Effects of guanidinium ions on the conformational structure of glucose oxidase studied by electrochemistry, spectroscopy, and theoretical calculations: Towards developing a chemical-induced protein conformation assay

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 14, Issue 16, 2012, Pages 5824-5836

  Xu, Xiaoqing ^a   Wu, Ping ^a   Xu, Wang ^a   Shao, Qian ^a   An, Li ^a   Zhang, Hui ^a   Cai, Chenxin ^a   Zhao, Bo ^a  

^a NANJING NORMAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GLUCOSE OXIDASE; GUANIDINE; ION;

ARTICLE; BIOCATALYSIS; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CIRCULAR DICHROISM; ELECTROCHEMISTRY; FLUORESCENCE; INFRARED SPECTROSCOPY; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; PROTEIN CONFORMATION; ULTRAVIOLET SPECTROPHOTOMETRY;

BIOCATALYSIS; CIRCULAR DICHROISM; ELECTROCHEMISTRY; FLUORESCENCE; GLUCOSE OXIDASE; GUANIDINE; IONS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PROTEIN CONFORMATION; SPECTROPHOTOMETRY, ULTRAVIOLET; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED;

EID: 84859302639     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp24121h     Document Type: Article

References (87)

1. R. J. Ellis T. J. T. Pinheiro Nature 2002 416 483 484
2. C. M. Dobson Nature 2003 426 884 890
3. H. W. He J. Zhang H. M. Zhou Y. B. Yan Biophys. J. 2005 89 2650 2658
4. X. C. Li W. Zheng L. M. Zhang P. Yu Y. Q. Lin L. Su L. Q. Mao Anal. Chem. 2009 81 8557 8563
5. Q. Wang W. Xu P. Wu H. Zhang C. X. Cai B. Zhao J. Phys. Chem. B 2010 114 12754 12764
6. F.-F. Liu X.-Y. Dong L. He A. P. J. Middelberg Y. Sun J. Phys. Chem. B 2011 115 11879 11887
7. Z. B. Mai X. J. Zhao Z. Dai X. Y. Zou J. Phys. Chem. B 2010 114 7090 7097
8. R. A. Stanoforth M. G. Bigotti F. Cutruzzol C. T. Allocatelli M. Brunori J. Mol. Biol. 1998 275 133 148
9. K. Kobayashi M. Mizuno M. Fujikawa Y. Mizutani Biochemistry 2011 50 9468 9474
10. E. Botello N. C. Harris J. Sargent W.-H. Chen K.-J. Lin C.-H. Kiang J. Phys. Chem. B 2009 113 10845 10848
11. S.-Y. Dong Z.-W. Zhao H.-M. Ma J. Proteome Res. 2006 5 26 31
12. E. Saguer P. Alvarez J. Sedman H. S. Ramaswamy A. A. Ismail Food Hydrocolloids 2009 23 874 879
13. H. Maekawa C. Toniolo Q. B. Broxterman N.-H. Ge J. Phys. Chem. B 2007 111 3222 3235
14. K. P. Fears B. Sivaraman G. L. Powell Y. N. Wu R. A. Latour Langmuir 2009 25 9319 9327
15. A. Panuszko P. Bruździak J. Zielkiewicz D. Wyrzykowski J. Stangret J. Phys. Chem. B 2009 113 14797 14809
16. R. Polsky J. C. Harper S. M. Dirk D. C. Arango D. R. Wheeler S. M. Brozik Langmuir 2007 23 364 366
17. O. V. Stepanenko I. M. Kuznetsova K. K. Turoverov C. Huang C.-C. Wang Biochemistry 2004 43 5296 5303
18. M. R. Sawaya S. Sambashivan R. Nelson M. I. Ivanova S. A. Sievers M. I. Apostol M. J. Thompson M. Balbirnie J. J. W. Wiltzius H. T. McFarlane A. O. Madsen C. Riekel D. Eisenberg Nature 2007 447 453 457
19. A. Baumketner M. G. Krone J.-E. Shea Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 6027 6032
20. R. W. Carrell B. Gooptu Curr. Opin. Struct. Biol. 1998 8 799 809
21. J. D. Harper P. T. Lansbury Jr. Annu. Rev. Biochem. 1997 66 385 407
22. Y. Shu M. Liu S. Chen X. Chen J. Wang J. Phys. Chem. B 2011 115 12306 12314
23. G. A. Baker W. T. Heller Chem. Eng. J. 2009 147 6 12
24. T. A. Page N. D. Kraut P. M. Page G. A. Baker F. V. Bright J. Phys. Chem. B 2009 113 12825 12830
25. Q. Shao P. Wu P. Gu X. Xu H. Zhang C. X. Cai J. Phys. Chem. B 2011 115 8627 8637
26. X. Wu B. Zhao P. Wu H. Zhang C. X. Cai J. Phys. Chem. B 2009 113 13365 13373
27. S. Spector M. Wang S. A. Carp J. Robblee Z. S. Hendsch R. Fairman B. Tidor D. P. Raleigh Biochemistry 2000 39 872 879
28. V. V. Loladze B. Ibarra-Molero J. M. Sanchez-Ruiz G. I. Makhatadze Biochemistry 1999 38 16419 16423
29. P. Perl U. Mueller U. Heineman F. X. Schmid Nat. Struct. Biol. 2000 7 380 383
30. S. M. Nabuurs A. H. Westphal C. P. M. van Mierlo J. Am. Chem. Soc. 2009 131 2739 2746
31. M. M. Malabanan T. L. Amyes J. P. Richard J. Am. Chem. Soc. 2011 133 16428 16431
32. Y. Hong C. Feng Y. Yu J. Liu J. W. Y. Lam K. Q. Luo B. Z. Tang Anal. Chem. 2010 82 7035 7043
33. C. E. Dempsey P. E. Mason P. Jungwirth J. Am. Chem. Soc. 2011 133 7300 7303
34. A. Natalello D. Ami S. Brocca M. Lotti S. M. Doglia Biochem. J. 2005 385 511 517
35. T. Cellmer E. R. Henry J. Kubelka J. Hofrichter W. A. Eaton J. Am. Chem. Soc. 2007 129 14564 14565
36. J. Zimmermann M. C. Thielges Y. J. Seo P. E. Dawson F. E. Romesberg Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 8333 8337
37. A. Chakraborty M. Sarkar S. Basak J. Colloid Interface Sci. 2005 287 312 317
38. T. Ishida P. J. Rossky E. W. Castner Jr. J. Phys. Chem. B 2004 108 17583 17590
39. A. Berteotti A. Barducci M. Parrinello J. Am. Chem. Soc. 2011 133 17200 17206
40. I. Baskakov D. W. Bolen J. Biol. Chem. 1998 273 4831 4834
41. I. Baskkov R. Kumar G. Srinivasan Y. Ji D. W. Bolen E. B. Thompson J. Biol. Chem. 1999 274 10693 10696
42. P. E. Mason J. W. Brady G. W. Neilson C. E. Dempsey Biophys. J. 2007 93 L4 L6
43. P. E. Mason C. E. Dempsey L. Vrbka J. Heyda J. W. Brady P. Jungwirth J. Phys. Chem. B 2009 113 3227 3234
44. E. Wernersson J. Heyda A. Kubíková T. Kíek P. Coufal P. Jungwirth J. Phys. Chem. B 2010 114 11934 11941
45. A. Möglich F. Krieger T. Kiefhaber J. Mol. Biol. 2005 345 153 162
46. L. Ma L. Pegram M. T. Record Q. Cui Biochemistry 2010 49 1954 1962
47. A. G. Cochran N. J. Skelton M. A. Starovasnik Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 5578 5583
48. P. E. Mason C. E. Dempsey G. W. Neilson S. R. Kline J. W. Brady J. Am. Chem. Soc. 2009 131 16689 16696
49. E. S. Courtenay M. W. Capp M. T. Record Protein Sci. 2001 10 2485 2497
50. T. O. Street D. W. Bolen G. D. Rose Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 13997 14002
51. K. D. Collins Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1995 92 5553 5557
52. P. E. Mason G. W. Neilson C. E. Dempsey A. C. Barnes J. M. Cruickshank Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 4557 4561
53. B. Hribar N. T. Southall V. Vlachy K. A. Dill J. Am. Chem. Soc. 2002 124 12302 12311
54. O. K. Abou-Zied O. I. Al-Shihi J. Am. Chem. Soc. 2008 130 10793 10801
55. M. K. Santra A. Banerjee S. S. Krishnakumar O. Rahaman D. Panda Eur. J. Biochem. 2004 271 1789 1797
56. J. M. Scholtz Biochemistry 1996 35 7292 7297
57. L. Meng J. Jin G. Yang T. Lu H. Zhang C. X. Cai Anal. Chem. 2009 81 7271 7280
58. Z. Wang S. Liu P. Wu C. X. Cai Anal. Chem. 2009 81 1638 1645
59. M. Zhao X. Wu C. X. Cai J. Phys. Chem. B 2009 113 4987 4996
60. D. M. Gouda S. A. Singh A. G. A. Rao M. S. Thakur N. G. Karanth J. Biol. Chem. 2003 278 24324 24333
61. G. Böhm R. Muhr R. Jaenicke Protein Eng., Des. Sel. 1992 5 191 195
62. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery Jr., T. Vreven, N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, Gaussian 03, revision B.03, Gaussian Inc, Pittsburgh, PA, 2003
63. A. Szucs G. D. Hitchens J. O'M. Bockris J. Electrochem. Soc. 1989 136 3748 3755
64. C. Bourdillon C. Demaille J. Moiroux J.-M. Savéant J. Am. Chem. Soc. 1993 115 2 10
65. H. M. Kalisz H.-J. Hecht D. Schomburg R. D. Schmid J. Mol. Biol. 1990 213 207 209
66. X. Pang P. Imin I. Zhitomirsky A. Adronov Macromolecules 2010 43 10376 10381
67. A. N. Bhatt N. Shukla A. Aliverti G. Zanetti V. Bhakuni Protein Sci. 2005 14 980 992
68. Y. A. Skvortsova R. M. Freeney Z. Zhong M. L. Geng Anal. Chem. 2010 82 6712 6716
69. A. Kowalska M. Gyugos D. Szego A. L. Pineda D. Ayala Y. Xu N. Hughes A. Tito J. Jabłońska Food Sci. Biotechnol. 2007 71 35 48
70. H. J. Hecht H. M. Kalisz J. Hendle R. D. Schmid D. Schomburg J. Mol. Biol. 1993 229 153 172
71. A. Ahmad M. S. Akhtar V. Bhakuni Biochemistry 2001 40 1945 1955
72. B. E. P. Swoboda Biochim. Biophys. Acta, Protein Struct. 1969 175 365 379
73. K. Singh V. Bhakuni J. Biochem. 2009 145 721 731
74. M. S. Akhtar A. Ahmad V. Bhakuni Biochemistry 2002 41 7142 7149
75. J. L. R. Arrondo F. M. Goni Prog. Biophys. Mol. Biol. 1999 72 367 405
76. P. I. Haris F. Severcan J. Mol. Catal. B: Enzym. 1999 7 207 221
77. L. P. DeFlores A. Tokmakoff J. Am. Chem. Soc. 2006 128 16520 16521
78. S. Zhou H. Peng X. Yu X. Zheng W. Cui Z. Zhang X. Li J. Wang J. Weng W. Jia F. Li J. Phys. Chem. B 2008 112 11209 11216
79. P. Pal T. Kamilya M. Mahato G. B. Talapatra Colloids Surf., B 2009 73 122 131
80. L. Shang Y. Z. Wang J. G. Jiang S. J. Dong Langmuir 2007 23 2714 2721
81. X. E. Jiang J. G. Jiang Y. D. Jin E. K. Wang S. J. Dong Biomacromolecules 2005 6 46 53
82. G. oldák A. Musatov M. Stupák M. Sprinzl E. Sedlák Gen. Physiol. Biophys. 2005 24 279 298
83. V. M. Bolanos-Garcia S. Ramos R. Castillo J. Xicohtencatl-Cortes J. Mas-Oliva J. Phys. Chem. B 2001 105 5757 5765
84. N. Vigneshwaran A. A. Kathe P. V. Varadarajan R. P. Nachane R. H. Balasubramanya Langmuir 2007 23 7113 7117
85. B. M. Smith S. Franzen Anal. Chem. 2002 74 4076 4080
86. A. Kondyurin N. J. Nosworthy M. M. Bilek Langmuir 2011 27 6138 6148
87. E. N. Baker R. E. Hubbard Prog. Biophys. Mol. Biol. 1984 44 97 179