Interaction of collagen with chlorosulphonated paraffin tanning agents: Fourier transform infrared spectroscopic analysis and molecular dynamics simulations

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 15, Issue 35, 2013, Pages 14736-14747

  Monti, Susanna ^a   Bramanti, Emilia ^a   Porta, Valentina Della ^a   Onor, Massimo ^a   D'Ulivo, Alessandro ^a   Barone, Vincenzo ^b  

^a CNR   (Italy)

^b SCUOLA NORMALE SUPERIORE   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COLLAGEN; CROSS LINKING REAGENT; DRUG DERIVATIVE; PARAFFIN; SULFONE;

ANIMAL; ARTICLE; CATTLE; CHEMISTRY; HALOGENATION; INFRARED SPECTROSCOPY; LEATHER INDUSTRY; METHODOLOGY; MOLECULAR DYNAMICS; PROTEIN CONFORMATION;

ANIMALS; CATTLE; COLLAGEN; CROSS-LINKING REAGENTS; HALOGENATION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PARAFFIN; PROTEIN CONFORMATION; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED; SULFONES; TANNING;

EID: 84882338954     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3cp52404c     Document Type: Article

References (99)

1. E. M. Brown Int. J. Biol. Macromol. 2013 53 20 25
2. A. Bracalello V. Santopietro M. Vassalli G. Marletta R. D. Gaudio B. Bochicchio A. Pepe Biomacromolecules 2011 12 2957 2965
3. A. P. Duarte J. F. Coelho J. C. Bordado M. T. Cidade M. H. Gil Prog. Polym. Sci. 2012 37 1031 1050
4. E. M. Brown R. J. Latona M. M. Taylor J. Am. Leather Chem. Assoc. 2013 108 23 29
5. E. M. Brown R. J. Latona M. M. Taylor R. A. Garcia J. Am. Leather Chem. Assoc. 2012 107 1 7
6. E. M. Brown D. C. Shelly J. Am. Leather Chem. Assoc. 2011 106 145 152
7. E. M. Brown R. J. Latona M. M. Taylor J. Am. Leather Chem. Assoc. 2010 105 116 120
8. E. M. Brown J. Am. Leather Chem. Assoc. 2009 104 275 285
9. K. Ding M. M. Taylor E. M. Brown J. Am. Leather Chem. Assoc. 2008 103 377 382
10. E. M. Brown P. X. Qi J. Am. Leather Chem. Assoc. 2008 103 290 297
11. K. Ding M. M. Taylor E. M. Brown J. Am. Leather Chem. Assoc. 2007 102 164 170
12. P. X. Qi E. M. Brown J. Am. Leather Chem. Assoc. 2002 97 235 242
13. B. Brodsky G. Thiagarajan B. Madhan K. Kar Biopolymers 2008 89 345 353
14. I. G. Mogilner G. Ruderman J. R. Grigera J. Mol. Graphics Modell. 2002 21 209 213
15. K. Terao K. Mizuno M. Murashima Y. Kita C. Hongo K. Okuyama T. Norisuye H. P. Bachinger Macromolecules 2008 41 7203 7210
16. A. D. Simone L. Vitagliano R. Berisio Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008 372 121 125
17. S. Sweeney J. P. Orgel A. Fertala J. D. McAuliffe K. R. Turner G. A. D. Lullo S. Chen O. Antipova S. Perumal L. Ala-Kokko A. Forlino W. A. Cabral A. M. Barnes J. C. Marini J. D. S. Antonio J. Biol. Chem. 2008 372 121 125
18. M. J. Buehler Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 12285 12290
19. W. Friedrichs B. Ohler W. Langel S. Monti S. Koeppen Adv. Eng. Mater. 2011 13 B334 B342
20. S. Monti J. Phys. Chem. C 2007 111 6086 6094
21. S. Koeppen W. Langel Langmuir 2010 26 15248 15256
22. R. Gopalakrishnan V. Subramanian J. Biomed. Nanotechnol. 2011 7 186 187
23. R. Gopalakrishnan K. Balamurugan E. R. A. Singam S. Sundaramana V. Subramanian Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 13046 13057
24. V. Punitha S. S. Raman R. Parthasarathi V. Subramanian J. R. Rao B. U. Nair T. Ramasami J. Phys. Chem. B 2009 113 8983 8992
25. A. Gautieri S. Vesentini A. Redaelli M. J. Buehler Matrix Biol. 2012 31 141 149
26. S. W. Chang S. J. Shefelbine M. J. Buehler Biophys. J. 2012 102 640 648
27. S. G. M. Uzel M. J. Buehler J. Mech. Behav. Biomed. Mater. 2011 4 153 161
28. A. Gautieri S. Vesentini A. Redaelli M. J. Buehler Nano Lett. 2011 11 757 766
29. A. Gautieri A. Russo S. Vesentini A. Redaelli M. J. Buehler J. Chem. Theory Comput. 2010 6 1210 1218
30. J. W. Smith Nature 1968 219 157 158
31. J. P. Orgel T. C. Irving A. Miller T. J. Wess Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 9001 9005
32. H. W. Sung D. M. Huang W. H. Chang R. N. Huang J. C. Hsu J. Biomed. Mater. Res. 1999 46 520 530
33. I. Kolodziejska B. Piotrowska Food Chem. 2007 103 295 300
34. J. A. Gerrard Trends Food Sci. Technol. 2002 13 389 397
35. A. Bigi G. Cojazzi S. Panzavolta K. Rubini N. Roveri Biomaterials 2001 22 763 768
36. J. A. Gerrard P. K. Brown S. E. Faye Food Chem. 2002 79 343 349
37. J. A. Gerrard P. K. Brown S. E. Faye Food Chem. 2003 80 35 43
38. J. F. Martucci R. A. Ruseckaite A. Vazquez Mater. Sci. Eng., A 2006 435-436 681 686
39. D. Olde P. J. Dijkstra M. J. A. van Luyn P. B. van Wachem P. Nieuwenhuis J. Feijen J. Mater. Sci.: Mater. Med. 1995 6 460 472
40. T. H. Ji Methods Enzymol. 1983 91 580 609
41. J. Blass B. Bizzini M. C. R. Raynaud C. R. Hebd. Seances Acad. Sci. 1965 261 1448 1449
42. E. Khor Biomaterials 1997 18 95 105
43. G. Matheis J. R. Whitaker J. Food Biochem. 1984 8 137 162
44. T. N. Asquith L. G. Butler Phytochemistry 1986 25 1591 1593
45. J. Wu S. C. Chiu E. M. Pearce T. K. Kwei J. Polym. Sci., Part A: Polym. Chem. 2001 39 224 231
46. S. Chatterjee R. Chowdhury P. Bhattacharya Biochem. Eng. J. 2000 5 77 82
47. H. M. Rawel J. Kroll U. C. Hohl Nahrung 2001 2 72 81
48. G. Strauss S. M. Gibson Food Hydrocolloids 2004 18 81 89
49. F. Xing G. Cheng K. Yi L. Ma J. Appl. Polym. Sci. 2005 96 2225 2229
50. N. Cao Y. Fu J. He Food Hydrocolloids 2007 21 575 584
51. A. J. Charlton N. J. Baxter M. L. Khan A. J. G. Moir E. Haslam A. P. Davies M. P. Williamson J. Agric. Food Chem. 2002 50 1593 1601
52. C. Kalyanaraman S. B. K. Kanchinadham L. V. Devi S. Porselvam J. R. Rao Ind. Eng. Chem. Res. 2012 51 16171 16181
53. G. T. Tomy G. A. Stern W. L. Lockhart D. C. G. Muir Environ. Sci. Technol. 1999 33 2858 2863
54. A. E. Marlowe A. Singh Y. G. Yingling Mater. Sci. Eng., C 2012 32 2583 2588
55. A. V. Persikov J. A. M. Ramshaw A. Kirkpatrick B. Brodsky Biochemistry 2000 39 14960 14967
56. R. J. Radmer T. E. Klein Biochemistry 2004 43 5314 5323
57. A. Gautieri S. Uzel S. Vesentini A. Redaelli M. J. Buehler Biophys. J. 2009 97 857 865
58. S. S. Raman R. Gopalakrishnan R. C. Wade V. Subramanian J. Phys. Chem. B 2011 115 2593 2607
59. E. R. A. Singam K. Balamurugan R. Gopalakrishnan S. R. Subramanian V. Subramanian T. Ramasami Biopolymers 2012 97 847 863
60. H. K. Ravi F. Simona J. Hulliger M. Cascella J. Phys. Chem. B 2012 116 1901 1907
61. N. Almora-Barrios N. D. Leeuw Cryst. Growth Des. 2012 12 756 763
62. Z. Qin A. Gautieri A. K. Nair H. Inbar M. J. Buehler Langmuir 2012 28 1982 1992
63. E. M. Brown R. L. Dudley J. Am. Leather Chem. Assoc. 2005 100 401 409
64. G. King E. M. Brown J. M. Chen Protein Eng. 1996 9 43 49
65. E. M. Brown R. L. Dudley A. R. Elsetinow J. Am. Leather Chem. Assoc. 1997 62 225 233
66. P. X. Qi E. M. Brown J. Am. Leather Chem. Assoc. 2002 97 235 342
67. S. Bronco C. Cappelli S. Monti J. Phys. Chem. B 2004 108 10101 10112
68. S. Monti S. Bronco C. Cappelli J. Phys. Chem. B 2005 109 11389 11398
69. C. Cappelli S. Bronco S. Monti Chirality 2005 17 577 589
70. E. Bramanti M. Bramanti P. Stiavetti E. Benedetti J. Chemom. 1994 8 409 421
71. E. Bramanti E. Benedetti Biopolymers 1996 38 639 653
72. D. Ami A. Natalello G. Taylor G. Tonon S. M. Doglia Biochim. Biophys. Acta 2006 1764 793 799
73. M. J. Li H. S. Hsu R. C. Liang S. Y. Lin Ultrastruct. Pathol. 2002 26 365 370
74. A. Sgarbossa S. Monti F. Lenci E. Bramanti R. Bizzarri V. Barone Biochim. Biophys. Acta 2013 1830 2924 2937
75. E. Bramanti F. Lenci A. Sgarbossa Eur. Biophys. J. 2010 39 1493 1501
76. E. Bramanti C. Ferrari V. Angeli M. Onor R. E. Synovec Talanta 2011 85 2553 2561
77. I. A. Vakser Biopolymers 1996 39 455 464
78. I. A. Vakser O. G. Matar C. F. Lam Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 8477 8482
79. A. Tovchigrechko C. A. Wells I. A. Vakser Protein Sci. 2002 11 1888 1896
80. P. Cieplak W. D. Cornell C. I. Bayly P. A. Kollman J. Comput. Chem. 1995 16 1357 1377
81. C. I. Bayly P. Cieplak W. D. Cornell P. A. Kollman J. Phys. Chem. 1993 97 10269 10280
82. M. J. Frisch, et al., Gaussian 03 (Revision B.01), Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003
83. D. A. Case, et al., AMBER 11, University of California, San Francisco, CA, 2010
84. V. Hornak R. Abel A. Okur B. Strockbine A. Roitberg C. Simmerling Proteins 2006 65 712 725
85. K. Lindorff-Larsen S. Piana K. Palmo P. Maragakis J. L. Klepeis R. O. Dror D. E. Shaw Proteins 2010 78 1950 1958
86. J. Wang R. M. Wolf J. W. Caldwell P. A. Kollman D. A. Case J. Comput. Chem. 2004 25 1157 1174
87. C. Petibois G. Gouspillou K. Wehbe J.-P. Delage G. Déléris Anal. Bioanal. Chem. 2006 386 1961 1966
88. Q. Wang W. Sanad L. M. Miller A. Voigt K. Klingel R. Kandolf K. Stangl G. Baumann Vib. Spectrosc. 2005 38 217 222
89. D. L. Wetzel G. R. Post R. A. Loddler Vib. Spectrosc. 2005 38 53 59
90. C. Petibois G. Déléris Trends Biotechnol. 2006 24 455 462
91. H. Fabian D. Naumann Methods 2004 34 28 40
92. E. Goormaghtigh J. M. Ruysschaert V. Raussens Biophys. J. 2006 90 2946 2957
93. W. Y. Sun J. L. Fang M. Cheng P. Y. Xia W. X. Tang Biopolymers 1997 42 297 303
94. Y. Hu W. Li J. Hu Spectrochim. Acta, Part A 2005 62 16 21
95. Y. N. Chirgadze N. A. Nevskaya Biopolymers 1976 15 607 625
96. S. Krimm J. Bandekar Adv. Protein Chem. 1986 38 181 364
97. W. Kabsch C. Sander Biopolymers 1983 22 2577 2637
98. S. Salinal S. Cui H. Cochran P. Cummings Langmuir 2001 17 1773
99. C. Duce S. Monti R. Solaro M. R. Tiné J. Phys. Chem. B 2007 111 1165 1175