. 48-65
-
-
Koyutürk, M.1
Grama, A.2
Szpankowski, W.3
-
84
-
-
0034667776
-
-
Ogata, H., Fujibuchi, W., Goto, S., Kanehisa, M., Nucleic Acids Res. 2000, 28, 4021-4028.
-
(2000)
Nucleic Acids Res
, vol.28
, pp. 4021-4028
-
-
Ogata, H.1
Fujibuchi, W.2
Goto, S.3
Kanehisa, M.4
-
85
-
-
33746616867
-
-
Berg, J., Läsig, M., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 10967-10972.
-
(2006)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.103
, pp. 10967-10972
-
-
Berg, J.1
Läsig, M.2
-
86
-
-
33748257786
-
-
Flannick, J., Novak, A., Srinivasan, B. S., McAdams, H. H., Batzoglou, S., Genome Res. 2006, 16, 1169-1181.
-
(2006)
Genome Res
, vol.16
, pp. 1169-1181
-
-
Flannick, J.1
Novak, A.2
Srinivasan, B.S.3
McAdams, H.H.4
Batzoglou, S.5
-
87
-
-
33646347364
-
-
Shlomi, T., Segal, D., Ruppin, E., Sharan, R., BMC Bioinformatics 2006, 7, 199.
-
(2006)
BMC Bioinformatics
, vol.7
, pp. 199
-
-
Shlomi, T.1
Segal, D.2
Ruppin, E.3
Sharan, R.4
-
88
-
-
34548456859
-
-
András, S., Vera, G., Adrián, K. A., Jeffrey, S., Phys. Biol. 2005, 2, S1-S16.
-
(2005)
Phys. Biol
, vol.2
-
-
András, S.1
Vera, G.2
Adrián, K.A.3
Jeffrey, S.4
-
89
-
-
0035943340
-
-
Sprinzak, E., Margalit, H., J. Mol. Biol. 2001, 311, 681-692.
-
(2001)
J. Mol. Biol
, vol.311
, pp. 681-692
-
-
Sprinzak, E.1
Margalit, H.2
-
90
-
-
0036799752
-
-
Deng, M., Mehta, S., Sun, F., Chen, T., Genome Res. 2002, 12, 1540-1548.
-
(2002)
Genome Res
, vol.12
, pp. 1540-1548
-
-
Deng, M.1
Mehta, S.2
Sun, F.3
Chen, T.4
-
91
-
-
22944492735
-
-
Hayashida, M., Ueda, N., Akutsu, T., Bioinformatics 2003, 19, i58-i65.
-
(2003)
Bioinformatics
, vol.19
-
-
Hayashida, M.1
Ueda, N.2
Akutsu, T.3
-
92
-
-
18244400278
-
-
Hayashida, M., Ueda, N., Akutsu, T., Genome Inform. 2004, 15, 56-68.
-
(2004)
Genome Inform
, vol.15
, pp. 56-68
-
-
Hayashida, M.1
Ueda, N.2
Akutsu, T.3
-
93
-
-
16344381315
-
-
Nye, T. M., Berzuini, C., Gilks, W. R., Babu, M. M., Teichmann, S. A., Bioinformatics 2005, 21, 993-1001.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 993-1001
-
-
Nye, T.M.1
Berzuini, C.2
Gilks, W.R.3
Babu, M.M.4
Teichmann, S.A.5
-
94
-
-
25144479967
-
-
Liu, Y., Liu, N., Zhao, H., Bioinformatics 2005, 21, 3279-3285.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 3279-3285
-
-
Liu, Y.1
Liu, N.2
Zhao, H.3
-
95
-
-
34548084807
-
-
Riley, R., Lee, C., Sabatti, C., Eisenberg, D., Genome Biol. 2005, 6, R89.
-
(2005)
Genome Biol
, vol.6
-
-
Riley, R.1
Lee, C.2
Sabatti, C.3
Eisenberg, D.4
-
96
-
-
33745327144
-
-
Lee, H., Deng, M., Sun, F., Chen, T., BMC Bioinformatics 2006, 7, 269.
-
(2006)
BMC Bioinformatics
, vol.7
, pp. 269
-
-
Lee, H.1
Deng, M.2
Sun, F.3
Chen, T.4
-
97
-
-
33644835242
-
-
Chen, L., Wu, L.-Y., Wang, Y., Zhang, X.-S., Proteins 2006, 62, 833-837.
-
(2006)
Proteins
, vol.62
, pp. 833-837
-
-
Chen, L.1
Wu, L.-Y.2
Wang, Y.3
Zhang, X.-S.4
-
98
-
-
33847753484
-
-
Guimaraes, K. S., Jothi, R., Zotenko, E., Przytycka, T. M., Genome Biol. 2006, 7, R104.
-
(2006)
Genome Biol
, vol.7
-
-
Guimaraes, K.S.1
Jothi, R.2
Zotenko, E.3
Przytycka, T.M.4
-
99
-
-
34548443396
-
-
Springer-Verlag, Berlin
-
Zhang, X.-S., Wang, R., Wu, L.-Y., Zhang, S., Chen, L., IOMP Proceedings 2006, 2, 181-184, Springer-Verlag, Berlin 2006.
-
(2006)
IOMP Proceedings
, vol.2
, pp. 181-184
-
-
Zhang, X.-S.1
Wang, R.2
Wu, L.-Y.3
Zhang, S.4
Chen, L.5
-
100
-
-
0842288337
-
-
Friedman, N., Science 2004, 30, 799-805.
-
(2004)
Science
, vol.30
, pp. 799-805
-
-
Friedman, N.1
-
101
-
-
13844253637
-
-
Beal, M. J., Falciani, F., Ghahramani, Z., Rangel, C., Wild, D. L., Bioinformatics 2005, 21, 349-356.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 349-356
-
-
Beal, M.J.1
Falciani, F.2
Ghahramani, Z.3
Rangel, C.4
Wild, D.L.5
-
102
-
-
15944364151
-
-
Schafer, J., Strimmer, K., Bioinformatics 2005, 21, 754-764.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 754-764
-
-
Schafer, J.1
Strimmer, K.2
-
103
-
-
27644508196
-
-
Gustafsson, M., Gustafsson, M., Hornquist, M., Lombardi, A., IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinform. 2005, 2, 254-261.
-
Gustafsson, M., Gustafsson, M., Hornquist, M., Lombardi, A., IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinform. 2005, 2, 254-261.
-
-
-
-
104
-
-
0036576340
-
-
Chen, L., Aihara, K., IEEE Trans. on Circuits Syst. I 2002, 49, 602-608.
-
(2002)
IEEE Trans. on Circuits Syst. I
, vol.49
, pp. 602-608
-
-
Chen, L.1
Aihara, K.2
-
105
-
-
33845220382
-
-
Xia, K., Dong, D., Han J.-D. J., BMC Bioinformatics 2006, 7, 508.
-
(2006)
BMC Bioinformatics
, vol.7
, pp. 508
-
-
Xia, K.1
Dong, D.2
Han, J.-D.J.3
-
106
-
-
0242490780
-
-
Shannon, P., Markiel, A., Ozier, O., Baliga, N. S. et al., Genome Res. 2003, 13, 2498-2504.
-
(2003)
Genome Res
, vol.13
, pp. 2498-2504
-
-
Shannon, P.1
Markiel, A.2
Ozier, O.3
Baliga, N.S.4
-
107
-
-
0037264280
-
-
Breitkreutz, B. J., Stark, C., Tyers, M., Genome Biol. 2003, 4, R22.
-
(2003)
Genome Biol
, vol.4
-
-
Breitkreutz, B.J.1
Stark, C.2
Tyers, M.3
-
108
-
-
2542529262
-
-
Jünger, M, Mutzel, P, Eds, Springer
-
Batagelj, V., Mrvar, A., in: Jünger, M., Mutzel, P. (Eds.), Graph Drawing Software, Springer 2003, pp. 77-103.
-
(2003)
Graph Drawing Software
, pp. 77-103
-
-
Batagelj, V.1
Mrvar, A.2
-
109
-
-
33748672677
-
-
Vlasblom, J., Wu, S., Pu, S., Superina, M. et. al., Bioinformatics 2006, 22, 2178-2179.
-
(2006)
Bioinformatics
, vol.22
, pp. 2178-2179
-
-
Vlasblom, J.1
Wu, S.2
Pu, S.3
Superina, M.4
et., al.5
-
110
-
-
14844305006
-
-
Koyuturk, M., Grama, A., Szpankowski, W., Bioinformatics 2004, 20, i200-i207.
-
(2004)
Bioinformatics
, vol.20
-
-
Koyuturk, M.1
Grama, A.2
Szpankowski, W.3
-
111
-
-
29144474447
-
-
Hu, H., Yan, X., Huang, Y., Han, J., Zhou, X. J., Bioinformatics 2005, 21, i213-i221.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
-
-
Hu, H.1
Yan, X.2
Huang, Y.3
Han, J.4
Zhou, X.J.5
-
112
-
-
1942469444
-
-
Yeger-Lotem, E., Sattath, S., Kashtan, N., Itzkovitz, S. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 5934-5939.
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.101
, pp. 5934-5939
-
-
Yeger-Lotem, E.1
Sattath, S.2
Kashtan, N.3
Itzkovitz, S.4
-
113
-
-
17444391730
-
-
Moon, H. S., Bhak, J., Lee, K. H., Lee, D., Bioinformatics 2005, 21, 1479-1486.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 1479-1486
-
-
Moon, H.S.1
Bhak, J.2
Lee, K.H.3
Lee, D.4
-
114
-
-
13444283846
-
-
Chen, Y., Xu, D., Nucl. Acids Res. 2004, 32, 6414-6424.
-
(2004)
Nucl. Acids Res
, vol.32
, pp. 6414-6424
-
-
Chen, Y.1
Xu, D.2
-
115
-
-
33847051248
-
-
Zhang, L. V., King, O. D., Wong, S. L., Goldberg, D. S. et al., J. Biol. 2005, 4, 6.
-
(2005)
J. Biol
, vol.4
, pp. 6
-
-
Zhang, L.V.1
King, O.D.2
Wong, S.L.3
Goldberg, D.S.4
-
116
-
-
0037041888
-
-
Hasty, J., Dolnik, M., Rottschaer, V., Collins, J. J., Phys. Rev. Lett. 2002, 88, 148101.
-
(2002)
Phys. Rev. Lett
, vol.88
, pp. 148101
-
-
Hasty, J.1
Dolnik, M.2
Rottschaer, V.3
Collins, J.J.4
-
117
-
-
13744253986
-
-
Wang, R., Zhou, T., Jing, Z., Chen, L., Syst. Biol. 2004, 1, 71-84.
-
(2004)
Syst. Biol
, vol.1
, pp. 71-84
-
-
Wang, R.1
Zhou, T.2
Jing, Z.3
Chen, L.4
-
118
-
-
0345549531
-
-
Kobayashi, T., Chen, L., Aihara, K., J. Theor. Biol. 2002, 221, 379-399.
-
(2002)
J. Theor. Biol
, vol.221
, pp. 379-399
-
-
Kobayashi, T.1
Chen, L.2
Aihara, K.3
-
119
-
-
34548411346
-
-
Chen, L., Wang, R., IEEE Trans. on Circuits Syst. I 2006, 53, 2444-2450.
-
(2006)
IEEE Trans. on Circuits Syst. I
, vol.53
, pp. 2444-2450
-
-
Chen, L.1
Wang, R.2
-
121
-
-
37649029024
-
-
Chen, L., Wang, R., Kobayashi, T., Aihara, K., Phys. Rev. E 2004, 70, 011909.
-
(2004)
Phys. Rev. E
, vol.70
, pp. 011909
-
-
Chen, L.1
Wang, R.2
Kobayashi, T.3
Aihara, K.4
-
122
-
-
34548411782
-
Logic
-
Li, C., Chen, L., Aihara, K., Logic. IEEE Trans. on Circuits Syst. I 2006, 53, 2451-2458.
-
(2006)
IEEE Trans. on Circuits Syst. I
, vol.53
, pp. 2451-2458
-
-
Li, C.1
Chen, L.2
Aihara, K.3
-
123
-
-
0037154293
-
-
McMillen, D., Kopell, N., Hasty, J., Collins, J. J., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 679-684.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.99
, pp. 679-684
-
-
McMillen, D.1
Kopell, N.2
Hasty, J.3
Collins, J.J.4
-
124
-
-
38349061594
-
-
Li, C., Chen, L., Aihara, K., BMC Syst. Biol. 2007, 1, 6.
-
(2007)
BMC Syst. Biol
, vol.1
, pp. 6
-
-
Li, C.1
Chen, L.2
Aihara, K.3
-
125
-
-
33748030448
-
-
Li, C., Chen, L., Aihara, K., PLoS Comput. Biol. 2006, 2, e103.
-
(2006)
PLoS Comput. Biol
, vol.2
-
-
Li, C.1
Chen, L.2
Aihara, K.3
-
126
-
-
20744444887
-
-
Chen, L., Wang, R., Zhou, T., Aihara, K., Bioinformatics 2005, 21, 2722-2729.
-
(2005)
Bioinformatics
, vol.21
, pp. 2722-2729
-
-
Chen, L.1
Wang, R.2
Zhou, T.3
Aihara, K.4
-
127
-
-
28844491402
-
-
Zhou, T., Chen, L., Aihara, K., Phys. Rev. Lett. 2005, 95, 178103.
-
(2005)
Phys. Rev. Lett
, vol.95
, pp. 178103
-
-
Zhou, T.1
Chen, L.2
Aihara, K.3
-
128
-
-
34249915290
-
-
Zhang, S., Ning, X. M., Zhang, X. S., Eur. Phys. J. B 2007, 57, 67-74.
-
(2007)
Eur. Phys. J. B
, vol.57
, pp. 67-74
-
-
Zhang, S.1
Ning, X.M.2
Zhang, X.S.3
-
129
-
-
34547852210
-
-
doi: 10.1093/bioinformatics/btm156
-
Li, Z., Zhang, S., Wang, Y., Zhang, X. S., Chen, L., Bioinformatics 2007, 95, doi: 10.1093/bioinformatics/btm156.
-
(2007)
Bioinformatics
, vol.95
-
-
Li, Z.1
Zhang, S.2
Wang, Y.3
Zhang, X.S.4
Chen, L.5
|