About supramolecular systems for dynamically probing cells

Chemical Society Reviews

Volumn 43, Issue 13, 2014, Pages 4449-4469

  Brinkmann, Jenny ^a   Cavatorta, Emanuela ^a   Sankaran, Shrikrishnan ^a   Schmidt, Bettina ^a   Van Weerd, Jasper ^a   Jonkheijm, Pascal ^a  

^a UNIVERSITY OF TWENTE   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MOLECULAR PROBE; NANOMATERIAL;

CYTOLOGY; HYDROGEN BOND; MOLECULAR PROBE;

CELL BIOLOGY; HYDROGEN BONDING; MOLECULAR PROBES; NANOSTRUCTURES;

EID: 84902139772     PISSN: 03060012     EISSN: 14604744     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4cs00034j     Document Type: Review

References (132)

1. K. Jacobson E. D. Sheets R. Simson Science 1995 268 1441 1442
2. C. R. F. Monks B. A. Freiberg H. Kupfer N. Sciaky A. Kupfer Nature 1998 395 82 88
3. F. R. Maxfield Curr. Opin. Cell Biol. 2002 14 483 487
4. J. F. Hancock Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2006 7 456 462
5. K. Simons E. Ikonen Nature 1997 387 569 572
6. D. M. Engelman Nature 2005 438 578 580
7. E. Zamir P. I. H. Bastiaens Nat. Chem. Biol. 2008 4 643 647
8. L. Brunsveld B. J. B. Folmer E. W. Meijer R. P. Sijbesma Chem. Rev. 2001 101 4071 4097
9. F. J. M. Hoeben P. Jonkheijm E. W. Meijer A. P. H. J. Schenning Chem. Rev. 2005 105 1491 1546
10. T. Aida E. W. Meijer S. I. Stupp Science 2012 335 813 817
11. D. A. Uhlenheuer K. Petkau L. Brunsveld Chem. Soc. Rev. 2010 39 2817 2826
12. T. Fenske H.-G. Korth A. Mohr C. Schmuck Chem.-Eur. J. 2012 18 738 755
13. M. A. Cole N. H. Voelcker H. Thissen H. J. Griesser Biomaterials 2009 30 1827 1850
14. C. D. H. Alarcon S. Pennadam C. Alexander Chem. Soc. Rev. 2005 34 276 285
15. C. Alexander Nat. Mater. 2008 7 767 768
16. P. Y. W. Dankers M. C. Harmsen L. A. Brouwer M. J. A. van Luyn E. W. Meijer Nat. Mater. 2005 4 568 574
17. P. Y. W. Dankers J. M. Boomker A. Huizinga-van der Vlag E. Wisse W. P. J. Appel F. M. M. Smedts M. C. Harmsen A. W. Bosman E. W. Meijer M. J. A. van Luyn Biomaterials 2011 32 723 733
18. J. Geng F. Biedermann J. M. Zayed F. Tian O. A. Scherman Macromolecules 2011 44 4276 4281
19. K. S. Kim S. J. Park J. A. Yang J. H. Jeon S. H. Bhang B. S. Kim K. Kim Biomaterials 2011 32 7687 7694
20. K. M. Park J.-A. Yang H. Jung J. Yeom J. S. Park K.-H. Park A. S. Hoffman S. K. Hahn K. Kim ACS Nano 2012 6 2960 2968
21. J. Boekhoven C. M. Rubert Pérez S. Sur A. Worthy S. I. Stupp Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 12077 12080
22. H. Li J. Frith J. J. Cooper-White Biomacromolecules 2014 15 43 52
23. E. Kim D. Kim H. Jung J. Lee S. Paul N. Selvapalam Y. Yang N. Lim C. Park K. Kim Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 4405 4408
24. D. Kim E. Kim J. Kim K. Park K. Baek M. Jung Y. Ko W. Sung H. Kim J. Suh C. Park O. Na D.-k. Lee K. Lee S. Han K. Kim Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 3471 3474
25. A. Nelson J. M. Belitsky S. Vidal C. S. Joiner L. G. Baum J. F. Stoddart J. Am. Chem. Soc. 2004 126 11914 11922
26. J. Kim Y. Ahn K. M. Park D.-W. Lee K. Kim Chem.-Eur. J. 2010 16 12168 12173
27. N. Yui T. Ooya Chem.-Eur. J. 2006 12 6730 6737
28. J.-H. Seo S. Kakinoki Y. Inoue T. Yamaoka K. Ishihara N. Yui J. Am. Chem. Soc. 2013 135 5513 5516
29. H. Wang S. Wang H. Su K.-J. Chen A. Armijo W.-Y. Lin Y. Wang J. Sun K.-i. Kamei J. Czernin C. G. Radu H.-R. Tseng Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 4344 4348
30. H. Wang K. Liu K.-J. Chen Y. Lu S. Wang W.-Y. Lin F. Guo K. Kamei Y.-C. Chen M. Ohashi M. Wang X.-Z. Zhao C. K.-F. Shen H.-R. Tseng ACS Nano 2010 4 6235 6243
31. Y. Liu H. Wang K.-i. Kamei M. Yan K.-J. Chen Q. Yuan L. Shi Y. Lu H.-R. Tseng Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 3058 3062
32. H. Robson Marsden A. Kros Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 2988 3005
33. J. Mason, K. Müller and K. Arndt, in Protein Engineering Protocols, ed., K. Arndt, and, K. Müller, Humana Press, 2007, vol. 352, pp. 35-70
34. Y. Yano A. Yano S. Oishi Y. Sugimoto G. Tsujimoto N. Fujii K. Matsuzaki ACS Chem. Biol. 2008 3 341 345
35. H. R. Zope F. Versluis A. Ordas J. Voskuhl H. P. Spaink A. Kros Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 14247 14251
36. I. Nakase S. Okumura G. Tanaka K. Osaki M. Imanishi S. Futaki Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 7464 7467
37. A. Bill A. Schmitz B. Albertoni J.-N. Song L. C. Heukamp D. Walrafen F. Thorwith P. J. Verveer S. Zimmer L. Meffert A. Schreiber S. Chatterjee R. K. Thomas R. T. Ullrich T. Lang M. Famulok Cell 2010 143 201 211
38. Z. N. Mahmoud S. B. Gunnoo A. R. Thomson J. M. Fletcher D. N. Woolfson Biomaterials 2011 32 3712 3720
39. V. Villard O. Kalyuzhniy O. Riccio S. Potekhin T. N. Melnik A. V. Kajava C. Rüegg G. Corradin J. Pept. Sci. 2006 12 206 212
40. T. Nakaji-Hirabayashi K. Kato H. Iwata Biomacromolecules 2008 9 1411 1416
41. B. Liu Y. Liu J. J. Riesberg W. Shen J. Am. Chem. Soc. 2010 132 13630 13632
42. K. Zhang A. Sugawara D. A. Tirrell ChemBioChem 2009 10 2617 2619
43. Y.-b. Lim S. Park E. Lee H. Jeong J.-H. Ryu M. S. Lee M. Lee Biomacromolecules 2007 8 1404 1408
44. Y.-b. Lim S. Park E. Lee J.-H. Ryu Y.-R. Yoon T.-H. Kim M. Lee Chem.-Asian J. 2007 2 1363 1369
45. Y.-b. Lim E. Lee M. Lee Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 3475 3478
46. R. J. Hosse A. Rothe B. E. Power Protein Sci. 2006 15 14 27
47. R. H. Kimura A. M. Levin F. V. Cochran J. R. Cochran Proteins 2009 77 359 369
48. S. J. Moore M. G. Hayden Gephart J. M. Bergen Y. S. Su H. Rayburn M. P. Scott J. R. Cochran Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013 110 14598 14603
49. A. V. Pinheiro D. Han W. M. Shih H. Yan Nat. Nanotechnol. 2011 6 763 772
50. F. A. Aldaye W. T. Senapedis P. A. Silver J. C. Way J. Am. Chem. Soc. 2010 132 14727 14729
51. R. Meyer S. Giselbrecht B. E. Rapp M. Hirtz C. M. Niemeyer Curr. Opin. Chem. Biol. 2014 18 8 15
52. J. Voskuhl J. Brinkmann P. Jonkheijm Curr. Opin. Chem. Biol. 2014 18 1 7
53. U. Vermesh O. Vermesh J. Wang G. A. Kwong C. Ma K. Hwang J. R. Heath Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 7378 7380
54. N. S. Selden M. E. Todhunter N. Y. Jee J. S. Liu K. E. Broaders Z. J. Gartner J. Am. Chem. Soc. 2012 134 765 768
55. R. A. Chandra E. S. Douglas R. A. Mathies C. R. Bertozzi M. B. Francis Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 896 901
56. H. Schroeder B. Ellinger C. F. W. Becker H. Waldmann C. M. Niemeyer Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 4180 4183
57. H. Onoe S. C. Hsiao E. S. Douglas Z. J. Gartner C. R. Bertozzi M. B. Francis R. A. Matthies Langmuir 2010 28 8120 8130
58. S. Gandor S. Reisewitz M. Venkatachalapahty G. Arrabito M. Reibner H. Schroeder K. Ruf C. M. Niemeyer P. I. Bastiaens L. Dehmelt Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 4790 4794
59. G. Arrabito S. Reisewitz L. Dehmelt P. I. Bastiaens B. Pignataro H. Schroeder C. M. Niemeyer Small 2013 9 4243 4249
60. H. Cui M. J. Webber S. I. Stupp Pept. Sci. 2010 94 1 18
61. J. D. Hartgerink E. Beniash S. I. Stupp Science 2001 294 1684 1688
62. R. N. Shah N. A. Shah M. M. Del Rosario Lim C. Hsieha G. Nuber S. I. Stupp Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 3293 3298
63. H. Storrie M. O. Guler S. N. Abu-Amara T. Volberg M. Rao B. Geiger S. I. Stupp Biomaterials 2007 28 4608 4618
64. V. M. Tysseling-Mattiace V. Sahni K. L. Niece D. Birch C. Czeisler M. G. Fehlings S. I. Stupp J. A. Kessler J. Neurosci. 2008 28 3814 3823
65. D. Jiao J. Geng X. J. Loh D. Das T. C. Lee O. A. Scherman Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 9633 9637
66. J.-H. Ryu D.-J. Hong M. Lee Chem. Commun. 2008 1043 1054
67. B.-S. Kim W.-Y. Yang J.-H. Ryu Y.-S. Yoo M. Lee Chem. Commun. 2005 2035 2037
68. J.-H. Ryu E. Lee Y.-b. Lim M. Lee J. Am. Chem. Soc. 2007 129 4808 4814
69. M. K. Müller L. Brunsveld Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 2921 2924
70. K. Petkau-Milroy M. H. Sonntag A. H. A. M. van Onzen L. Brunsveld J. Am. Chem. Soc. 2012 134 8086 8089
71. L. Huang R. E. Pagano J. Cell Biol. 1975 67 38 48
72. H. R. Marsden I. Tomatsu A. Kros Chem. Soc. Rev. 2011 40 1572 1585
73. C. H. Yu J. T. Groves Med. Biol. Eng. Comput. 2010 48 955 963
74. D. S. Watson A. N. Endsley L. Huang Vaccine 2012 30 2256 2272
75. J. Nguyen F. C. Szoka Acc. Chem. Res. 2012 45 1153 1162
76. B. Yang S.-Y. Geng X.-M. Liu J.-T. Wang Y.-K. Chen Y.-L. Wang J.-Y. Wang Soft Matter 2012 8 518 525
77. A. Akinc A. Zumbuehl M. Goldberg E. S. Leshchiner V. Busini N. Hossain S. A. Bacallado D. N. Nguyen J. Fuller R. Alvarez A. Borodovsky T. Borland R. Constien A. de Fougerolles J. R. Dorkin K. N. Jayaprakash M. Jayaraman M. John V. Koteliansky M. Manoharan L. Nechev J. Qin T. Racie D. Raitcheva K. G. Rajeev D. W. Y. Sah J. Soutschek I. Toudjarska H.-P. Vornlocher T. S. Zimmermann R. Langer D. G. Anderson Nat. Biotechnol. 2008 26 561 569
78. S.-W. Cho M. Goldberg S. M. Son Q. Xu F. Yang Y. Mei S. Bogatyrev R. Langer D. G. Anderson Adv. Funct. Mater. 2009 19 3112 3118
79. K. T. Love K. P. Mahon C. G. Levins K. A. Whitehead W. Querbes J. R. Dorkin J. Qin W. Cantley L. L. Qin T. Racie M. Frank-Kamenetsky K. N. Yip R. Alvarez D. W. Y. Sah A. de Fougerolles K. Fitzgerald V. Koteliansky A. Akinc R. Langer D. G. Anderson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 1864 1869
80. E. Kluza D. W. J. van der Schaft P. A. Hautvast W. J. Mulder K. H. Mayo A. W. Griffioen G. J. Strijkers K. Nicolay Nano Lett. 2010 10 52 58
81. J. J. Reczek A. A. Kennedy B. T. Halbert A. R. Urbach J. Am. Chem. Soc. 2009 131 2408 2415
82. K. M. Park D.-W. Lee B. Sarkar H. Jung J. Kim Y. H. Ko K. E. Lee H. Jeon K. Kim Small 2010 6 1430 1441
83. X. Liang X. Li X. Yue Z. Dai Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 11622 11627
84. J. J. Moon H. Suh A. Bershteyn M. T. Stephan H. Liu B. Huang M. Sohail S. Luo S. H. Um H. Khant J. T. Goodwin J. Ramos W. Chiu D. J. Irvine Nat. Mater. 2011 10 243 251
85. D. Dutta A. Pulsipher W. Luo H. Mak M. N. Yousaf Bioconjugate Chem. 2011 22 2423 2433
86. S. S. Agasti M. Liong C. Tassa H. J. Chung S. Y. Shaw H. Lee R. Weissleder Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 450 454
87. J. A. Prescher D. H. Dube C. R. Bertozzi Nature 2004 430 873 877
88. S. C. Hsiao B. J. Shum H. Onoe E. S. Douglas Z. J. Gartner R. A. Mathies C. R. Bertozzi M. B. Francis Langmuir 2009 25 6985 6991
89. D. Sarkar P. K. Vemula W. Zhao A. Gupta R. Karnik J. M. Karp Biomaterials 2010 31 5266 5274
90. D. Dutta A. Pulsipher W. Luo M. N. Yousaf J. Am. Chem. Soc. 2011 133 8704 8713
91. M. T. Stephan J. J. Moon S. H. Um A. Bersthteyn D. J. Irvine Nat. Med. 2010 16 1035 1041
92. D. Lingwood K. Simons Science 2010 327 46 50
93. D. Afanasenkau A. Offenhausser Langmuir 2012 28 13387 13394
94. E. T. Castellana P. S. Cremer Surf. Sci. Rep. 2006 61 429 444
95. J. van Weerd S. O. Krabbenborg J. C. T. Eijkel H. B. J. Karperien J. Huskens P. Jonkheijm J. Am. Chem. Soc. 2014 136 100 103
96. J. M. Nam P. M. Nair R. M. Neve J. W. Gray J. T. Groves ChemBioChem 2006 7 436 440
97. N. C. Hartman J. T. Groves Curr. Opin. Cell Biol. 2011 23 370 376
98. N. C. Hartman J. A. Nye J. T. Groves Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 12729 12734
99. B. N. Manz B. L. Jackson R. S. Petit M. L. Dustin J. T. Groves Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 9089 9094
100. M. Charnley R. Kroschewski M. Textor Integr. Biol. 2012 4 1059 1071
101. B. Ananthanarayanan L. Little D. V. Schaffer K. E. Healy M. Tirrell Biomaterials 2010 31 8706 8715
102. S. Svedhem D. Dahlborg J. Ekeroth J. Kelly F. Höök J. Gold Langmuir 2003 19 6730 6736
103. D. Thid K. Holm P. S. Eriksson J. Ekeroth B. Kasemo J. Gold J. Biomed. Mater. Res., Part A 2008 84A 940 953
104. C.-J. Huang N.-J. Cho C.-J. Hsu P.-Y. Tseng C. W. Frank Y.-C. Chang Biomacromolecules 2010 11 1231 1240
105. M. Andreasson-Ochsner G. Romano M. Håkanson M. L. Smith D. E. Leckband M. Textor E. Reimhult Lab Chip 2011 11 2876 2883
106. R. L. C. Naumann C. Nowak W. Knoll Soft Matter 2011 7 9535 9548
107. K. Morigaki H. Schönherr T. Okazaki Langmuir 2007 23 12254 12260
108. Y. Deng Y. Wang B. Holtz J. Li N. Traaseth G. Veglia B. J. Stottrup R. Elde D. Pei A. Guo X.-Y. Zhu J. Am. Chem. Soc. 2008 130 6267 6271
109. C. E. Ashley E. C. Carnes G. K. Phillips D. Padilla P. N. Durfee P. A. Brown T. N. Hanna J. Liu B. Phillips M. B. Carter N. J. Carroll X. Jiang D. R. Dunphy C. L. Willman D. N. Petsev D. G. Evans A. N. Parikh B. Chackerian W. Wharton D. S. Peabody C. Jeffrey Brinker Nat. Mater. 2011 10 389 397
110. S. Yamaguchi S. Yamahira K. Kikuchi K. Sumaru T. Kanamori T. Nagamune Angew. Chem. 2012 124 132 135
111. K. Ishihara M. Takai J. R. Soc., Interface 2009 6 S279 S291
112. B. Wildt D. Wirtz P. C. Searson Nat. Methods 2009 6 211 213
113. S. Raghavan R. A. Desai Y. Kwon M. Mrksich C. S. Chen Langmuir 2010 26 17733 17738
114. Z. Chen Y. Li W. Liu D. Zhang Y. Zhao B. Yuan X. Jiang Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 8303 8305
115. X. Jiang R. Ferrigno M. Mrksich G. M. Whitesides J. Am. Chem. Soc. 2003 125 2366 2367
116. M. N. Yousaf B. T. Houseman M. Mrksich Angew. Chem., Int. Ed. 2001 40 1093 1096
117. W. S. Yeo M. N. Yousaf M. Mrksich J. Am. Chem. Soc. 2003 125 14994 14995
118. E. W. L. Chan M. N. Yousaf J. Am. Chem. Soc. 2006 128 15542 15546
119. E. W. L. Chan S. Park M. N. Yousaf Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 6267 6271
120. W. Luo E. W. L. Chan M. N. Yousaf J. Am. Chem. Soc. 2010 132 2614 2621
121. B. M. Lamb M. N. Yousaf J. Am. Chem. Soc. 2011 133 8870 8873
122. D. K. Hoover E. W. L. Chan M. N. Yousaf J. Am. Chem. Soc. 2008 130 3280 3281
123. I. Choi Y. K. Kim D. H. Min S. W. Lee W. S. Yeo J. Am. Chem. Soc. 2011 133 16718 16721
124. C. G. Rolli H. Nakayama K. Yamaguchi J. P. Spatz R. Kemkemer J. Nakanishi Biomaterials 2011 33 2409 2418
125. M. Wirkner J. M. Alonso V. Maus M. Salierno T. T. Lee A. J. García A. del Campo Adv. Mater. 2011 23 3907 3911
126. W. Luo M. N. Yousaf J. Am. Chem. Soc. 2011 133 10780 10783
127. D. Liu Y. Xie H. Shao X. Jiang Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 4406 4408
128. Y.-H. Gong C. Li J. Yang H.-Y. Wang R.-X. Zhuo X.-Z. Zhang Macromolecules 2011 44 7499 7502
129. A. González-Campo M. Brasch D. Uhlenheuer A. Gómez-Casado L. Yang L. Brunsveld J. Huskens P. Jonkheijm Langmuir 2012 28 16364 16371
130. A. Qi J. Brinkmann J. Huskens S. Krabbenborg J. de Boer P. Jonkheijm Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 12233 12337
131. P. Neirynck J. Brinkmann Q. An D. van der Schaft L. Gustav Milroy P. Jonkheijm L. Brunsveld Chem. Commun. 2013 49 3679 3681
132. J. Young H. D. Nguyen L. Yang J. Huskens P. Jonkheijm L. Brunsveld ChemBioChem 2010 11 180 183