Activation domain-mediator interactions promote transcription preinitiation complex assembly on promoter DNA

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 100, Issue 21, 2003, Pages 12003-12008

  Cantin, Greg T ^a   Stevens, Jennitte L ^a   Berk, Arnold J ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENOVIRUS VECTOR; BINDING PROTEIN; CELL EXTRACT; DNA; E1A PROTEIN; MITOGEN ACTIVATED PROTEIN KINASE; PROTEIN VP16; RNA POLYMERASE II; TRANSCRIPTION FACTOR; UNCLASSIFIED DRUG;

ANIMAL CELL; ARTICLE; CELL NUCLEUS; EMBRYO CELL; ENZYME ACTIVATION; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROMOTER REGION; PROTEIN ASSEMBLY; PROTEIN BINDING; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; STEM CELL; TRANSCRIPTION INITIATION; VIRUS ACTIVATION;

ADENOVIRUS E1A PROTEINS; ANIMALS; ATP-BINDING CASSETTE TRANSPORTERS; BINDING SITES; CELLS, CULTURED; DNA; DNA-BINDING PROTEINS; ETS-DOMAIN PROTEIN ELK-1; MICE; MICE, KNOCKOUT; MIXED FUNCTION OXYGENASES; MODELS, BIOLOGICAL; PROMOTER REGIONS (GENETICS); PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; PROTO-ONCOGENE PROTEINS; RNA POLYMERASE II; TRANS-ACTIVATORS; TRANSCRIPTION FACTORS;

ADENOVIRIDAE; ANIMALIA; METAZOA;

EID: 0142123132     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.2035253100     Document Type: Article

References (65)

1. Berger, S. L. (2002) Curr. Opin. Genet. Dev. 12, 142-148.
2. Becker, P. B. & Horz, W. (2002) Annu. Rev. Biochem. 71, 247-273.
3. Horn, P. J. & Peterson, C. L. (2002) Science 297, 1824-1827.
4. Jenuwein, T. & Allis, C. D. (2001) Science 293, 1074-1080.
5. Neely, K. E. & Workman, J. L. (2002) Mol. Genet. Metab. 76, 1-5.
6. Roeder, R. G. (1998) Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 63, 201-218.
7. Woychik, N. A. & Hampsey, M. (2002) Cell 108, 453-463.
8. Hampsey, M. & Reinberg, D. (1999) Curr. Opin. Genet. Dev. 9, 132-139.
9. Lee, T. I. & Young, R. A. (2000) Annu. Rev. Genet. 34, 77-137.
10. Malik, S. & Roeder, R. G. (2000) Trends Biochem. Sci. 25, 277-283.
11. Myers, L. C. & Kornberg, R. D. (2000) Annu. Rev. Biochem. 69, 729-749.
12. Naar, A. M. Lemon, B. D. & Tjian, R. (2001) Annu. Rev. Biochem. 70, 475-501.
13. Rachez, C. & Freedman, L. P. (2001) Curr. Opin. Cell Biol. 13, 274-280.
14. Lorch, Y., Beve, J., Gustafsson, C. M., Myers, L. C. & Kornberg, R. D. (2000) Mol. Cell 6, 197-201.
15. Ranish, J. A., Yudkovsky, N. & Hahn, S. (1999) Genes Dev. 13, 49-63.
16. Kuras, L. & Struhl, K. (1999) Nature 399, 609-613.
17. Li, X. Y., Virbasius, A., Zhu, X. & Green, M. R. (1999) Nature 399, 605-609.
18. Lieberman, P. M. & Berk, A. J. (1994) Genes Dev. 8, 995-1006.
19. Uesugi, M., Nyanguile, O., Lu, H., Levine, A. J. & Verdine, G. L. (1997) Science 277, 1310-1313.
20. Naar, A. M., Beaurang, P. A., Zhou, S., Abraham, S., Solomon, W. & Tjian, R. (1999) Nature 398, 828-832.
21. Hall, D. B. & Struhl, K. (2002) J. Biol. Chem. 277, 46043-46050.
22. Boyer, T. G., Martin, M. E., Lees, E., Ricciardi, R. P. & Berk, A. J. (1999) Nature 399, 276-279.
23. Wang, G. & Berk, A. J. (2002) J. Virol. 76, 9186-9193.
24. Culp, J. S., Webster, L. C., Friedman, D. J., Smith, C. L., Huang, W. J., Wu, F. Y., Rosenberg, M. & Ricciardi, R. P. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 6450-5454.
25. Webster, L. C. & Ricciardi, R. P. (1991) Mol. Cell. Biol. 11, 4287-4296.
26. Martin, K. J., Lillie, J. W. & Green, M. R. (1990) Nature 346, 147-152.
27. Sullivan, S. M., Horn, P. J., Olson, V. A., Koop, A. H., Niu, W., Ebright, R. H. & Triezenberg, S. J. (1998) Nucleic Acids Res. 26, 4487-4496.
28. Natarajan, K., Jackson, B. M., Zhou, H., Winston, F. & Hinnebusch, A. G. (1999) Mol. Cell 4, 657-664.
29. Stevens, J. L., Cantin, G. T., Wang, G., Shevchenko, A., Shevchenko, A. & Berk, A. J. (2002) Science 296, 755-758.
30. Ito, M., Okano, H. J., Darnell, R. B. & Roeder, R. G. (2002) EMBO J. 21, 3464-3475.
31. Tudor, M., Murray, P. J., Onufryk, C., Jaenisch, R. & Young, R. A. (1999) Genes Dev. 13, 2365-2368.
32. Ito, M., Yuan, C. X., Okano, H. J., Darnell, R. B. & Roeder, R. G. (2000) Mol. Cell 5, 683-693.
33. Holstege, F. C., Jennings, E. G., Wyrick, J. J., Lee, T. I., Hengartner, C. J., Green, M. R., Golub, T. R., Lander, E. S. & Young, R. A. (1998) Cell 95, 717-728.
34. Myers, L. C., Gustafsson, C. M., Hayashibara, K. C., Brown, P. O. & Kornberg, R. D. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 67-72.
35. Lee, Y. C., Park, J. M., Min, S., Han, S. J. & Kim, Y. J. (1999) Mol. Cell. Biol. 19, 2967-2976.
36. Koleske, A. J. & Young, R. A. (1995) Trends Biochem. Sci. 20, 113-116.
37. Kim, Y. J., Bjorklund, S., Li, Y., Sayre, M. H. & Kornberg, R. D. (1994) Cell 77, 599-608.
38. Gustafsson, C. M., Myers, L. C., Beve, J., Spahr, H., Lui, M., Erdjument-Bromage, H., Tempst, P. & Kornberg, R. D. (1998) J. Biol. Chem. 273, 30851-30854.
39. Han, S. J., Lee, Y. C., Gim, B. S., Ryu, G. H., Park, S. J., Lane, W. S. & Kim, Y. J. (1999) Mol. Cell. Biol. 19, 979-988.
40. Liu, Y., Ranish, J. A., Aebersold, R. & Hahn, S. (2001) J. Biol. Chem. 276, 7169-7175.
41. Dignam, J. D., Martin, P. L., Shastry, B. S. & Roeder, R. G. (1983) Methods Enzymol. 101, 582-598.
42. Jiang, Y. W., Veschambre, P., Erdjument-Bromage, H., Tempst, P., Conaway, J. W., Conaway, R. C. & Kornberg, R. D. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 8538-8543.
43. Fondell, J. D., Ge, H. & Roeder, R. G. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 8329-8333.
44. Ito, M., Yuan, C. X., Malik, S., Gu, W., Fondell, J. D., Yamamura, S., Fu, Z. Y., Zhang, X., Qin, J. & Roeder, R. G. (1999) Mol. Cell 3, 361-370.
45. Sun, X., Zhang, Y., Cho, H., Rickert, P., Lees, E., Lane, W. & Reinberg, D. (1998) Mol. Cell 2, 213-222.
46. Rachez, C., Lemon, B. D., Suldan, Z., Bromleigh, V., Gamble, M., Naar, A. M., Erdjument-Bromage, H., Tempst, P. & Freedman, L. P. (1999) Nature 398, 824-828.
47. Ryu, S. & Tjian, R. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 7137-7142.
48. Wang, G., Cantin, G. T., Stevens, J. L. & Berk, A. J. (2001) Mol. Cell. Biol. 21, 4604-4613.
49. Thompson, N. E., Aronson, D. B. & Burgess, R. R. (1990) J. Biol. Chem. 265, 7069-7077.
50. Hahn, S., Buratowski, S. & Sharp, P. A. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 5718-5722.
51. Johnson, K. M., Wang, J., Smallwood, A., Arayata, C. & Carey, M. (2002) Genes Dev. 16, 1852-1863.
52. Chao, D. M., Gadbois, E. L., Murray, P. J., Anderson, S. F., Sonu, M. S., Parvin, J. D. & Young, R. A. (1996) Nature 380, 82-85.
53. Ptashne, M. & Gann, A. (1997) Nature 386, 569-577.
54. Guermah, M., Tao, Y. & Roeder, R. G. (2001) Mol. Cell. Biol. 21, 6882-6894.
55. Mittler, G., Kremmer, E., Timmers, H. T. & Meisterernst, M. (2001) EMBO Rep. 2, 808-813.
56. Baek, H. J., Malik, S., Qin, J. & Roeder, R. G. (2002) Mol. Cell. Biol. 22, 2842-2852.
57. Reeves, W. M. & Hahn, S. (2003) Mol. Cell. Biol. 23, 349-358.
58. Ge, K., Guermah, M., Yuan, C. X., Ito, M., Wallberg, A. E., Spiegelman, B. M. & Roeder, R. G. (2002) Nature 417, 563-567.
59. Balciunas, D., Hallberg, M., Bjorklund, S. & Ronne, H. (2003) J. Biol. Chem. 278, 3831-3839.
60. Bushnell, D. A., Bamdad, C. & Kornberg, R. D. (1996) J. Biol. Chem. 271, 20170-20174.
61. Nikolov, D. B., Chen, H., Halay, E. D., Usheva, A. A., Hisatake, K., Lee, D. K., Roeder, R. G. & Burley, S. K. (1995) Nature 377, 119-128.
62. Coulombe, B., Li, J. & Greenblatt, J. (1994) J. Biol. Chem. 269, 19962-19967.
63. Kim, T. K., Ebright, R. H. & Reinberg, D. (2000) Science 288, 1418-1422.
64. Gnatt, A. L., Cramer, P., Fu, J., Bushnell, D. A. & Kornberg, R. D. (2001) Science 292, 1876-1882.
65. Sakurai, H. & Fukasawa, T. (2000) J. Biol. Chem. 275, 37251-37256.