Shotgun approach for quantitative imaging of phospholipids using nanospray desorption electrospray ionization mass spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 3, 2014, Pages 1872-1880

  Lanekoff, Ingela ^a   Thomas, Mathew ^a   Laskin, Julia ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DESORPTION ELECTROSPRAY IONIZATION; DESORPTION ELECTROSPRAY IONIZATION MASS SPECTROMETRIES; MASS SPECTROMETRY IMAGING (MSI); NANO-ELECTROSPRAY IONIZATIONS; ON-LINE QUANTIFICATION; PHOSPHATIDYLCHOLINE; QUANTITATIVE IMAGING; SIMULTANEOUS IMAGING;

DESORPTION; ELECTROSPRAY IONIZATION; MASS SPECTROMETRY; MOLECULES; SOLVENTS;

PHOSPHOLIPIDS;

PHOSPHATIDYLCHOLINE;

ANIMAL; ARTICLE; BRAIN; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; MALE; METABOLISM; METHODOLOGY; MOLECULAR IMAGING; NANOTECHNOLOGY; RAT; SPRAGUE DAWLEY RAT; STANDARD; STATISTICAL MODEL;

ANIMALS; BRAIN; LINEAR MODELS; MALE; MOLECULAR IMAGING; NANOTECHNOLOGY; PHOSPHATIDYLCHOLINES; RATS; RATS, SPRAGUE-DAWLEY; REFERENCE STANDARDS; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 84893542227     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac403931r     Document Type: Article

References (75)

1. Caprioli, R. M.; Farmer, T. B.; Gile, J. Anal. Chem. 1997, 69, 4751-4760
2. Cornett, D. S.; Reyzer, M. L.; Chaurand, P.; Caprioli, R. M. Nat. Methods 2007, 4, 828-833
3. Murphy, R. C.; Hankin, J. A.; Barkley, R. M. J. Lipid Res. 2009, 50, S317-S322
4. Prideaux, B.; Stoeckli, M. J. Proteomics 2012, 75, 4999-5013
5. Woods, A. S.; Colsch, B.; Jackson, S. N.; Post, J.; Baldwin, K.; Roux, A.; Hoffer, B.; Cox, B. M.; Hoffer, M.; Rubovitch, V.; Pick, C. G.; Schultz, J. A.; Balaban, C. ACS Chem. Neurosci. 2013, 4, 594-600
6. Sugiura, Y.; Konishi, Y.; Zaima, N.; Kajihara, S.; Nakanishi, H.; Taguchi, R.; Setou, M. J. Lipid Res. 2009, 50, 1776-1788
7. Roempp, A.; Spengler, B. Histochem. Cell Biol. 2013, 139, 759-783
8. Hankin, J.; Farias, S.; Barkley, R.; Heidenreich, K.; Frey, L.; Hamazaki, K.; Kim, H.-Y.; Murphy, R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 1014-1021
9. Passarelli, M. K.; Winograd, N. Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2011, 1811, 976-990
10. McDonnell, L. A.; Heeren, R. M. A. Mass Spectrom. Rev. 2007, 26, 606-643
11. Sjovall, P.; Lausmaa, J.; Johansson, B. Anal. Chem. 2004, 76, 4271-4278
12. Touboul, D.; Kollmer, F.; Niehuis, E.; Brunelle, A.; Laprévote, O. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 1608-1618
13. Ostrowski, S. G.; Van Bell, C. T.; Winograd, N.; Ewing, A. G. Science 2004, 305, 71-73
14. Amaya, K. R.; Sweedler, J. V.; Clayton, D. F. J. Neurochem. 2011, 118, 499-511
15. Wu, C.; Dill, A. L.; Eberlin, L. S.; Cooks, R. G.; Ifa, D. R. Mass Spectrom. Rev. 2013, 32, 218-243
16. Eberlin, L. S.; Norton, I.; Dill, A. L.; Golby, A. J.; Ligon, K. L.; Santagata, S.; Cooks, R. G.; Agar, N. Y. R. Cancer Res. 2012, 72, 645-654
17. Cooks, R. G.; Ouyang, Z.; Takats, Z.; Wiseman, J. M. Science 2006, 311, 1566-1570
18. Vismeh, R.; Waldon, D. J.; Teffera, Y.; Zhao, Z. Anal. Chem. 2012, 84, 5439-5445
19. Perry, R. H.; Bellovin, D. I.; Shroff, E. H.; Ismail, A. I.; Zabuawala, T.; Felsher, D. W.; Zare, R. N. Anal. Chem. 2013, 85, 4259-4262
20. Gerbig, S.; Golf, O.; Balog, J.; Denes, J.; Baranyai, Z.; Zarand, A.; Raso, E.; Timar, J.; Takats, Z. Anal. Bioanal. Chem. 2012, 403, 2315-2325
21. Blanksby, S. J.; Mitchell, T. W. Annu. Rev. Anal. Chem. 2010, 3, 433-465
22. Stoeckli, M.; Staab, D.; Schweitzer, A. Int. J. Mass. Spectrom. 2007, 260, 195-202
23. Pirman, D. A.; Reich, R. F.; Kiss, A.; Heeren, R. M. A.; Yost, R. A. Anal. Chem. 2013, 85, 1081-1089
24. Prideaux, B.; Dartois, V.; Staab, D.; Weiner, D. M.; Goh, A.; Via, L. E.; Barry, C. E., III; Stoeckli, M. Anal. Chem. 2011, 83, 2112-2118
25. Koeniger, S. L.; Talaty, N.; Luo, Y.; Ready, D.; Voorbach, M.; Seifert, T.; Cepa, S.; Fagerland, J. A.; Bouska, J.; Buck, W.; Johnson, R. W.; Spanton, S. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2011, 25, 503-510
26. Goodwin, R. J. A.; Mackay, C. L.; Nilsson, A.; Harrison, D. J.; Farde, L.; Andren, P. E.; Iverson, S. L. Anal. Chem. 2011, 83, 9694-9701
27. Nilsson, A.; Fehniger, T. E.; Gustavsson, L.; Andersson, M.; Kenne, K.; Marko-Varga, G.; Andren, P. E. PloS One 2010, 5 e11411
28. Groseclose, M. R.; Castellino, S. Anal. Chem. 2013, 85, 10099-10106
29. Kertesz, V.; Van Berkel, G. J.; Vavrek, M.; Koeplinger, K. A.; Schneider, B. B.; Covey, T. R. Anal. Chem. 2008, 80, 5168-5177
30. Wiseman, J. M.; Ifa, D. R.; Zhu, Y.; Kissinger, C. B.; Manicke, N. E.; Kissinger, P. T.; Cooks, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 18120-18125
31. Landgraf, R. R.; Garrett, T. J.; Conaway, M. C. P.; Calcutt, N. A.; Stacpoole, P. W.; Yost, R. A. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2011, 25, 3178-3184
32. Hamm, G.; Bonnel, D.; Legouffe, R.; Pamelard, F.; Delbos, J.-M.; Bouzom, F.; Stauber, J. J. Proteomics 2012, 75, 4952-4961
33. Lanekoff, I.; Sjövall, P.; Ewing, A. G. Anal. Chem. 2011, 83, 5337-5343
34. Ostrowski, S. G.; Kurczy, M. E.; Roddy, T. P.; Winograd, N.; Ewing, A. G. Anal. Chem. 2007, 79, 3554-3560
35. Lam, S. M.; Shui, G. J. Genet. Genomics 2013, 40, 375-390
36. Wenk, M. R. Nat. Rev. Drug Discovery 2005, 4, 594-610
37. Brown, H. A.; Murphy, R. C. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 602-606
38. Han, X. L.; Gross, R. W. Mass Spectrom. Rev. 2005, 24, 367-412
39. Navas-Iglesias, N.; Carrasco-Pancorbo, A.; Cuadros-Rodriguez, L. Trac-trend anal. chem 2009, 28, 393-403
40. Li, M.; Yang, L.; Bai, Y.; Liu, H. Anal. Chem. 2013, 86, 161-175
41. Carrasco-Pancorbo, A.; Navas-Iglesias, N.; Cuadros-Rodríguez, L. TrAC, Trends Anal. Chem. 2009, 28, 263-278
42. Pulfer, M.; Murphy, R. C. Mass Spectrom. Rev. 2003, 22, 332-364
43. Schwudke, D.; Schuhmann, K.; Herzog, R.; Bornstein, S. R.; Shevchenko, A. Cold Spring Harbor Perspect. Biol. 2011, 3, a004614
44. Liebisch, G.; Lieser, B.; Rathenberg, J.; Drobnik, W.; Schmitz, G. Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2004, 1686, 108-117
45. Yang, K.; Zhao, Z.; Gross, R. W.; Han, X. Anal. Chem. 2011, 83, 4243-4250
46. Lehmann, W. D.; Koester, M.; Erben, G.; Keppler, D. Anal. Biochem. 1997, 246, 102-110
47. Han, X. L.; Gross, R. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 10635-10639
48. Fridriksson, E. K.; Shipkova, P. A.; Sheets, E. D.; Holowka, D.; Baird, B.; McLafferty, F. W. Biochemistry 1999, 38, 8056-8063
49. Brugger, B.; Erben, G.; Sandhoff, R.; Wieland, F. T.; Lehmann, W. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 2339-2344
50. Ivanova, P. T.; Cerda, B. A.; Horn, D. M.; Cohen, J. S.; McLafferty, F. W.; Brown, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 7152-7157
51. Ejsing, C. S.; Sampaio, J. L.; Surendranath, V.; Duchoslav, E.; Ekroos, K.; Klemm, R. W.; Simons, K.; Shevchenko, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 2136-2141
52. Ekroos, K.; Chernushevich, I. V.; Simons, K.; Shevchenko, A. Anal. Chem. 2002, 74, 941-949
53. Ejsing, C. S.; Duchoslav, E.; Sampaio, J.; Simons, K.; Bonner, R.; Thiele, C.; Ekroos, K.; Shevchenko, A. Anal. Chem. 2006, 78, 6202-6214
54. Deeley, J. M.; Mitchell, T. W.; Wei, X.; Korth, J.; Nealon, J. R.; Blanksby, S. J.; Truscott, R. J. W. Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2008, 1781, 288-298
55. DeLong, C. J.; Baker, P. R. S.; Samuel, M.; Cui, Z.; Thomas, M. J. J. Lipid Res. 2001, 42, 1959-1968
56. Zacarias, A.; Bolanowski, D.; Bhatnagar, A. Anal. Biochem. 2002, 308, 152-159
57. Roach, P. J.; Laskin, J.; Laskin, A. Analyst 2010, 135, 2233-2236
58. Lanekoff, I.; Heath, B. S.; Liyu, A.; Thomas, M.; Carson, J. P.; Laskin, J. Anal. Chem. 2012, 84, 8351-8356
59. Laskin, J.; Heath, B. S.; Roach, P. J.; Cazares, L.; Semmes, O. J. Anal. Chem. 2012, 84, 141-148
60. Lanekoff, I.; Geydebrekht, O.; Pinchuk, G. E.; Konopka, A. E.; Laskin, J. Analyst 2013, 138, 1971-1978
61. Laskin, J.; Eckert, P. A.; Roach, P. J.; Heath, B. S.; Nizkorodov, S. A.; Laskin, A. Anal. Chem. 2012, 84, 7179-7187
62. Lanekoff, I.; Thomas, M.; Carson, J. P.; Smith, J. N.; Timchalk, C.; Laskin, J. Anal. Chem. 2012, 85, 882-889
63. Lanekoff, I.; Burnum-Johnson, K.; Thomas, M.; Short, J.; Carson, J. P.; Cha, J.; Dey, S. K.; Yang, P.; Conaway, M.; Laskin, J. Anal. Chem. 2013, 85, 9596-9603
64. Jaitly, N.; Mayampurath, A.; Littlefield, K.; Adkins, J. N.; Anderson, G. A.; Smith, R. D. BMC Bioinf. 2009, 10, 87
65. Schiller, J.; Süß, R.; Arnhold, J.; Fuchs, B.; Leßig, J.; Müller, M.; Petković, M.; Spalteholz, H.; Zschörnig, O.; Arnold, K. Prog. Lipid Res. 2004, 43, 449-488
66. Harvey, D. J. J. Mass Spectrom. 1995, 30, 1333-1346
67. Koivusalo, M.; Haimi, P.; Heikinheimo, L.; Kostiainen, R.; Somerharju, P. J. Lipid Res. 2001, 42, 663-672
68. Brunelle, A.; Touboul, D.; Laprevote, O. J. Mass Spectrom. 2005, 40, 985-999
69. Hankin, J. A.; Murphy, R. C. Anal. Chem. 2010, 82, 8476-8484
70. Ivanova, P. T.; Milne, S. B.; Byrne, M. O.; Xiang, Y.; Brown, H. A. In Methods in Enzymology; Brown, H. A., Ed.; Academic Press: New York, 2007; Vol. 432, pp 21-57.
71. Obrien, J. S.; Sampson, E. L. J. Lipid Res. 1965, 6, 545-551
72. Raghanti, M. A.; Spocter, M. A.; Butti, C.; Hof, P. R.; Sherwood, C. C. Front. Neuroanat. 2010, 4, 3
73. Axelsen, P. H.; Murphy, R. C. J. Lipid Res. 2010, 51, 660-671
74. Ma, K.; Langenbach, R.; Rapoport, S. I.; Basselin, M. J. Lipid Res. 2007, 48, 848-854
75. Chavko, M.; Nemoto, E. M.; Melick, J. A. Mol. Chem. Neuropathol. 1993, 18, 123-131