-
1
-
-
84988122931
-
-
Baker, J
-
Baker, J. J. Comput. Chem. 1986, 7, 385-395.
-
(1986)
J. Comput. Chem
, vol.7
, pp. 385-395
-
-
-
3
-
-
10044290486
-
-
Weinan, E.; Ren, W.; Vanden-Eijnden, E. Phys. Rev. B 2002, 66, 1.
-
(2002)
Phys. Rev. B
, vol.66
, pp. 1
-
-
Weinan, E.1
Ren, W.2
Vanden-Eijnden, E.3
-
10
-
-
2442486484
-
-
Peters, B.; Heyden, A.; Bell, A. T.; Chakrabory, A. K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 7877.
-
(2004)
J. Chem. Phys
, vol.120
, pp. 7877
-
-
Peters, B.1
Heyden, A.2
Bell, A.T.3
Chakrabory, A.K.4
-
13
-
-
0036424048
-
-
Bolhuis, P. G.; Chandler, D.; Dellago, C.; Geissler, P. G. Annu. Rev. Phys. Chem. 2002, 53, 291-318.
-
(2002)
Annu. Rev. Phys. Chem
, vol.53
, pp. 291-318
-
-
Bolhuis, P.G.1
Chandler, D.2
Dellago, C.3
Geissler, P.G.4
-
14
-
-
2742515916
-
-
Bolhuis, P. G.; Dellago, C.; Chandler, D. Faraday Discuss. 1998, 110, 421-436.
-
(1998)
Faraday Discuss
, vol.110
, pp. 421-436
-
-
Bolhuis, P.G.1
Dellago, C.2
Chandler, D.3
-
15
-
-
0000801009
-
-
Dellago, C.; Bolhuis, P. G.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1998, 108, 9236-9245.
-
(1998)
J. Chem. Phys
, vol.108
, pp. 9236-9245
-
-
Dellago, C.1
Bolhuis, P.G.2
Chandler, D.3
-
16
-
-
4444242987
-
-
Dellago, C.; Bolhuis, P. G.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1999, 110, 6617-6625.
-
(1999)
J. Chem. Phys
, vol.110
, pp. 6617-6625
-
-
Dellago, C.1
Bolhuis, P.G.2
Chandler, D.3
-
17
-
-
0000729781
-
-
Dellago, C.; Bolhuis, P. G.; Csajka, F. S.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1998, 108, 1964-1977.
-
(1998)
J. Chem. Phys
, vol.108
, pp. 1964-1977
-
-
Dellago, C.1
Bolhuis, P.G.2
Csajka, F.S.3
Chandler, D.4
-
18
-
-
66749099419
-
-
Dellago, C.; Bolhuis, P. G.; Geissler, P. G. Adv. Chem. Phys. 2001, 123, 1-86.
-
(2001)
Adv. Chem. Phys
, vol.123
, pp. 1-86
-
-
Dellago, C.1
Bolhuis, P.G.2
Geissler, P.G.3
-
19
-
-
0001374686
-
-
Geissler, P. G.; Dellago, C.; Chandler, D. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 3706-3710.
-
(1999)
J. Phys. Chem. B
, vol.103
, pp. 3706-3710
-
-
Geissler, P.G.1
Dellago, C.2
Chandler, D.3
-
22
-
-
0001568871
-
-
Apostolakis, J.; Ferrara, P.; Caflisch, A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 2099-2108.
-
(1999)
J. Chem. Phys
, vol.110
, pp. 2099-2108
-
-
Apostolakis, J.1
Ferrara, P.2
Caflisch, A.3
-
23
-
-
11644251375
-
-
Scarsi, M.; Apostolakis, J.; Caflisch, A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3637-3641.
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3637-3641
-
-
Scarsi, M.1
Apostolakis, J.2
Caflisch, A.3
-
24
-
-
0000435390
-
-
Marrone, T. J.; Gilson, M. K.; McCammon, J. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 1439-1441.
-
(1996)
J. Phys. Chem
, vol.100
, pp. 1439-1441
-
-
Marrone, T.J.1
Gilson, M.K.2
McCammon, J.A.3
-
27
-
-
36449009704
-
-
Lazaridis, T.; Tobias, D. J.; Brooks, C. L.; Paulaitis, M. E. J. Chem. Phys. 1991, 95, 7612-7625.
-
(1991)
J. Chem. Phys
, vol.95
, pp. 7612-7625
-
-
Lazaridis, T.1
Tobias, D.J.2
Brooks, C.L.3
Paulaitis, M.E.4
-
28
-
-
11444262351
-
-
Chu, J. W.; Brooks, B. R.; Trout, B. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16601-16607.
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc
, vol.126
, pp. 16601-16607
-
-
Chu, J.W.1
Brooks, B.R.2
Trout, B.L.3
-
29
-
-
0034705109
-
-
Bolhuis, P. G.; Dellago, C.; Chandler, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 5877-5882.
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.97
, pp. 5877-5882
-
-
Bolhuis, P.G.1
Dellago, C.2
Chandler, D.3
-
31
-
-
42449162353
-
-
Hu, J.; Ma, A.; Dinner, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 4615-4620.
-
(2008)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.105
, pp. 4615-4620
-
-
Hu, J.1
Ma, A.2
Dinner, A.R.3
-
35
-
-
0035896410
-
-
Geissler, P. G.; Dellago, C.; Chandler, D.; Hutter, J.; Parrinello, M. Science 2001, 291, 2121-2124.
-
(2001)
Science
, vol.291
, pp. 2121-2124
-
-
Geissler, P.G.1
Dellago, C.2
Chandler, D.3
Hutter, J.4
Parrinello, M.5
-
36
-
-
62149119829
-
-
Hedges, L. O.; Jack, R. L.; Garrahan, J. P.; Chandler, D. Science 2009, 323, 1309-1313.
-
(2009)
Science
, vol.323
, pp. 1309-1313
-
-
Hedges, L.O.1
Jack, R.L.2
Garrahan, J.P.3
Chandler, D.4
-
38
-
-
33745666779
-
-
Grünwald, M.; Rabini, E.; Dellago, C. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 255701.
-
(2006)
Phys. Rev. Lett
, vol.96
, pp. 255701
-
-
Grünwald, M.1
Rabini, E.2
Dellago, C.3
-
39
-
-
48149111993
-
-
Beckham, G. T.; Peters, B.; Trout, B. L. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 7460-7466.
-
(2008)
J. Phys. Chem. B
, vol.112
, pp. 7460-7466
-
-
Beckham, G.T.1
Peters, B.2
Trout, B.L.3
-
40
-
-
34247490604
-
-
Beckham, G. T.; Peters, B.; Variankaval, N.; Starbuck, C.; Trout, B. L. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4714-4724.
-
(2007)
J. Am. Chem. Soc
, vol.129
, pp. 4714-4724
-
-
Beckham, G.T.1
Peters, B.2
Variankaval, N.3
Starbuck, C.4
Trout, B.L.5
-
44
-
-
29144531189
-
-
Matthews, J. F.; Skopec, C. E.; Mason, P. E.; Zuccato, P.; Torget, R. W.; Sugiyama, J.; Himmel, M. E.; Brady, J. W. Carbohydr. Res. 2006, 341, 138-152.
-
(2006)
Carbohydr. Res
, vol.341
, pp. 138-152
-
-
Matthews, J.F.1
Skopec, C.E.2
Mason, P.E.3
Zuccato, P.4
Torget, R.W.5
Sugiyama, J.6
Himmel, M.E.7
Brady, J.W.8
-
45
-
-
34347381336
-
-
Nimlos, M. R.; Matthews, J. F.; Crowley, M. F.; Walker, R. C.; Chukkapalli, G.; Brady, J. W.; Adney, W. S.; Cleary, J. M.; Zhong, L.; Himmel, M. E. Protein Eng., Des. Sel. 2007, 20, 179-187.
-
(2007)
Protein Eng., Des. Sel
, vol.20
, pp. 179-187
-
-
Nimlos, M.R.1
Matthews, J.F.2
Crowley, M.F.3
Walker, R.C.4
Chukkapalli, G.5
Brady, J.W.6
Adney, W.S.7
Cleary, J.M.8
Zhong, L.9
Himmel, M.E.10
-
46
-
-
0037189899
-
-
Koivula, A.; Ruohonen, L.; Wohlfahrt, G.; Reinikainen, T.; Teeri, T. T.; Piens, K.; Claeyssens, M.; Weber, M.; Vasella, A.; Becker, D.; et al. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10015-10024.
-
(2002)
J. Am. Chem. Soc
, vol.124
, pp. 10015-10024
-
-
Koivula, A.1
Ruohonen, L.2
Wohlfahrt, G.3
Reinikainen, T.4
Teeri, T.T.5
Piens, K.6
Claeyssens, M.7
Weber, M.8
Vasella, A.9
Becker, D.10
-
47
-
-
67650045870
-
-
Petersen, L.; Ardevol, A.; Rovira, C.; Reilly, P. J. J. Phys. Chem. B. 2009, 113, 7331-7339.
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 7331-7339
-
-
Petersen, L.1
Ardevol, A.2
Rovira, C.3
Reilly, P.J.4
-
48
-
-
46849091179
-
-
Zhao, X.; Rignall, T. R.; McCabe, C.; Adney, W. S.; Himmel, M. E. Chem. Phys. Lett. 2008, 460, 284-288.
-
(2008)
Chem. Phys. Lett
, vol.460
, pp. 284-288
-
-
Zhao, X.1
Rignall, T.R.2
McCabe, C.3
Adney, W.S.4
Himmel, M.E.5
-
49
-
-
41149175076
-
-
Fushinobu, S.; Mertz, B.; Hill, A. D.; Hidaka, M.; Kitaoka, M.; Reilly, P. J. Carbohydr. Res. 2008, 343, 1023-1033.
-
(2008)
Carbohydr. Res
, vol.343
, pp. 1023-1033
-
-
Fushinobu, S.1
Mertz, B.2
Hill, A.D.3
Hidaka, M.4
Kitaoka, M.5
Reilly, P.J.6
-
50
-
-
24644500001
-
-
Mulakala, C.; Reilly, P. J. Proteins: Struct., Funct., Bioinform. 2005, 60, 598-605.
-
(2005)
Proteins: Struct., Funct., Bioinform
, vol.60
, pp. 598-605
-
-
Mulakala, C.1
Reilly, P.J.2
-
51
-
-
34547354279
-
-
Peters, B.; Beckham, G. T.; Trout, B. L. J. Chem. Phys. 2007, 127, 034109.
-
(2007)
J. Chem. Phys
, vol.127
, pp. 034109
-
-
Peters, B.1
Beckham, G.T.2
Trout, B.L.3
-
53
-
-
0001563395
-
-
Du, R.; Pande, V. S.; Grosberg, A. Y.; Tanaka, T.; Shakhnovich, E. S. J. Chem. Phys. 1998, 108, 334-350.
-
(1998)
J. Chem. Phys
, vol.108
, pp. 334-350
-
-
Du, R.1
Pande, V.S.2
Grosberg, A.Y.3
Tanaka, T.4
Shakhnovich, E.S.5
-
55
-
-
67749108283
-
-
Peters, B.; Zimmermann, N. E. R.; Beckham, G. T.; Tester, J. W.; Trout, B. L. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 17342-17350.
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc
, vol.130
, pp. 17342-17350
-
-
Peters, B.1
Zimmermann, N.E.R.2
Beckham, G.T.3
Tester, J.W.4
Trout, B.L.5
-
59
-
-
33746255471
-
-
Maragliano, L.; Fischer, A.; Vanden-Eijnden, E.; Ciccotti, G. J. Chem. Phys. 2006, 125, 024106.
-
(2006)
J. Chem. Phys
, vol.125
, pp. 024106
-
-
Maragliano, L.1
Fischer, A.2
Vanden-Eijnden, E.3
Ciccotti, G.4
-
60
-
-
0027794972
-
-
Schlitter, J.; Engels, M.; Kruger, P.; Jacoby, E.; Wollmer, A. Mol. Sim. 1993, 10, 291-308.
-
(1993)
Mol. Sim
, vol.10
, pp. 291-308
-
-
Schlitter, J.1
Engels, M.2
Kruger, P.3
Jacoby, E.4
Wollmer, A.5
-
63
-
-
0344270866
-
-
Hagan, M. F.; Dinner, A. R.; Chandler, D.; Chakrabory, A. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 13922-13927.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.100
, pp. 13922-13927
-
-
Hagan, M.F.1
Dinner, A.R.2
Chandler, D.3
Chakrabory, A.K.4
-
64
-
-
33749016486
-
-
Hu, J.; Ma, A.; Dinner, A. R. J. Chem. Phys. 2006, 125, 114101.
-
(2006)
J. Chem. Phys
, vol.125
, pp. 114101
-
-
Hu, J.1
Ma, A.2
Dinner, A.R.3
-
66
-
-
17444412625
-
-
ten Wolde, P. R.; Ruiz-Montero, M. J.; Frenkel, D. J. Chem. Phys. 1996, 104, 9932-9947.
-
(1996)
J. Chem. Phys
, vol.104
, pp. 9932-9947
-
-
Ten Wolde, P.R.1
Ruiz-Montero, M.J.2
Frenkel, D.3
-
67
-
-
27744538230
-
-
Moroni, D.; ten Wolde, P. R.; Bolhuis, P. G. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 235703.
-
(2005)
Phys. Rev. Lett
, vol.94
, pp. 235703
-
-
Moroni, D.1
Ten Wolde, P.R.2
Bolhuis, P.G.3
-
69
-
-
1842581318
-
-
Moroni, D.; Bolhuis, P. G.; van Erp, T. S. J. Chem. Phys. 2004, 120, 4055-4065.
-
(2004)
J. Chem. Phys
, vol.120
, pp. 4055-4065
-
-
Moroni, D.1
Bolhuis, P.G.2
Van Erp, T.S.3
-
71
-
-
56849114069
-
-
Grünwald, M.; Dellago, C.; Geissler, P. L. J. Chem. Phys. 2008, 129, 194101.
-
(2008)
J. Chem. Phys
, vol.129
, pp. 194101
-
-
Grünwald, M.1
Dellago, C.2
Geissler, P.L.3
-
73
-
-
6344260593
-
-
MacKerell, A. D.; Wiórkiewicz-Kuczera, J.; Karplus, M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11946-11975.
-
(1995)
J. Am. Chem. Soc
, vol.117
, pp. 11946-11975
-
-
Mackerell, A.D.1
Wiórkiewicz-Kuczera, J.2
Karplus, M.3
-
74
-
-
27344436659
-
-
Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kale, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781-1802.
-
(2005)
J. Comput. Chem
, vol.26
, pp. 1781-1802
-
-
Phillips, J.C.1
Braun, R.2
Wang, W.3
Gumbart, J.4
Tajkhorshid, E.5
Villa, E.6
Chipot, C.7
Skeel, R.D.8
Kale, L.9
Schulten, K.10
-
75
-
-
34547648612
-
-
Allen, R. J.; Frenkel, D.; ten Wolde, P. R. J. Chem. Phys. 2006, 124, 194111.
-
(2006)
J. Chem. Phys
, vol.124
, pp. 194111
-
-
Allen, R.J.1
Frenkel, D.2
Ten Wolde, P.R.3
-
76
-
-
30744470375
-
-
Allen, R. J.; Frenkel, D.; ten Wolde, P. R. J. Chem. Phys. 2006, 124, 024102.
-
(2006)
J. Chem. Phys
, vol.124
, pp. 024102
-
-
Allen, R.J.1
Frenkel, D.2
Ten Wolde, P.R.3
-
80
-
-
34247210226
-
-
West, A. M. A.; Elber, R.; Shalloway, D. J. Chem. Phys. 2007, 126, 145104.
-
(2007)
J. Chem. Phys
, vol.126
, pp. 145104
-
-
West, A.M.A.1
Elber, R.2
Shalloway, D.3
-
81
-
-
3042734977
-
-
Moroni, D.; van Erp, T. S.; Bolhuis, P. G. Physica A 2004, 340, 395-401.
-
(2004)
Physica A
, vol.340
, pp. 395-401
-
-
Moroni, D.1
Van Erp, T.S.2
Bolhuis, P.G.3
-
82
-
-
0038515443
-
-
van Erp, T. S.; Moroni, D.; Bolhuis, P. G. J. Chem. Phys. 2003, 118, 7762-7774.
-
(2003)
J. Chem. Phys
, vol.118
, pp. 7762-7774
-
-
Van Erp, T.S.1
Moroni, D.2
Bolhuis, P.G.3
-
83
-
-
36149016302
-
-
Onsager, L. Phys. Rev. 1938, 54, 554-557.
-
(1938)
Phys. Rev
, vol.54
, pp. 554-557
-
-
Onsager, L.1
-
84
-
-
24344467850
-
-
Weinan, E.; Ren, W. Q.; Vanden-Eijnden, E. Chem. Phys. Lett. 2005, 413, 242-247.
-
(2005)
Chem. Phys. Lett
, vol.413
, pp. 242-247
-
-
Weinan, E.1
Ren, W.Q.2
Vanden-Eijnden, E.3
-
90
-
-
4243661501
-
-
Carter, E. A.; Ciccotti, G.; Hynes, J. T.; Kapral, R. Chem. Phys. Lett. 1989, 156, 472.
-
(1989)
Chem. Phys. Lett
, vol.156
, pp. 472
-
-
Carter, E.A.1
Ciccotti, G.2
Hynes, J.T.3
Kapral, R.4
-
93
-
-
65249137778
-
-
Maragakis, P.; van der Vaart, A.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 4664-4673.
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 4664-4673
-
-
Maragakis, P.1
Van Der Vaart, A.2
Karplus, M.3
-
99
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Rosenberg, J. M.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021.
-
(1992)
J. Comput. Chem
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Rosenberg, J.M.2
Bouzida, D.3
Swendsen, R.H.4
Kollman, P.A.5
-
100
-
-
68149156908
-
-
Bu, L.; Beckham, G. T.; Crowley, M. F.; Chang, C. H.; Matthews, J. F.; Bomble, Y. J.; Adney, W. S.; Himmel, M. E.; Nimlos, M. R. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 10994-11002.
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 10994-11002
-
-
Bu, L.1
Beckham, G.T.2
Crowley, M.F.3
Chang, C.H.4
Matthews, J.F.5
Bomble, Y.J.6
Adney, W.S.7
Himmel, M.E.8
Nimlos, M.R.9
-
101
-
-
34547555018
-
-
Dimelow, R. J.; Bryce, R. A.; Masters, A. J.; Hillier, I. H.; Burton, N. A. J. Chem. Phys. 2006, 124, 114113.
-
(2006)
J. Chem. Phys
, vol.124
, pp. 114113
-
-
Dimelow, R.J.1
Bryce, R.A.2
Masters, A.J.3
Hillier, I.H.4
Burton, N.A.5
-
102
-
-
11444262351
-
-
Chu, J. W.; Brooks, B. R.; Trout, B. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16601-16607.
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc
, vol.126
, pp. 16601-16607
-
-
Chu, J.W.1
Brooks, B.R.2
Trout, B.L.3
-
103
-
-
3042728351
-
-
Lo, C.; Giurumescu, C. A.; Radhakrishnan, R.; Trout, B. L. Mol. Phys. 2004, 102, 281-288.
-
(2004)
Mol. Phys
, vol.102
, pp. 281-288
-
-
Lo, C.1
Giurumescu, C.A.2
Radhakrishnan, R.3
Trout, B.L.4
-
104
-
-
59349116439
-
-
Ju, L. P.; Han, K. L.; Zhang, J. Z. H. J. Comput. Chem. 2009, 30, 305-316.
-
(2009)
J. Comput. Chem
, vol.30
, pp. 305-316
-
-
Ju, L.P.1
Han, K.L.2
Zhang, J.Z.H.3
-
105
-
-
33748633480
-
-
Warshel, A.; Sharma, P. K.; Kato, M.; Xiang, Y.; Liu, H.; Olsson, M. H. M. Chem. Rev. 2006, 106, 3210-3235.
-
(2006)
Chem. Rev
, vol.106
, pp. 3210-3235
-
-
Warshel, A.1
Sharma, P.K.2
Kato, M.3
Xiang, Y.4
Liu, H.5
Olsson, M.H.M.6
-
106
-
-
0346726109
-
-
Garcia-Viloca, M.; Gao, J.; Karplus, M.; Truhlar, D. G. Science 2004, 303, 186-195.
-
(2004)
Science
, vol.303
, pp. 186-195
-
-
Garcia-Viloca, M.1
Gao, J.2
Karplus, M.3
Truhlar, D.G.4
-
107
-
-
33748584863
-
-
Gao, J.; Ma, S.; Major, D. T.; Nam, K.; Pu, J.; Truhlar, D. G. Chem. Rev. 2006, 106, 3188-3209.
-
(2006)
Chem. Rev
, vol.106
, pp. 3188-3209
-
-
Gao, J.1
Ma, S.2
Major, D.T.3
Nam, K.4
Pu, J.5
Truhlar, D.G.6
-
111
-
-
0001069331
-
-
Schulten, K.; Schulten, Z.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 1981, 74, 4426-4432.
-
(1981)
J. Chem. Phys
, vol.74
, pp. 4426-4432
-
-
Schulten, K.1
Schulten, Z.2
Szabo, A.3
-
112
-
-
0032853084
-
-
Jacob, M.; Geeves, M.; Holtermann, G.; Schmid, F. X. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 923-926.
-
(1999)
Nat. Struct. Biol
, vol.6
, pp. 923-926
-
-
Jacob, M.1
Geeves, M.2
Holtermann, G.3
Schmid, F.X.4
|