Gate manipulation of DNA capture into nanopores

ACS Nano

Volumn 5, Issue 10, 2011, Pages 8391-8397

  He, Yuhui ^a   Tsutsui, Makusu ^a   Fan, Chun ^b   Taniguchi, Masateru ^a   Kawai, Tomoji ^a  

^a OSAKA UNIVERSITY   (Japan)

^b PEKING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

DNA capture; gate manipulation; nanopore sequencing

Indexed keywords

CAPTURE RATE; ELECTROOSMOTIC FLOW; ERROR RATE; GATE MANIPULATION; GATE VOLTAGES; GENOME SEQUENCING; MANIPULATION SYSTEM;

DNA; ELECTRIC FIELDS; ELECTROOSMOSIS; NANOPORES;

GENE ENCODING;

ALUMINUM OXIDE; DNA; POLYMER;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CONFORMATION; ELECTRICITY; ELECTROOSMOSIS; KINETICS; METHODOLOGY; MOTION; NANOPORE;

ALUMINUM OXIDE; DNA; ELECTRICITY; ELECTROOSMOSIS; KINETICS; MODELS, MOLECULAR; MOTION; NANOPORES; NUCLEIC ACID CONFORMATION; POLYMERS;

EID: 80055020968     PISSN: 19360851     EISSN: 1936086X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/nn203186c     Document Type: Article

References (39)

1. Craighead, H. Nature 2006, 442, 387-393
2. Dekker, C. Nat. Nanotechnol. 2007, 2, 209-215
3. Zwolak, M.; Di Ventra, M. Rev. Mod. Phys. 2008, 80, 141-165
4. Branton, D.; Deamer, D. W.; Marziali, A.; Bayley, H.; Benner, S. A.; Butler, T.; Di Ventra, M.; Garaj, S.; Hibbs, A.; Huang, X.; Jovanovich, S. B.; Krstic, P. S.; Lindsay, S.; Ling, X. S.; Mastrangelo, C. H. et al. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 1146-1153
5. Clarke, J.; Wu, H.-C.; Jayasinghe, L.; Patel, A.; Reid, S.; Bayley, H. Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 265-270
6. Kasianowicz, J. J.; Brandin, E.; Branton, D.; Deamer, D. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996, 93, 13770-13773
7. Akeson, M.; Branton, D.; Kasianowicz, J. J.; Brandin, E.; Deamer, D. W. Biophys. J. 1999, 77, 3227-3233
8. Meller, A.; Nivon, L.; Brandin, E.; Golovchenko, J.; Branton, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000, 97, 1079-1084
9. Zwolak, M.; Di Ventra, M. Nano Lett. 2005, 5, 421-424
10. Lagerqvist, J.; Zwolak, M.; Di Ventra, M. Nano Lett. 2006, 6, 779-782
11. Tsutsui, M.; Taniguchi, M.; Yokota, K.; Kawai, T. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 286-290
12. Li, J.; Gershow, M.; Stein, D.; Brandin, E.; Golovchenko, J. A. Nat. Mater. 2003, 2, 611-615
13. Chen, P.; Mitsui, T.; Farmer, D. B.; Golovchenko, J.; Gordon, R. G.; Branton, D. Nano Lett. 2004, 4, 1333-1337
14. Chen, P.; Gu, J.; Brandin, E.; Kim, Y.-R.; Wang, Q.; Branton, D. Nano Lett. 2004, 4, 2293-2298
15. Venkatesan, B. M.; Shah, A. B.; Zuo, J.-M.; Bashir, R. Adv. Funct. Mater. 2010, 20, 1266-1275
16. Nakane, J.; Akeson, M.; Marziali, A. Electrophoresis 2002, 23, 2592-2601
17. Grosberg, A. Y.; Rabin, Y. J. Chem. Phys. 2010, 133, 165102
18. Wanunu, M.; Morrison, W.; Rabin, Y.; Grosberg, A. Y.; Meller, A. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 160-165
19. Wong, C. T. A.; Muthukumar, M. J. Chem. Phys. 2007, 126, 164903
20. Muthukumar, M. J. Chem. Phys. 2010, 132, 195101
21. Smeets, R. M. M.; Keyser, U. F.; Krapf, D.; Wu, M.-Y.; Dekker, N. H.; Dekker, C. Nano Lett. 2006, 6, 89-95
22. Keyser, U. F.; Koeleman, B. N.; van Dorp, S.; Krapf, D.; Smeets, R. M. M.; Lemay, S. G.; Dekker, N. H.; Dekker, C. Nat. Phys. 2006, 2, 473-477
23. Skinner, G. M.; van den Hout, M.; Broekmans, O.; Dekker, C.; Dekker, N. H. Nano Lett. 2009, 9, 2953-2960
24. van Dorp, S.; Keyser, U. F.; Dekker, N. H.; Dekker, C.; Lemay, S. G. Nat. Phys. 2009, 5, 347-351
25. Behrens, S. H.; Grier, D. G. J. Chem. Phys. 2001, 115, 6716-6721
26. Alami-Younssi, S.; Larbot, A.; Persin, M.; Sarrazin, J.; Cot, L. J. Membr. Sci. 1995, 102, 123-129
27. Ghosal, S. Phys. Rev. Lett. 2007, 98, 238104
28. Postma, H. W. C. Nano Lett. 2010, 10, 420-425
29. Garaj, S.; Hubbard, W.; Reina, A.; Kong, J.; Branton, D.; Golovchenko, J. A. Nature 2010, 467, 190-193
30. Merchant, C. A.; Healy, K.; Wanunu, M.; Ray, V.; Peterman, N.; Bartel, J.; Fischbein, M. D.; Venta, K.; Luo, Z.; Johnson, A. T. C.; Drndic, M. Nano Lett. 2010, 10, 2915-2921
31. Schneider, G. F.; Kowalczyk, S. W.; Calado, V. E.; Pandraud, G.; Zandbergen, H. W.; Vandersypen, L. M. K.; Dekker, C. Nano Lett. 2010, 10, 3163-3167
32. Min, S. K.; Kim, W. Y.; Cho, Y.; Kim, K. S. Nat. Nanotechnol. 2011, 6, 162-165
33. Prasongkit, J.; Grigoriev, A.; Pathak, B.; Ahuja, R.; Scheicher, R. H. Nano Lett. 2011, 11, 1941-1945
34. Kumara, R.; Muthukumar, M. J. Chem. Phys. 2009, 131, 194903
35. de Gennes, P.-G. J. Chem. Phys. 1974, 60, 5030
36. Nam, S.-W.; Rooks, M. J.; Kim, K.-B.; Rossnagel, S. M. Nano Lett. 2009, 9, 2044-2048
37. Nam, S.-W.; Lee, M.-H.; Lee, S.-H.; Lee, D.-J.; Rossnagel, S. M.; Kim, K.-B. Nano Lett. 2010, 10, 3324-3329
38. He, Y.; Tsutsui, M.; Fan, C.; Taniguchi, M.; Kawai, T. ACS Nano 2011, 5, 5509-5518
39. Nkodo, A. E.; Garnier, J. M.; Tinland, B.; Ren, H.; Desruisseaux, C.; McCormick, L. C.; Drouin, G.; Slater, G. W. Electrophoresis 2001, 22, 2424-2432