Genome projects and the functional-genomic era

Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening

Volumn 8, Issue 8, 2005, Pages 659-667

  Sauer, Sascha ^a   Konthur, Zoltán ^a   Lehrach, Hans ^a  

^a MAX PLANCK INSTITUTE FOR MOLECULAR GENETICS   (Germany)

Author keywords

Cell; Expression analysis; Functional genomics; Genotyping; Microarray; Proteomics; RNAi

Indexed keywords

DNA MARKER; MOLECULAR MARKER;

DNA MICROARRAY; FUNCTIONAL GENOMICS; GENE AMPLIFICATION; GENE EXPRESSION; GENE FUNCTION; GENE SEQUENCE; GENETIC VARIABILITY; GENOME; GENOTYPE; HAPLOTYPE; HUMAN; MOLECULAR GENETICS; NONHUMAN; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; POLYMERASE CHAIN REACTION; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN DNA INTERACTION; PROTEOMICS; REVIEW; RNA INTERFERENCE; SERIAL ANALYSIS OF GENE EXPRESSION; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM;

ANIMALS; BIOMEDICAL TECHNOLOGY; DNA; GENOMICS; HUMAN GENOME PROJECT; HUMANS; SEQUENCE ANALYSIS;

EID: 28844473537     PISSN: 13862073     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/138620705774962436     Document Type: Review

References (115)

1. Meyer, U. A. Nat. Rev. Genet. 2004, 5, 669.
2. Watson, J. D.; Crick, F. H. Nature 1953, 171, 737.
3. Lander, E. S.; Linton, L. M.; Birren, B.; Nusbaum, C.; Zody, M. C.; Baldwin, J.; Devon, K.; Dewar, K.; Doyle, M.; FitzHugh, W.; Funke, R.; Gage, D.; Harris, K.; Heaford, A.; Howland, J.; Kann, L.; Lehoczky, J.; LeVine, R.; McEwan, P.; McKernan, K.; Meldrim, J.; Mesirov, J. P.; Miranda, C.; Morris, W.; Naylor, J.; Raymond, C.; Rosetti, M.; Santos, R.; Sheridan, A.; Sougnez, C.; Stange-Thomann, N.; Stojanovic, N.; Subramanian, A.; Wyman, D.; Rogers, J.; Sulston, J.; Ainscough, R.; Beck, S.; Bentley, D.; Burton, J.; Clee, C.; Carter, N.; Coulson, A.; Deadman, R.; Deloukas, P.; Dunham, A.; Dunham, I.; Durbin, R.; French, L.; Grafham, D.; Gregory, S.; Hubbard, T.; Humphray, S.; Hunt, A.; Jones, M.; Lloyd, C.; McMurray, A.; Matthews, L.; Mercer, S.; Milne, S.; Mullikin, J. C.; Mungall, A.; Plumb, R.; Ross, M.; Shownkeen, R.; Sims, S.; Waterston, R. H.; Wilson, R. K.; Hillier, L. W.; McPherson, J. D.; Marra, M. A.; Mardis, E. R.; Fulton, L. A.; Chinwalla, A. T.; Pepin, K. H.; Gish, W. R.; Chissoe, S. L.; Wendl, M. C.; Delehaunty, K. D.; Miner, T. L.; Delehaunty, A. Kramer, J. B.; Cook, L. L.; Fulton, R. S.; Johnson, D. L.; Minx, P. J.; Clifton, S. W.; Hawkins, T.; Branscomb, E.; Predki, P. Richardson, P.; Wenning, S.; Slezak, T.; Doggett, N.; Cheng, J. F.; Olsen, A.; Lucas, S.; Elkin, C.; Uberbacher, E.; Frazier, M. Nature 2001, 409, 860.
4. Seo, H. C.; Kube, M.; Edvardsen, R. B.; Jensen, M. F.; Beck, A.; Spriet, E.; Gorsky, G.; Thompson, E. M.; Lehrach, H.; Reinhardt, R.; Chourrout, D. Science 2001, 294, 2506.
5. Hurt, P.; Walter, L.; Sudbrak, R.; Klages, S.; Muller, I.; Shiina, T.; Inoko, H.; Lehrach, H.; Gunther, E.; Reinhardt, R.; Himmelbauer, H. Genome Res. 2004, 14, 631.
6. Panopoulou, G.; Hennig, S.; Groth, D.; Krause, A.; Poustka, A. J.; Herwig, R.; Vingron, M.; Lehrach, H. Genome Res. 2003, 13, 1056.
7. Klipp, E.; Herwig, R.; Kowald, A.; Wierling, C.; Lehrach, H. Systems Biology in Practice. Concepts, Implementation and Application, Wiley-VCH, Weinheim, 2005.
8. The International HapMap Consortium Nature 2003, 426, 789.
9. Aebersold, R.; Mann, M. Nature 2003, 422, 198.
10. Reboul, J.; Vaglio, P.; Rual, J. F.; Lamesch, P.; Martinez, M.; Armstrong, C. M.; Li, S.; Jacotot, L.; Bertin, N.; Janky, R.; Moore, T.; Hudson, J. R., Jr.; Hartley, J. L.; Brasch, M. A.; Vandenhaute, J.; Boulton, S.; Endress, G. A.; Jenna, S.; Chevet, E.; Papasotiropoulos, V.; Tolias, P. P.; Ptacek, J.; Snyder, M.; Huang, R.; Chance, M. R.; Lee, H.; Doucette-Stamm, L.; Hill, D. E.; Vidal, M. Nat. Genet. 2003, 34, 35.
11. Grigorenko, E. V. DNA Arrays: Technologies and Experimental Strategies, CRC Press, Boca Raton, 2001.
12. Norberg, J.; Nilsson, L. Q Rev. Biophys. 2003, 36, 257.
13. Kell, D. B. Curr. Opin. Microbiol. 2004, 7, 296.
14. Pollock, D. D. Appl. Bioinformatics 2002, 1, 81.
15. Beckers, J.; Hrabe de Angelis, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 17.
16. Brookes, A. J. Gene 1999, 234, 177.
17. Eckhardt, F.; Beck, S.; Gut, I. G.; Berlin, K. Expert Rev. Mol. Diagn. 2004, 4, 609.
18. Olek, A.; Oswald, J.; Walter, J. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 5064.
19. Sanger, F.; Nickens, S.; Coulson, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1977, 74, 5463.
20. Nickerson, D. A.; Tobe, V. O.; Taylor, S. L. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 2745.
21. Underhill, P. A.; Jin, L.; Lin, A. A.; Mehdi, S. Q.; Jenkins, T.; Vollrath, D.; Davis, R. W.; Cavalli-Sforza, L. L.; Oefner, P. J. Genome Res. 1997, 7, 996.
22. Nordhoff, E.; Luebbert, C.; Thiele, G.; Heiser, V.; Lehrach, H. Nucleic Acids Res. 2000, 28, e86.
23. Krebs, S.; Medugorac, I.; Seichter, D.; Forster, M. Nucleic Acids Res. 2003, 31, e37.
24. Stanssens, P.; Zabeau, M.; Meersseman, G.; Remes, G.; Gansemans, Y.; Storm, N.; Hartmer, R.; Honisch, C.; Rodi, C. P.; Bocker, S.; van den Boom, D. Genome Res. 2004, 14, 126.
25. Hacia, J. G.; Fan, J. B.; Ryder, O.; Jin, L.; Edgemon, K.; Ghandour, G.; Mayer, R. A.; Sun, B.; Hsie, L.; Robbins, C. M.; Brody, L. C.; Wang, D.; Lander, E. S.; Lipshutz, R.; Fodor, S. P.; Collins, F. S. Nat. Genet. 1999, 22, 164.
26. Roberts, E.; Deeble, V. J.; Woods, C. G.; Taylor, G. R. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 3377.
27. Youil, R.; Kemper, B.; Cotton, R. G. Genomics 1996, 32, 431.
28. Fodde, R.; Losekoot, M. Hum. Mutat. 1994, 3, 83.
29. Hayashi, K. PCR Methods Applications 1991, 1, 34.
30. Faham, M.; Baharloo, S.; Tomitaka, S.; DeYoung, J.; Freimer, N. B. Hum. Mol. Genet. 2001, 10, 1657.
31. Mitra, R. D.; Shendure, J.; Olejnik, J.; Edyta Krzymanska, O.; Church, G. M. Anal. Biochem. 2003, 320, 55.
32. Mitra, R. D.; Church, G. M. Nucleic Acids Res. 1999, 27, e34.
33. Shendure, J.; Porreca, G. J.; Reppas, N. B.; Lin, X.; McCutcheon, J. P.; Rosenbaum, A. M.; Wang, M. D.; Zhang, K.; Mitra, R. D.; Church, G. M. Science 2005, 309, 1728.
34. Margulies, M.; Egholm, M.; Altman, W. E.; Attiya, S.; Bader, J. S.; Bemben, L. A.; Berka, J.; Braverman, M. S.; Chen, Y. J.; Chen, Z.; Dewell, S. B.; Du, L.; Fierro, J. M.; Gomes, X. V.; Godwin, B. C.; He, W.; Helgesen, S.; Ho, C. H.; Irzyk, G. P.; Jando, S. C.; Alenquer, M. L.; Jarviem, T. P.; Kirage, K. B.; Kim, J. B.; Knight, J. R.; Lanza, J. R.; Leamon, J. H.; Lefkowitz, S. M.; Lei, M.; LI, J.; Lohman, K. L.; Lu, H.; Makhijani, V. B.; McDade, K. E.; McKenna, M. P.; Myers, E. W.; Nickerson, E.; Nobile, J. R.; Plant, R.; Puc, B. P.; Ronan, M. T.; Roth, G. T.; Sarkis, G. J.; Simons, J. R.; Simpson, J. W.; Srinivasan, M.; Tartaro, K. R.; Tomasz, A.; Vogt, K. A.; Volkmer, G. A.;I Wang, S. H.; Wang, Y.; Weiner, M. P.; Yu, P.; Begley, R. F.; Rothberg, J. M. Nature 2005, in press.
35. Poustka, A.; Pohl, T.; Barlow, D. P.; Zehetner, G.; Craig, A.; Michiels, F.; Ehrich, E.; Frischauf, A. M.; Lehrach, H. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 1986, 51, 131.
36. Meier-Ewert, S.; Lange, J.; Gerst, H.; Herwig, R.; Schmitt, A.; Freund, J.; Elge, T.; Mott, R.; Herrmann, B.; Lehrach, H. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 2216.
37. Guerasimova, A.; Nyarsik, L.; Girnus, I.; Steinfath, M.; Wruck, W.; Griffiths, H.; Herwig, R.; Wierling, C.; O'Brien, J.; Eickhoff, H.; Lehrach, H.; Radelof, U. Biotechniques 2001, 31, 490.
38. Bauer, O.; Guerasimova, A.; Sauer, S.; Thamm, S.; Steinfath, M.; Herwig, R.; Janitz, M.; Lehrach, H.; Radelof, U. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 1821.
39. Howell, W. M.; Jobs, M.; Brookes, A. J. Genome Res. 2002, 12, 1401.
40. Smigielski, E. M.; Sirotkin, K.; Ward, M.; Sherry, S. T. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 352.
41. Matsuzaki, H.; Loi, H.; Dong, S.; Tsai, Y. Y.; Fang, J.; Law, J.; Di, X.; Liu, W. M.; Yang, G.; Liu, G.; Huang, J.; Kennedy, G. C.; Ryder, T. B.; Marcus, G. A.; Walsh, P. S.; Shriver, M. D.; Puck, J. M.; Jones, K. W.; Mei, R. Genome Res. 2004, 14, 414.
42. Hoehe, M. R. Pharmacogenomics 2003, 4, 547.
43. Velculescu, V. E.; Zhang, L.; Vogelstein, B.; Kinzler, K. W. Science 1995, 270, 484.
44. Brenner, S.; Johnson, M.; Bridgham, J.; Golda, G.; Lloyd, D. H.; Johnson, D.; Luo, S.; McCurdy, S.; Foy, M.; Ewan, M.; Roth, R.; George, D.; Eletr, S.; Albrecht, G.; Vermaas, E.; Williams, S. R.; Moon, K.; Burcham, T.; Pallas, M.; DuBridge, R. B.; Kirchner, J.; Fearon, K.; Mao, J.; Corcoran, K. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 630.
45. Burgtorf, C.; Kepper, P.; Hoehe, M.; Schmitt, C.; Reinhardt, R.; Lehrach, H.; Sauer, S. Genome Res. 2003, 13, 2717.
46. Hardenbol, P.; Baner, J.; Jain, M.; Nilsson, M.; Namsaraev, E. A.; Karlin-Neumann, G. A.; Fakhrai-Rad, H.; Ronaghi, M.; Willis, T. D.; Landegren, U.; Davis, R. W. Nat. Biotechnol. 2003, 5, 1.
47. Oliphant, A.; Barker, D. L.; Stuelpnagel, J. R.; Chee, M. S. Biotechniques 2002, Suppl, 56-8, 60.
48. Holland, P. M.; Abramson, R. D.; Watson, R.; Gelfand, D. H. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 7276.
49. Sauer, S.; Gut, I. G. J. Chrom. B Analyt. Technol. Biomed. Life Sci. 2002, 782, 73.
50. Haff, L. A.; Smirnov, I. P. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 3749.
51. Buetow, K. H.; Edmonson, M.; MacDonald, R.; Clifford, R.; Yip. P.; Kelley, J.; Little, D. P.; Strausberg, R.; Koester, H.; Cantor, C. R.; Braun, A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 581.
52. Sauer, S.; Lehrach, H.; Reinhardt, R. Nucleic Acids Res. 2003, 31, e63.
53. Sauer, S; Kepper, P; Smyra, A; Dahl, A.; Ferse, F-T; Lehrach, H; Reinhardt, R J. Chrom. A 2004, 1049, 9.
54. Lesage, S.; Zouali, H.; Cezard, J. P.; Colombel, J. F.; Belaiche, J.; Almer, S.; Tysk, C.; O'Morain, C.; Gassull, M.; Binder, V.; Finkel, Y.; Modigliani, R.; Gower-Rousseau, C.; Macry, J.; Merlin, F.; Chamaillard, M.; Jannot, A. S.; Thomas, G.; Hugot, J. P. Am. J. Hum. Genet. 2002, 70, 845.
55. Walter, J.; Paulsen, M. Semin. Cell Dev. Biol. 2003, 14, 101.
56. Adorjan, P.; Distler, J.; Lipscher, E.; Model, F.; Muller, J.; Pelet, C.; Braun, A.; Florl, A. R.; Gutig, D.; Grabs, G.; Howe, A.; Kursar, M.; Lesche, R.; Leu, E.; Lewin, A.; Maier, S.; Muller, V.; Otto, T.; Scholz, C.; Schulz, W. A.; Seifert, H. H.; Schwope, I.; Ziebarth, H.; Berlin, K.; Piepenbrock, C.; Olek, A. Nucleic Acids Res. 2002, 30, e21.
57. Cottrell, S. E.; Distler, J.; Goodman, N. S.; Mooney, S. H.; Kluth, A.; Olek, A.; Schwope, I.; Tetzner, R.; Ziebarth, H.; Berlin, K. Nucleic Acids Res. 2004, 32, e10.
58. Chuaqui, R. F.; Bonner, R. F.; Best, C. J.; Gillespie, J. W.; Flaig, M. J.; Hewitt, S. M.; Phillips, J. L.; Krizman, D. B.; Tangrea, M. A.; Ahram, M.; Linehan, W. M.; Knezevic, V.; Emmert-Buck, M. R. Nat. Genet. 2002, 32, 509.
59. Endrizzi, K.; Fischer, J.; Klein, K.; Schwab, M.; Nussler, A.; Neuhaus, P.; Eichelbaum, M.; Zanger, U. M. Anal. Biochem. 2002, 300, 121.
60. Biran, I.; Walt, D. R. Anal. Chem. 2002, 74, 3046.
61. Lizardi, P. M.; Huang, X.; Zhu, Z.; Bray-Ward, P.; Thomas, D. C.; Ward, D. C. Nat. Genet. 1998, 19, 225.
62. Angenendt, P.; Nyarsik, L.; Szaflarski, W.; Glokler, J.; Nierhaus, K. H.; Lehrach, H.; Cahill, D. J.; Lucking, A. Anal. Chem. 2004, 76, 1844.
63. Fire, A.; Xu, S.; Montgomery, M. K.; Kostas, S. A.; Driver, S. E.; Mello, C. C. Nature 1998, 391, 806.
64. Dorsett, Y.; Tuschl, T. Nat. Rev. Drug Discov. 2004, 3, 318.
65. Sohail, M.; Hochegger, H.; Klotzbucher, A.; Guellec, R. L.; Hunt, T.; Southern, E. M. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 2041.
66. Elbashir, S. M.; Harborth, J.; Lendeckel, W.; Yalcin, A.; Weber, K.; Tuschl, T. Nature 2001, 411, 494.
67. Sohail, M.; Doran, G.; Riedemann, J.; Macaulay, V.; Southern, E. M. Nucleic Acids Res. 2003, 31, e38.
68. Yuan, B.; Latek, R.; Hossbach, M.; Tuschl, T.; Lewitter, F. Nucleic Acids Res. 2004, 32, W130.
69. Scacheri, P.C.; Rozenblatt-Rosen, O.; Caplen, N.J.; Wolfsberg, T.G.; Umayam, L.; Lee, J.C.; Hughes, C.M.; Shanmugam, K.S.; Bhattacharjee, A.; Meyerson, M.; Collins, F.S. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 1892.
70. Persengiev, S.P.; Zhu, X.; Green, M.R. RNA 2004, 10, 12.
71. Bussow, K.; Quedenau, C.; Sievert, V.; Tischer, J.; Scheich, C.; Seitz, H.; Hieke, B.; Niesen, F. H.; Gotz, F.; Harttig, U.; Lehrach, H. Genome Biol. 2004, 5, 17.
72. Agaton, C.; Uhlen, M.; Hober, S. Electrophoresis 2004, 25, 1280.
73. Heinemann, U.; Frevert, J.; Hofmann, K.; Illing, G.; Maurer, C.; Oschkinat, H.; Saenger, W. Prog. Biophys. Mol. Biol. 2000, 73, 347.
74. Cherkasov A; Jones S. J. BMC Bioinformatics 2004, 5, 37.
75. Gullberg, M.; Fredriksson, S.; Taussig, M.; Jarvius, J.; Gustafsdottir, S.; Landegren, U. Curr. Opin. Biotechnol. 2003, 14, 82.
76. Agaton, C.; Falk, R.; Hoiden Guthenberg, I.; Gostring, L.; Uhlen, M.; Hober, S. J. Chrom. A 2004, 1043, 33.
77. Kohler, G.; Milstein, C. Nature 1975, 256, 495.
78. Konthur, Z.; Walter, G. Targets 2002, 1, 30.
79. Binz, H. K.; Amstutz, P.; Kohl, A.; Stumpp, M. T.; Briand, C.; Forrer, P.; Grutter, M. G.; Pluckthun, A. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 575.
80. Bock, L. C.; Griffin, L. C.; Latham, J. A.; Vermaas, E. H.; Toole, J. J. Nature 1992, 355, 564.
81. Tuerk, C.; Gold, L. Science 1990, 249, 505.
82. Golden, M. C.; Collins, B. D.; Willis, M. C.; Koch, T. H. J. Biotechnol. 2000, 81, 167.
83. Cox, J. C.; Rajendran, M.; Riedel, T.; Davidson, E. A.; Sooter, L. J.; Bayer, T. S.; Schmitz-Brown, M.; Ellington, A. D. Comb. Chem. High Throughput Screen. 2002, 5, 289.
84. Drolet, D. W.; Jenison, R. D.; Smith, D. E.; Pratt, D.; Hicke, B. J. Comb. Chem. High Throughput Screen. 1999, 2, 271.
85. Bussow, K.; Cahill, D.; Nietfeld, W.; Bancroft, D.; Scherzinger, E.; Lehrach, H.; Walter, G. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 5007.
86. Lueking, A.; Possling, A.; Huber, O.; Beveridge, A.; Horn, M.; Eickhoff, H.; Schuchardt, J.; Lehrach, H.; Cahill, D. J. Mol. Cell Proteomics 2003, 2, 1342.
87. Angenendt, P.; Glokler, J.; Murphy, D.; Lehrach, H.; Cahill, D. J. Anal. Biochem. 2002, 309, 253.
88. Angenendt, P.; Glokler, J.; Konthur, Z.; Lehrach, H.; Cahill, D. J. Anal. Chem. 2003, 75, 4368.
89. Angenendt, P.; Wilde, J.; Kijanka, G.; Baars, S.; Cahill, D. J.; Kreutzberger, J.; Lehrach, H.; Konthur, Z.; Glokler, J. Anal. Chem. 2004, 76, 2916.
90. Zhu, H.; Klemic, J. F.; Chang, S.; Bertone, P.; Casamayor, A.; Klemic, K. G.; Smith, D.; Gerstein, M.; Reed, M. A.; Snyder, M. Nat. Genet. 2000, 26, 283.
91. He, M.; Taussig, M. J. Nucleic Acids Res. 2001, 29, e73.
92. Giavalisco, P.; Nordhoff, E.; Lehrach, H.; Gobom, J.; Klose, J. Electrophoresis 2003, 24, 207.
93. Washburn, M. P.; Wolters, D.; Yates, J. R. 3rd, Nat. Biotechnol. 2001, 19, 242.
94. Fenn, J. B. Angew Chem. Int. Ed. Engl. 2003, 42, 3871.
95. Karas, M.; Hillenkamp, F. Anal. Chem. 1988, 60, 2299.
96. Mann, M.; Jensen, O. N. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 255.
97. Klose, J.; Nock, C.; Herrmann, M.; Stuhler, K.; Marcus, K.; Bluggel, M.; Krause, E.; Schalkwyk, L. C.; Rastan, S.; Brown, S. D.; Bussow, K.; Himmelbauer, H.; Lehrach, H. Nat. Genet. 2002, 30, 385.
98. Gavin, A. C.; Bosche, M.; Krause, R.; Grandi, P.; Marzioch, M.; Bauer, A.; Schultz, J.; Rick, J. M.; Michon, A. M.; Cruciat, C. M.; Remor, M.; Hofert, C.; Scheider, M.; Brajenovic, M.; Ruffner, H.; Merino, A.; Klein, K.; Hudak, M.; Dickson, D.; Rudi, T.; Gnau, V.; Bauch, A.; Bastuck, S.; Huhse, B.; Leutwein, C.; Heurtier, M. A.; Copley, R. R.; Edelmann, A.; Querfurth, E.; Rybin, V.; Drewes, G.; Raida, M.; Bouwmeester, T.; Bork, P.; Seraphin, B.; Kuster, B.; Neubauer, G.; Superti-Furga, G. Nature 2002, 415, 141.
99. Rigaut, G.; Shevchenko, A.; Rutz, B.; Wilm, M.; Mann, M.; Seraphin, B. Nat. Biotechnol. 1999, 17, 1030.
100. Bouwmeester, T.; Bauch, A.; Ruffner, H.; Angrand, P. O.; Bergamini, G.; Croughton, K.; Cruciat, C.; Eberhard, D.; Gagneur, J.; Ghidelli, S.; Hopf, C.; Huhse, B.; Mangano, R.; Michon, A. M.; Schirle, M.; Schlegl, J.; Schwab, M.; Stein, M. A.; Bauer, A.; Casari, G.; Drewes, G.; Gavin, A. C.; Jackson, D. B.; Joberty, G.; Neubauer, G.; Rick, J.; Kuster, B.; Superti-Furga, G. Nat. Cell Biol. 2004, 6, 97.
101. Fields, S.; Song, O. Nature 1989, 340, 245.
102. Goehler, H.; Lalowski, M.; Stelzl, U.; Waelter, S.; Stroedicke, M.; Worm, U.; Droege, A.; Lindenberg, K. S.; Knoblich, M.; Haenig, C.; Herbst, M.; Suopanki, J.; Scherzinger, E.; Abraham, C.; Bauer, B.; Hasenbank, R.; Fritzsche, A.; Ludewig, A. H.; Buessow, K.; Coleman, S. H.; Gutekunst, C. A.; Landwehrmeyer, B. G.; Lehrach, H.; Wanker, E. E. Mol. Cell 2004, 15, 853.
103. Uetz, P.; Giot, L.; Cagney, G.; Mansfield, T. A.; Judson, R. S.; Knight, J. R.; Lockshon, D.; Narayan, V.; Srinivasan, M.; Pochart, P.; Qureshi-Emili, A.; Li, Y.; Godwin, B.; Conover, D.; Kalbfleisch, T.; Vijayadamodar, G.; Yang, M.; Johnston, M.; Fields, S.; Rothberg, J. M. Nature 2000, 403, 623.
104. Hu, J. C. Trends Microbiol. 2001, 9, 219.
105. Fredriksson, S.; Gullberg, M.; Jarvius, J.; Olsson, C.; Pietras, K.; Gustafsdottir, S. M.; Ostman, A.; Landegren, U. Nat. Biotechnol. 2002, 20, 473.
106. Ruano, G.; Kidd, K. K.; Stephens, J. C. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1990, 87, 6296.
107. Weiss, S. Science 1999, 253, 1676.
108. Woolley, A. T.; Guillemette, C.; Li Cheung, C.; Housman, D. E.; Lieber, C. M. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 760.
109. Eigen, M.; Rigler, R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 5740.
110. Schwille, P.; Meyer-Almes, F. J.; Rigler, R. Biophys. J. 1997, 72, 1878.
111. Landegren, U.; Schallmeiner, E.; Nilsson, M.; Fredriksson, S.; Baner, J.; Gullberg, M.; Jarvius, J.; Gustafsdottir, S.; Dahl, F.; Soderberg, O.; Ericsson, O.; Stenberg, J. J. Mol. Recognit. 2004, 17, 194.
112. Nilsson, M.; Antson, D. O.; Barbany, G.; Landegren, U. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 578.
113. Kononen, J.; Bubendorf, L.; Kallioniemi, A.; Barlund, M.; Schraml, P.; Leighton, S.; Torhorst, J.; Mihatsch, M. J.; Sauter, G.; Kallioniemi, O. P. Nat Med. 1998, 4, 844.
114. Ziauddin, J.; Sabatini, D. M. Nature 2001, 411, 107.
115. Mousses, S.; Caplen, N. J.; Cornelison, R.; Weaver, D.; Basik, M.; Hautaniemi, S.; Elkahloun, A. G.; Lotufo, R. A.; Choudary, A.; Dougherty, E. R.; Suh, E.; Kallioniemi, O. Genome Res. 2003, 13, 2341.