An optical-logic system based on cationic conjugated polymer/DNA/ intercalating dyes assembly for label-free detection of conformational conversion of DNA i-motif structure

Polymer Chemistry

Volumn 2, Issue 6, 2011, Pages 1341-1346

  Li, Juan ^a   Huang, Yan Qin ^a   Qin, Wei Sheng ^a   Liu, Xing Fen ^a   Huang, Wei ^a  

^a NANJING UNIVERSITY OF POSTS AND TELECOMMUNICATIONS   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIO-MOLECULAR; CATIONIC CONJUGATED POLYMER; CONFORMATIONAL CONVERSION; COST EFFICIENCY; ENVIRONMENTAL CHANGE; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; I-MOTIF; INTERCALATING DYE; LABEL-FREE DETECTION; LOGIC SYSTEMS; MULTIPLE LOGIC; SYSTEM-BASED;

CHEMICAL MODIFICATION; CONFORMATIONS; DNA; ENERGY TRANSFER; FLUORESCENCE; OLIGONUCLEOTIDES;

LOGIC GATES;

EID: 79956269546     PISSN: 17599954     EISSN: 17599962     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0py00375a     Document Type: Article

References (60)

1. Q. H. Liu L. M. Wang A. G. Frutos A. E. Condon R. M. Corn L. M. Smith Nature 2000 403 175 179
2. F. M. Raymo S. Giordani Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 4941 4944
3. J.-M. Montenegro E. Perez-Inestrosa D. Collado Y. Vida R. Suau Org. Lett. 2004 6 2353 2355
4. M. Moshe J. Elbaz I. Willner Nano Lett. 2009 9 1196 1200
5. M. Zhou Y. Du C. G. Chen B. L. Li D. Wen S. J. Dong E. K. Wang J. Am. Chem. Soc. 2010 132 2172 2174
6. A. P.d. Silva N. D. McClenaghan Chem.-Eur. J. 2002 8 4935 4945
7. D. Margulies G. Melman C. E. Felder R. Arad-Yellin A. Shanzer J. Am. Chem. Soc. 2004 126 15400 15401
8. H. S. Rye S. Yue D. E. Wemmer M. A. Quesada R. P. Haugland R. A. Mathies A. N. Glazer Nucleic Acids Res. 1992 20 2803 2812
9. S. J. Langford T. Yann J. Am. Chem. Soc. 2003 125 11198 11199
10. P. Ball Nature 2000 406 118 120
11. A. P.d. Silva D. P. Fox A. J. M. Huxley T. S. Moody Coord. Chem. Rev. 2000 205 41 57
12. F. M. Raymo Adv. Mater. 2002 14 401 414
13. T. Niazov R. Baron E. Katz O. Lioubashevski I. Willner Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 17160 17163
14. Y. L. Tang F. He S. Wang Y. L. Li D. B. Zhu G. C. Bazan Adv. Mater. 2006 18 2105 2110
15. A. Credi V. Balzani S. J. Langford J. F. Stoddart J. Am. Chem. Soc. 1997 119 2679 2681
16. A. Saghatelian N. H. Völcker K. M. Guckian V. S.-Y. Lin M. R. Ghadiri J. Am. Chem. Soc. 2003 125 346 347
17. M. N. Stojanovic S. Semova D. Kolpashchikov J. Macdonald C. Morgan D. Stefanovic J. Am. Chem. Soc. 2005 127 6914 6915
18. X. L. Feng X. R. Duan L. B. Liu F. D. Feng S. Wang Y. L. Li D. B. Zhu Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 5316 5321
19. A. M. Jose G. A. Soukup R. R. Breaker Nucleic Acids Res. 2001 29 1631 1637
20. G. Ashkenasy M. R. Ghadiri J. Am. Chem. Soc. 2004 126 11140 11141
21. K. E. Prehoda J. A. Scott R. D. Mullins W. A. Lim Science 2000 290 801 806
22. R. S. Braich N. Chelyapov C. Johnson P. W. K. Rothemund L. Adleman Science 2002 296 499 502
23. Y. Benenson T. Paz-Elizur R. Adar E. Keinan Z. Livneh E. Shapiro Nature 2001 414 430 434
24. N. H. Voelcker K. M. Guckian A. Saghatelian M. R. Ghadiri Small 2008 4 427 431
25. W. Yoshida Y. Yokobayashi Chem. Commun. 2007 195 197
26. J. W. Liu Y. Lu Adv. Mater. 2006 18 1667 1671
27. L. H. Wang X. F. Liu Q. Yang Q. L. Fan S. P. Song C. H. Fan W. Huang Biosens. Bioelectron. 2010 25 1838 1842
28. X. Li Y. Peng J. Ren X. Qu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 19658 19663
29. K. Gehring J. L. Leroy M. Gueron Nature 1993 363 561 565
30. S. W. Thomas G. D. Joly T. M. Swager Chem. Rev. 2007 107 1339 1386
31. U. H. F. Bunz Chem. Rev. 2000 100 1605 1644
32. C. H. Fan K. W. Plaxco A. J. Heeger J. Am. Chem. Soc. 2002 124 5642 5643
33. C. Li M. Numata M. Takeuchi S. Shinkai Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 6371 6374
34. F. D. Feng F. He L. L. An S. Wang Y. H. Li D. B. Zhu Adv. Mater. 2008 20 2959 2964
35. Q. Guo M. Lu L. A. Marky N. R. Kallenbach Biochemistry 1992 31 2451 2455
36. J. Nygren N. Svanvik M. Kubista Biopolymers 1998 46 39 51
37. B. L. Li H. Wei S. J. Dong Chem. Commun. 2007 73 75
38. B. Liu G. C. Bazan Macromol. Rapid Commun. 2007 28 1804 1808
39. Q. L. Fan Y. Zhou X. M. Lu X. Y. Hou W. Huang Macromolecules 2005 38 2927 2936
40. J. M. Benevides C. Kang G. J. Thomas Biochemistry 1996 35 5747 5755
41. L. H. Chen D. W. McBranch H. L. Wang R. Helgeson F. Wudl D. G. Whitten Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 12287 12292
42. T. Miura G. J. Thomas Biochemistry 1994 33 7848 7856
43. D. T. McQuade A. E. Pullen T. M. Swager Chem. Rev. 2000 100 2537 2574
44. J. L. Mergny Biochemistry 1999 38 1573 1581
45. A. T. Phan, M. Gueron and J. L. Leroy, in Nuclear Magnetic Resonance of Biological Macromolecules, Pt A, Academic Press Inc, San Diego, 2001, pp. 341-371
46. A. T. Phan J. L. Mergny Nucleic Acids Res. 2002 30 4618 4625
47. Y. Xu H. Sugiyama Nucleic Acids Res. 2006 34 949 954
48. Y. Q. Huang Q. L. Fan X. M. Lu C. Fang S. J. Liu L. H. Yu-Wen L. H. Wang W. Huang J. Polym. Sci., Part A: Polym. Chem. 2006 44 5778 5794
49. S. Wang B. S. Gaylord G. C. Bazan J. Am. Chem. Soc. 2004 126 5446 5451
50. Q. H. Xu S. Wang D. Korystov A. Mikhailovsky G. C. Bazan D. Moses A. J. Heeger Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 530 535
51. K. Li B. Liu Anal. Chem. 2009 81 4099 4105
52. A. J. Harwood, Basic DNA and RNA Protocols, Humana Press Totowa, NJ, 1996
53. Y. Gao C. C. Wang L. Wang H. L. Wang Langmuir 2007 23 7760 7767
54. C. D. Byrne A. J. de Mello Biophys. Chem. 1998 70 173 184
55. S. K. Pal D. Mandal K. Bhattacharyya J. Phys. Chem. B 1998 102 11017 11023
56. J. D. Shepherd M. J. Fritzler J. I. Watson J. H. van de Sande J. Rheumatol. 1978 5 391 398
57. H. Arthanari S. Basu T. L. Kawano P. H. Bolton Nucleic Acids Res. 1998 26 3724 3728
58. B. L. Feringa, Molecular Switches, Wiley-VCH Press, Weinheim, Germany, 2001
59. V. Balzani, M. Venturi and A. Credi, Molecular Devices and Machines, Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2003
60. F. Pu C. Y. Wang D. Hu Z. Z. Huang J. Ren S. Wang X. G. Qu Mol. BioSyst. 2010 6 1928 1932