Structural characterization of plasma metabolites detected via LC-electrochemical coulometric array using LC-UV fractionation, MS, and NMR

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 22, 2012, Pages 9889-9898

  Bird, Susan S ^a   Sheldon, Diane P ^a   Gathungu, Rose M ^b   Vouros, Paul ^b   Kautz, Roger ^b   Matson, Wayne R ^c   Kristal, Bruce S ^a  

^a BRIGHAM AND WOMEN S HOSPITAL   (United States)

^b NORTHEASTERN UNIVERSITY   (United States)

^c VETERANS AFFAIRS MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTICAL METHOD; ARRAY DETECTION; BIO-MARKER DISCOVERY; BUFFER REQUIREMENTS; CLINICAL UTILITY; DETECTION MECHANISM; DIRECT TRANSFER; HUMAN PLASMAS; LC-MS METHODS; LIMITS OF DETECTION; METABOLITE EXTRACTION; METABOLOMICS; MULTIPLE PLATFORMS; MULTIPLE SAMPLES; OFFLINE; PLASMA METABOLITES; PROFILING METHODS; REDOX-ACTIVE; RETENTION TIME; ROBUST TECHNIQUE; STRUCTURAL CHARACTERIZATION; STRUCTURAL DATA; STRUCTURAL IDENTIFICATION;

CHEMICAL DETECTION; COULOMETERS; DIGITAL STORAGE; LIQUID CHROMATOGRAPHY; METABOLITES;

BIOMOLECULES;

ANALYSIS; ARTICLE; BLOOD ANALYSIS; ELECTROCHEMISTRY; FEMALE; HUMAN; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MALE; MASS SPECTROMETRY; METABOLOMICS; METHODOLOGY; MULTIVARIATE ANALYSIS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; ULTRAVIOLET RADIATION;

ANALYTIC SAMPLE PREPARATION METHODS; BLOOD CHEMICAL ANALYSIS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; ELECTROCHEMISTRY; FEMALE; HUMANS; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; MALE; MASS SPECTROMETRY; METABOLOMICS; MULTIVARIATE ANALYSIS; ULTRAVIOLET RAYS;

EID: 84869388565     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac302278u     Document Type: Article

References (55)

1. Rozen, S.; Cudkowicz, M. E.; Bogdanov, M.; Matson, W. R.; Kristal, B. S.; Beecher, C.; Harrison, S.; Vouros, P.; Flarakos, J.; Vigneau-Callahan, K.; Matson, T. D.; Newhall, K. M.; Beal, M. F.; Brown, R. H., Jr.; Kaddurah-Daouk, R. Metabolomics 2005, 1, 101-108
2. Kind, T.; Tolstikov, V.; Fiehn, O.; Weiss, R. H. Anal. Biochem. 2007, 363, 185-195
3. Kaddurah-Daouk, R.; Kristal, B. S.; Weinshilboum, R. M. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2008, 48, 653-683
4. Nicholson, J. K.; Lindon, J. C.; Holmes, E. Xenobiotica 1999, 29, 1181-1189
5. Viant, M. R. Mol. Biosyst. 2008, 4, 980-986
6. Hines, A.; Oladiran, G. S.; Bignell, J. P.; Stentiford, G. D.; Viant, M. R. Environ. Sci. Technol. 2007, 41, 3375-3381
7. Poynton, H. C.; Taylor, N. S.; Hicks, J.; Colson, K.; Chan, S.; Clark, C.; Scanlan, L.; Loguinov, A. V.; Vulpe, C.; Viant, M. R. Environ. Sci. Technol. 2011, 45, 3710-3717
8. Walsh, M. C.; Brennan, L.; Malthouse, J. P.; Roche, H. M.; Gibney, M. J. Am. J. Clin. Nutr. 2006, 84, 531-539
9. Vinayavekhin, N.; Homan, E. A.; Saghatelian, A. ACS Chem. Biol. 2009, 5, 91-103
10. Paolucci, U.; Vigneau-Callahan, K. E.; Shi, H.; Matson, W. R.; Kristal, B. S. Omics 2004, 8, 221-238
11. Lloyd, A. J.; Beckmann, M.; Fave, G.; Mathers, J. C.; Draper, J. Br. J. Nutr. 2011, 106, 812-824
12. Lloyd, A. J.; Fave, G.; Beckmann, M.; Lin, W.; Tailliart, K.; Xie, L.; Mathers, J. C.; Draper, J. Am. J. Clin. Nutr. 2011, 94, 981-991
13. Kind, T.; Fiehn, O. BMC Bioinf. 2007, 8, 105
14. Abate, S.; Ahn, Y. G.; Kind, T.; Cataldi, T. R.; Fiehn, O. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2010, 24, 1172-1180
15. Lindon, J. C.; Holmes, E.; Nicholson, J. K. Anal. Chem. 2003, 75, 384 A-391 A
16. Brown, M.; Wedge, D. C.; Goodacre, R.; Kell, D. B.; Baker, P. N.; Kenny, L. C.; Mamas, M. A.; Neyses, L.; Dunn, W. B. Bioinformatics 2011, 27, 1108-1112
17. Kaddurah-Daouk, R.; Boyle, S. H.; Matson, W.; Sharma, S.; Matson, S.; Zhu, H.; Bogdanov, M. B.; Churchill, E.; Krishnan, R. R.; Rush, A. J.; Pickering, E.; Delnomdedieu, M. Transl. Psychiatry 2011, 1 (7) e26
18. Redman, L. M.; Ravussin, E. Adipose Tissue in Health and Disease; Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA: Weinheim, Germany, 2010; pp 423-439.
19. Vigneau-Callahan, K. E.; Shestopalov, A. I.; Milbury, P. E.; Matson, W. R.; Kristal, B. S. J. Nutr. 2001, 131, 924S-932S
20. Matson, W. R.; Langlais, P.; Volicer, L.; Gamache, P. H.; Bird, E.; Mark, K. A. Clin. Chem. 1984, 30, 1477-1488
21. Kristal, B. S.; Shurubor, Y. I.; Kaddurah-Daouk, R.; Matson, W. R. Methods Mol. Biol. 2007, 371, 393-409
22. Kristal, B. S.; Shurubor, Y. I.; Kaddurah-Daouk, R.; Matson, W. R. Methods Mol. Biol. 2007, 358, 159-174
23. Shurubor, Y. I.; Matson, W. R.; Willett, W. C.; Hankinson, S. E.; Kristal, B. S. BMC Clin. Pathol. 2007, 7, 9
24. Condray, R.; Dougherty, G. G., Jr.; Keshavan, M. S.; Reddy, R. D.; Haas, G. L.; Montrose, D. M.; Matson, W. R.; McEvoy, J.; Kaddurah-Daouk, R.; Yao, J. K. Int. J. Neuropsychopharmacol. 2011, 14, 756-767
25. Kristal, B. S.; Vigneau-Callahan, K. E.; Matson, W. R. Anal. Biochem. 1998, 263, 18-25
26. Kristal, B. S.; Vigneau-Callahan, K.; Matson, W. R. Methods Mol. Biol. 2002, 186, 185-194
27. Kristal, B. S.; Vigneau-Callahan, K. E.; Moskowitz, A. J.; Matson, W. R. Arch. Biochem. Biophys. 1999, 370, 22-33
28. Yao, J. K.; Dougherty, G. G., Jr.; Reddy, R. D.; Keshavan, M. S.; Montrose, D. M.; Matson, W. R.; McEvoy, J.; Kaddurah-Daouk, R. PLoS One 2010, 5, e9508
29. Johansen, K. K.; Wang, L.; Aasly, J. O.; White, L. R.; Matson, W. R.; Henchcliffe, C.; Beal, M. F.; Bogdanov, M. PLoS One 2009, 4, e7551
30. Kaddurah-Daouk, R.; Rozen, S.; Matson, W.; Han, X.; Hulette, C. M.; Burke, J. R.; Doraiswamy, P. M.; Welsh-Bohmer, K. A. Alzheimer's Dementia 2011, 7, 309-317
31. Bogdanov, M.; Brown, R. H.; Matson, W.; Smart, R.; Hayden, D.; O'Donnell, H.; Flint Beal, M.; Cudkowicz, M. Free Radic. Biol. Med. 2000, 29, 652-658
32. Bogdanov, M. B.; Beal, M. F.; McCabe, D. R.; Griffin, R. M.; Matson, W. R. Free Radic. Biol. Med. 1999, 27, 647-666
33. Paul, S.; Bogdanov, M. B.; Matson, W. R.; Metakis, L.; Jacobs, J.; Beal, M. F. Free Radic. Res. 2003, 37, 499-502
34. Bogdanov, M.; Matson, W. R.; Wang, L.; Matson, T.; Saunders-Pullman, R.; Bressman, S. S.; Flint Beal, M. Brain 2008, 131, 389-396
35. Stack, E. C.; Ferro, J. L.; Kim, J.; Del Signore, S. J.; Goodrich, S.; Matson, S.; Hunt, B. B.; Cormier, K.; Smith, K.; Matson, W. R.; Ryu, H.; Ferrante, R. J. Biochim. Biophys. Acta 2008, 1782, 151-162
36. Ebbel, E. N.; Leymarie, N.; Schiavo, S.; Sharma, S.; Gevorkian, S.; Hersch, S.; Matson, W. R.; Costello, C. E. Anal. Biochem. 2010, 399, 152-161
37. Schiavo, S.; Ebbel, E.; Sharma, S.; Matson, W.; Kristal, B. S.; Hersch, S.; Vouros, P. Anal. Chem. 2008, 80, 5912-5923
38. Smith, K. M.; Matson, S.; Matson, W. R.; Cormier, K.; Del Signore, S. J.; Hagerty, S. W.; Stack, E. C.; Ryu, H.; Ferrante, R. J. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1762, 616-626
39. Patkar, A. A.; Rozen, S.; Mannelli, P.; Matson, W.; Pae, C. U.; Krishnan, K. R.; Kaddurah-Daouk, R. Psychopharmacology (Berlin, Ger.) 2009, 206, 479-489
40. Paolucci, U.; Vigneau-Callahan, K. E.; Shi, H.; Matson, W. R.; Kristal, B. S. Omics 2004, 8, 209-220
41. Shi, H.; Paolucci, U.; Vigneau-Callahan, K. E.; Milbury, P. E.; Matson, W. R.; Kristal, B. S. Omics 2004, 8, 197-208
42. Shi, H.; Vigneau-Callahan, K. E.; Shestopalov, A. I.; Milbury, P. E.; Matson, W. R.; Kristal, B. S. J. Nutr. 2002, 132, 1031-1038
43. Shi, H.; Vigneau-Callahan, K. E.; Shestopalov, A. I.; Milbury, P. E.; Matson, W. R.; Kristal, B. S. J. Nutr. 2002, 132, 1039-1046
44. Kaddurah-Daouk, R.; Yuan, P.; Boyle, S. H.; Matson, W.; Wang, Z.; Zeng, Z. B.; Zhu, H.; Dougherty, G. G.; Yao, J. K.; Chen, G.; Guitart, X.; Carlson, P. J.; Neumeister, A.; Zarate, C.; Krishnan, R. R.; Manji, H. K.; Drevets, W. Sci. Rep. 2012, 2, 667
45. Long, J. D.; Matson, W. R.; Juhl, A. R.; Leavitt, B. R.; Paulsen, J. S. Neurobiol. Dis. 2012, 46, 625-634
46. Ascherio, A.; LeWitt, P. A.; Xu, K.; Eberly, S.; Watts, A.; Matson, W. R.; Marras, C.; Kieburtz, K.; Rudolph, A.; Bogdanov, M. B.; Schwid, S. R.; Tennis, M.; Tanner, C. M.; Beal, M. F.; Lang, A. E.; Oakes, D.; Fahn, S.; Shoulson, I.; Schwarzschild, M. A. Arch Neurol. 2009, 66, 1460-1468
47. Matson, W. R.; Langlais, P.; Volicer, L.; Gamache, P. H.; Bird, E.; Mark, K. A. Clin. Chem. 1984, 30, 1477-1488
48. Jeitner, T. M.; Bogdanov, M. B.; Matson, W. R.; Daikhin, Y.; Yudkoff, M.; Folk, J. E.; Steinman, L.; Browne, S. E.; Beal, M. F.; Blass, J. P.; Cooper, A. J. J. Neurochem. 2001, 79, 1109-1112
49. Liu, L.; Li, S.; Chen, Z. J. Pharm. Biomed. Anal. 2012, 61, 252-255
50. Shao, X.; Lv, L.; Parks, T.; Wu, H.; Ho, C. T.; Sang, S. J. Agric. Food Chem. 2010, 58, 12608-12614
51. Smith, C. A.; O'Maille, G.; Want, E. J.; Qin, C.; Trauger, S. A.; Brandon, T. R.; Custodio, D. E.; Abagyan, R.; Siuzdak, G. Ther. Drug Monit. 2005, 27, 747-751
52. Wishart, D. S.; Knox, C.; Guo, A. C.; Eisner, R.; Young, N.; Gautam, B.; Hau, D. D.; Psychogios, N.; Dong, E.; Bouatra, S.; Mandal, R.; Sinelnikov, I.; Xia, J.; Jia, L.; Cruz, J. A.; Lim, E.; Sobsey, C. A.; Shrivastava, S.; Huang, P.; Liu, P.; Fang, L.; Peng, J.; Fradette, R.; Cheng, D.; Tzur, D.; Clements, M.; Lewis, A.; De Souza, A.; Zuniga, A.; Dawe, M.; Xiong, Y.; Clive, D.; Greiner, R.; Nazyrova, A.; Shaykhutdinov, R.; Li, L.; Vogel, H. J.; Forsythe, I. Nucleic Acids Res. 2009, 37, D603-610
53. Yang, F. Q.; Li, D. Q.; Feng, K.; Hu, D. J.; Li, S. P. J. Chromatogr., A 2010, 1217, 5501-5510
54. Lu, W.; Clasquin, M. F.; Melamud, E.; Amador-Noguez, D.; Caudy, A. A.; Rabinowitz, J. D. Anal. Chem. 2010, 82, 3212-3221
55. Olson, D. L.; Lacey, M. E.; Sweedler, J. V. Anal. Chem. 1998, 70, 645-650