Impact of increasing fruit and vegetables and flavonoid intake on the human gut microbiota

Food and Function

Volumn 7, Issue 4, 2016, Pages 1788-1796

  Klinder, Annett ^a,b   Shen, Qing ^a   Heppel, Susanne ^a   Lovegrove, Julie A ^a   Rowland, Ian ^a   Tuohy, Kieran M ^a,c  

^a UNIVERSITY OF READING   (United Kingdom)

^b ROSTOCK UNIVERSITY MEDICAL CENTER   (Germany)

^c RESEARCH AND INNOVATION CENTRE   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DISEASES; FLAVONOIDS; FLUORESCENCE MICROSCOPY; FRUITS; VEGETABLES;

BACTERIAL POPULATION; CARDIOVASCULAR DISEASE; CORRELATION ANALYSIS; EPIDEMIOLOGICAL STUDIES; FRUIT AND VEGETABLES; FRUITS AND VEGETABLES; HUMAN GUT MICROBIOTA; PROTECTIVE EFFECTS;

RISK ASSESSMENT;

FLAVONOID;

BACTERIUM; CARDIOVASCULAR DISEASES; CLASSIFICATION; CONTROLLED STUDY; DIET; EATING; FECES; FEMALE; FRUIT; GENETICS; GROWTH, DEVELOPMENT AND AGING; HUMAN; INTESTINE FLORA; ISOLATION AND PURIFICATION; MALE; METABOLISM; MICROBIOLOGY; MIDDLE AGED; RANDOMIZED CONTROLLED TRIAL; VEGETABLE;

BACTERIA; CARDIOVASCULAR DISEASES; DIET; EATING; FECES; FEMALE; FLAVONOIDS; FRUIT; GASTROINTESTINAL MICROBIOME; HUMANS; MALE; MIDDLE AGED; VEGETABLES;

EID: 84966355957     PISSN: 20426496     EISSN: 2042650X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5fo01096a     Document Type: Article

References (82)

1. S. Liu J. E. Manson I. M. Lee S. R. Cole C. H. Hennekens W. C. Willett J. E. Buring Am. J. Clin. Nutr. 2000 72 922 928
2. K. J. Joshipura F. B. Hu J. E. Manson M. J. Stampfer E. B. Rimm F. E. Speizer G. Colditz A. Ascherio B. Rosner D. Spiegelman W. C. Willett Ann. Intern. Med. 2001 134 1106 1114
3. S. Liu I. M. Lee U. Ajani S. R. Cole J. E. Buring J. E. Manson Int. J. Epidemiol. 2001 30 130 135
4. L. A. Bazzano J. He L. G. Ogden C. M. Loria S. Vupputuri L. Myers P. K. Whelton Am. J. Clin. Nutr. 2002 76 93 99
5. WHO Joint WHO/FAO Expert Consultation, Diet, Nutrition and the Prevention of Chronic Disease, Technical Report Series No 916, 2003
6. United States Department of Agriculture, Food and Nutrition Service, http://www.fns.usda.gov/tn/myplate
7. (accessed August 2015)
8. S. Liu J. E. Buring H. D. Sesso E. B. Rimm W. C. Willett J. E. Manson J. Am. Coll. Cardiol. 2002 39 49 56
9. L. A. Bazzano J. He L. G. Ogden C. M. Loria P. K. Whelton Arch. Intern. Med. 2003 163 1897 1904
10. D. Mozaffarian S. K. Kumanyika R. N. Lemaitre J. L. Olson G. L. Burke D. S. Siscovick JAMA 2003 289 1659 1666
11. J. W. Erdman D. Balentine L. Arab G. Beecher J. T. Dwyer J. Folts J. Harnly P. Hollman C. L. Keen G. Mazza M. Messina A. Scalbert J. Vita G. Williamson J. Burrowes J. Nutr. 2007 137 718S 737S
12. P. D. Cani J. Amar M. A. Iglesias M. Poggi C. Knauf D. Bastelica A. M. Neyrinck F. Fava K. M. Tuohy C. Chabo A. Waget E. Delmee B. Cousin T. Sulpice B. Chamontin J. Ferrieres J. F. Tanti G. R. Gibson L. Casteilla N. M. Delzenne M. C. Alessi R. Burcelin Diabetes 2007 56 1761 1772
13. K. M. Tuohy F. Fava R. Viola Proc. Nutr. Soc. 2014 73 172 185
14. G. R. Gibson H. M. Probert J. V. Loo R. A. Rastall M. B. Roberfroid Nutr. Res. Rev. 2004 17 259 275
15. S. Kolida G. R. Gibson J. Nutr. 2007 137 2503S 2506S
16. E. Olano-Martin G. R. Gibson R. A. Rastall J. Appl. Microbiol. 2002 93 505 511
17. K. Manderson M. Pinart K. M. Tuohy W. E. Grace A. T. Hotchkiss W. Widmer M. P. Yadhav G. R. Gibson R. A. Rastall Appl. Environ. Microbiol. 2005 71 8383 8389
18. T. R. Licht M. Hansen A. Bergstrom M. Poulsen B. N. Krath J. Markowski L. O. Dragsted A. Wilcks BMC Microbiol. 2010 10 13
19. K. Da S. Queiroz-Monici G. E. Costa N. da Silva S. M. Reis A. C. de Oliveira Nutrition 2005 21 602 608
20. R. Simmering H. Pforte G. Jacobasch M. Blaut FEMS Microbiol. Ecol. 2002 40 243 248
21. X. Tzounis A. Rodriguez-Mateos J. Vulevic G. R. Gibson C. Kwik-Uribe J. P. Spencer Am. J. Clin. Nutr. 2011 93 62 72
22. M. I. Queipo-Ortuño M. Boto-Ordóñez M. Murri J. M. Gomez-Zumaquero M. Clemente-Postigo R. Estruch F. Cardona Diaz C. Andrés-Lacueva F. J. Tinahones Am. J. Clin. Nutr. 2012 95 1323 1334
23. M. F. Chong T. W. George D. Alimbetov Y. Jin M. Weech A. L. Macready J. P. Spencer O. B. Kennedy A. M. Minihane M. H. Gordon J. A. Lovegrove Eur. J. Nutr. 2013 52 361 378
24. S. Martin-Pelaez G. R. Gibson S. M. Martin-Orue A. Klinder R. A. Rastall R. M. La Ragione M. J. Woodward A. Costabile FEMS Microbiol. Ecol. 2008 66 608 619
25. P. S. Langendijk F. Schut G. J. Jansen G. C. Raangs G. R. Kamphuis M. H. Wilkinson G. W. Welling Appl. Environ. Microbiol. 1995 61 3069 3075
26. W. Manz R. Amann W. Ludwig M. Vancanneyt K. H. Schleifer Microbiology 1996 142 1097 1106
27. A. H. Franks H. J. Harmsen G. C. Raangs G. J. Jansen F. Schut G. W. Welling Appl. Environ. Microbiol. 1998 64 3336 3345
28. H. J. M. Harmsen P. Eifferich F. Schut G. W. Welling Microb. Ecol. Health Dis. 1999 11 3 12
29. H. J. Harmsen A. C. Wildeboer-Veloo J. Grijpstra J. Knol J. E. Degener G. W. Welling Appl. Environ. Microbiol. 2000 66 4523 4527
30. G. L. Hold A. Schwiertz R. I. Aminov M. Blaut H. J. Flint Appl. Environ. Microbiol. 2003 69 4320 4324
31. H. J. Harmsen G. C. Raangs T. He J. E. Degener G. W. Welling Appl. Environ. Microbiol. 2002 68 2982 2990
32. R. Simmering B. Kleessen M. Blaut Appl. Environ. Microbiol. 1999 65 3705 3709
33. H. Daims A. Bruhl R. Amann K. H. Schleifer M. Wagner Syst. Appl. Microbiol. 1999 22 434 444
34. A. L. Macready T. W. George M. F. Chong D. S. Alimbetov Y. Jin A. Vidal J. P. Spencer O. B. Kennedy K. M. Tuohy A. M. Minihane M. H. Gordon J. A. Lovegrove Am. J. Clin. Nutr. 2014 99 479 489
35. M. Nelson, M. Atkinson and J. Meyer, A Photographic Atlas of Food Portion Sizes, MAFF Publications, London, 1997
36. http://www.statstutor.ac.uk/resources/uploaded/spearmans.pdf
37. (accessed November 2015)
38. Total dietary fibre in foods, AOAC Official Methods of Analysis, AOAC International, Gaithersburg, MD, 16th edn, 1995
39. H. C. Lee A. M. Jenner C. S. Low Y. K. Lee Res. Microbiol. 2006 157 876 884
40. M. V. Selma J. C. Espín F. A. Tomás-Barberán J. Agric. Food. Chem. 2009 57 6485 6501
41. T. Unno M. Sakuma S. Mitsuhashi J. Nutr. Sci. Vitaminol. 2014 60 213 219
42. A. W. Walker J. Ince S. H. Duncan L. M. Webster G. Holtrop X. Ze D. Brown M. D. Stares P. Scott A. Bergerat P. Louis F. McIntosh A. M. Johnstone G. E. Lobley J. Parkhill H. J. Flint ISME J. 2011 5 220 230
43. R. K. Le Leu J. M. Winter C. T. Christophersen G. P. Young K. J. Humphreys Y. Hu S. W. Gratz R. B. Miller D. L. Topping A. R. Bird M. A. Conlon Br. J. Nutr. 2015 114 220 230
44. X. Ze S. H. Duncan P. Louis H. J. Flint ISME J. 2012 6 1535 1543
45. L. A. David C. F. Maurice R. N. Carmody D. B. Gootenberg J. E. Button B. E. Wolfe A. V. Ling A. S. Devlin Y. Varma M. A. Fischbach S. B. Biddinger R. J. Dutton P. J. Turnbaugh Nature 2014 505 559 563
46. C. De Filippo D. Cavalieri M. Di Paola M. Ramazzotti J. B. Poullet S. Massart S. Collini G. Pieraccini P. Lionetti Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 14691 14696
47. F. De Filippis N. Pellegrini L. Vannini I. B. Jeffery A. La Storia L. Laghi D. I. Serrazanetti R. Di Cagno I. Ferrocino C. Lazzi S. Turroni L. Cocolin P. Brigidi E. Neviani M. Gobbetti P. W. O'Toole D. Ercolini Gut 2015 10.1136/gutjnl-2015-309957
48. M. L. Bertoia K. J. Mukamal L. E. Cahill T. Hou D. S. Ludwig D. Mozaffarian W. C. Willett F. B. Hu E. B. Rimm PLoS Med. 2015 12 e1001878 10.1371/journal.pmed.1001878
49. R. E. Ley Curr. Opin. Gastroenterol. 2010 26 5 11
50. L. C. Kong B. A. Holmes A. Cotillard F. Habi-Rachedi R. Brazeilles S. Gougis N. Gausserès P. D. Cani S. Fellahi J. P. Bastard S. P. Kennedy J. Doré S. D. Ehrlich J. D. Zucker S. W. Rizkalla K. Clément PLoS One 2014 9 e109434 10.1371/journal.pone.0109434
51. R. E. Ley F. Bäckhed P. Turnbaugh C. A. Lozupone R. D. Knight J. I. Gordon Proc. Natl. Acad. Sci U. S. A. 2005 102 11070 11075
52. I. Nadal A. Santacruz A. Marcos J. Warnberg J. M. Garagorri L. A. Moreno M. Martin-Matillas C. Campoy A. Martí A. Moleres M. Delgado O. L. Veiga M. García-Fuentes C. G. Redondo Y. Sanz Int. J. Obes. 2009 33 758 767
53. F. Fava R. Gitau B. A. Griffin G. R. Gibson K. M. Tuohy J. A. Lovegrove Int. J. Obes. 2013 37 216 223
54. S. H. Duncan G. E. Lobley G. Holtrop J. Ince A. M. Johnstone P. Louis H. J. Flint Int. J. Obes. 2008 32 1720 1724
55. A. Schwiertz D. Taras K. Schäfer S. Beijer N. A. Bos C. Donus P. D. Hardt Obesity 2010 18 190 195
56. M. Arumugam J. Raes E. Pelletier D. Le Paslier T. Yamada D. R. Mende G. R. Fernandes J. Tap T. Bruls J. M. Batto M. Bertalan N. Borruel F. Casellas L. Fernandez L. Gautier T. Hansen M. Hattori T. Hayashi M. Kleerebezem K. Kurokawa M. Leclerc F. Levenez C. Manichanh H. B. Nielsen T. Nielsen N. Pons J. Poulain J. Qin T. Sicheritz-Ponten S. Tims D. Torrents E. Ugarte E. G. Zoetendal J. Wang F. Guarner O. Pedersen W. M. de Vos S. Brunak J. Doré; MetaHIT Consortium M. Antolín F. Artiguenave H. M. Blottiere M. Almeida C. Brechot C. Cara C. Chervaux A. Cultrone C. Delorme G. Denariaz R. Dervyn K. U. Foerstner C. Friss M. van de Guchte E. Guedon F. Haimet W. Huber J. van Hylckama-Vlieg A. Jamet C. Juste G. Kaci J. Knol O. Lakhdari S. Layec K. Le Roux E. Maguin A. Mérieux R. Melo Minardi C. M'rini J. Muller R. Oozeer J. Parkhill P. Renault M. Rescigno N. Sanchez S. Sunagawa A. Torrejon K. Turner G. Vandemeulebrouck E. Varela Y. Winogradsky G. Zeller J. Weissenbach S. D. Ehrlich P. Bork Nature 2011 473 174 180
57. G. D. Wu J. Chen C. Hoffmann K. Bittinger Y. Y. Chen S. A. Keilbaugh M. Bewtra D. Knights W. A. Walters R. Knight R. Sinha E. Gilroy K. Gupta R. Baldassano L. Nessel H. Li F. D. Bushman J. D. Lewis Science 2011 334 105 108
58. M. Roberfroid G. R. Gibson L. Hoyles A. L. McCartney R. Rastall I. Rowland D. Wolvers B. Watzl H. Szajewska B. Stahl F. Guarner F. Respondek K. Whelan V. Coxam M. J. Davicco L. Léotoing Y. Wittrant N. M. Delzenne P. D. Cani A. M. Neyrinck A. Meheust Br. J. Nutr. 2010 104 Suppl 2 S1 63
59. P. D. Cani S. Possemiers T. Van de Wiele Y. Guiot A. Everard O. Rottier L. Geurts D. Naslain A. Neyrinck D. M. Lambert G. G. Muccioli N. M. Delzenne Gut 2009 58 1091 1103
60. J. A. Peña J. Versalovic Cell Microbiol. 2003 5 277 285
61. M. Schultz H. J. Linde N. Lehn K. Zimmermann J. Grossmann W. Falk J. Schölmerich J. Dairy Res. 2003 70 165 173
62. J. Vulevic A. Drakoularakou P. Yaqoob G. Tzortzis G. R. Gibson Am. J. Clin. Nutr. 2008 88 1438 1446
63. M. Begley C. Hill C. G. M. Gahan Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 1729 1738
64. L. G. Ooi M. T. Liong Int. J. Mol. Sci. 2010 11 2499 2522
65. P. L. Hollænder A. B. Ross M. Kristensen Am. J. Clin. Nutr. 2015 102 556 572
66. E. A. de Deckere W. J. Kloots J. M. van Amelsvoort J. Nutr. 1993 123 2142 2151
67. H. H. Cheng M. H. Lai J. Nutr. 2000 130 1991 1995
68. K. H. Han M. Iijuka K. Shimada M. Sekikawa K. Kuramochi K. Ohba L. Ruvini H. Chiji M. Fukushima Br. J. Nutr. 2005 94 902 908
69. D. Chen Z. Yang X. Chen Y. Huang B. Yin F. Guo H. Zhao T. Zhao H. Qu J. Huang Y. Wu R. Gu BMC Complement. Altern. Med. 2014 14 386 10.1186/1472-6882-14-386
70. Ł. Krych D. S. Nielsen A. K. Hansen C. H. Hansen Gut Microbes 2015 6 101 109
71. B. Di Luccia R. Crescenzo A. Mazzoli L. Cigliano P. Venditti J. C. Walser A. Widmer L. Baccigalupi E. Ricca S. Iossa PLoS One 2015 10 e0134893 10.1371/journal.pone.0134893
72. M. Y. Song J. H. Wang T. Eom H. Kim Nutr. Res. 2015 35 655 663
73. L. Lahti A. Salonen R. A. Kekkonen J. Salojärvi J. Jalanka-Tuovinen A. Palva M. Orešič W. M. de Vos PeerJ 2013 1 e32 10.7717/peerj.32
74. P. J. Turnbaugh M. Hamady T. Yatsunenko B. L. Cantarel A. Duncan R. E. Ley M. L. Sogin W. J. Jones B. A. Roe J. P. Affourtit M. Egholm B. Henrissat A. C. Heath R. Knight J. I. Gordon Nature 2009 457 480 484
75. R. A. Koeth Z. Wang B. S. Levison J. A. Buffa E. Org B. T. Sheehy E. B. Britt X. Fu Y. Wu L. Li J. D. Smith J. A. DiDonato J. Chen H. Li G. D. Wu J. D. Lewis M. Warrier J. M. Brown R. M. Krauss W. H. Tang F. D. Bushman A. J. Lusis S. L. Hazen Nat. Med. 2013 19 576 585
76. Z. Wang E. Klipfell B. J. Bennett R. Koeth B. S. Levison B. Dugar A. E. Feldstein E. B. Britt X. Fu Y. M. Chung Y. Wu P. Schauer J. D. Smith H. Allayee W. H. Tang J. A. DiDonato A. J. Lusis S. L. Hazen Nature 2011 472 57 63
77. W. H. Tang Z. Wang B. S. Levison R. A. Koeth E. B. Britt X. Fu Y. Wu S. L. Hazen N. Engl. J. Med. 2013 368 1575 1584
78. N. Nakajima K. Ishihara Y. Matsuura Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002 59 182 189
79. T. Kanai Y. Mikami A. Hayashi J. Gastroenterol. 2015 50 928 939
80. F. Y. Wang J. M. Liu H. H. Luo A. H. Liu Y. Jiang World J. Gastroenterol. 2015 21 8340 8351
81. M. Seo I. Inoue M. Tanaka N. Matsuda T. Nakano T. Awata S. Katayama D. H. Alpers T. Komoda Dig. Dis. Sci. 2013 58 3534 3544
82. H. Endo M. Niioka N. Kobayashi M. Tanaka T. Watanabe PLoS One 2013 8 e63388 10.1371/journal.pone.0063388