Conserved water molecules contribute to the extensive network of interactions at the active site of protein kinase A

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 95, Issue 2, 1998, Pages 484-491

  Shaltiel, Shmuel ^b   Cox, Sarah ^a,c   Taylor, Susan S ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE   (Israel)

^c DUPONT COMPANY   (United States)

Author keywords

Conformational malleability; Protein crystallography; Substrate recognition

Indexed keywords

ADENOSINE TRIPHOSPHATE; CYCLIC AMP DEPENDENT PROTEIN KINASE; PEPTIDE;

ARTICLE; CARBOXY TERMINAL SEQUENCE; CRYSTALLOGRAPHY; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME REGULATION; ENZYME SUBUNIT; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN INTERACTION; STRUCTURE ANALYSIS; WATER ANALYSIS;

ANIMALS; BINDING SITES; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; CYCLIC AMP-DEPENDENT PROTEIN KINASES; ENZYME ACTIVATION; HUMANS; INFANT; PROTEIN CONFORMATION; WATER;

EID: 0031930594     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.95.2.484     Document Type: Article

References (49)

1. Walsh, D. A., Perkins, J. P. & Krebs, E. G. (1968) J. Biol. Chem. 243, 3763-3765.
2. Taylor, S. S., Knighton, D. R., Zheng, J., Ten Eyck, L. F. & Sowadski, J. M. (1992) Annu. Rev. Cell Biol. 8, 429-462.
3. Hanks, S. K., Quinn, A. M. & Hunter, T. (1988) Science 241, 42-52.
4. Knighton, D. R., Zheng, J., Ten Eyck, L. F., Ashford, V. A., Xuong, N.-H., Taylor, S. S. & Sowadski, J. M. (1991) Science 253, 407-414.
5. Knighton, D. R., Zheng, J., Ten Eyck, L. F., Xuong, N.-H., Taylor, S. S. & Sowadski, J. M. (1991) Science 253, 414-420.
6. Zheng, J., Knighton, D. R., Ten Eyck, L. F., Karlsson, R., Xuong, N.-H., Taylor, S. S. & Sowadski, J. M. (1993) Biochemistry 32, 2154-2161.
7. Zheng, J., Trafny, E. A., Knighton, D. R., Xuong, N.-H., Taylor, S. S., Ten Eyck, L. F. & Sowadski, J. M. (1993) Acta Crystallogr. D 49, 362-365.
8. Bossemeyer, D., Engh, R. A., Kinzel, V., Ponstingl, H. & Huber, R. (1993) EMBO J. 12, 849-859.
9. Taylor, S. S. & Radzio-Andzelm, E. (1994) Structure 2, 345-355.
10. Veron, M., Radzio-Andzelm, E., Tsigelny, I., Ten Eyck, L. F. & Taylor, S. S. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 10618-10622.
11. Herberg, F., Zimmermann, B., McGlone, M. & Taylor, S. S. (1997) Protein Sci. 6, 569-579.
12. Alhanaty, E. & Shaltiel, S. (1979) Biochem. Biophys. Res. Commun. 39, 323-332.
13. Alhanaty, E., Patinkin, J., Tauber-Finkelstein, M. & Shaltiel, S. (1981) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 73, 3492-3495.
14. Alhanaty, E., Tauber-Finkelstein, M., Schmeeda, H. & Shaltiel, S. (1985) Curr. Top. Cell. Regul. 27, 267-278.
15. Jiménez, J. S., Kupfer, A., Gani, V. & Shaltiel, S. (1982) Biochemistry 21, 1623-1630.
16. Nelson, N. & Taylor, S. S. (1983) J. Biol. Chem. 258, 10981-10987.
17. Kupfer, A., Jiménez, J. S. & Shaltiel, S. (1980) Biochem. Biophys. Res. Comm. 96, 77-80.
18. Buechler, J. A. & Taylor, S. S. (1990) Biochemistry 29, 1937-1943.
19. Kupfer, A., Jiménez, J. S., Gottlieb, P. & Shaltiel, S. (1982) Biochemistry 21, 1631-1637.
20. Karlsson, R., Zheng, J., Xuong, N.-H., Taylor, S. S. & Sowadski, J. M. (1993) Acta Crystallogr. D 49, 381-388.
21. Zheng, J., Knighton, D. R., Xuong, N.-H., Taylor, S. S., Sowadski, J. M. & Ten Eyck, L. F. (1993) Protein Sci. 2, 1559-1573.
22. Chestukhin, A., Litovchick, L., Muradov, K., Batkin, M. & Shaltiel, S. (1997) J. Biol. Chem. 272, 3153-3160.
23. Olah, G. A., Mitchell, R. D., Sosnick, T. R., Walsh, D. A. & Trewhella, J. (1993) Biochemistry 32, 3649-3657.
24. Reed, J. & Kinzel, V. (1984) Biochemistry 23, 968-973.
25. Reed, J., Kinzel, V., Kemp, B. E., Cheng, H.-C. & Walsh, D. A. (1985) Biochemistry 24, 2967-2973.
26. Narayana, N., Cox, S., Xuong, N.-H., TenEyck, L. F. & Taylor, S. S. (1997) Structure 5, 921-935.
27. Chestukhin, A., Litovchick, L., Schourov, D., Cox, S., Taylor, S. S. & Shaltiel, S. (1996) J. Biol. Chem. 271, 10175-10182.
28. Knighton, D. R., Bell, S. M., Zheng, J., Ten Eyck, L. F., Xuong, N.-H., Taylor, S. S. & Sowadski, J. M. (1993) Acta Crystallogr. D 49, 357-361.
29. Narayana, N., Cox, S., Shaltiel, S., Taylor, S. S. & Xuong, N. (1997) Biochemistry 36, 4438-4448.
30. Madhusudan, K. R., Trafny, E. A., Xuong, N.-H., Adams, J. A., Ten Eyck, L. F., Taylor, S. S. & Sowadski, J. M. (1994) Protein Sci. 3, 176-187.
31. Hoppe, J., Freist, W., Marutzky, R. & Shaltiel, S. (1978) Eur. J. Biochem. 90, 427-432.
32. Taylor, S. S. & Radzio-Andzelm, E. (1997) Curr. Opin. Chem. Biol. 1, 219-226.
33. Edsall, J. T. & McKenzie, H. A. (1983) Adv. Biophys. 16, 53-183.
34. Finney, J. L. (1977) Philos. Trans. R. Soc. London 278, 3-32.
35. Meyer, E. (1992) Protein Sci. 1, 1543-62.
36. Meyer, E., Cole, G., Radhakrishnan, R. & Epp, O. (1988) Acta Crystallogr. 44, 26-38.
37. Sreenivasan, U. & Axelson, P. H. (1992) Biochemistry 31, 12785-12791.
38. Malin, R., Zielenkiewicz, P. & Saenger, W. (1991) J. Biol. Chem 266, 4848-4852.
39. Zegers, I., Macs, D., Dao-Thi, M. H., Poortmans, F., Palmer, R. & Wyns, L. (1994) Protein Sci. 3, 2322-2339.
40. Komives, E. A., Lougheed, J. C., Liu, K., Sugio, S., Zhang, Z., Petsko, G. A. & Ringe, D. (1995) Biochemistry 34, 13612-13621.
41. Grant, B. D. & Adams, J. A. (1996) Biochemistry 35, 2022-2029.
42. Adams, J. A. & Taylor, S. S. (1992) Biochemistry 31, 8516-8522.
43. Lew, J., Taylor, S. S. & Adams, J. A. (1997) J. Biol. Chem. 36, 6717-6724.
44. Adams, J. A., McGlone, M. L., Gibson, R. & Taylor, S. S. (1995) Biochemistry 34, 2447-2454.
45. Xu, W., Harrison, S. C. & Eck, M. J. (1997) Nature (London) 385, 595-599.
46. Sicheri, F., Moarefi, I. & Kuriyan, J. (1997) Nature (London) 385, 602-609.
47. deBondt, H. L., Rosenblatt, J., Jancarik, J., Jones, H. D., Morgan, D. O. & Kim, S.-H. (1993) Nature (London) 363, 595-602.
48. Jeffrey, P. D., Russo, A. A., Polyak, K., Gibbs, E., Hurwitz, J., Massague, J. & Pavletich, N. P. (1995) Nature (London) 376, 313-320.
49. Canagarajah, B. J., Khokhlatchev, A., Cobb, M. H. & Goldsmith, E. J. (1997) Cell 5, 859-869.