Anharmonic overtone and combination states of glycine and two model peptides examined by vibrational self-consistent field theory

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 6, 2011, Pages 2001-2013

  Meng, Kuo ^a   Wang, Jianping ^a  

^a INSTITUTE OF CHEMISTRY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACETAMIDE DERIVATIVE; GLYCINE; N METHYLACETAMIDE; N-METHYLACETAMIDE; PEPTIDE FRAGMENT;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; VIBRATION;

ACETAMIDES; COMPUTER SIMULATION; GLYCINE; MODELS, CHEMICAL; MODELS, MOLECULAR; PEPTIDE FRAGMENTS; VIBRATION;

EID: 79251558153     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cp01177k     Document Type: Article

References (99)

1. S. Ataka H. Takeuchi M. Tasumi J. Mol. Struct. 1984 113 147 160
2. S. G. Stepanian I. D. Reva E. D. Radchenko M. T. S. Rosado M. L. T. S. Duarte R. Fausto L. Adamowicz J. Phys. Chem. A 1998 102 1041 1054
3. D. McNaughton C. J. Evans S. Lane C. J. Nielsen J. Mol. Spectrosc. 1999 193 104 117
4. J. Lummila O. Vaittinen P. Jungner L. Halonen A. M. Tolonen J. Mol. Spectrosc. 1997 185 296 303
5. O. Vaittinen M. Hamalainen P. Jungner K. Pulkkinen L. Halonen H. Burger O. Polanz J. Mol. Spectrosc. 1998 187 193 199
6. M. C. Asplund M. Lim R. M. Hochstrasser Chem. Phys. Lett. 2000 323 269 277
7. R. M. Hochstrasser Adv. Chem. Phys. 2006 132 1 56
8. P. Hamm M. H. Lim R. M. Hochstrasser J. Phys. Chem. B 1998 102 6123 6138
9. A. W. Smith J. Lessing Z. Ganim C. S. Peng A. Tokmakoff S. Roy T. L. C. Jansen J. Knoester J. Phys. Chem. B 2010 114 10913 10924
10. S. Bagchi C. Falvo S. Mukamel R. M. Hochstrasser J. Phys. Chem. B 2009 113 11260 11273
11. S. Sul Y. Feng U. Le D. J. Tobias N.-H. Ge J. Phys. Chem. B 2009 114 1180 1190
12. W. Xiong J. E. Laaser P. Paoprasert R. A. Franking R. J. Hamers P. Gopalan M. T. Zanni J. Am. Chem. Soc. 2009 131 18040 18041
13. C. Kolano J. Helbing M. Kozinski W. Sander P. Hamm Nature 2006 444 469 472
14. H. Maekawa C. Toniolo Q. B. Broxterman N.-H. Ge J. Phys. Chem. B 2007 111 3222 3235
15. Y. Kim J. Wang R. M. Hochstrasser J. Phys. Chem. B 2005 109 7511 7521
16. E. H. G. Backus R. Bloem P. M. Donaldson J. A. Ihalainen R. Pfister B. Paoli A. Caflisch P. Hamm J. Phys. Chem. B 2010 114 3735 3740
17. E. R. Andresen P. Hamm J. Phys. Chem. B 2009 113 6520 6527
18. J. Wang K. Cai X. Ma Chem. Phys. Chem 2009 10 2242 2250
19. M. L. Zheng D. C. Zheng J. Wang J. Phys. Chem. B 2010 114 2327 2336
20. D. B. Strasfeld Y. L. Ling R. Gupta D. P. Raleigh M. T. Zanni J. Phys. Chem. B 2009 113 15679 15691
21. P. Hamm M. Lim W. F. DeGrado R. M. Hochstrasser Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 2036 2041
22. M. T. Zanni S. Gnanakaran J. Stenger R. M. Hochstrasser J. Phys. Chem. B 2001 105 6520 6535
23. J. Wang J. Phys. Chem. B 2007 111 9193 9196
24. D. Luckhaus M. J. Coffey M. D. Fritz F. F. Crim J. Chem. Phys. 1996 104 3472 3478
25. D. L. Howard H. G. Kjaergaard J. Phys. Chem. A 2006 110 9597 9601
26. M. S. Child L. Halonen Adv. Chem. Phys. 1984 57 1 58
27. S. Hsieh B. J. Miller A. H. Sodergren H. G. Kjaergaard J. Phys. Chem. A 2007 111 5415 5421
28. K. Takahashi K. L. Plath J. L. Axson G. C. Nelson R. T. Skodje V. Vaida J. Chem. Phys. 2010 132 094305
29. V. Barone G. Festa A. Grandi N. Rega N. Sanna Chem. Phys. Lett. 2004 388 279 283
30. P. Carbonniere V. Barone Chem. Phys. Lett. 2004 399 226 229
31. V. Barone J. Chem. Phys. 2005 122 014108 014110
32. V. Barone J. Phys. Chem. A 2004 108 4146 4150
33. J. M. Bowman J. Chem. Phys. 1978 68 608 610
34. G. D. Carney L. L. Sprandel C. W. Kern Adv. Chem. Phys. 1978 37 305 379
35. R. B. Gerber M. A. Ratner Chem. Phys. Lett. 1979 68 195
36. J. M. Bowman Acc. Chem. Res. 1986 19 202 208
37. K. Yagi T. Taketsugu K. Hirao M. S. Gordon J. Chem. Phys. 2000 113 1005 1017
38. G. Rauhut H. J. Werner Phys. Chem. Chem. Phys. 2003 5 2001 2008
39. L. Pele R. B. Gerber J. Chem. Phys. 2008 128 165105
40. B. Njegic M. S. Gordon J. Chem. Phys. 2008 129 164107
41. G. M. Chaban R. B. Gerber Theor. Chem. Acc. 2008 120 273 279
42. D. M. Benoit J. Chem. Phys. 2008 129 234304
43. B. Njegic M. S. Gordon J. Chem. Phys. 2006 125 224102
44. Y. Miller G. M. Chaban R. B. Gerber J. Phys. Chem. A 2005 109 6565 6574
45. B. Brauer G. M. Chaban R. B. Gerber Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 2543 2556
46. L. Koziol Y. Wang B. J. Braams J. M. Bowman A. I. Krylov J. Chem. Phys. 2008 128 204310
47. M. B. Hansen M. Sparta P. Seidler D. Toffoli O. Christiansen J. Chem. Theory Comput. 2010 6 235 248
48. H. G. Kjaergaard D. L. Howard D. P. Schofield T. W. Robinson S. Ishiuchi M. Fujii J. Phys. Chem. A 2002 106 258 266
49. K. Takahashi M. Sugawara S. Yabushita J. Phys. Chem. A 2003 107 11092 11101
50. D. L. Howard P. Jorgensen H. G. Kjaergaard J. Am. Chem. Soc. 2005 127 17096 17103
51. V. P. Bulychev K. G. Tokhadze J. Mol. Struct. 2004 708 47 54
52. D. Luckhaus J. Chem. Phys. 2003 118 8797 8806
53. J. F. Stanton B. A. Flowers D. A. Matthews A. F. Ware G. B. Ellison J. Mol. Spectrosc. 2008 251 384 393
54. K. L. Plath K. Takahashi R. T. Skodje V. Vaida J. Phys. Chem. A 2009 113 7294 7303
55. J. Wang R. M. Hochstrasser J. Phys. Chem. B 2006 110 3798 3807
56. C. Cappelli S. Monti G. Scalmani V. Barone J. Chem. Theory Comput. 2010 6 1660 1669
57. V. Barone G. Festa A. Grandi N. Rega N. Sanna Chem. Phys. Lett. 2004 388 279 283
58. G. Wang X. Ma J. Wang Chin. J. Chem. Phys. 2009 22 563 570
59. X. Zhang M. R. Nimlos G. B. Ellison M. E. Varner J. F. Stanton J. Chem. Phys. 2007 126 174308
60. J. O. Jung R. B. Gerber J. Chem. Phys. 1996 105 10332 10348
61. G. M. Chaban J. O. Jung R. B. Gerber J. Chem. Phys. 1999 111 1823 1829
62. L. Pele B. Brauer R. B. Gerber Theor. Chem. Acc. 2007 117 69 72
63. L. S. Norris M. A. Ratner A. E. Roitberg R. B. Gerber J. Chem. Phys. 1996 105 11261 11267
64. N. Matsunaga G. M. Chaban R. B. Gerber J. Chem. Phys. 2002 117 3541 3547
65. J. Lundell J. Mol. Struct. 2002 614 87 95
66. G. M. Chaban S. S. Xantheas R. B. Gerber J. Phys. Chem. A 2003 107 4952 4956
67. A. T. Kowal J. Mol. Struc. -Theochem. 2003 625 71 79
68. C. A. Brindle G. M. Chaban R. B. Gerber K. C. Janda Phys. Chem. Chem. Phys. 2005 7 945 954
69. Y. Miller G. M. Chaban R. B. Gerber Chem. Phys. 2005 313 213 224
70. A. T. Kowal J. Chem. Phys. 2006 124 014304
71. B. Brauer F. Dubnikova Y. Zeiri R. Kosloff R. B. Gerber Spectrochim. Acta, Part A 2008 71 1438 1445
72. K. Marushkevich L. Khriachtchev J. Lundell A. V. Domanskaya M. Rasanen J. Mol. Spectrosc. 2010 259 105 110
73. M. Barbatti M. A. C. Nascimento J. Chem. Phys. 2003 119 5444 5448
74. J. M. Headrick E. G. Diken R. S. Walters N. I. Hammer R. A. Christie J. Cui E. M. Myshakin M. A. Duncan M. A. Johnson K. D. Jordan Science 2005 308 1765 1769
75. G. M. Chaban J. O. Jung R. B. Gerber J. Phys. Chem. A 2000 104 2772 2779
76. F. J. Torres B. Civalleri A. Meyer P. Musto A. R. Albunia P. Rizzo G. Guerra J. Phys. Chem. B 2009 113 5059 5071
77. Y. Futami Y. Ozaki Y. Hamada M. J. Wojcik Chem. Phys. Lett. 2009 482 320 324
78. M. E. Dunn G. C. Shields K. Takahashi R. T. Skodje V. Vaida J. Phys. Chem. A 2008 112 10226 10235
79. N. J. Wright R. B. Gerber J. Chem. Phys. 2000 112 2598 2604
80. R. B. Gerber B. Brauer S. K. Gregurick G. M. Chaban PhysChemComm 2002 5 142 150
81. S. K. Gregurick G. M. Chaban R. B. Gerber J. Phys. Chem. A 2002 106 8696 8707
82. S. Carter S. J. Culik J. M. Bowman J. Chem. Phys. 1997 107 10458 10469
83. I. Suwan R. B. Gerber Chem. Phys. 2010 373 267 273
84. D. M. Bishop B. Kirtman J. Chem. Phys. 1991 95 2646 2658
85. M. W. Schmidt K. K. Baldridge J. A. Boatz S. T. Elbert M. S. Gordon J. H. Jensen S. Koseki N. Matsunaga K. A. Nguyen S. Su T. L. Windus M. Dupuis J. A. M. Jr J. Comput. Chem. 1993 14 1347 1363
86. E. C. Fulmer F. Ding M. T. Zanni J. Chem. Phys. 2005 122 034302 034312
87. E. Hirota R. Sugisaki C. J. Nielsen G. O. Sorensen J. Mol. Spectrosc. 1974 49 251 267
88. K. Iijima K. Tanaka S. Onuma J. Mol. Struct. 1991 246 257 266
89. M. Kitano T. Fukuyama K. Kuchitsu Bull. Chem. Soc. Jpn. 1973 46 384 387
90. H. G. Kjaergaard A. L. Garden G. M. Chaban R. B. Gerber D. A. Matthews J. F. Stanton J. Phys. Chem. A 2008 112 4324 4335
91. M. Bounouar C. Scheurer Chem. Phys. 2006 323 87 101
92. G. M. Chaban J. O. Jung R. B. Gerber J. Phys. Chem. A 2000 104 10035 10044
93. G. M. Chaban R. B. Gerber J. Chem. Phys. 2001 115 1340 1348
94. J. Wang Chin. J. Chem. Phys. 2007 20 475 482
95. J. Park J.-H. Ha R. M. Hochstrasser J. Chem. Phys. 2004 121 7281 7292
96. M. Lima R. Chelli V. V. Volkov R. Righini J. Chem. Phys. 2009 130 204518
97. K. Kumar L. E. Sinks J. Wang Y. Kim R. M. Hochstrasser Chem. Phys. Lett. 2006 432 122 127
98. I. V. Rubtsov J. Wang R. M. Hochstrasser Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 5601 5606
99. Y. Tanaka K. Machida J. Mol. Spectrosc. 1976 63 306 316