Selective detection and inhibition of active caspase-3 in cells with optimized peptides

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 34, 2013, Pages 12869-12876

  Vickers, Chris J ^a   González Páez, Gonzalo E ^a   Wolan, Dennis W ^a  

^a SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIVITY-BASED PROBE; CARDIO-VASCULAR DISEASE; CELLULAR DIFFERENTIATION; DETECTION AND CONTROLS; NEURODEGENERATIVE DISORDERS; NEUROLOGICAL DISORDERS; PEPTIDE-BASED INHIBITORS; PROTEOLYTIC FUNCTIONS;

AMINO ACIDS; CELL DEATH; DISEASES; OPTIMIZATION;

PEPTIDES;

CASPASE 3; CASPASE 7; PROTEINASE; CASPASE INHIBITOR; CELL PENETRATING PEPTIDE;

ACTIVITY BASED PROBE; APOPTOSIS; ARTICLE; CARDIOVASCULAR DISEASE; CELL MEMBRANE PERMEABILITY; ENZYME ACTIVITY; HUMAN; HUMAN CELL; METHODOLOGY; NEUROLOGIC DISEASE; PHENOTYPE; PROTEIN DEGRADATION; SEPSIS; CELL SURVIVAL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; DOSE RESPONSE; DRUG EFFECTS; ENZYME ACTIVATION; HELA CELL LINE; HL 60 CELL LINE; HT 29 CELL LINE; MCF 7 CELL LINE; METABOLISM; STRUCTURE ACTIVITY RELATION; SYNTHESIS; TUMOR CELL LINE;

CASPASE 3; CASPASE INHIBITORS; CELL LINE, TUMOR; CELL SURVIVAL; CELL-PENETRATING PEPTIDES; DOSE-RESPONSE RELATIONSHIP, DRUG; ENZYME ACTIVATION; HELA CELLS; HL-60 CELLS; HT29 CELLS; HUMANS; MCF-7 CELLS; MOLECULAR STRUCTURE; STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP;

EID: 84883265786     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja406399r     Document Type: Article

References (57)

1. Riedl, J. R.; Shi, Y. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004, 5, 897
2. Fuchs, Y.; Steller, H. Cell 2011, 147, 742
3. Martin, S. J.; Henry, C. M.; Cullen, S. P. Mol. Cell 2012, 46, 387
4. Strowig, T.; Henao-Mejia, J.; Elinav, E.; Flavell, R. Nature 2012, 481, 278
5. Fernando, P.; Kelly, J. F.; Balazsi, K.; Slack, R. S.; Megeney, L. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 11025
6. Fujita, J.; Crane, A. M.; Souza, M. K.; Dejosez, M.; Kyba, M.; Flavell, R. A.; Thomson, J. A.; Zwaka, T. P Cell Stem Cell 2008, 2, 595
7. Larsen, B. D.; Rampalli, S.; Burns, L. E.; Brunette, S.; Dilworth, F. J.; Megeney, L. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 4230
8. Basu, S.; Rajakaruna, S.; Menko, A. S. J. Biol. Chem. 2012, 287, 8384
9. Lamkanfi, M.; Festjens, N.; Declercq, W.; Vanden Berghe, T.; Vandenabeele, P. Cell Death Differ. 2007, 14, 44
10. Kikuchi, M.; Kuroki, S.; Kayama, M.; Sakaguchi, S.; Lee, K. K.; Yonehara, S. J. Biol. Chem. 2012, 287, 41165
11. Boatright, K. M.; Salvesen, G. S. Curr. Opin. Cell Biol. 2003, 15, 725
12. Pop, C.; Salvesen, G. S. J. Biol. Chem. 2009, 284, 21777
13. Salvesen, G. S.; Dixit, V. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 10964
14. Shi, Y. Cell 2004, 117, 855
15. Feeney, B.; Clark, A. C. J. Biol. Chem. 2005, 280, 39772
16. Keller, N.; Grütter, M. G.; Zerbe, O. Cell Death Differ. 2010, 17, 710
17. Devarajan, E.; Sahin, A. A.; Chen, J. S.; Krishnamurthy, R. R.; Aggarwal, N.; Brun, A. M.; Sapino, A.; Zhang, F.; Sharma, D.; Yang, X. H.; Tora, A. D.; Mehta, K. Oncogene 2002, 21, 8843
18. Olsson, M.; Zhivotovsky, B. Cell Death Differ. 2011, 18, 1441
19. Graham, R. K.; Deng, Y.; Slow, E. J.; Haigh, B.; Bissada, N.; Lu, G.; Pearson, J.; Shehadeh, J.; Bertram, L.; Murphy, Z.; Warby, S. C.; Doty, C. N.; Roy, S.; Wellington, C. L.; Leavitt, B. R.; Raymond, L. A.; Nicholson, D. W.; Hayden, M. R. Cell 2006, 125, 1179
20. Leyva, M. J.; Degiacomo, F.; Kaltenbach, L. S.; Holcomb, J.; Zhang, N.; Gafni, J.; Park, H.; Lo, D. C.; Salvesen, G. S.; Ellerby, L. M.; Ellman, J. A. Chem. Biol. 2010, 17, 1189
21. D'Amelio, M.; Sheng, M.; Cecconi, F. Trends Neurosci. 2012, 35, 700
22. Communal, C.; Sumandea, M.; de Tombe, P.; Narula, J.; Solaro, R. J.; Hajjar, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 6252
23. Cai, L.; Li, W.; Wang, G.; Guo, L.; Jiang, Y.; Kang, Y. J. Diabetes 2002, 51, 1938
24. Moretti, A.; Weig, H. -J.; Ott, T.; Seyfarth, M.; Holthoff, H. -P.; Grewe, D.; Gillitzer, A.; Bott-Flügel, L.; Schömig, A.; Ungerer, M.; Laugwitz, K. -L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 11860
25. Hotchkiss, R. S.; Chang, K. C.; Swanson, P. E.; Tinsley, K. W.; Hui, J. J.; Klender, P.; Xanthoudakis, S.; Roy, S.; Black, C.; Grimm, E.; Aspiotis, R.; Han, Y.; Nicholson, D. W.; Karl, I. E. Nat. Immunol. 2000, 1, 496
26. Hotchkiss, R. S.; Nicholson, D. W. Nat. Rev. Immunol. 2006, 6, 813
27. Putt, K. S.; Chen, G. W.; Pearson, J. M.; Sandhorst, J. S.; Hoagland, M. S.; Kwon, J. -T.; Jin, H.; Churchwell, M. I.; Cho, M. -H.; Doerge, D. R.; Helferich, W. G.; Hergenrother, P. J. Nat. Chem. Biol. 2006, 2, 543
28. Wolan, D. W.; Zorn, J. A.; Gray, D. C.; Wells, J. A. Science 2009, 326, 853
29. Walsh, J. G.; Cullen, S. P.; Sheridan, C.; Lüthi, A. U.; Gerner, C.; Martin, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 12815
30. Shimbo, K.; Hsu, G. W.; Nguyen, H.; Mahrus, S.; Trinidad, J. C.; Burlingame, A. L.; Wells, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 12432
31. Burguillos, M. A.; Deierborg, T.; Kavanagh, E.; Persson, A.; Hajji, N.; Garcia-Quintanilla, A.; Cano, J.; Brundin, P.; Englund, E.; Venero, J. L.; Joseph, B. Nature 2011, 472, 319
32. Al-Jamala, K. T.; Gherardini, L.; Bardi, G.; Nunes, A.; Guo, C.; Bussy, C.; Herrero, M. A.; Bianco, A.; Prato, M.; Kostarelos, K.; Pizzorusso, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 10952
33. Porter, A. G.; Jänicke, R. U. Cell Death Differ. 1999, 6, 99
34. Gray, D. C.; Mahrus, S.; Wells, J. A. Cell 2010, 142, 637
35. Xiao, J.; Broz, P.; Puri, A. W.; Deu, E.; Morell, M.; Monack, D. M.; Bogyo, M. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 9130
36. Edgington, L. E.; van Raam, B. J.; Verdoes, M.; Wierschem, C.; Salvesen, G. S.; Bogyo, M. Chem. Biol. 2012, 19, 340
37. Paulick, M. G.; Bogyo, M. Curr. Opin. Genet. Dev. 2008, 18, 97
38. Nomura, D. K.; Dix, M. M.; Cravatt, B. F. Nat. Rev. Cancer 2010, 10, 630
39. Serim, S.; Haedke, U.; Verhelst, S. H. L. ChemMedChem 2012, 7, 1146
40. Kato, D.; Boatright, K. M.; Berger, A. B.; Nazif, T.; Blum, G.; Ryan, C.; Chehade, K. A.; Salvesen, G. S.; Bogyo, M. Nat. Chem. Biol. 2005, 1, 33
41. Edgington, L. E.; Verdoes, M.; Ortega, A.; Withana, N. P.; Lee, J.; Syed, S.; Bachmann, M. H.; Blum, G.; Bogyo, M. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 174
42. Blum, G.; von Degenfeld, G.; Merchant, M. J.; Blau, H. M.; Bogyo, M. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 668
43. Berger, A. B.; Sexton, K. B.; Bogyo, M. Cell Res. 2006, 16, 961
44. Thornberry, N. A.; Rano, T. A.; Peterson, E. P.; Rasper, D. M.; Timkey, T.; Garcia-Calvo, M.; Houtzager, V. M.; Nordstrom, P. A.; Roy, S.; Vaillancourt, J. P.; Chapman, K. T.; Nicholson, D. W. J. Biol. Chem. 1997, 272, 17907
45. Denault, J. B.; Salvesen, G. S. Curr. Protoc. Protein Sci. 2003, Chapter 21:Unit 21.13.
46. Vickers, C. J.; González-Páez, G. E.; Wolan, D. W. ACS Chem. Biol. 2013, 8, 1558
47. Pop, C.; Chen, Y. R.; Smith, B.; Bose, K.; Bobay, B.; Tripathy, A.; Franzen, S.; Clark, A. C. Biochemistry 2001, 40, 14224
48. Svingen, P. A.; Loegering, D.; Rodriquez, J.; Meng, X. W.; Mesner, P. W.; Holbeck, S.; Monks, A.; Krajewski, S.; Scudiero, D. A.; Sausville, E. A.; Reed, J. C.; Lazebnik, Y. A.; Kaufmann, S. H. Clin. Cancer Res. 2004, 10, 6807
49. Jänicke, R. U.; Sprengart, M. L.; Wati, M. R.; Porter, A. G. J. Biol. Chem. 1998, 273, 9357
50. Blanc, C.; Deveraux, Q. L.; Krajewski, S.; Jänicke, R. U.; Porter, A. G.; Reed, J. C.; Jaggi, R.; Marti, A. Cancer Res. 2000, 60, 4386
51. Voss, O. H.; Batra, S.; Kolattukudy, S. J.; Gonzalez-Mejia, M. E.; Smith, J. B.; Doseff, A. L. J. Biol. Chem. 2007, 282, 25088
52. Baliga, B. C.; Colussi, P. A.; Read, S. H.; Dias, M. M.; Jans, D. A.; Kumar, S. J. Biol. Chem. 2003, 278, 4899
53. Erener, S.; Pétrilli, V.; Kassner, I.; Minotti, R.; Castillo, R.; Santoro, R.; Hassa, P. O.; Tschopp, J.; Hottiger, M. O. Mol. Cell 2012, 46, 200
54. Kamada, S.; Kikkawa, U.; Tsujimoto, Y.; Hunter, T. J. Biol. Chem. 2005, 280, 857
55. Crawford, E. D.; Wells, J. A. Annu. Rev. Biochem. 2011, 80, 1055
56. Scott, C. W.; Sobotka-Briner, C.; Wilkins, D. E.; Jacobs, R. T.; Folmer, J. J.; Frazee, W. J.; Bhat, R. V.; Ghanekar, S. V.; Aharony, D. J. Pharmacol. Exp. Ther. 2003, 304, 433
57. Chauvier, D.; Ankri, S.; Charriaut-Marlangue, C.; Casimir, R.; Jacotot, E. Cell Death Differ. 2007, 14, 387