The effect of urea on aqueous hydrophobic contact-pair interactions

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 15, Issue 1, 2013, Pages 213-222

  Shpiruk, Tanner A ^a   Khajehpour, Mazdak ^a  

^a UNIVERSITY OF MANITOBA   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

SOLVENT; UREA; WATER;

ARTICLE; CHEMICAL PHENOMENA; CHEMISTRY; HYDROGEN BOND; PROTEIN DENATURATION; THERMODYNAMICS;

HYDROGEN BONDING; HYDROPHOBIC AND HYDROPHILIC INTERACTIONS; PROTEIN DENATURATION; SOLVENTS; THERMODYNAMICS; UREA; WATER;

EID: 84870894895     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp42759a     Document Type: Article

References (64)

1. D. W. Bolen G. D. Rose Annu. Rev. Biochem. 2008 77 339 362
2. Y. Zhang P. S. Cremer Annu. Rev. Phys. Chem. 2010 63 83
3. A. Das C. Mukhopadhyay J. Phys. Chem. B 2009 113 12816 12824
4. B. J. Bennion V. Daggett Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 5142 5147
5. W. K. Lim J. Rosgen S. W. Englander Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 2595 2600
6. W. Li R. Zhou Y. Mu J. Phys. Chem. B 2012 116 1446 1451
7. E. J. Guinn L. M. Pegram M. W. Capp M. N. Pollock M. T. Record, Jr. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 16932 16937
8. J. Heyda M. Kozisek L. Bednarova G. Thompson J. Konvalinka J. Vondrasek P. Jungwirth J. Phys. Chem. B 2011 115 8910 8924
9. A. C. Miklos C. Li N. G. Sharaf G. J. Pielak Biochemistry 2010 49 6984 6991
10. S. Lee Y. L. Shek T. V. Chalikian Biopolymers 2010 93 866 879
11. L. Ma L. Pegram M. T. Record Q. Cui Biochemistry 2010 49 1954 1962
12. D. R. Canchi D. Paschek A. E. Garcia J. Am. Chem. Soc. 2010 132 2338 2344
13. C. N. Pace B. M. P. Huyghues-Despointes H. Fu K. Takano J. M. Scholtz G. R. Grimsley Protein Sci. 2010 19 929 943
14. F. Vanzi B. Madan K. Sharp J. Am. Chem. Soc. 1998 120 10748 10753
15. X. Chen L. B. Sagle P. S. Cremer J. Am. Chem. Soc. 2007 129 15104 15105
16. R. Zangi R. Zhou B. J. Berne J. Am. Chem. Soc. 2009 131 1535 1541
17. K. A. Sharp B. Madan E. Manas J. M. Vanderkooi J. Chem. Phys. 2001 114 1791 1796
18. Y. L. A. Rezus H. J. Bakker Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 18417 18420
19. D. Horinek R. R. Netz J. Phys. Chem. A 2011 115 6125 6136
20. J. D. Batchelor A. Olteanu A. Tripathy G. J. Pielak J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1958 1961
21. M. M. Thayer R. C. Haltiwanger V. S. Allured S. C. Gill S. J. Gill Biophys. Chem. 1993 46 165 169
22. H. Schoenert L. Stroth Biopolymers 1981 20 817 831
23. O. D. Bonner J. M. Bednarek R. K. Arisman J. Am. Chem. Soc. 1977 99 2898 2902
24. L. M. F. Holthauzen J. Roesgen D. W. Bolen Biochemistry 2010 49 1310 1318
25. H. Patel G. Raval M. Nazari H. Heerklotz Biophys. Chem. 2010 150 119 128
26. H. Raghuraman S. K. Pradhan A. Chattopadhyay J. Phys. Chem. B 2004 108 2489 2496
27. L. Costantino G. D'Errico P. Roscigno V. Vitagliano J. Phys. Chem. B 2000 104 7326 7333
28. Y. Feng Z.-W. Yu P. J. Quinn Chem. Phys. Lipids 2002 114 149 157
29. A. Walter G. Kuehl K. Barnes G. VanderWaerdt Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2000 1508 20 33
30. N. Muller J. Phys. Chem. 1990 94 3856 3859
31. D. B. Wetlaufer S. K. Malik L. Stoller R. L. Coffin J. Am. Chem. Soc. 1964 86 508 514
32. G. Graziano J. Phys. Chem. B 2001 105 2632 2637
33. G. Graziano Can. J. Chem. 2002 80 388 400
34. R. H. Wood P. T. Thompson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1990 87 946 949
35. S. Shimizu H. S. Chan Proteins: Struct., Funct., Genet. 2002 49 560 566
36. R. Beal Q. Deveraux G. Xia M. Rechsteiner C. Pickart Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93 861 866
37. A. G. Cochran N. J. Skelton M. A. Starovasnik Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 5578 5583
38. L. C. Tisi P. A. Evans J. Mol. Biol. 1995 249 251 258
39. P. Lijnzaad K. A. Feenstra J. Heringa F. C. P. Holstege Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2008 72 105 114
40. Y. S. Yun G. H. Nam Y.-G. Kim B.-H. Oh K. Y. Choi FEBS J. 2005 272 1999 2011
41. J. Funahashi K. Takano Y. Yamagata K. Yutani Biochemistry 2000 39 14448 14456
42. A. Soranno R. Longhi T. Bellini M. Buscaglia Biophys. J. 2009 96 1515 1528
43. S. Miyazawa R. L. Jernigan Protein Eng. 1994 7 1209 1220
44. C. L. Pashley G. J. Morgan A. P. Kalverda G. S. Thompson C. Kleanthous S. E. Radford J. Mol. Biol. 2012 416 300 318
45. F. Huang E. Lerner S. Sato D. Amir E. Haas A. R. Fersht Biochemistry 2009 48 3468 3476
46. R. Sarma S. Paul J. Phys. Chem. B 2012 116 2831 2841
47. R. Sarma S. Paul J. Chem. Phys. 2011 135 174501 174513
48. M. Ikeguchi S. Nakamura K. Shimizu J. Am. Chem. Soc. 2001 123 677 682
49. M.-E. Lee D. V. N. F. A. Van J. Am. Chem. Soc. 2006 128 4948 4949
50. A. Wallqvist D. G. Covell D. Thirumalai J. Am. Chem. Soc. 1998 120 427 428
51. R. M. Jackson M. J. E. Sternberg Protein Eng. 1994 7 371 383
52. D. L. Beauchamp M. Khajehpour Biophys. Chem. 2012 163-164 35 43
53. D. K. Kunimitsu A. Y. Woody E. R. Stimson H. A. Scheraga J. Phys. Chem. 1968 72 856 866
54. A. Y. Moon D. C. Poland H. A. Scheraga J. Phys. Chem. 1965 69 2960 2966
55. J. R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy, Springer, New York, 3rd edn, 2006
56. J. I. Steinfeld, J. S. Francisco and W. L. Hase, Chemical Kinetics Dynamics, Upper Saddle River, NJ, 2nd edn, 1999
57. B. J. Siwick M. J. Cox H. J. Bakker J. Phys. Chem. B 2008 112 378 389
58. D. Trzesniak D. V. N. F. A. Van G. W. F. Van Mol. Phys. 2007 105 33 39
59. D. V. N. F. A. Van M.-E. Lee D. Trzesniak G. W. F. Van J. Phys. Chem. B 2006 110 12852 12855
60. H. A. Yu M. Karplus J. Chem. Phys. 1988 89 2366 2379
61. B. Lee Biophys. Chem. 1994 51 271 278
62. G. Graziano J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1998 94 3345 3352
63. K. Itoh R. Holroyd J. Phys. Chem. 1990 94 8850 8854
64. A. J. Saunders P. R. Davis-Searles D. L. Allen G. J. Pielak D. A. Erie Biopolymers 2000 53 293 307