Inhibition of insulin amyloid fibrillization by glyco-acridines: An in vitro and in silico study

MedChemComm

Volumn 6, Issue 5, 2015, Pages 810-822

  Van Vuong, Quan ^a   Bednarikova, Zuzana ^b,c   Antosova, Andrea ^b   Huy, Pham Dinh Quoc ^a,d   Siposova, Katarina ^b   Tuan, Nguyen Anh ^e   Li, Mai Suan ^a,d   Gazova, Zuzana ^b  

^a INSTITUTE FOR COMPUTATIONAL SCIENCE AND TECHNOLOGY   (Viet Nam)

^b INSTITUTE OF EXPERIMENTAL PHYSICS   (Slovakia)

^c P J AFÁRIK UNIVERSITY   (Slovakia)

^d INSTITUTE OF PHYSICS   (Poland)

^e UNIVERSITY OF NATURAL SCIENCES   (Viet Nam)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACRIDINE DERIVATIVE; AMYLOID; CYCLIC 1,3 THIAZOLIDINONE DERIVATIVE; FUSED CARBON NITROGEN HETEROCYCLE; INSULIN; ISOTHIOSEMICARBAZIDE DERIVATIVE; THIOSEMICARBAZIDE DERIVATIVE; UNCLASSIFIED DRUG;

ALPHA HELIX; ANTI AGGREGATION ACTIVITY; ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; BETA SHEET; BINDING AFFINITY; BINDING FREE ENERGY; COMPUTER MODEL; CONCENTRATION RESPONSE; CONTROLLED STUDY; DRUG ACTIVITY; DRUG BINDING SITE; DRUG MECHANISM; DRUG SCREENING; DRUG STRUCTURE; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; HYDROGEN BOND; IC50; IN VITRO STUDY; LAG TIME; MOLECULAR DOCKING; MOLECULAR DYNAMICS; PHARMACOLOGICAL PARAMETERS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN AGGREGATION; STEREOISOMERISM; STRUCTURE ACTIVITY RELATION;

EID: 84929320322     PISSN: 20402503     EISSN: 20402511     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5md00004a     Document Type: Article

References (46)

1. F. Chiti C. M. Dobson Annu. Rev. Biochem. 2006 75 333 366
2. C. M. Dobson Nature 2003 426 884 890
3. M. M. Varughese J. Newman J. Biophys. 2012 434289
4. F. E. Cohen J. W. Kelly Nature 2003 426 905 909
5. T. Härd C. Lendel J. Mol. Biol. 2012 421 441 465
6. Y. Porat A. Abramowitz E. Gazit Chem. Biol. Drug Des. 2006 67 27 37
7. Y. Hong L. Meng S. Chen C. W. T. Leung L.-T. Da M. Faisal D.-A. Silva J. Liu J. W. Y. Lam X. Huang B. Z. Tang J. Am. Chem. Soc. 2012 134 1680 1689
8. D. Latawiec F. Herrera A. Bek V. Losasso M. Candotti F. Benetti E. Carlino A. Kranjc M. Lazzarino S. Gustincich P. Carloni G. Legname PLoS One 2010 5 e9234
9. B. Y. Feng B. H. Toyama H. Wille D. W. Colby S. R. Collins B. C. H. May S. B. Prusiner J. Weissman B. K. Shoichet Nat. Chem. Biol. 2008 4 197 199
10. N. Sarkar M. Kumar V. K. Dubey Biochim. Biophys. Acta, Gen. Subj. 2011 1810 809 814
11. S. T. Ngo M. S. Li J. Phys. Chem. B 2012 116 10165 10175
12. F. Yang G. P. Lim A. N. Begum O. J. Ubeda M. R. Simmons S. S. Ambegaokar P. P. Chen R. Kayed C. G. Glabe S. A. Frautschy G. M. Cole J. Biol. Chem. 2005 280 5892 5901
13. K. Ono M. Yamada J. Neurochem. 2006 97 105 115
14. E. Kachooei A. A. Moosavi-Movahedi F. Khodagholi F. Mozaffarian P. Sadeghi H. Hadi-Alijanvand A. Ghasemi A. A. Saboury M. Farhadi N. Sheibani J. Biochem. 2014 155 361 373
15. Z. Gazova K. Siposova E. Kurin P. Mučaji M. Nagy Proteins 2013 81 994 1004
16. Z. Gazova A. Bellova Z. Daxnerova J. Imrich P. Kristian J. Tomascikova J. Bagelova D. Fedunova M. Antalik Eur. Biophys. J. 2008 37 1261 1270
17. A. Antosova B. Chelli E. Bystrenova K. Siposova F. Valle J. Imrich M. Vilkova P. Kristian F. Biscarini Z. Gazova Biochim. Biophys. Acta, Gen. Subj. 2011 1810 465 474
18. Q. Van Vuong K. Siposova T. T. Nguyen A. Antosova L. Balogova L. Drajna J. Imrich M. S. Li Z. Gazova Biomacromolecules 2013 14 1035 1043
19. M. Evans P. M. Schumm-Draeger J. Vora A. B. King Diabetes, Obes. Metab. 2011 13 677 684
20. K. R. Wilhelm K. Yanamandra M. A. Gruden V. Zamotin M. Malisauskas V. Casaite A. Darinskas L. Forsgren L. A. Morozova-Roche Eur. J. Neurol. 2007 14 327 334
21. K. Giger R. P. Vanam E. Seyrek P. L. Dubin Biomacromolecules 2008 9 2338 2344
22. S. Störkel H. M. Schneider H. Müntefering S. Kashiwagi Lab. Invest. 1983 48 108 111
23. L. Nielsen S. Frokjaer J. F. Carpenter J. Brange J. Pharm. Sci. 2001 90 29 37
24. J. L. Whittingham D. J. Scott K. Chance A. Wilson J. Finch J. Brange G. G. Dodson J. Mol. Biol. 2002 318 479 490
25. T. J. Dolinsky J. E. Nielsen J. A. McCammon N. A. Baker Nucleic Acids Res. 2004 32 W665 W667
26. M. F. Sanner J. Mol. Graphics Modell. 1999 17 57 61
27. G. M. Morris R. Huey W. Lindstrom M. F. Sanner R. K. Belew D. S. Goodsell A. J. Olson J. Comput. Chem. 2009 30 2785 2791
28. O. Trott A. J. Olson J. Comput. Chem. 2010 31 455 461
29. C. G. Broyden J. Inst. Math. Its Appl. 1970 6 76 90
30. D. Case, T. A. Darden, T. E. Cheatham, C. Simmerling, J. Wang, R. Duke, R. Luo, M. Crowley, R. Walker, W. Zhang, K. M. Merz, B. Wang, S. Hayik, A. Roitberg, G. Seabra, I. Kolossváry, K. F. Wong, F. Paesani, J. Vanicek, X. Wu, S. Brozell, T. Steinbrecher, H. Gohlke, L. Yang, C. Tan, J. Mongan, V. Hornak, G. Cui, D. H. Mathews, M. G. Seetin, C. Sagui, V. Babin and P. Kollman, Amber 11 OR, University of California, San Francisco, 2010
31. M. M. Francl and L. E. Chirlian, Reviews in Computational Chemistry, John Wiley & Sons, Inc., 2000, pp. 1-31
32. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven Jr, J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski and D. J. Fox, Gaussian 09, Gaussian Inc., Wallingford, CT, 2009
33. V. Tsui D. A. Case J. Am. Chem. Soc. 2000 122 2489 2498
34. V. Tsui and A. D. Case, Theory and applications of the generalized Born solvation model in macromolecular simulations, 2001
35. S. G. Lambrakos J. P. Boris E. S. Oran I. Chandrasekhar M. Nagumo J. Comput. Phys. 1989 85 473 486
36. T. Hou J. Wang Y. Li W. Wang J. Chem. Inf. Model. 2011 51 69 82
37. F. Godschalk S. Genheden P. Soderhjelm U. Ryde Phys. Chem. Chem. Phys. 2013 15 7731 7739
38. J. Wang R. M. Wolf J. W. Caldwell P. A. Kollman D. A. Case J. Comput. Chem. 2004 25 1157 1174
39. M. I. Ivanova M. J. Thompson D. Eisenberg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 4079 4082
40. M. I. Ivanova S. A. Sievers M. R. Sawaya J. S. Wall D. Eisenberg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 18990 18995
41. H.-L. Chiang S. T. Ngo C.-J. Chen C.-K. Hu M. S. Li PLoS One 2013 8 e65358
42. J. Haas E. Vöhringer-Martinez A. Bögehold D. Matthes U. Hensen A. Pelah B. Abel H. Grubmüller ChemBioChem 2009 10 1816 1822
43. A. K. Buell P. Hung X. Salvatella M. E. Welland C. M. Dobson T. P. Knowles Biophys. J. 2013 104 5 1116 1126
44. A. K. Buell A. Dhulesia D. A. White T. P. J. Knowles C. M. Dobson M. E. Welland Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 5247 5251
45. L. Di Michele E. Eiser V. J. Fodera J. Phys. Chem. Lett. 2013 4 18 3158 3164
46. V. Fodera A. Zaccone M. Lattuada A. M. Donald Phys. Rev. Lett. 2013 111 108105