Conserved functional surface of antimammalian scorpion β-toxins

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 116, Issue 16, 2012, Pages 4796-4800

  Chen, Rong ^a   Chung, Shin Ho ^a  

^a AUSTRALIAN NATIONAL UNIVERSITY   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING ENERGY; DISSOCIATION; MAMMALS; METABOLITES; MOLECULAR DYNAMICS; SODIUM;

BINDING MODES; CHARGED RESIDUES; DISSOCIATION CONSTANT; FUNCTIONAL SURFACES; MOLECULAR DOCKING; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; RECEPTOR SITES; UMBRELLA SAMPLING;

TOXIC MATERIALS;

SCORPION VENOM;

ADSORPTION; AMINO ACID SEQUENCE; ANIMAL; ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; METABOLISM; MOLECULAR GENETICS; SCORPION; SEQUENCE ALIGNMENT; SURFACE PROPERTY;

ADSORPTION; AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR SEQUENCE DATA; SCORPION VENOMS; SCORPIONS; SEQUENCE ALIGNMENT; SURFACE PROPERTIES;

EID: 84860267724     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp300127j     Document Type: Article

References (40)

1. Catterall, W. A.; Goldin, A. L.; Waxman, S. G. Pharmacol. Rev. 2005, 57, 397-409
2. Ren, D.; Navarro, B.; Xu, H.; Yue, L.; Shi, Q.; Clapham, D. E. Science 2001, 294, 2372-2375
3. Koishi, R.; Xu, H.; Ren, D.; Navarro, B.; Spiller, B. W.; Shi, Q.; Clapham, D. E. J. Biol. Chem. 2004, 279, 9532-9538
4. Payandeh, J.; Scheuer, T.; Zheng, N.; Catterall, W. A. Nature 2011, 475, 353-358
5. Catterall, W. A.; Cestele, S.; Yarov-Yarovoy, V.; Yu, F. H.; Konoki, K.; Scheuer, T. Toxicon 2007, 49, 124-141
6. Gurevitz, M.; Karbat, I.; Cohen, L.; Ilan, N.; Kahn, R.; Turkov, M.; Stankiewicz, M.; Stühmer, W.; Dong, K.; Gordon, D. Toxicon 2007, 49, 473-489
7. Possani, L. D.; Becerril, B.; Delepierre, M.; Tytgat, J. Eur. J. Biochem. 1999, 264, 287-300
8. Vazquez, A.; Tapia, J. V.; Eliason, W. K.; Martin, B. M.; Lebreton, F.; Delepierre, M.; Possani, L. D.; Becerril, B. Toxicon 1995, 33, 1161-1170
9. Schiavon, E.; Sacco, T.; Cassulini, R. R.; Gurrola, G.; Tempia, F.; Possani, L. D.; Wanke, E. J. Biol. Chem. 2006, 281, 20326-20337
10. Martin, M. F.; Garcia y Perez, L. G.; El Ayeb, M.; Kopeyan, C.; Bechis, G.; Jover, E.; Rochat, H. J. Biol. Chem. 1987, 262, 4452-4459
11. Zhang, J. Z.; Yarov-Yarovoy, V.; Scheuer, T.; Karbat, I.; Cohen, L.; Gordon, D.; Gurevitz, M.; Catterall, W. A. J. Biol. Chem. 2011, 286, 33641-33651
12. Marcotte, P.; Chen, L. Q.; Kallen, R. G.; Chahine, M. Circ. Res. 1997, 80, 363-369
13. Cestèle, S.; Qu, Y.; Rogers, J. C.; Rochat, H.; Scheuer, T.; Catterall, W. A. Neuron 1998, 21, 919-931
14. Cestèle, S.; Scheuer, T.; Mantegazza, M.; Rochat, H.; Catterall, W. A. J. Gen. Physiol. 2001, 118, 291-302
15. Cohen, L.; Karbat, I.; Gilles, N.; Ilan, N.; Benveniste, M.; Gordon, D.; Gurevitz, M. J. Biol. Chem. 2005, 280, 5045-5053
16. Cestèle, S.; Yarov-Yarovoy, V.; Qu, Y.; Sampieri, F.; Scheuer, T.; Catterall, W. A. J. Biol. Chem. 2006, 281, 21332-21344
17. Karbat, I.; Ilan, N.; Zhang, J. Z.; Cohen, L.; Kahn, R.; Benveniste, M.; Scheuer, T.; Catterall, W. A.; Gordon, D.; Gurevitz, M. J. Biol. Chem. 2010, 285, 30531-30538
18. Cohen, L.; Ilan, N.; Gur, M.; Stuhmer, W.; Gordon, D.; Gurevitz, M. J. Biol. Chem. 2007, 282, 29424-29430
19. Leipold, E.; Hansel, A.; Borges, A.; Heinemann, S. H. Mol. Pharmacol. 2006, 70, 340-347
20. He, H. Q.; Liu, Z. R.; Dong, B. Q.; Zhang, J. W.; Shu, X. Q.; Zhou, J. J.; Ji, Y. H. PLoS One 2011, 6, e14510
21. Song, W.; Du, Y.; Liu, Z.; Luo, N.; Turkov, M.; Gordon, D.; Gurevitz, M.; Goldin, A. L.; Dong, K. J. Biol. Chem. 2011, 286, 15781-15788
22. Cohen, L.; Karbat, I.; Gilles, N.; Froy, O.; Corzo, G.; Angelovici, R.; Gordon, D.; Gurevitz, M. J. Biol. Chem. 2004, 279, 8206-8211
23. Guex, N.; Peitsch, M. C. Electrophoresis 1997, 18, 2714-2723
24. Schwede, T.; Kopp, J.; Guex, N.; Peitsch, M. C. Nucleic Acids Res. 2003, 31, 3381-3385
25. Arnold, K.; Bordoli, L.; Kopp, J.; Schwede, T. Bioinformatics 2006, 22, 195-201
26. Pintar, A.; Possani, L. D.; Delepierre, M. J. Mol. Biol. 1999, 287, 359-367
27. Mintseris, J.; Pierce, B.; Wiehe, K.; Anderson, R.; Chen, R.; Weng, Z. Proteins 2007, 69, 511-520
28. Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kalé, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781-1802
29. MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616
30. Klauda, J. B.; Venable, R. M.; Freites, J. A.; O'Connor, J. W.; Tobias, D. J.; Mondragon-Ramirez, C.; Vorobyov, I.; MacKerell, A. D., Jr.; Pastor, R. W. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 7830-7843
31. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1982, 79, 926-935
32. Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341
33. Miyamoto, S.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 952-962
34. Kästner, J.; Thiel, W. J. Chem. Phys. 2006, 124, 234106
35. Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021
36. Chen, R.; Robinson, A.; Gordon, D.; Chung, S. H. Biophys. J. 2011, 101, 2652-2660
37. Mantegazza, M.; Cestèle, S. J. Physiol. 2005, 568, 13-30
38. Karbat, I.; Turkov, M.; Cohen, L.; Kahn, R.; Gordon, D.; Gurevitz, M.; Frolow, F. J. Mol. Biol. 2007, 366, 586-601
39. Calderon-Aranda, E. S.; Selisko, B.; York, E. J.; Gurrola, G. B.; Stewart, J. M.; Possani, L. D. Eur. J. Biochem. 1999, 264, 746-755
40. Canul-Tec, J. C.; Riano-Umbarila, L.; Rudino-Pinera, E.; Becerril, B.; Possani, L. D.; Torres-Larios, A. J. Biol. Chem. 2011, 286, 20892-20900