Elucidating DNA damage and repair processes by independently generating reactive and metastable intermediates

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 5, Issue 1, 2007, Pages 18-30

  Greenberg, Marc M ^a  

^a JOHNS HOPKINS UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOPOLYMERS; DISEASE CONTROL; DISEASES; IONIZING RADIATION; PATIENT TREATMENT; TUMORS;

DNA DAMAGE; HETEROGENEOUS POLYMERS; MULTIPLE REACTIVE PATHWAYS; REPAIR PROCESSES;

DNA;

EID: 33845513405     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b612729k     Document Type: Article

References (106)

1. J. D. Trzupek J. M. Gottesfeld D. L. Boger Nat. Chem. Biol. 2006 2 79 82
2. D. L. Boger R. M. Garbaccio Acc. Chem. Res. 1999 32 1043 1052
3. J. Chen J. Stubbe Nat. Rev. Cancer 2005 5 102 112
4. Z. Xi and I. H. Goldberg, in Comprehensive Natural Products Chemistry, Volume 7, DNA and Aspects of Molecular Biology, ed., E. T. Kool, Elsevier, Amsterdam, 1999, pp. 553-592
5. C. Von Sonntag, Free-Radical-Induced DNA Damage and Its Repair, Springer-Verlag, Berlin, 2006
6. M. M. Greenberg Chem. Res. Toxicol. 1998 11 1235 1248
7. M. M. Greenberg, in Comprehensive Natural Products Chemistry, Volume 7, DNA and Aspects of Molecular Biology, ed., E. T. Kool Elsevier, Amsterdam, 1999, pp. 371-426
8. B. Giese A. Dussy E. Meggers M. Petretta U. Schwitter J. Am. Chem. Soc. 1997 119 11130 11131
9. A. Dussy E. Meggers B. Giese J. Am. Chem. Soc. 1998 120 7399 7403
10. B. Giese Acc. Chem. Res. 2000 33 631 636
11. A. C. Bryant-Friedrich Org. Lett. 2004 6 2329 2332
12. Q. Zhang Y. Wang J. Am. Chem. Soc. 2003 125 12795 12802
13. K. Miaskiewicz R. Osman J. Am. Chem. Soc. 1994 116 232 238
14. A. O. Colson M. D. Sevilla J. Phys. Chem. 1995 99 3867 3874
15. M. Dizdaroglu D. Schulte-Frohlinde C. Von Sonntag Int. J. Radiat. Biol. 1977 32 481 483
16. M. Roginskaya W. A. Bernhard R. T. Marion Y. Razskazovskiy Radiat. Res. 2005 163 85 89
17. M. Roginskaya Y. Razskazovskiy W. A. Bernhard Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 6210 6213
18. D. S. Sigman Acc. Chem. Res. 1986 19 180 186
19. D. S. Sigman A. Mazumder D. M. Perrin Chem. Rev. 1993 93 2295 2316
20. B. K. Goodman M. M. Greenberg J. Org. Chem. 1996 61 2 3
21. J.-T. Hwang M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 1999 121 4311 4315
22. C. Tronche B. K. Goodman M. M. Greenberg Chem. Biol. 1998 5 263 271
23. J.-T. Hwang K. A. Tallman M. M. Greenberg Nucleic Acids Res. 1999 27 3805 3810
24. Y. Zheng T. L. Sheppard Chem. Res. Toxicol. 2004 17 197 207
25. K. A. Tallman C. Tronche D. J. Yoo M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 1998 120 4903 4909
26. C. J. Emanuel M. Newcomb C. Ferreri C. Chatgilialoglu J. Am. Chem. Soc. 1999 121 2927 2928
27. C. von Sonntag H.-P. Schuchmann Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1991 30 1229 1253
28. J. M. Brown L.-H. Wang Anti-Cancer Drug Des. 1998 13 529 537
29. D. J. Scott K. S. Gates J. Am. Chem. Soc. 1996 118 3380 3385
30. J. S. Daniels K. S. Gates C. Tronche M. M. Greenberg Chem. Res. Toxicol. 1998 11 1254 1257
31. J. T. Hwang M. M. Greenberg T. Fuchs K. S. Gates Biochemistry 1999 38 14248 14255
32. M. Kotera A.-G. Bourdat E. Defrancq J. Lhomme J. Am. Chem. Soc. 1998 120 11810 11811
33. C. Crey-Desbiolles J. Lhomme P. Dumy M. Kotera J. Am. Chem. Soc. 2004 126 9532 9533
34. H. J. Lenox C. P. McCoy T. L. Sheppard Org. Lett. 2001 3 2415 2418
35. M. M. Meijler O. Zelenko D. S. Sigman J. Am. Chem. Soc. 1997 119 1135 1136
36. T. Chen M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 1998 120 3815 3816
37. T. Oyoshi H. Sugiyama J. Am. Chem. Soc. 2000 122 6313 6314
38. B. C. Bales M. Pitié B. Meunier M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 2002 124 9062 9063
39. B. C. Bales T. Kodama Y. N. Weledji M. Pitie B. Meunier M. M. Greenberg Nucleic Acids Res. 2005 33 5371 5379
40. O. D. Schärer Angew. Chem., Int. Ed. 2003 42 2946 2974
41. S. S. Parikh C. D. Mol D. J. Hosfiield J. A. Tainer Curr. Opin. Struct. Biol. 1999 9 37 47
42. S. S. David S. D. Williams Chem. Rev. 1998 98 1221 1261
43. T. Lindahl Nature 1993 362 709 715
44. Y. K. K. Matsumoto Science 1995 269 699 702
45. M. Hashimoto M. M. Greenberg Y. W. Kow J.-T. Hwang R. P. Cunningham J. Am. Chem. Soc. 2001 123 3161 3162
46. K. M. Kroeger M. Hashimoto Y. W. Kow M. M. Greenberg Biochemistry 2003 42 2449 2455
47. K. Makino H. Ide J. Biol. Chem. 2003 278 25264 25272
48. E. C. Friedberg, G. C. Walker and W. Siede, DNA Repair and Mutagenesis, American Society for Microbiology, D. C. Washington, 1995
49. Y.-j. Xu M. S. DeMottt J. T. Hwang M. M. Greenberg B. Demple DNA Repair 2003 2 175 185
50. M. M. Greenberg Y. N. Weledji J. Kim B. C. Bales Biochemistry 2004 43 8178 8183
51. M. S. DeMott E. Beyret D. Wong B. C. Bales J.-T. Hwang M. M. Greenberg B. Demple J. Biol. Chem. 2002 277 7637 7640
52. L. F. Povirk I. H. Goldberg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1985 82 3182 3186
53. J. S. Sung M. S. Demott B. Demple J. Biol. Chem. 2005 280 39095 39103
54. J. Stubbe J. W. Kozarich Chem. Rev. 1987 87 1107 1136
55. M. Dizdaroglu P. Jaruga M. Birincioglu H. Rodriguez Free Radical Biol. Med. 2002 32 1102 1115
56. A. Adhikary D. Becker S. Collins J. Koppen M. D. Sevilla Nucleic Acids Res. 2006 34 1501 1511
57. K. Hildenbrand D. Schulte-Frohlinde Int. J. Radiat. Biol. 1989 55 725 738
58. K. Hildenbrand G. Behrens D. J. Schulte-Frohlinde J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1989 283 289
59. D. G. E. Lemaire E. Bothe D. Schulte-Frohlinde Int. J. Radiat. Biol. 1984 45 351 358
60. M. R. Barvian M. M. Greenberg J. Org. Chem. 1995 60 1916 1917
61. M. R. Barvian M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 1995 117 8291 8292
62. M. M. Greenberg M. R. Barvian G. P. Cook B. K. Goodman T. J. Matray C. Tronche H. Venkatesan J. Am. Chem. Soc. 1997 119 1828 1839
63. K. N. Carter M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 2003 125 13376 13378
64. K. N. Carter M. M. Greenberg J. Org. Chem. 2003 68 4275 4280
65. I. S. Hong K. N. Carter M. M. Greenberg J. Org. Chem. 2004 69 6974 6978
66. M. R. Barvian R. M. Barkley M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 1995 117 4894 4904
67. M. R. Barvian M. M. Greenberg Tetrahedron Lett. 1992 33 6057 6060
68. M. Newcomb Tetrahedron 1993 49 1151 1176
69. I. Janik P. Ulanski J. M. Rosiak C. Von Sonntag J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2000 2 2034
70. M. N. Schuchmann C. Von Sonntag Z. Naturforsch. 1986 42b 495
71. Q. Zhang Y. Wang J. Am. Chem. Soc. 2004 126 13287 13297
72. H. C. Box J. C. Wallace Radiat. Res. 1995 141 91
73. H. C. Box H. B. Patrzyc J. B. Dawidzik J. C. Wallace H. G. Freund H. Iijima E. E. Budzinski Radiat. Res. 2000 153 442 446
74. G. L. Dianov P. O'Neill D. T. Goodhead Bioessays 2001 23 745 749
75. M. E. Lomax M. K. Gulston P. O'Neill Radiat. Prot. Dosim. 2002 99 63 68
76. M. Weinfeld A. ResouliNia M. A. Chaudhry R. A. Britten Radiat. Res. 2001 156 584 589
77. T. J. Jenner J. Fulford P. O'Neill Radiat. Res. 2001 156 590 593
78. Q. Zhang Y. Wang Chem. Res. Toxicol. 2005 18 1897 1906
79. H. Hong H. Cao Y. Wang Chem. Res. Toxicol. 2006 19 614 621
80. A. Romieu S. Bellon D. Gasparutto J. Cadet Org. Lett. 2000 2 1085 1088
81. S. Bellon D. Gasparutto A. Romieu J. Cadet Nucleosides, Nucleotides Nucleic Acids 2001 20 967 971
82. Q. Zhang Y. Wang Nucleic Acids Res. 2005 33 1593 1603
83. A. S. Anderson J. T. Hwang M. M. Greenberg J. Org. Chem. 2000 65 4648 4654
84. I. S. Hong M. M. Greenberg Org. Lett. 2004 6 5011 5013
85. I. S. Hong H. Ding M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 2006 128 485 491
86. I. S. Hong M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 2005 127 3692 3693
87. M. Tomasz Y. Palom Pharmacol. Ther. 1997 76 73 87
88. D. M. Noll T. M. Mason P. S. Miller Chem. Rev. 2006 106 277 301
89. J. T. Millard M. F. Weidner J. J. Kirchner S. Ribeiro P. B. Hopkins Nucleic Acids Res. 1991 19 1885 1892
90. J. M. Brown W. R. Wilson Nat. Rev. Cancer 2004 4 437 447
91. H. Sugiyama I. Saito J. Am. Chem. Soc. 1990 112 6720
92. G. P. Cook M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 1996 118 10025 10030
93. H. Sugiyama K. Fujimoto I. Saito Tetrahedron Lett. 1996 37 1805 1808
94. N. A. P. Franken C. V. Bree M. A. T. Veltmaat H. M. Rodermond J. Haveman G. W. Barendsen J. Radiat. Res. 2001 42 179 190
95. L. L. Ling J. F. Ward Radiat. Res. 1990 121 76 83
96. I. S. Hong H. Ding M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 2006 128 2230 2231
97. I. S. Hong M. M. Greenberg J. Am. Chem. Soc. 2005 127 10510 10511
98. R. Tang K. Mislow J. Am. Chem. Soc. 1970 92 2100 2104
99. H. J. Reich K. E. Yelm S. Wollowitz J. Am. Chem. Soc. 1983 105 2503 2504
100. A. Krief F. Lonez Tetrahedron Lett. 2002 43 6255 6257
101. J. Ye J. G. Muller W. Luo C. L. Mayne A. J. Shallop J. Am. Chem. Soc. 2003 125 13926 13927
102. R. P. Hickerson F. Prat J. G. Muller C. S. Foote C. J. Burrows J. Am. Chem. Soc. 1999 121 9423 9428
103. J.-L. Ravanat P. Di Mascio G. R. Martinez M. H. G. Medeiros J. Cadet J. Biol. Chem. 2000 275 40601 40604
104. P. C. C. Lee M. A. J. Rodgers Photochem. Photobiol. 1987 45 79 86
105. W. M. Sharman C. M. Allen J. E. van Lier Methods Enzymol. 2000 319 376 400
106. D. E. Dolmans D. Fukumura R. Jain Nat. Rev. Cancer 2003 3 380 387