Portable nucleic acid thermocyclers

Chemical Society Reviews

Volumn 42, Issue 22, 2013, Pages 8769-8798

  Almassian, David R ^a   Cockrell, Lisa M ^a   Nelson, William M ^a  

^a TETRACORE INC   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

NUCLEIC ACID;

EQUIPMENT; EQUIPMENT DESIGN; HUMAN; METHODOLOGY; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION; REVIEW;

EQUIPMENT DESIGN; HUMANS; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES; NUCLEIC ACIDS;

EID: 84886507451     PISSN: 03060012     EISSN: 14604744     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3cs60144g     Document Type: Article

References (112)

1. R. K. Saiki, S. Scharf, F. Faloona, K. B. Mullis, G. T. Horn, H. A. Erlich, N. Arnheim, Science, 1985, 230, 1350-1354
2. M. Molsa, K. A. Koskela, E. Ronkko, N. Ikonen, T. Ziegler, S. Nikkari, J. Virol. Methods, 2012, 181, 188-191
3. T. A. Paixao, A. V. Neta, N. O. Paiva, J. R. Reis, M. S. Barbosa, C. V. Serra, R. R. Silva, T. R. Beckham, B. M. Martin, N. P. Clarke, L. G. Adams, R. L. Santos, BMC Vet. Res., 2008, 4, 53
4. K. B. Mullis, F. A. Faloona, Methods Enzymol., 1987, 155, 335-350
5. D. H. Persing, J. Clin. Microbiol., 1991, 29, 1281-1285
6. J. Aslanzadeh, Ann. Clin. Lab. Sci., 2004, 34, 389-396
7. T. D. Brock, Genetics, 1997, 146, 1207-1210
8. K. A. Eckert, T. A. Kunkel, PCR Methods Appl., 1991, 1, 17-24
9. C. T. Wittwer, M. G. Herrmann, A. A. Moss, R. P. Rasmussen, Biotechniques, 1997, 22, 130-131, 134-138
10. M. Bengtsson, H. J. Karlsson, G. Westman, M. Kubista, Nucleic Acids Res., 2003, 31, e45
11. S. Gurrieri, S. B. Smith, K. S. Wells, I. D. Johnson, C. Bustamante, Nucleic Acids Res., 1996, 24, 4759-4767
12. E. S. Mansfield, J. M. Robertson, R. V. Lebo, M. Y. Lucero, P. E. Mayrand, E. Rappaport, T. Parrella, M. Sartore, S. Surrey, P. Fortina, Am. J. Med. Genet., 1993, 48, 200-208
13. P. M. Holland, R. D. Abramson, R. Watson, D. H. Gelfand, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1991, 88, 7276-7280
14. Y. L. Tsai, H. T. Wang, H. F. Chang, C. F. Tsai, C. K. Lin, P. H. Teng, C. Su, C. C. Jeng, P. Y. Lee, PLoS One, 2012, 7, e45278
15. S. Tyagi, F. R. Kramer, Nat. Biotechnol., 1996, 14, 303-308
16. S. Y. Park, B. Lee, K. S. Park, Y. Chong, M. Y. Yoon, S. J. Jeon, D. E. Kim, Appl. Microbiol. Biotechnol., 2010, 85, 807-812
17. O. Piepenburg, C. H. Williams, D. L. Stemple, N. A. Armes, PLoS Biol., 2006, 4, e204
18. M. Vincent, Y. Xu, H. Kong, EMBO Rep., 2004, 5, 795-800
19. T. Notomi, H. Okayama, H. Masubuchi, T. Yonekawa, K. Watanabe, N. Amino, T. Hase, Nucleic Acids Res., 2000, 28, E63
20. J. Kim, C. J. Easley, Bioanalysis, 2011, 3, 227-239
21. P. J. Asiello, A. J. Baeumner, Lab Chip, 2011, 11, 1420-1430
22. M. Hashimoto, P. C. Chen, M. W. Mitchell, D. E. Nikitopoulos, S. A. Soper, M. C. Murphy, Lab Chip, 2004, 4, 638-645
23. K. Sun, A. Yamaguchi, Y. Ishida, S. Matsuo, H. Misawa, Sens. Actuators, B, 2002, 84, 283-289
24. P. Neuzil, C. Zhang, J. Pipper, S. Oh, L. Zhuo, Nucleic Acids Res., 2006, 34, e77
25. M. Amasia, M. Cozzens, M. J. Madou, Sens. Actuators, B, 2012, 161, 1191-1197, 10.1016/j.snb.2011.11.080
26. D. Chen, M. Mauk, X. Qiu, C. Liu, J. Kim, S. Ramprasad, S. Ongagna, W. R. Abrams, D. Malamud, P. L. Corstjens, H. H. Bau, Biomed. Microdevices, 2010, 12, 705-719
27. T. H. Fang, N. Ramalingam, D. Xian-Dui, T. S. Ngin, Z. Xianting, A. T. Lai Kuan, E. Y. Peng Huat, G. Hai-Qing, Biosens. Bioelectron., 2009, 24, 2131-2136
28. K. E. Herold, N. Sergeev, A. Matviyenko, A. Rasooly, Methods Mol. Biol., 2009, 504, 441-458
29. B. S. Ferguson, S. F. Buchsbaum, J. S. Swensen, K. Hsieh, X. Lou, H. T. Soh, Anal. Chem., 2009, 81, 6503-6508
30. Y. T. Kim, Y. Chen, J. Y. Choi and T. S. Seo, 15th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (uTAS), Seattle, WA, 2011
31. P. Liu, X. Li, S. A. Greenspoon, J. R. Scherer, R. A. Mathies, Lab Chip, 2011, 11, 1041-1048
32. S. S. Yeung, T. M. Lee, I. M. Hsing, Anal. Chem., 2008, 80, 363-368
33. T. M. Lee, M. C. Carles, I. M. Hsing, Lab Chip, 2003, 3, 100-105
34. F. Wang, M. A. Burns, Biomed. Microdevices, 2009, 11, 1071-1080
35. N. Thaitrong, P. Liu, T. Briese, W. I. Lipkin, T. N. Chiesl, Y. Higa, R. A. Mathies, Anal. Chem., 2010, 82, 10102-10109
36. T. Abe, Y. Segawa, H. Watanabe, T. Yotoriyama, S. Kai, A. Yasuda, N. Shimizu, N. Tojo, Lab Chip, 2011, 11, 1166-1167
37. X. Fang, H. Zhang, F. Zhang, F. Jing, H. Mao, Q. Jin, J. Zhao, Lab Chip, 2012, 12, 3190-3196
38. I. Schneegass, R. Brautigam, J. M. Kohler, Lab Chip, 2001, 1, 42-49
39. M. U. Kopp, A. J. De Mello, A. Manz, Science, 1998, 280, 1046-1048
40. H. Nagai, Y. Fuchiwaki, K. Yamanaka, M. Saito and E. Tamiya, 15th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (uTAS), Seattle, WA, 2011
41. K. Yamanaka, M. Saito, K. Kondoh, M. M. Hossain, R. Koketsu, T. Sasaki, N. Nagatani, K. Ikuta, E. Tamiya, Analyst, 2011, 136, 2064-2068
42. N. Nagatani, K. Yamanaka, H. Ushijima, R. Koketsu, T. Sasaki, K. Ikuta, M. Saito, T. Miyahara, E. Tamiya, Analyst, 2012, 137, 3422-3426
43. N. Park, S. Kim, J. H. Hahn, Anal. Chem., 2003, 75, 6029-6033
44. Y. Li, C. Zhang, D. Xing, Microfluid. Nanofluid., 2011, 10, 367-380
45. S. Brunklaus, T. E. Hansen-Hagge, J. Erwes, J. Hoth, M. Jung, D. Latta, X. Strobach, C. Winkler, M. Ritzi-Lehnert, K. S. Drese, Electrophoresis, 2012, 33, 3222-3228
46. K. S. Lok, Y. C. Kwok, P. P. F. Lee, N.-T. Nguyen, Sens. Actuators, B, 2012, 166-167, 893-897, 10.1016/j.snb.2012.03.001
47. A. Sueki, K. Matsuda, C. Taira, A. Yamaguchi, H. Koeda, F. Takagi, Y. Kobayashi, M. Sugano, T. Honda, Clin. Chim. Acta, 2013, 415, 276-278
48. K. Matsuda, A. Yamaguchi, C. Taira, A. Sueki, H. Koeda, F. Takagi, M. Sugano, T. Honda, Clin. Chim. Acta, 2012, 413, 1742-1745
49. D. Pal, V. Venkataraman, Sens. Actuators, A, 2002, 102, 151-156
50. S. K. Baek, J. Min, J. H. Park, Lab Chip, 2010, 10, 909-917
51. S. Mondal, V. Venkataraman, J. Biochem. Biophys. Methods, 2007, 70, 773-777
52. N. Pak, D. C. Saunders, C. R. Phaneuf, C. R. Forest, Biomed. Microdevices, 2012, 14, 427-433
53. S. H. Lee, S. W. Kim, J. Y. Kang, C. H. Ahn, Lab Chip, 2008, 8, 2121-2127
54. C. J. Easley, J. M. Karlinsey, J. M. Bienvenue, L. A. Legendre, M. G. Roper, S. H. Feldman, M. A. Hughes, E. L. Hewlett, T. J. Merkel, J. P. Ferrance, J. P. Landers, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2006, 103, 19272-19277
55. K. A. Hagan, J. V. Norris, B. E. Root, O. N. Scott, R. Lovaglio, M. Egan, P. Trost, J. M. Bienvenue and J. P. Landers, 15th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (uTAS), Seattle, WA, 2011
56. J. Burger, A. Gross, D. Mark, F. von Stetten, R. Zengerle and G. Roth, Solid-State Sensors, Actuators and Microsystems Conference (TRANSDUCERS), 2011 16th International, 2011
57. B. C. Giordano, J. Ferrance, S. Swedberg, A. F. Huhmer, J. P. Landers, Anal. Biochem., 2001, 291, 124-132
58. K. A. Hagan, C. R. Reedy, M. L. Uchimoto, D. Basu, D. A. Engel, J. P. Landers, Lab Chip, 2011, 11, 957-961
59. C. Ke, H. Berney, A. Mathewson, M. Sheehan, Sens. Actuators, B, 2004, 102, 308-314
60. A. F. Huhmer, J. P. Landers, Anal. Chem., 2000, 72, 5507-5512
61. R. P. Oda, M. A. Strausbauch, A. F. Huhmer, N. Borson, S. R. Jurrens, J. Craighead, P. J. Wettstein, B. Eckloff, B. Kline, J. P. Landers, Anal. Chem., 1998, 70, 4361-4368
62. K. J. Shaw, P. T. Docker, J. V. Yelland, C. E. Dyer, J. Greenman, G. M. Greenway, S. J. Haswell, Lab Chip, 2010, 10, 1725-1728
63. M. Krishnan, V. M. Ugaz, M. A. Burns, Science, 2002, 298, 793
64. D. Braun, N. L. Goddard, A. Libchaber, Phys. Rev. Lett., 2003, 91, 158103
65. E. K. Wheeler, W. Benett, P. Stratton, J. Richards, A. Chen, A. Christian, K. D. Ness, J. Ortega, L. G. Li, T. H. Weisgraber, K. Goodson, F. Milanovich, Anal. Chem., 2004, 76, 4011-4016
66. H. F. Chang, Y. L. Tsai, C. F. Tsai, C. K. Lin, P. Y. Lee, P. H. Teng, C. Su, C. C. Jeng, Biotechnol. J., 2012, 7, 662-666
67. W. P. Chou, P. H. Chen, M. Miao, Jr., L. S. Kuo, S. H. Yeh, P. J. Chen, Biotechniques, 2011, 50, 52-57
68. R. Muddu, Y. A. Hassan, V. M. Ugaz, Angew. Chem., Int. Ed., 2011, 50, 3048-3052
69. Y.-F. Hsieh, D.-S. Lee, P.-H. Chen, S.-K. Liao, S.-H. Yeh, P.-J. Chen, A.-S. Yang, Sens. Actuators, B, 2013, 183, 434-440, 10.1016/j.snb.2013.04.003
70. P. LaBarre, K. R. Hawkins, J. Gerlach, J. Wilmoth, A. Beddoe, J. Singleton, D. Boyle, B. Weigl, PLoS One, 2011, 6, e19738
71. K. A. Curtis, D. L. Rudolph, I. Nejad, J. Singleton, A. Beddoe, B. Weigl, P. LaBarre, S. M. Owen, PLoS One, 2012, 7, e31432
72. C. Liu, M. G. Mauk, R. Hart, X. Qiu, H. H. Bau, Lab Chip, 2011, 11, 2686-2692
73. M. M. Kiss, L. Ortoleva-Donnelly, N. R. Beer, J. Warner, C. G. Bailey, B. W. Colston, J. M. Rothberg, D. R. Link, J. H. Leamon, Anal. Chem., 2008, 80, 8975-8981
74. P. Belgrader, W. Benett, D. Hadley, G. Long, R. Mariella, Jr., F. Milanovich, S. Nasarabadi, W. Nelson, J. Richards, P. Stratton, Clin. Chem., 1998, 44, 2191-2194
75. F. Shen, W. Du, J. E. Kreutz, A. Fok, R. F. Ismagilov, Lab Chip, 2010, 10, 2666-2672
76. Y. Zeng, M. Shin, T. Wang, Lab Chip, 2013, 13, 267-273
77. J. S. Marcus, W. F. Anderson, S. R. Quake, Anal. Chem., 2006, 78, 956-958
78. M. Mahalanabis, J. Do, H. ALMuayad, J. Y. Zhang, C. M. Klapperich, Biomed. Microdevices, 2010, 12, 353-359
79. H. Becker, N. Hlawatsch, R. Klemm and C. Gärtner, Proc. SPIE 7929, Microfluidics, BioMEMS, and Medical Microsystems IX, 792903, 2011, DOI: 10.1117/12.874551
80. S. K. Jha, R. Chand, D. Han, Y. C. Jang, G. S. Ra, J. S. Kim, B. H. Nahm, Y. S. Kim, Lab Chip, 2012, 12, 4455-4464
81. A. Holmberg, A. Blomstergren, O. Nord, M. Lukacs, J. Lundeberg, M. Uhlen, Electrophoresis, 2005, 26, 501-510
82. Q. Cao, M. Mahalanabis, J. Chang, B. Carey, C. Hsieh, A. Stanley, C. A. Odell, P. Mitchell, J. Feldman, N. R. Pollock, C. M. Klapperich, PLoS One, 2012, 7, e33176
83. G. V. Kaigala, M. Behnam, C. Bliss, M. Khorasani, S. Ho, J. N. McMullin, D. G. Elliott, C. J. Backhouse, IET Nanobiotechnol., 2009, 3, 1-7
84. G. Y. Ang, C. Y. Yu, C. Y. Yean, Biosens. Bioelectron., 2012, 38, 151-156
85. S. Nihonyanagi, Y. Kanoh, K. Okada, T. Uozumi, Y. Kazuyama, T. Yamaguchi, N. Nakazaki, K. Sakurai, Y. Hirata, S. Munekata, S. Ohtani, T. Takemoto, Y. Bandoh, T. Akahoshi, Inflammation Res., 2012, 35, 927-934
86. K. Glynou, P. C. Ioannou, T. K. Christopoulos, V. Syriopoulou, Anal. Chem., 2003, 75, 4155-4160
87. P. F. Mens, H. M. de Bes, P. Sondo, N. Laochan, L. Keereecharoen, A. van Amerongen, J. Flint, J. R. Sak, S. Proux, H. Tinto, H. D. Schallig, J. Clin. Microbiol., 2012, 50, 3520-3525
88. D. J. Carter, R. B. Cary, Nucleic Acids Res., 2007, 35, e74
89. P. Corstjens, M. Zuiderwijk, A. Brink, S. Li, H. Feindt, R. S. Niedbala, H. Tanke, Clin. Chem., 2001, 47, 1885-1893
90. T. Kaewphinit, S. Santiwatanakul, P. Jaratsing, K. Chansiri, N. Arunrut and W. Kiatpathomchai, Biomedical Engineering International Conference (BMEiCON), 2011, 2012
91. W. Kiatpathomchai, W. Jaroenram, N. Arunrut, S. Jitrapakdee, T. W. Flegel, J. Virol. Methods, 2008, 153, 214-217
92. Electrochemical DNA Biosensors, ed. M. Ozsoz, 2012
93. G. Marrazza, G. Chiti, M. Mascini, M. Anichini, Clin. Chem., 2000, 46, 31-37
94. B. Meric, K. Kerman, D. Ozkan, P. Kara, S. Erensoy, U. S. Akarca, M. Mascini, M. Ozsoz, Talanta, 2002, 56, 837-846
95. S. Aydinlik, D. Ozkan-Ariksoysal, P. Kara, A. A. Sayiner, M. Ozsoz, Anal. Methods, 2011, 3, 1607-1614
96. R. Y. Lai, E. T. Lagally, S. H. Lee, H. T. Soh, K. W. Plaxco, A. J. Heeger, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2006, 103, 4017-4021
97. D. Jiang, G. Xiang, J. Y. ChangLiu, L. Liu, X. Pu, Int. J. Electrochem. Sci., 2012, 7, 10607-10619
98. T. Defever, M. Druet, D. Evrard, D. Marchal, B. Limoges, Anal. Chem., 2011, 83, 1815-1821
99. B. Y. Won, S. Shin, S. Baek, Y. L. Jung, T. Li, S. C. Shin, D. Y. Cho, S. B. Lee, H. G. Park, Analyst, 2011, 136, 1573-1579
100. X. Luo, J. Xu, J. Barford, I. Hsing, Electrochem. Commun., 2010, 12, 531-534
101. M. U. Ahmed, S. Nahar, M. Safavieh, M. Zourob, Analyst, 2013, 138, 907-915
102. M. Aitichou, R. Henkens, A. M. Sultana, R. G. Ulrich, M. Sofi Ibrahim, Mol. Cell. Probes, 2004, 18, 373-377
103. B. J. Hindson, K. D. Ness, D. A. Masquelier, P. Belgrader, N. J. Heredia, A. J. Makarewicz, I. J. Bright, M. Y. Lucero, A. L. Hiddessen, T. C. Legler, T. K. Kitano, M. R. Hodel, J. F. Petersen, P. W. Wyatt, E. R. Steenblock, P. H. Shah, L. J. Bousse, C. B. Troup, J. C. Mellen, D. K. Wittmann, N. G. Erndt, T. H. Cauley, R. T. Koehler, A. P. So, S. Dube, K. A. Rose, L. Montesclaros, S. Wang, D. P. Stumbo, S. P. Hodges, S. Romine, F. P. Milanovich, H. E. White, J. F. Regan, G. A. Karlin-Neumann, C. M. Hindson, S. Saxonov, B. W. Colston, Anal. Chem., 2011, 83, 8604-8610
104. Z. Zhu, W. Zhang, X. Leng, M. Zhang, Z. Guan, J. Lu, C. J. Yang, Lab Chip, 2012, 12, 3907-3913
105. M. M. Packard, E. K. Wheeler, E. C. Alocilja, M. Shusteff, Diagnostics, 2013, 3, 105-116
106. K.-Y. Hwang, S.-Y. Jeong, Y.-R. Kim, K. Namkoong, H.-K. Lim, W.-S. Chung, J.-H. Kim, N. Huh, Sens. Actuators, B, 2011, 154, 46-51
107. O. Strohmeier, A. Emperle, G. Roth, D. Mark, R. Zengerle, F. von Stetten, Lab Chip, 2013, 13, 146-155
108. A. V. Govindarajan, S. Ramachandran, G. D. Vigil, P. Yager, K. F. Bohringer, Lab Chip, 2012, 12, 174-181
109. T.-M. Hsieh, C.-H. Luo, J.-H. Wang, J.-L. Lin, K.-Y. Lien, G.-B. Lee, Microfluid. Nanofluid., 2009, 6, 797-809
110. S. Babikian, L. Wu, G. Li and M. Bachman, Electronic Components and Technology Conference (ECTC), 2012 IEEE 62nd, 2012
111. Y.-F. Hsieh, A.-S. Yang, C.-W. Chen, S.-K. Liao, L.-Y. Tseng and P.-H. Chen, Automation Science and Engineering (CASE), 2012 IEEE International Conference on, 2012
112. Y. T. Kim, Y. Chen, J. Y. Choi, W. J. Kim, H. M. Dae, J. Jung, T. S. Seo, Biosens. Bioelectron., 2012, 33, 88-94