Protein expression in the striatum and cortex regions of the brain for a mouse model of Huntington's Disease

Journal of Proteome Research

Volumn 6, Issue 8, 2007, Pages 3134-3142

  Liu, Xiaoyun ^a   Miller, Benjamin R ^a   Rebec, George V ^a   Clemmer, David E ^a  

^a INDIANA UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Brain proteome; Cortex; Huntington's disease; Label free quantification; Liquid chromatography; Mass spectrometry; Striatum

Indexed keywords

ANIMAL EXPERIMENT; ANIMAL MODEL; ANIMAL TISSUE; ARTICLE; BRAIN CORTEX; CONTROLLED STUDY; CORPUS STRIATUM; DATA BASE; GENETIC TRANSCRIPTION; HUNTINGTON CHOREA; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MALE; MASS SPECTROMETRY; MOUSE; NEUROPATHOLOGY; NEUROTOXICITY; NEUROTRANSMISSION; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN EXPRESSION; PROTEOMICS;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; CEREBRAL CORTEX; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; CORPUS STRIATUM; DISEASE MODELS, ANIMAL; HUNTINGTON DISEASE; MICE; MICE, TRANSGENIC; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NERVE TISSUE PROTEINS; PEPTIDES; PROTEOME; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

ANIMALIA;

EID: 34548179070     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr070092s     Document Type: Article

References (47)

1. Huntington's Disease Collaborative Research Group. A novel gene containing a trinucleotide repeat that is expanded an unstable on Huntington's disease chromosomes. Cell 1993, 72, 971-993.
2. Bates, G. P. Lancet 2003, 361, 1642-1644.
3. Browne, S. E.; Ferrante, R. J.; Beal, M. F. Brain Pathol. 1999, 9, 147-163.
4. Browne, S. E.; Beal, M. F. Neurochem. Res. 2004, 29, 531-546.
5. Bence, N. F.; Sampat, R. M.; Kopito, R. R. Science 2001, 292, 1552-1555.
6. Mangiarini, L.; Sathasivam, K.; Seller, M.; Cozens, B.; Harper, A.; Hetherington, C.; Lawton, M.; Trottier, Y.; Lehrach, H.; Davies, S. W.; Bates, G. P. Cell 1996, 87, 493-506.
7. Carter, R. J.; Lione, L. A.; Humby, T.; Mangiarini, L.; Mahal, A.; Bates, G. P.; Dunnett, S. B.; Morton, A. J. J. Neurosci. 1999, 19, 3248-3257.
8. Desplats, P. A.; Kass, K. E.; Gilmartin, T.; Stanwood, G. D.; Woodward, E. L.; Head, S. R.; Sutcliffe, J. G.; Thomas, E. A. J. Neurochem. 2006, 96, 743-757.
9. Crocker, S. F.; Costain, W. J.; Robertson, H. A. Brain Res. 2006, 1088, 176-186.
10. Tsang, T. M.; Woodman, B.; McLoughlin, G. A.; Griffin, J. L.; Tabrizi, S. J.; Bates, G. P.; Holmes, E. J. Proteome Res. 2006, 5, 483-492.
11. Perluigi, M.; Poon, H. F.; Maragos, W.; Pierce, W. M.; Klein, J. B.; Calabrese, V.; Cini, C.; Marco, C. D.; Butterfield, D. A. Mol. Cell. Proteomics 2005, 4, 1849-1861.
12. Zabel, C.; Chamrad, D. C.; Priller, J.; Woodman, B.; Meyer, H. E.; Bates, G. P.; Klose, J. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 366-375.
13. Romijin, E. P.; Krijgsveld, J.; Heck, A. J. R. J. Chromatogr. A 2003, 1000, 589-608.
14. Hancock, W. S.; Apffel, A. J.; Chakel, J. A.; Hahnenberger, K. C.; Choudhary, G.; Traina, J.; Pungor, E. Anal. Chem. 1999, 71, 742A-748A.
15. Figeys, D. Anal. Chem. 2003, 75, 2891-2905.
16. Aebersold, R.; Mann, M. Nature 2003, 422, 198-207.
17. Venable, J. D.; Dong, M.; Wohlschlegel, J.; Dillin, A.; Yates, J. R. Nature Methods 2004, 1, 39-45.
18. Washburn, M. P.; Wolters, D. A.; Yates, J. R. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 242-247.
19. Shen, Y.; Jacobs, J. M.; Camp, D. G., II; Fang, R.; Moore, R. J.; Smith, R. D.; Xiao, W.; Davis, R. W.; Tompkins, R. G. Anal. Chem. 2004, 76, 1134-1144.
20. Shen, Y.; Zhang, R.; Moore, R. J.; Kim, J.; Metz, T. O.; Hixson, K. K.; Zhao, R.; Livesay, E. A.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2005, 77, 3090-100.
21. Syka, J. E. P.; Coon, J. J.; Schroeder, M. J.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F. Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A. 2004, 101, 9528-9533.
22. Zubarev, R. A.; Kelleher, N. L.; McLafferty, F. W. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 3265-3266.
23. Garcia, B. A.; Siuti, N.; Thomas, C. E.; Mizzen, C. A.; Kelleher, N. L. Int. J. Mass Spectrom. 2007, 259, 184-196.
24. Myung, S.; Lee, Y. L.; Moon, M. H.; Taraszka, J. A.; Sowell, R.; Koeniger, S. L.; Hilderbrand, A. E.; Valentine, S. J.; Cherbas, L.; Cherbas, P.; Kaufmann, T. C.; Miller, D. F.; Mechref, Y.; Novotny, M. V.; Ewing, M.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2003, 75, 5137-5145.
25. Valentine, S. J.; Kulchania, M.; Srebalus Barnes, C. A.; Clemmer, D. E. Int. J. Mass Spectrom. 2001, 212, 97-109.
26. Wang, H.; Qian, W.; Mottaz, H. M.; Clauss, T. R. W.; Anderson, D. J.; Moore, R. J.; Camp, D. G., II; Khan, A. H.; Sforza, D. M.; Pallavicini, M.; Smith, D. J.; Smith, R. D. J. Proteome Res. 2005, 4, 2397-2403.
27. Wang, H.; Qian, W.; Chin, M. H.; Petyuk, V. A.; Barry, R. C.; Liu, T.; Gritsenko, M. A.; Mottaz, H. M.; Moore, R. J.; Camp, D. G., II; Khan, A. H.; Smith, D. J.; Smith, R. D. J. Proteome Res. 2006, 5, 361-369.
28. Taraszka, J. A.; Gao, X.; Valentine, S. J.; Sowell, R. A.; Koeniger, S. L.; Miller, D. F.; Kaufman, T. C.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2005, 4, 1238-1247.
29. Taraszka, J. A.; Kurulugama, R.; Sowell, R.; Valentine, S. J.; Koeniger, S. L.; Arnold, R. J.; Miller, D. F.; Kaufman, T. C.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2005, 4, 1223-1237.
30. Xun, Z.; Sowell, R. A.; Kaufman, T. C.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2006, 6, 348-357.
31. Anderson, N. L.; Anderson, N. G. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 845-867.
32. Liu, X.; Plasencia, M.; Ragg, S.; Valentine, S. J.; Clemmer, D. E. Brief. Funct. Genomic. Proteomic. 2004, 3, 177-186.
33. Liu, X.; Valentine, S. J.; Plasencia, M.; Trimpin, S.; Naylor, S.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, in press.
34. Valentine, S. J.; Liu, X.; Plasencia, M.; Hilderbrand, A. E.; Kurulugama, R. T.; Koeniger, S. L.; Clemmer, D. E. Expert Rev. Proteomics 2005, 2, 553-565.
35. Valentine, S. J.; Plasencia, M.; Liu, X.; Krishnan, M.; Naylor, S.; Udseth, H. R.; Smith, R. D.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2006, 5, 2977-2984.
36. Qian, W.; Monroe, M. E.; Liu, T.; Jacobs, J. M.; Anderson, G. A.; Shen, Y.; Moore, R. J.; Anderson, D. J.; Zhang, R.; Calvano, S. E.; Lowry, S. F.; Xiao, W.; Moldawer, L. L.; Davis, R. W.; Tompkins, R. G.; Camp, D. G., II; Smith, R. D. Mol. Cell. Proteomics 2005, 4, 700-709.
37. Vila, M.; Wu, D. C.; Przedborski, S. Trends Neurosci. 2001, 24, S49-S55.
38. Charles, V.; Mezey, E.; Reddy, P. H.; Dehejia, A.; Young, T. A.; Polymeropoulos, M. H.; Brownstein, M. J.; Tagle, D. A. Neurosci. Lett. 2000, 289, 29-32.
39. Bihan, T. L.; Goh, T.; Stewart, I. I.; Salter, A. M.; Bukhman, Y. V.; Dharsee, M.; Ewing, R.; Wiśniewski, J. R. J. Proteome Res. 2006, 5, 2701-2710.
40. Pierson, J.; Norris, J. L.; Aerni, H.; Svenningsson, P.; Caprioli, R. M.; Andrén, P. E. J. Proteome Res. 2004, 3, 289-295.
41. Rebec, G. V.; Conroy, S. K.; Barton, S. J. Neuroscience 2006, 137, 327-336.
42. Liévens, J. C.; Woodman, B.; Mahal, A.; Spasic-Boscovic, O.; Samuel, D.; Goff, L. K.; Bates, G. P. Neurobiol. Dis. 2001, 8, 807-821.
43. Behrens, P. F.; Franz, P.; Woodman, B.; Lindenberg, K. S.; Landwehrmeyer, G. B. Brain 2002, 125, 1908-1922.
44. Sharp, S.; Workman, P. Adv. Cancer Res. 2006, 95, 323-48.
45. Taylor, J. P.; Hardy, J.; Fischbeck, K. H. Science 2002, 296, 1991-1995.
46. Chiang, M.; Juo, C.; Chang, H.; Chen, H.; Yi, E. C.; Chern, Y. Mol. Cell. Proteomics 2007, 6, 781-797.
47. Luthi-Carter, R.; Strand, A.; Peters, N. L.; Solano, S. M.; Hollingsworth, Z. R.; Menon, A. S.; Frey, A. S.; Spektor, B. S.; Penney, E. B.; Schilling, G.; Ross, C. A.; Borchelt, D. R.; Tapscott, S. J.; Young, A. B.; Cha, J. H. J.; Olson, J. M. Hum. Mol. Genet. 2000, 9, 1259-1271.