Simulation of adhesion forces and energies of peptides on titanium dioxide surfaces

Langmuir

Volumn 26, Issue 19, 2010, Pages 15248-15256

  Köppen, Susan ^a,b   Langel, Walter ^a  

^a UNIVERSITY OF GREIFSWALD   (Germany)

^b UNIVERSITY OF BREMEN   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADHESION; BIOINFORMATICS; COLLAGEN; MOLECULAR DYNAMICS; OXIDE MINERALS; PEPTIDES; TITANIUM DIOXIDE;

AB INITIO MOLECULAR DYNAMICS; ADHESION FORCES; FORCE-DISTANCE CURVES; GLUTAMATE SIDE CHAIN; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PEPTIDE SEQUENCES; SURFACE HYDROXYL GROUPS; TITANIUM DIOXIDE SURFACES;

HYDROXYPROLINE;

PEPTIDE; TITANIUM; TITANIUM DIOXIDE;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CHEMISTRY; SURFACE PROPERTY;

MICROSCOPY, ATOMIC FORCE; PEPTIDES; SURFACE PROPERTIES; TITANIUM;

EID: 79952113660     PISSN: 07437463     EISSN: 15205827     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/la101687m     Document Type: Article

References (38)

1. Morra, M. Eur. Cells Mater. 2006, 13, 1-16.
2. Diebold, U. Surf. Sci. Rep. 2003, 48, 53-239.
3. Köppen, S.; Langel, W. Surf. Sci. 2006, 600, 2150-2160.
4. Teng, S.; Lee, E.; Park, C.; Choi, W.; Shin, D.; Kim, H. J. Mater. Sci.: Mater. Med. 2008, 20, 2553-2561.
5. Schliephake, H.; Aref, A.; Scharnweber, D.; Bierbaum, S.; Sewing, A. Clin. Oral Implant Res. 2009, 21, 31-37.
6. Köppen, S.; Ohler, B.; Langel, W. Z. Phys. Chem. 2007, 231, 3-21.
7. Oren, E. E.; Tamerler, C.; Shahin, D.; Hnilova, M.; Seker, U. O. S.; Sarikaya, M.; Samudrala, R. Bioinformatics 2007, 24, 2817-2823.
8. Shoulders, M. D.; Raines, R. T. Annu. Rev. Biochem. 2009, 78, 929-958.
9. Park, S.; Radmer, R. J.; Klein, T. E.; Pande, V. S. J. Comput. Chem. 2005, 25, 1713-1717.
10. Butt, H. J.; Berger, R.; Bonaccurso, E.; Chen, Y.; Wang, J. Adv. Colloid Interface Sci. 2007, 143, 91-104.
11. Friedsam, C.; Gaub, H. E.; Netz, R. R. Biointerphases 2006, 1, 1-22.
12. Horinek, D.; Serr, A.; Geisler, M.; Pirzer, T.; Slotta, U.; Lud, S. Q.; Garrido, J. A.; Scheibel, T.; Hugel, T.; Netz, R. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 2842-2847.
13. Serr, A.; Horinek, D.; Netz, R. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 12408-12413.
14. Schwender, N.; Huber, K.; Al Marrawi, F.; Hannig, M.; Ziegler, Ch. Appl. Surf. Sci. 2002, 252, 12.
15. Jähnchen, G.; Mertig, M.; Pompe, W. Surf. Interface Anal. 1999, 27, 444-449.
16. Lee, H.; Scherer, N. F.; Messersmith, P. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 13999-14003.
17. Heymann, B.; Grubmüller, H. Chem. Phys. Lett. 1999, 305, 213-219.
18. Heymann, B.; Grubmüller, H. Chem. Phys. Lett. 1999, 303, 1-9.
19. Heymann, B.; Grubmüller, H. Phys. Rev. Lett. 2000, 84, 6135-6139.
20. Krammer, A.; Lu, H.; Schulten, K.; Vogel, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 1451-1456.
21. Lu, H.; Isralewitz, B.; Krammer, A.; Vogel, V.; Schulten, K. Biophys. J. 1998, 75, 662-671.
22. Köppen, S.; Langel, W. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 1907-1915.
23. Köppen, S.; Bronkalla, O.; Langel, W. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 13600-13606.
24. Langel, W.; Menken, L. Surf. Sci. 2003, 538, 1-9.
25. Swamy, V.; Gale, J. D. Phys. Rev. B 2000, 62, 5406-5413.
26. Ohler, B.; Langel, W. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 10189-10197.
27. Cox, S. R.; Williams, D. E. J. Comput. Chem. 1981, 2, 304-323.
28. Chandra Singh, U.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1984, 5, 129-145.
29. Woods, R. J.; Khalia, M.; Pell, W.; Moffat, S. H.; Smith, V. H. J. Comput. Chem. 1989, 3, 297-310.
30. De Vita, A. D.; Canning, A.; Galli, G.; Gygi, F.; Mauri, F.; Car, R. EPFL Supercomput. Rev. 1994, 6, 22.
31. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471-2474.
32. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244-13249.
33. Blöchl, P. E. Phys. Rev. B 1994, 50, 17953-17979.
34. Schneider, J.; Ciacchi, L. C. Surf. Sci. 2010, 604, 1105-1115.
35. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollmann, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 128, 5189-5207.
36. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, J. A., Jr.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, N. J.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, Ö.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian09, revision G98; Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2009.
37. Klein, T. E.; Huang, C. C. Biopolymers 1999, 49, 177-193.
38. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. VMD -Visual Molecular Dynamics. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33-38.