-
5
-
-
84870810902
-
-
Winter, A.; Higueruelo, A. P.; Marsh, M.; Sigurdardottir, A.; Pitt, W. R.; Blundell, T. L. Q. Rev. Biophys. 2012, 45, 383
-
(2012)
Q. Rev. Biophys.
, vol.45
, pp. 383
-
-
Winter, A.1
Higueruelo, A.P.2
Marsh, M.3
Sigurdardottir, A.4
Pitt, W.R.5
Blundell, T.L.6
-
15
-
-
34548779127
-
-
Moreira, I. S.; Fernandes, P. A.; Ramos, M. J. Proteins 2007, 68, 803
-
(2007)
Proteins
, vol.68
, pp. 803
-
-
Moreira, I.S.1
Fernandes, P.A.2
Ramos, M.J.3
-
17
-
-
80051966197
-
-
Kozakov, D.; Hall, D. R.; Chuang, G. Y.; Cencic, R.; Brenke, R.; Grove, L. E.; Beglov, D.; Pelletier, J.; Whitty, A.; Vajda, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 13528
-
(2011)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.108
, pp. 13528
-
-
Kozakov, D.1
Hall, D.R.2
Chuang, G.Y.3
Cencic, R.4
Brenke, R.5
Grove, L.E.6
Beglov, D.7
Pelletier, J.8
Whitty, A.9
Vajda, S.10
-
19
-
-
0032540358
-
-
Clackson, T.; Ultsch, M. H.; Wells, J. A.; de Vos, A. M. J. Mol. Biol. 1998, 277, 1111
-
(1998)
J. Mol. Biol.
, vol.277
, pp. 1111
-
-
Clackson, T.1
Ultsch, M.H.2
Wells, J.A.3
De Vos, A.M.4
-
20
-
-
7944225979
-
-
Li, X.; Keskin, O.; Ma, B.; Nussinov, R.; Liang, J. J. Mol. Biol. 2004, 344, 781
-
(2004)
J. Mol. Biol.
, vol.344
, pp. 781
-
-
Li, X.1
Keskin, O.2
Ma, B.3
Nussinov, R.4
Liang, J.5
-
21
-
-
11844249426
-
-
Keskin, O.; Ma, B.; Nussinov, R. J. Mol. Biol. 2005, 345, 1281
-
(2005)
J. Mol. Biol.
, vol.345
, pp. 1281
-
-
Keskin, O.1
Ma, B.2
Nussinov, R.3
-
22
-
-
34548764386
-
-
Darnell, S. J.; Page, D.; Mitchell, J. C. Proteins 2007, 68, 813
-
(2007)
Proteins
, vol.68
, pp. 813
-
-
Darnell, S.J.1
Page, D.2
Mitchell, J.C.3
-
23
-
-
65549157572
-
-
Tuncbag, N.; Kar, G.; Keskin, O.; Gursoy, A.; Nussinov, R. Briefings Bioinf. 2009, 10, 217
-
(2009)
Briefings Bioinf.
, vol.10
, pp. 217
-
-
Tuncbag, N.1
Kar, G.2
Keskin, O.3
Gursoy, A.4
Nussinov, R.5
-
24
-
-
77950651626
-
-
Xia, J. F.; Zhao, X. M.; Song, J.; Huang, D. S. BMC Bioinf. 2010, 11, 174
-
(2010)
BMC Bioinf.
, vol.11
, pp. 174
-
-
Xia, J.F.1
Zhao, X.M.2
Song, J.3
Huang, D.S.4
-
26
-
-
17144373303
-
-
Hajduk, P. J.; Huth, J. R.; Fesik, S. W. J. Med. Chem. 2005, 48, 2518
-
(2005)
J. Med. Chem.
, vol.48
, pp. 2518
-
-
Hajduk, P.J.1
Huth, J.R.2
Fesik, S.W.3
-
29
-
-
33645067372
-
-
Mattos, C.; Bellamacina, C. R.; Peisach, E.; Pereira, A.; Vitkup, D.; Petsko, G. A.; Ringe, D. J. Mol. Biol. 2006, 357, 1471
-
(2006)
J. Mol. Biol.
, vol.357
, pp. 1471
-
-
Mattos, C.1
Bellamacina, C.R.2
Peisach, E.3
Pereira, A.4
Vitkup, D.5
Petsko, G.A.6
Ringe, D.7
-
30
-
-
77957889281
-
-
de Kloe, G. E.; Retra, K.; Geitmann, M.; Kallblad, P.; Nahar, T.; van Elk, R.; Smit, A. B.; van Muijlwijk-Koezen, J. E.; Leurs, R.; Irth, H.; Danielson, U. H.; de Esch, I. J. J. Med. Chem. 2010, 53, 7192
-
(2010)
J. Med. Chem.
, vol.53
, pp. 7192
-
-
De Kloe, G.E.1
Retra, K.2
Geitmann, M.3
Kallblad, P.4
Nahar, T.5
Van Elk, R.6
Smit, A.B.7
Van Muijlwijk-Koezen, J.E.8
Leurs, R.9
Irth, H.10
Danielson, U.H.11
De Esch, I.J.12
-
33
-
-
84862869077
-
-
Scott, D. E.; Coyne, A. G.; Hudson, S. A.; Abell, C. Biochemistry 2012, 51, 4990
-
(2012)
Biochemistry
, vol.51
, pp. 4990
-
-
Scott, D.E.1
Coyne, A.G.2
Hudson, S.A.3
Abell, C.4
-
34
-
-
61449104961
-
-
Brenke, R.; Kozakov, D.; Chuang, G. Y.; Beglov, D.; Hall, D.; Landon, M. R.; Mattos, C.; Vajda, S. Bioinformatics 2009, 25, 621
-
(2009)
Bioinformatics
, vol.25
, pp. 621
-
-
Brenke, R.1
Kozakov, D.2
Chuang, G.Y.3
Beglov, D.4
Hall, D.5
Landon, M.R.6
Mattos, C.7
Vajda, S.8
-
35
-
-
0037007068
-
-
Dennis, S.; Kortvelyesi, T.; Vajda, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 4290
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.99
, pp. 4290
-
-
Dennis, S.1
Kortvelyesi, T.2
Vajda, S.3
-
36
-
-
33947658802
-
-
Landon, M. R.; Lancia, D. R., Jr.; Yu, J.; Thiel, S. C.; Vajda, S. J. Med. Chem. 2007, 50, 1231
-
(2007)
J. Med. Chem.
, vol.50
, pp. 1231
-
-
Landon, M.R.1
Lancia Jr., D.R.2
Yu, J.3
Thiel, S.C.4
Vajda, S.5
-
37
-
-
84865494461
-
-
Zerbe, B. S.; Hall, D. R.; Vajda, S.; Whitty, A.; Kozakov, D. J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 2236
-
(2012)
J. Chem. Inf. Model.
, vol.52
, pp. 2236
-
-
Zerbe, B.S.1
Hall, D.R.2
Vajda, S.3
Whitty, A.4
Kozakov, D.5
-
43
-
-
21244496344
-
-
Dolcet, X.; Llobet, D.; Pallares, J.; Matias-Guiu, X. Virchows Arch. 2005, 446, 475
-
(2005)
Virchows Arch.
, vol.446
, pp. 475
-
-
Dolcet, X.1
Llobet, D.2
Pallares, J.3
Matias-Guiu, X.4
-
44
-
-
14644413996
-
-
Feinman, R.; Siegel, D. S.; Berenson, J. Clin. Adv. Hematol. Oncol. 2004, 2, 162
-
(2004)
Clin. Adv. Hematol. Oncol.
, vol.2
, pp. 162
-
-
Feinman, R.1
Siegel, D.S.2
Berenson, J.3
-
45
-
-
40949123149
-
-
Salminen, A.; Huuskonen, J.; Ojala, J.; Kauppinen, A.; Kaarniranta, K.; Suuronen, T. Ageing Res. Rev. 2008, 7, 83
-
(2008)
Ageing Res. Rev.
, vol.7
, pp. 83
-
-
Salminen, A.1
Huuskonen, J.2
Ojala, J.3
Kauppinen, A.4
Kaarniranta, K.5
Suuronen, T.6
-
46
-
-
78650871053
-
-
Ivanenkov, Y. A.; Balakin, K. V.; Lavrovsky, Y. Mini Rev. Med. Chem. 2011, 11, 55
-
(2011)
Mini Rev. Med. Chem.
, vol.11
, pp. 55
-
-
Ivanenkov, Y.A.1
Balakin, K.V.2
Lavrovsky, Y.3
-
47
-
-
0034284715
-
-
May, M. J.; D'Acquisto, F.; Madge, L. A.; Glockner, J.; Pober, J. S.; Ghosh, S. Science 2000, 289, 1550
-
(2000)
Science
, vol.289
, pp. 1550
-
-
May, M.J.1
D'Acquisto, F.2
Madge, L.A.3
Glockner, J.4
Pober, J.S.5
Ghosh, S.6
-
48
-
-
0037195419
-
-
May, M. J.; Marienfeld, R. B.; Ghosh, S. J. Biol. Chem. 2002, 277, 45992
-
(2002)
J. Biol. Chem.
, vol.277
, pp. 45992
-
-
May, M.J.1
Marienfeld, R.B.2
Ghosh, S.3
-
49
-
-
77951581684
-
-
Baima, E. T.; Guzova, J. A.; Mathialagan, S.; Nagiec, E. E.; Hardy, M. M.; Song, L. R.; Bonar, S. L.; Weinberg, R. A.; Selness, S. R.; Woodard, S. S.; Chrencik, J.; Hood, W. F.; Schindler, J. F.; Kishore, N.; Mbalaviele, G. J. Biol. Chem. 2010, 285, 13498
-
(2010)
J. Biol. Chem.
, vol.285
, pp. 13498
-
-
Baima, E.T.1
Guzova, J.A.2
Mathialagan, S.3
Nagiec, E.E.4
Hardy, M.M.5
Song, L.R.6
Bonar, S.L.7
Weinberg, R.A.8
Selness, S.R.9
Woodard, S.S.10
Chrencik, J.11
Hood, W.F.12
Schindler, J.F.13
Kishore, N.14
Mbalaviele, G.15
-
50
-
-
38849117068
-
-
Dave, S. H.; Tilstra, J. S.; Matsuoka, K.; Li, F.; Karrasch, T.; Uno, J. K.; Sepulveda, A. R.; Jobin, C.; Baldwin, A. S.; Robbins, P. D.; Plevy, S. E. J. Immunol. 2007, 179, 7852
-
(2007)
J. Immunol.
, vol.179
, pp. 7852
-
-
Dave, S.H.1
Tilstra, J.S.2
Matsuoka, K.3
Li, F.4
Karrasch, T.5
Uno, J.K.6
Sepulveda, A.R.7
Jobin, C.8
Baldwin, A.S.9
Robbins, P.D.10
Plevy, S.E.11
-
51
-
-
79960394765
-
-
Gaurnier-Hausser, A.; Patel, R.; Baldwin, A. S.; May, M. J.; Mason, N. J. Clin. Cancer Res. 2011, 17, 4661
-
(2011)
Clin. Cancer Res.
, vol.17
, pp. 4661
-
-
Gaurnier-Hausser, A.1
Patel, R.2
Baldwin, A.S.3
May, M.J.4
Mason, N.J.5
-
52
-
-
42949159409
-
-
Rushe, M.; Silvian, L.; Bixler, S.; Chen, L. L.; Cheung, A.; Bowes, S.; Cuervo, H.; Berkowitz, S.; Zheng, T.; Guckian, K.; Pellegrini, M.; Lugovskoy, A. Structure 2008, 16, 798
-
(2008)
Structure
, vol.16
, pp. 798
-
-
Rushe, M.1
Silvian, L.2
Bixler, S.3
Chen, L.L.4
Cheung, A.5
Bowes, S.6
Cuervo, H.7
Berkowitz, S.8
Zheng, T.9
Guckian, K.10
Pellegrini, M.11
Lugovskoy, A.12
-
54
-
-
84876704394
-
-
Manuscript submitted.
-
Cote, S. M.; Golden, M. S.; Gilmore, T. D.; Glover, K.; Herscovitch, M.; Ennis, T.; Whitty, A. Manuscript submitted.
-
-
-
Cote, S.M.1
Golden, M.S.2
Gilmore, T.D.3
Glover, K.4
Herscovitch, M.5
Ennis, T.6
Whitty, A.7
-
57
-
-
11144265736
-
-
Roehrl, M. H. A.; Wang, J. Y.; Wagner, G. Biochemistry 2004, 43, 16056
-
(2004)
Biochemistry
, vol.43
, pp. 16056
-
-
Roehrl, M.H.A.1
Wang, J.Y.2
Wagner, G.3
-
59
-
-
84858044079
-
-
Hall, D. R.; Ngan, C. H.; Zerbe, B. S.; Kozakov, D.; Vajda, S. J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 199
-
(2012)
J. Chem. Inf. Model.
, vol.52
, pp. 199
-
-
Hall, D.R.1
Ngan, C.H.2
Zerbe, B.S.3
Kozakov, D.4
Vajda, S.5
-
60
-
-
77956187570
-
-
Kozakov, D.; Chuang, G. Y.; Beglov, D.; Vajda, S. Trends Biochem. Sci. 2010, 35, 471
-
(2010)
Trends Biochem. Sci.
, vol.35
, pp. 471
-
-
Kozakov, D.1
Chuang, G.Y.2
Beglov, D.3
Vajda, S.4
-
61
-
-
84855712140
-
-
Beglov, D.; Hall, D. R.; Brenke, R.; Shapovalov, M. V.; Dunbrack, R. L., Jr.; Kozakov, D.; Vajda, S. Proteins 2012, 80, 591
-
(2012)
Proteins
, vol.80
, pp. 591
-
-
Beglov, D.1
Hall, D.R.2
Brenke, R.3
Shapovalov, M.V.4
Dunbrack Jr., R.L.5
Kozakov, D.6
Vajda, S.7
-
63
-
-
67650500988
-
-
Brooks, B. R.; Brooks, C. L., III; Mackerell, A. D., Jr.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1545
-
(2009)
J. Comput. Chem.
, vol.30
, pp. 1545
-
-
Brooks, B.R.1
Brooks III, C.L.2
Mackerell Jr., A.D.3
Nilsson, L.4
Petrella, R.J.5
Roux, B.6
Won, Y.7
Archontis, G.8
Bartels, C.9
Boresch, S.10
Caflisch, A.11
Caves, L.12
Cui, Q.13
Dinner, A.R.14
Feig, M.15
Fischer, S.16
Gao, J.17
Hodoscek, M.18
Im, W.19
Kuczera, K.20
Lazaridis, T.21
Ma, J.22
Ovchinnikov, V.23
Paci, E.24
Pastor, R.W.25
Post, C.B.26
Pu, J.Z.27
Schaefer, M.28
Tidor, B.29
Venable, R.M.30
Woodcock, H.L.31
Wu, X.32
Yang, W.33
York, D.M.34
Karplus, M.35
more..
-
64
-
-
72149100511
-
-
Chuang, G. Y.; Kozakov, D.; Brenke, R.; Beglov, D.; Guarnieri, F.; Vajda, S. Biophys. J. 2009, 97, 2846
-
(2009)
Biophys. J.
, vol.97
, pp. 2846
-
-
Chuang, G.Y.1
Kozakov, D.2
Brenke, R.3
Beglov, D.4
Guarnieri, F.5
Vajda, S.6
-
65
-
-
38549150173
-
-
Landon, M. R.; Amaro, R. E.; Baron, R.; Ngan, C. H.; Ozonoff, D.; McCammon, J. A.; Vajda, S. Chem. Biol. Drug. Des. 2008, 71, 106
-
(2008)
Chem. Biol. Drug. Des.
, vol.71
, pp. 106
-
-
Landon, M.R.1
Amaro, R.E.2
Baron, R.3
Ngan, C.H.4
Ozonoff, D.5
McCammon, J.A.6
Vajda, S.7
-
66
-
-
67650979223
-
-
Landon, M. R.; Lieberman, R. L.; Hoang, Q. Q.; Ju, S.; Caaveiro, J. M.; Orwig, S. D.; Kozakov, D.; Brenke, R.; Chuang, G. Y.; Beglov, D.; Vajda, S.; Petsko, G. A.; Ringe, D. J. Comput. Aided Mol. Des. 2009, 23, 491
-
(2009)
J. Comput. Aided Mol. Des.
, vol.23
, pp. 491
-
-
Landon, M.R.1
Lieberman, R.L.2
Hoang, Q.Q.3
Ju, S.4
Caaveiro, J.M.5
Orwig, S.D.6
Kozakov, D.7
Brenke, R.8
Chuang, G.Y.9
Beglov, D.10
Vajda, S.11
Petsko, G.A.12
Ringe, D.13
-
67
-
-
40549103434
-
-
Lo, Y. C.; Maddineni, U.; Chung, J. Y.; Rich, R. L.; Myszka, D. G.; Wu, H. Biochemistry 2008, 47, 3109
-
(2008)
Biochemistry
, vol.47
, pp. 3109
-
-
Lo, Y.C.1
Maddineni, U.2
Chung, J.Y.3
Rich, R.L.4
Myszka, D.G.5
Wu, H.6
-
71
-
-
77958048793
-
-
Petros, A. M.; Huth, J. R.; Oost, T.; Park, C. M.; Ding, H.; Wang, X.; Zhang, H.; Nimmer, P.; Mendoza, R.; Sun, C.; Mack, J.; Walter, K.; Dorwin, S.; Gramling, E.; Ladror, U.; Rosenberg, S. H.; Elmore, S. W.; Fesik, S. W.; Hajduk, P. J. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010, 20, 6587
-
(2010)
Bioorg. Med. Chem. Lett.
, vol.20
, pp. 6587
-
-
Petros, A.M.1
Huth, J.R.2
Oost, T.3
Park, C.M.4
Ding, H.5
Wang, X.6
Zhang, H.7
Nimmer, P.8
Mendoza, R.9
Sun, C.10
MacK, J.11
Walter, K.12
Dorwin, S.13
Gramling, E.14
Ladror, U.15
Rosenberg, S.H.16
Elmore, S.W.17
Fesik, S.W.18
Hajduk, P.J.19
-
73
-
-
33745029344
-
-
Strnad, J.; McDonnell, P. A.; Riexinger, D. J.; Mapelli, C.; Cheng, L.; Gray, H.; Ryseck, R. P.; Burke, J. R. J. Mol. Recognit. 2006, 19, 227
-
(2006)
J. Mol. Recognit.
, vol.19
, pp. 227
-
-
Strnad, J.1
McDonnell, P.A.2
Riexinger, D.J.3
Mapelli, C.4
Cheng, L.5
Gray, H.6
Ryseck, R.P.7
Burke, J.R.8
-
74
-
-
84875391572
-
-
Flicek, P.; Ahmed, I.; Amode, M. R.; Barrell, D.; Beal, K.; Brent, S.; Carvalho-Silva, D.; Clapham, P.; Coates, G.; Fairley, S.; Fitzgerald, S.; Gil, L.; Garcia-Giron, C.; Gordon, L.; Hourlier, T.; Hunt, S.; Juettemann, T.; Kahari, A. K.; Keenan, S.; Komorowska, M.; Kulesha, E.; Longden, I.; Maurel, T.; McLaren, W. M.; Muffato, M.; Nag, R.; Overduin, B.; Pignatelli, M.; Pritchard, B.; Pritchard, E.; Riat, H. S.; Ritchie, G. R.; Ruffier, M.; Schuster, M.; Sheppard, D.; Sobral, D.; Taylor, K.; Thormann, A.; Trevanion, S.; White, S.; Wilder, S. P.; Aken, B. L.; Birney, E.; Cunningham, F.; Dunham, I.; Harrow, J.; Herrero, J.; Hubbard, T. J.; Johnson, N.; Kinsella, R.; Parker, A.; Spudich, G.; Yates, A.; Zadissa, A.; Searle, S. M. Nucleic Acids Res. 2013, 41, D48
-
(2013)
Nucleic Acids Res.
, vol.41
, pp. 48
-
-
Flicek, P.1
Ahmed, I.2
Amode, M.R.3
Barrell, D.4
Beal, K.5
Brent, S.6
Carvalho-Silva, D.7
Clapham, P.8
Coates, G.9
Fairley, S.10
Fitzgerald, S.11
Gil, L.12
Garcia-Giron, C.13
Gordon, L.14
Hourlier, T.15
Hunt, S.16
Juettemann, T.17
Kahari, A.K.18
Keenan, S.19
Komorowska, M.20
Kulesha, E.21
Longden, I.22
Maurel, T.23
McLaren, W.M.24
Muffato, M.25
Nag, R.26
Overduin, B.27
Pignatelli, M.28
Pritchard, B.29
Pritchard, E.30
Riat, H.S.31
Ritchie, G.R.32
Ruffier, M.33
Schuster, M.34
Sheppard, D.35
Sobral, D.36
Taylor, K.37
Thormann, A.38
Trevanion, S.39
White, S.40
Wilder, S.P.41
Aken, B.L.42
Birney, E.43
Cunningham, F.44
Dunham, I.45
Harrow, J.46
Herrero, J.47
Hubbard, T.J.48
Johnson, N.49
Kinsella, R.50
Parker, A.51
Spudich, G.52
Yates, A.53
Zadissa, A.54
Searle, S.M.55
more..
-
75
-
-
79955481873
-
-
Xu, G.; Lo, Y. C.; Li, Q.; Napolitano, G.; Wu, X.; Jiang, X.; Dreano, M.; Karin, M.; Wu, H. Nature 2011, 472, 325
-
(2011)
Nature
, vol.472
, pp. 325
-
-
Xu, G.1
Lo, Y.C.2
Li, Q.3
Napolitano, G.4
Wu, X.5
Jiang, X.6
Dreano, M.7
Karin, M.8
Wu, H.9
|