Comparative analysis on the membrane proteome of Clostridium acetobutylicum wild type strain and its butanol-tolerant mutant

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 5, 2011, Pages 1660-1677

  Mao, Shaoming ^a,b   Luo, Yuanming ^a   Bao, Guanhui ^a   Zhang, Yanping ^a   Li, Yin ^a   Ma, Yanhe ^a  

^a INSTITUTE OF MICROBIOLOGY   (China)

^b CENTRAL SOUTH UNIVERSITY OF FORESTRY AND TECHNOLOGY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIA (MICROORGANISMS); CLOSTRIDIUM; CLOSTRIDIUM ACETOBUTYLICUM;

EID: 79954526956     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0mb00330a     Document Type: Article

References (103)

1. H. Dong Y. Zhang Z. Dai Y. Li PLoS One 2010 5 e9038
2. G. Sakaguchi Pharmacol. Ther. 1982 19 165 194
3. C. P. Kelly C. Pothoulakis J. T. LaMont N. Engl. J. Med. 1994 330 257 262
4. D. Paredes-Sabja M. R. Sarker Future Microbiol. 2009 4 519 525
5. I. Brook Expert Rev. Anticancer Ther. 2008 6 327 336
6. D. T. Jones D. R. Woods Microbiol. Rev. 1986 50 484 524
7. M. D. Timmons B. L. Knutson S. E. Nokes H. J. Strobel B. C. Lynn Appl. Microbiol. Biotechnol. 2009 82 929 939
8. A. Wright R. Wait S. Begum B. Crossett J. Nagy K. Brown N. Fairweather Proteomics 2005 5 2443 2452
9. S. I. Alam S. Bansod R. B. Kumar N. Sengupta L. Singh BMC Microbiol. 2009 9 162
10. T. I. Williams J. C. Combs B. C. Lynn H. J. Strobel Appl. Microbiol. Biotechnol. 2007 74 422 432
11. S. Schaffer N. Isci B. Zickner P. Durre Electrophoresis 2002 23 110 121
12. S. Mao Y. Luo T. Zhang J. Li G. Bao Y. Zhu Z. Chen Y. Zhang Y. Li Y. Ma J. Proteome Res. 2010 9 3046 3061
13. L. Sullivan G. N. Bennett J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2006 33 298 308
14. L. K. Bowles W. L. Ellefson Appl. Environ. Microbiol. 1985 50 1165 1170
15. K. Ounine H. Petitdemange G. Raval R. Gay Appl. Environ. Microbiol. 1985 49 874 878
16. S. Liu N. Qureshi New Biotechnol. 2009 26 117 121
17. K. Vollherbst-Schneck J. A. Sands B. S. Montenecourt Appl. Environ. Microbiol. 1984 47 193 194
18. R. Wildgruber G. Reil O. Drews H. Parlar A. Gorg Proteomics 2002 2 727 732
19. A. Shevchenko M. Wilm O. Vorm M. Mann Anal. Chem. 1996 68 850 858
20. E. Fernandez-Arenas V. Cabezon C. Bermejo J. Arroyo C. Nombela R. Diez-Orejas C. Gil Mol. Cell. Proteomics 2007 6 460 478
21. A. Shevchenko H. Tomas J. Havlis J. V. Olsen M. Mann Nat. Protoc. 2006 1 2856 2560
22. X. S. Jiang L. Y. Tang X. J. Cao H. Zhou Q. C. Xia J. R. Wu R. Zeng Electrophoresis 2005 26 4540 4562
23. W. Sun F. Li J. Wang D. Zheng Y. Gao Mol. Cell. Proteomics 2004 3 1194 1199
24. F. Li W. Sun Y. Gao J. Wang Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004 18 1655 1659
25. T. Chaze B. Meunier C. Chambon C. Jurie B. Picard Proteomics 2008 8 4236 4248
26. A. I. Saeed V. Sharov J. White J. Li W. Liang N. Bhagabati J. Braisted M. Klapa T. Currier M. Thiagarajan A. Sturn M. Snuffin A. Rezantsev D. Popov A. Ryltsov E. Kostukovich I. Borisovsky Z. Liu A. Vinsavich V. Trush J. Quackenbush BioTechniques 2003 34 374 378
27. M. P. Molloy B. R. Herbert M. B. Slade T. Rabilloud A. S. Nouwens K. L. Williams A. A. Gooley Eur. J. Biochem. 2000 267 2871 2881
28. N. D. Phadke M. P. Molloy S. A. Steinhoff P. J. Ulintz P. C. Andrews J. R. Maddock Proteomics 2001 1 705 720
29. K. Bunai K. Yamane J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2005 815 227 236
30. X. Chen A. K. Walker J. R. Strahler E. S. Simon S. L. Tomanicek-Volk B. B. Nelson M. C. Hurley S. A. Ernst J. A. Williams P. C. Andrews Mol. Cell. Proteomics 2006 5 306 312
31. S. Helling E. Schmitt C. Joppich T. Schulenborg S. Mullner S. Felske-Muller T. Wiebringhaus G. Becker G. Linsenmann B. Sitek P. Lutter H. E. Meyer K. Marcus Proteomics 2006 6 4506 4513
32. L. Zhang J. Xie X. Wang X. Liu X. Tang R. Cao W. Hu S. Nie C. Fan S. Liang Proteomics 2005 5 4510 4524
33. F. Chevalier Proteome Sci. 2010 8 23
34. S. Tan H. T. Tan M. C. Chung Proteomics 2008 8 3924 3932
35. A. K. Bendt A. Burkovski S. Schaffer M. Bott M. Farwick T. Hermann Proteomics 2003 3 1637 1646
36. Y. Kumar A. Khachane M. Belwal S. Das K. Somsundaram U. Tatu Proteomics 2004 4 1672 1683
37. B. D. Halligan V. Ruotti W. Jin S. Laffoon S. N. Twigger E. A. Dratz Nucleic Acids Res. 2004 32 W638 W644
38. A. P. Snijders J. Walther S. Peter I. Kinnman M. G. de Vos H. J. van de Werken S. J. Brouns J. van der Oost P. C. Wright Proteomics 2006 6 1518 1529
39. F. Huang I. Parmryd F. Nilsson A. L. Persson H. B. Pakrasi B. Andersson B. Norling Mol. Cell. Proteomics 2002 1 956 966
40. A. Krogh B. Larsson G. von Heijne E. L. Sonnhammer J. Mol. Biol. 2001 305 567 580
41. Y. Chen D. C. Indurthi S. W. Jones E. T. Papoutsakis mBio 2011 2 e00340-10
42. H. W. van Veen W. N. Konings Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 1998 1365 31 36
43. M. Crouvoisier D. Mengin-Lecreulx J. van Heijenoort FEBS Lett. 1999 449 289 292
44. L. Jones R. Carballido-López J. Errington Cell 2001 104 913 922
45. M. Doi M. Wachi F. Ishino S. Tomioka M. Ito Y. Sakagami A. Suzuki M. Matsuhashi J. Bacteriol. 1988 170 4619 4624
46. R. M. Figge A. V. Divakaruni J. W. Gober Mol. Microbiol. 2004 51 1321 1332
47. J. V. Holtje Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998 62 181 203
48. L. M. Harris N. E. Welker E. T. Papoutsakis J. Bacteriol. 2002 184 3586 3597
49. I. H. Huang M. Waters R. R. Grau M. R. Sarker FEMS Microbiol. Lett. 2004 233 233 240
50. S. R. Wilkinson D. I. Young J. G. Morris M. Young FEMS Microbiol. Rev. 1995 17 275 285
51. C. J. Paredes K. V. Alsaker E. T. Papoutsakis Nat. Rev. Microbiol. 2005 3 969 978
52. A. Ravagnani K. C. B. Jennert E. Steiner R. Grunberg J. R. Jefferies S. R. Wilkinson D. I. Young E. C. Tidswell D. P. Brown P. Youngman J. G. Morris M. Young Mol. Microbiol. 2000 37 1172 1185
53. J. C. Joly W. Wickner EMBO J. 1993 12 255 263
54. F. Narberhaus K. Giebeler H. Bahl J. Bacteriol. 1992 174 3290 3299
55. U. Sauer P. Durre J. Bacteriol. 1993 175 3394 3400
56. J. S. Terracciano E. Rapaport E. R. Kashket Appl. Environ. Microbiol. 1988 54 1989 1995
57. L. Sullivan C. Paredes E. Papoutsakis G. Bennett Enzyme Microb. Technol. 2007 42 29 43
58. M. Desvaux A. Khan A. Scott-Tucker R. R. Chaudhuri M. J. Pallen I. R. Henderson Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Res. 2005 1745 223 253
59. C. A. Tomas N. E. Welker E. T. Papoutsakis Appl. Environ. Microbiol. 2003 69 4951 4965
60. J. Nolling G. Breton M. Omelchenko K. Makarova Q. Zeng R. Gibson H. Lee J. Dubois D. Qiu J. Hitti J. Bacteriol. 2001 183 4823 4838
61. M. Lyristis Z. L. Boynton D. Petersen Z. Kan G. N. Bennett F. B. Rudolph Anaerobe 2000 6 69 79
62. N. A. Gutierrez I. S. Maddox Biotechnol. Lett. 1990 12 853 856
63. D. J. Petersen G. N. Bennett Curr. Microbiol. 1991 23 253 258
64. P. D. Cotter C. Hill Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2003 67 429 453
65. H. Kobayashi J. Biol. Chem. 1985 260 72 76
66. K. V. Alsaker C. Paredes E. T. Papoutsakis Biotechnol. Bioeng. 2010 105 1131 1147
67. J. J. Baronofsky W. J. Schreurs E. R. Kashket Appl. Environ. Microbiol. 1984 48 1134 1139
68. M. Huesemann E. Papoutsakis Biotechnol. Lett. 1986 8 37 42
69. J. S. Terracciano E. R. Kashket Appl. Environ. Microbiol. 1986 52 86 91
70. S. H. Baer D. L. Bryant H. P. Blaschek Appl. Environ. Microbiol. 1989 55 2729 2731
71. L. O. Ingram Crit. Rev. Biotechnol. 1990 9 305 319
72. C. A. Tomas J. Beamish E. T. Papoutsakis J. Bacteriol. 2004 186 2006 2018
73. A. El Zoeiby F. Sanschagrin A. Darveau J. R. Brisson R. C. Levesque J. Antimicrob. Chemother. 2003 51 531 543
74. A. El Zoeiby F. Sanschagrin P. C. Havugimana A. Garnier R. C. Levesque FEMS Microbiol. Lett. 2001 201 229 235
75. S. W. Chiu S. Y. Chen H. C. Wong Appl. Environ. Microbiol. 2008 74 7016 7022
76. M. Wachi M. Matsuhashi J. Bacteriol. 1989 171 3123 3127
77. P. Mazza E. E. Noens K. Schirner N. Grantcharova A. M. Mommaas H. K. Koerten G. Muth K. Flardh G. P. van Wezel W. Wohlleben Mol. Microbiol. 2006 60 838 852
78. T. H. Szeto S. L. Rowland L. I. Rothfield G. F. King Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 15693 15698
79. P. M. Santos D. Benndorf I. Sa-Correia Proteomics 2004 4 2640 2652
80. L. F. Zhang H. M. Yang S. X. Cui J. Hu J. Wang T. Y. Kuang B. Norling F. Huang J. Proteome Res. 2009 8 2892 2902
81. P. A. de Boer R. E. Crossley L. I. Rothfield Cell (Cambridge, Mass.) 1989 56 641 649
82. L. I. Rothfield C. R. Zhao Cell (Cambridge, Mass.) 1996 84 183 186
83. S. W. Jones C. J. Paredes B. Tracy N. Cheng R. Sillers R. S. Senger E. T. Papoutsakis GenomeBiology 2008 9 R114
84. K. V. Alsaker E. T. Papoutsakis J. Bacteriol. 2005 187 7103 7118
85. C. A. Tomas K. V. Alsaker H. P. Bonarius W. T. Hendriksen H. Yang J. A. Beamish C. J. Paredes E. T. Papoutsakis J. Bacteriol. 2003 185 4539 4547
86. K. V. Alsaker T. R. Spitzer E. T. Papoutsakis J. Bacteriol. 2004 186 1959 1971
87. A. D. Grossman Annu. Rev. Genet. 1995 29 477 508
88. E. M. Green Z. L. Boynton L. M. Harris F. B. Rudolph E. T. Papoutsakis G. N. Bennett Microbiology 1996 142 2079 2086
89. L. M. Harris R. P. Desai N. E. Welker E. T. Papoutsakis Biotechnol. Bioeng. 2000 67 1 11
90. Y. Zhao C. A. Tomas F. B. Rudolph E. T. Papoutsakis G. N. Bennett Appl. Environ. Microbiol. 2005 71 530 537
91. A. J. Sussman C. Gilvarg Annu. Rev. Biochem. 1971 40 397 408
92. S. H. Baer H. P. Blaschek T. L. Smith Appl. Environ. Microbiol. 1987 53 2854 2861
93. A. A. Herrero R. F. Gomez M. F. Roberts Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 1982 693 195 204
94. D. W. Grogan J. E. Cronan, Jr. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1997 61 429 441
95. Y. Y. Chang J. E. Cronan Mol. Microbiol. 1999 33 249 259
96. Y. S. Zhao L. A. Hindorff A. Chuang M. Monroe-Augustus M. Lyristis M. L. Harrison F. B. Rudolph G. N. Bennett Appl. Environ. Microbiol. 2003 69 2831 2841
97. L. Zhu J. Cheng B. Luo S. Feng J. Lin S. Wang J. E. Cronan H. Wang BMC Microbiol. 2009 9 119
98. L. Paoletti Y. J. Lu G. E. Schujman D. de Mendoza C. O. Rock J. Bacteriol. 2007 189 5816 5824
99. Y. Zhang Z. Wen M. P. Washburn L. Florens Anal. Chem. 2009 81 6317 6326
100. W. M. Old K. Meyer-Arendt L. Aveline-Wolf K. G. Pierce A. Mendoza J. R. Sevinsky K. A. Resing N. G. Ahn Mol. Cell. Proteomics 2005 4 1487 1502
101. H. Liu R. G. Sadygov J. R. Yates, 3rd Anal. Chem. 2004 76 4193 4201
102. B. Zybailov A. L. Mosley M. E. Sardiu M. K. Coleman L. Florens M. P. Washburn J. Proteome Res. 2006 5 2339 2347
103. X. Fu S. A. Gharib P. S. Green M. L. Aitken D. A. Frazer D. R. Park T. Vaisar J. W. Heinecke J. Proteome Res. 2008 7 845 854