Ion mobility mass spectrometry of peptide ions: Effects of drift gas and calibration strategies

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 16, 2012, Pages 7124-7130

  Bush, Matthew F ^a   Campuzano, Iain D G ^b   Robinson, Carol V ^c  

^a UNIVERSITY OF WASHINGTON   (United States)

^b AMGEN INC   (United States)

^c UNIVERSITY OF OXFORD   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR BIOLOGY; PEPTIDES;

AMERICAN CHEMICAL SOCIETY; COLLISION CROSS SECTIONS; GAS COMPOSITIONS; ION CONFINEMENTS; ION MOBILITY-MASS SPECTROMETRY; RADIO FREQUENCIES; SHAPE PARAMETERS; TEMPERATURE DRIFTS;

IONS;

EID: 84865496053     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac3014498     Document Type: Article

References (63)

1. Borsdorf, H.; Mayer, T.; Zarejousheghani, M.; Eiceman, G. A. Appl. Spectrosc. Rev. 2011, 46, 472-521
2. Wyttenbach, T.; Bowers, M. T. Top. Curr. Chem. 2003, 225, 207-232
3. Bohrer, B. C.; Merenbloom, S. I.; Koeniger, S. L.; Hilderbrand, A. E.; Clemmer, D. E. Ann. Rev. Anal. Chem. 2008, 1, 293-327
4. Kanu, A. B.; Dwivedi, P.; Tam, M.; Matz, L.; Hill, H. H. J. Mass Spectrom. 2008, 43, 1-22
5. Steiner, W. E.; Klopsch, S. J.; English, W. A.; Clowers, B. H.; Hill, H. H. Anal. Chem. 2005, 77, 4792-4799
6. Roscioli, K. M.; Davis, E.; Siems, W. F.; Mariano, A.; Su, W.; Guharay, S. K.; Hill, H. H. Anal. Chem. 2011, 83, 5965-5971
7. Bagal, D.; Zhang, H.; Schnier, P. D. Anal. Chem. 2008, 80, 2408-2418
8. Trimpin, S.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2008, 80, 9073-9083
9. Chan, E. C. Y.; New, L. S.; Yap, C. W.; Goh, L. T. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2009, 23, 384-394
10. Bagal, D.; Valliere-Douglass, J. F.; Balland, A.; Schnier, P. D. Anal. Chem. 2010, 82, 6751-6755
11. Campuzano, I.; Bush, M. F.; Robinson, C. V.; Beaumont, C.; Richardson, K.; Kim, H.; Kim, H. I. Anal. Chem. 2011, 84, 1026-1033
12. Dwivedi, P.; Schultz, A. J.; Hill, H. H. Int. J. Mass Spectrom. 2010, 298, 78-90
13. Dear, G. J.; Munoz-Muriedas, J.; Beaumont, C.; Roberts, A.; Kirk, J.; Williams, J. P.; Campuzano, I. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2010, 24, 3157-3162
14. Dwivedi, P.; Bendiak, B.; Clowers, B. H.; Hill, H. H. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1163-1175
15. Fenn, L. S.; McLean, J. A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 2196-2205
16. Ridenour, W. B.; Kliman, M.; McLean, J. A.; Caprioli, R. M. Anal. Chem. 2010, 82, 1881-1889
17. Ekeowa, U. I.; Freeke, J.; Miranda, E.; Gooptu, B.; Bush, M. F.; Perez, J.; Teckman, J.; Robinson, C. V.; Lomas, D. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 17146-17151
18. Shoemaker, G. K.; van Duijn, E.; Crawford, S. E.; Uetrecht, C.; Baclayon, M.; Roos, W. H.; Wuite, G. J. L.; Estes, M. K.; Prasad, B. V. V; Heck, A. J. R. Mol. Cell. Proteomics 2010, 9, 1742-1751
19. Bleiholder, C.; Dupuis, N. F.; Wyttenbach, T.; Bowers, M. T. Nat. Chem. 2010, 3, 172-177
20. Zhou, M.; Morgner, N.; Barrera, N. P.; Politis, A.; Isaacson, S. C.; Matak-Vinković, D.; Murata, T.; Bernal, R. A.; Stock, D.; Robinson, C. V. Science 2011, 334, 380-385
21. Angel, T. E.; Aryal, U. K.; Hengel, S. M.; Baker, E. S.; Kelly, R. T.; Robinson, E. W.; Smith, R. D. Chem. Soc. Rev. 2012, 41, 3912
22. Asbury, G. R.; Hill, H. H. Anal. Chem. 1999, 72, 580-584
23. McLean, J. A.; Ruotolo, B. T.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. Int. J. Mass Spectrom. 2005, 240, 301-315
24. Liu, X.; Valentine, S. J.; Plasencia, M. D.; Trimpin, S.; Naylor, S.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 1249-1264
25. Baker, E. S.; Livesay, E. A.; Orton, D. J.; Moore, R. J.; Danielson, W. F.; Prior, D. C.; Ibrahim, Y. M.; LaMarche, B. L.; Mayampurath, A. M.; Schepmoes, A. A.; Hopkins, D. F.; Tang, K.; Smith, R. D.; Belov, M. E. J. Proteome Res. 2010, 9, 997-1006
26. Valentine, S. J.; Ewing, M. A.; Dilger, J. M.; Glover, M. S.; Geromanos, S.; Hughes, C.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2011, 10, 2318-2329
27. Woods, A. S.; Ugarov, M.; Egan, T.; Koomen, J.; Gillig, K. J.; Fuhrer, K.; Gonin, M.; Schultz, J. A. Anal. Chem. 2004, 76, 2187-2195
28. Fenn, L. S.; Kliman, M.; Mahsut, A.; Zhao, S. R.; McLean, J. A. Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 235-244
29. Valentine, S. J.; Counterman, A. E.; Hoaglund, C. S.; Reilly, J. P.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1998, 9, 1213-1216
30. Huang, X.; Liu, M.; Nold, M. J.; Tian, C.; Fu, K.; Zheng, J.; Geromanos, S. J.; Ding, S.-J. Anal. Chem. 2011, 83, 6971-6979
31. Geromanos, S. J.; Hughes, C.; Golick, D.; Ciavarini, S.; Gorenstein, M. V.; Richardson, K.; Hoyes, J. B.; Vissers, J. P. C.; Langridge, J. I. Proteomics 2011, 11, 1189-1211
32. Ruotolo, B. T.; McLean, J. A.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. J. Mass Spectrom. 2004, 39, 361-367
33. Hogan, C. J.; de la Mora, J. F. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 158-172
34. Maißer, A.; Premnath, V.; Ghosh, A.; Nguyen, T. A.; Attoui, M.; Hogan, C. J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 21630-21641
35. Ude, S.; de la Mora, J. F. J. Aerosol Sci. 2005, 36, 1224-1237
36. Giles, K.; Pringle, S. D.; Worthington, K. R.; Little, D.; Wildgoose, J. L.; Bateman, R. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 2401-2414
37. Pringle, S. D.; Giles, K.; Wildgoose, J. L.; Williams, J. P.; Slade, S. E.; Thalassinos, K.; Bateman, R. H.; Bowers, M. T.; Scrivens, J. H. Int. J. Mass Spectrom. 2007, 261, 1-12
38. Giles, K.; Williams, J. P.; Campuzano, I. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2011, 25, 1559-1566
39. Zhong, Y.; Hyung, S.-J.; Ruotolo, B. T. Analyst 2011, 136, 3534-3541
40. von Helden, G.; Hsu, M. T.; Kemper, P. R.; Bowers, M. T. J. Chem. Phys. 1991, 95, 3835-3837
41. Shvartsburg, A. A.; Jarrold, M. F. Chem. Phys. Lett. 1996, 261, 86-91
42. Mesleh, M. F.; Hunter, J. M.; Shvartsburg, A. A.; Schatz, G. C.; Jarrold, M. F. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16082-16086
43. Wang, B.; Valentine, S.; Plasencia, M.; Raghuraman, S.; Zhang, X. BMC Bioinf. 2010, 11, 182
44. Ruotolo, B. T.; Benesch, J. L. P.; Sandercock, A. M.; Hyung, S.-J.; Robinson, C. V. Nat. Protoc. 2008, 3, 1139-1152
45. Smith, D. P.; Knapman, T.; Campuzano, I.; Malham, R. W.; Berryman, J. T.; Radford, S. E.; Ashcroft, A. E. Eur. J. Mass Spectrom. 2009, 15, 113-130
46. Thalassinos, K.; Grabenauer, M.; Slade, S. E.; Hilton, G. R.; Bowers, M. T.; Scrivens, J. H. Anal. Chem. 2009, 81, 248-254
47. Bush, M. F.; Hall, Z.; Giles, K.; Hoyes, J.; Robinson, C. V.; Ruotolo, B. T. Anal. Chem. 2010, 82, 9557-9565
48. Hernández, H.; Robinson, C. V. Nat. Protoc. 2007, 2, 715-726
49. Marquardt, D. W. SIAM J. Appl. Math. 1963, 11, 431-441
50. Jones, E.; Oliphant, T.; Peterson, P. SciPy: Open Source Scientific Tools for Python 2001, not supplied.
51. Mason, E. A.; McDaniel, E. W. Transport Properties of Ions in Gases; Wiley: New York, 1998.
52. Shelimov, K. B.; Clemmer, D. E.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2240-2248
53. Siu, C.-K.; Guo, Y.; Saminathan, I. S.; Hopkinson, A. C.; Siu, K. W. M. J. Phys. Chem. B 2009, 114, 1204-1212
54. Verbeck, G. F.; Ruotolo, B. T.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2004, 15, 1320-1324
55. Valentine, S. J.; Counterman, A. E.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1999, 10, 1188-1211
56. von Helden, G.; Hsu, M. T.; Gotts, N.; Bowers, M. T. J. Phys. Chem. 1993, 97, 8182-8192
57. Henderson, S. C.; Li, J.; Counterman, A. E.; Clemmer, D. E. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 8780-8785
58. Shvartsburg, A. A.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2008, 80, 9689-9699
59. Salbo, R.; Bush, M. F.; Naver, H.; Campuzano, I.; Robinson, C. V.; Petterson, I.; Jørgensen, T. J. D.; Haselmann, K. F. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2012, 26, 1181-1193
60. Williams, J. P.; Scrivens, J. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008, 22, 187-196
61. Ruotolo, B. T.; Verbeck; Thomson, L. M.; Woods, A. S.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. J. Proteome Res. 2002, 1, 303-306
62. Ruotolo, B. T.; Gillig, K. J.; Woods, A. S.; Egan, T. F.; Ugarov, M. V.; Schultz, J. A.; Russell, D. H. Anal. Chem. 2004, 76, 6727-6733
63. Counterman, A. E.; Clemmer, D. E. Anal. Chem. 2002, 74, 1946-1951