Phosphoryl transfer by protein kinase A is captured in a crystal lattice

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 12, 2013, Pages 4788-4798

  Bastidas, Adam C ^a   Deal, Michael S ^b   Steichen, Jon M ^b   Guo, Yurong ^b   Wu, Jian ^b   Taylor, Susan S ^a,b  

^a San Diego   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

OCTAHEDRAL COORDINATION GEOMETRY; PHOSPHORYL TRANSFER; PHOSPHORYLATED SUBSTRATES; PROTEIN CRYSTAL; PROTEIN KINASE A; RATE-LIMITING STEPS; RESOLUTION DISPLAYS; SUBSTRATE PEPTIDES;

AMINO ACIDS; CRYSTAL LATTICES; METAL IONS; PEPTIDES; SUBSTRATES;

ENZYMES;

ADENOSINE TRIPHOSPHATE; CYCLIC AMP DEPENDENT PROTEIN KINASE; MAGNESIUM ION;

ARTICLE; BINDING AFFINITY; CATALYSIS; CRYSTAL STRUCTURE; GEOMETRY; PHOSPHORYLATION;

ADENYLYL IMIDODIPHOSPHATE; ANIMALS; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; CYCLIC AMP-DEPENDENT PROTEIN KINASES; MAGNESIUM; MICE; MODELS, MOLECULAR; PEPTIDES; PHOSPHORYLATION;

EID: 84875759348     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja312237q     Document Type: Article

References (54)

1. Manning, G.; Whyte, D. B.; Martinez, R.; Hunter, T.; Sudarsanam, S. Science 2002, 298, 1912
2. Taylor, S. S.; Kornev, A. P. PKA: Prototype for Dynamic Signaling in Time and Space. Quantitative Biology: From Molecular to Cellular Systems; Wall, M. E., Ed.; CRC Press: Boca Raton, London, New York, 2012; pp 267-298.
3. Tasken, K.; Skalhegg, B. S.; Tasken, K. A.; Solberg, R.; Knutsen, H. K.; Levy, F. O.; Sandberg, M.; Orstavik, S.; Larsen, T.; Johansen, A. K.; Vang, T.; Schrader, H. P.; Reinton, N. T.; Torgersen, K. M.; Hansson, V.; Jahnsen, T. Adv. Second Messenger Phosphoprotein Res. 1997, 31, 191
4. Johnson, D. A.; Akamine, P.; Radzio-Andzelm, E.; Madhusudan, M.; Taylor, S. S. Chem. Rev. 2001, 101, 2243
5. Kim, C.; Cheng, C. Y.; Saldanha, S. A.; Taylor, S. S. Cell 2007, 130, 1032
6. Knighton, D. R.; Zheng, J. H.; Ten Eyck, L. F.; Ashford, V. A.; Xuong, N. H.; Taylor, S. S.; Sowadski, J. M. Science 1991, 253, 407
7. Taylor, S. S.; Keshwani, M. M.; Steichen, J. M.; Kornev, A. P. Philos. Trans. R. Soc. London: Ser. B 2012, 367, 2517
8. Zheng, J.; Trafny, E. A.; Knighton, D. R.; Xuong, N. H.; Taylor, S. S.; Ten Eyck, L. F.; Sowadski, J. M. Acta Crystallogr., Sect. D 1993, 49, 362
9. Masterson, L. R.; Shi, L.; Metcalfe, E.; Gao, J.; Taylor, S. S.; Veglia, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 6969
10. Armstrong, R. N.; Kondo, H.; Granot, J.; Kaiser, E. T.; Mildvan, A. S. Biochemistry 1979, 18, 1230
11. Grace, M. R.; Walsh, C. T.; Cole, P. A. Biochemistry 1997, 36, 1874
12. Bossemeyer, D.; Engh, R. A.; Kinzel, V.; Ponstingl, H.; Huber, R. EMBO J. 1993, 12, 849
13. Herberg, F. W.; Doyle, M. L.; Cox, S.; Taylor, S. S. Biochemistry 1999, 38, 6352
14. Adams, J. A.; Taylor, S. S. Protein Sci. 1993, 2, 2177
15. Zheng, J.; Knighton, D. R.; ten Eyck, L. F.; Karlsson, R.; Xuong, N.; Taylor, S. S.; Sowadski, J. M. Biochemistry 1993, 32, 2154
16. Shaltiel, S.; Cox, S.; Taylor, S. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 484
17. Shaffer, J.; Adams, J. A. Biochemistry 1999, 38, 5572
18. Cook, P. F.; Neville, M. E., Jr.; Vrana, K. E.; Hartl, F. T.; Roskoski, R., Jr. Biochemistry 1982, 21, 5794
19. Kovalevsky, A. Y.; Johnson, H.; Hanson, B. L.; Waltman, M. J.; Fisher, S. Z.; Taylor, S.; Langan, P. Acta Crystallogr., Sect. D 2012, 68, 854
20. Valiev, M.; Yang, J.; Adams, J. A.; Taylor, S. S.; Weare, J. H. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 13455
21. Cheng, Y.; Zhang, Y.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1553
22. Szarek, P.; Dyguda-Kazimierowicz, E.; Tachibana, A.; Sokalski, W. A. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 11819
23. Tereshko, V.; Teplova, M.; Brunzelle, J.; Watterson, D. M.; Egli, M. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 899
24. Wu, J.; Tseng, Y. D.; Xu, C. F.; Neubert, T. A.; White, M. F.; Hubbard, S. R. Nat. Struct. Mol. Biol. 2008, 15, 251
25. Bao, Z. Q.; Jacobsen, D. M.; Young, M. A. Structure 2011, 19, 675
26. Jacobsen, D. M.; Bao, Z. Q.; O'Brien, P.; Brooks, C. L., III; Young, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 15357
27. Mukherjee, K.; Sharma, M.; Urlaub, H.; Bourenkov, G. P.; Jahn, R.; Sudhof, T. C.; Wahl, M. C. Cell 2008, 133, 328
28. Adams, J. A. Chem. Rev. 2001, 101, 2271
29. Gibbs, C. S.; Zoller, M. J. J. Biol. Chem. 1991, 266, 8923
30. Valiev, M.; Kawai, R.; Adams, J. A.; Weare, J. H. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9926
31. Zoller, M. J.; Nelson, N. C.; Taylor, S. S. J. Biol. Chem. 1981, 256, 10837
32. Iyer, G. H.; Garrod, S.; Woods, V. L., Jr.; Taylor, S. S. J. Mol. Biol. 2005, 351, 1110
33. Iyer, G. H.; Moore, M. J.; Taylor, S. S. J. Biol. Chem. 2005, 280, 8800
34. Madhusudan; Akamine, P.; Xuong, N. H.; Taylor, S. S. Nat. Struct. Biol. 2002, 9, 273
35. Olsen, S. R.; Uhler, M. D. Mol. Endocrinol. 1991, 5, 1246
36. Madhusudan; Trafny, E. A.; Xuong, N. H.; Adams, J. A.; Ten Eyck, L. F.; Taylor, S. S.; Sowadski, J. M. Protein Sci. 1994, 3, 176
37. Yount, R. G.; Babcock, D.; Ballantyne, W.; Ojala, D. Biochemistry 1971, 10, 2484
38. Tomaszek, T. A., Jr.; Schuster, S. M. J. Biol. Chem. 1986, 261, 2264
39. Suzuki, Y.; Shimizu, T.; Morii, H.; Tanokura, M. FEBS Lett. 1997, 409, 29
40. Taylor, J. S. J. Biol. Chem. 1981, 256, 9793
41. Herberg, F. W.; Bell, S. M.; Taylor, S. S. Protein Eng. 1993, 6, 771
42. Duronio, R. J.; Jackson-Machelski, E.; Heuckeroth, R. O.; Olins, P. O.; Devine, C. S.; Yonemoto, W.; Slice, L. W.; Taylor, S. S.; Gordon, J. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 1506
43. Bastidas, A. C.; Deal, M. S.; Steichen, J. M.; Keshwani, M. M.; Guo, Y.; Taylor, S. S. J. Mol. Biol. 2012, 422, 215
44. Wu, J.; Yang, J.; Kannan, N.; Madhusudan; Xuong, N. H.; Ten Eyck, L. F.; Taylor, S. S. Protein Sci. 2005, 14, 2871
45. Yang, J.; Ten Eyck, L. F.; Xuong, N. H.; Taylor, S. S. J. Mol. Biol. 2004, 336, 473
46. Battye, T. G.; Kontogiannis, L.; Johnson, O.; Powell, H. R.; Leslie, A. G. Acta Crystallogr., Sect. D 2011, 67, 271
47. McCoy, A. J.; Grosse-Kunstleve, R. W.; Adams, P. D.; Winn, M. D.; Storoni, L. C.; Read, R. J. J. Appl. Crystallogr. 2007, 40, 658
48. Thompson, E. E.; Kornev, A. P.; Kannan, N.; Kim, C.; Ten Eyck, L. F.; Taylor, S. S. Protein Sci. 2009, 18, 2016
49. Acta Crystallogr, D. Biol Crystallogr 1994, 50, 760
50. Emsley, P.; Cowtan, K. Acta Crystallogr., Sect. D 2004, 60, 2126
51. Zhang, P.; Smith-Nguyen, E. V.; Keshwani, M. M.; Deal, M. S.; Kornev, A. P.; Taylor, S. S. Science 2012, 335, 712
52. Brown, S. H.; Wu, J.; Kim, C.; Alberto, K.; Taylor, S. S. J. Mol. Biol. 2009, 393, 1070
53. Khavrutskii, I. V.; Grant, B.; Taylor, S. S.; McCammon, J. A. Biochemistry 2009, 48, 11532
54. Yang, J.; Cron, P.; Good, V. M.; Thompson, V.; Hemmings, B. A.; Barford, D. Nat. Struct. Biol. 2002, 9, 940