Anharmonicity of amide modes

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 8, 2006, Pages 3798-3807

  Wang, Jianping ^a   Hochstrasser, Robin M ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

INFRARED SPECTROSCOPY; MOLECULAR STRUCTURE; MOLECULAR VIBRATIONS; PHASE TRANSITIONS; QUANTUM THEORY;

ANHARMONIC COUPLING; ANHARMONICITY; QUARTIC COUPLING;

ORGANIC COMPOUNDS;

EID: 33644902935     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0530092     Document Type: Article

References (57)

1. Hamm, P.; Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6123.
2. Hamm, P.; Lim, M.; DeGrado, W. F.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 2036.
3. Asplund, M. C.; Lim, M.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 2000, 323, 269.
4. Zanni, M. T.; Gnanakaran, S.; Stenger, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6520.
5. Zanni, M. T.; Ge, N.-H.; Kim, Y. S.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 11265.
6. Woutersen, S.; Hamm, P. J. Chem. Phys. 2001, 114, 2727.
7. Fang, C.; Wang, J.; Charnley, A. K.; Barber-Armstrong, W.; Smith, A. B.; Decatur, S. M.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 2003, 382, 586.
8. Fang, C.; Wang, J.; Kim, Y. S.; Charnley, A. K.; Barber-Armstrong, W.; Smith, A. B., III; Decatur, S. M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10415.
9. Mukherjee, P.; Krummel, A. T.; Fulmer, E. C.; Kass, I.; Arkin, I. T.; Zanni, M. T. J. Chem. Phys. 2004, 120, 10215.
10. Volkov, V.; Hamm, P. Biophys. J. 2004, 87, 4213.
11. Chung, H. S.; Khalil, M.; Smith, A. W.; Ganim, Z.; Tokmakoff, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 612.
12. Neugebauer, J.; Hess, B. A. J. Chem. Phys. 2003, 118, 7215.
13. Barone, V. J. Chem. Phys. 2005, 122, 014108/1.
14. Rubtsov, I. V.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 9165.
15. Kim, Y. S.; Wang, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 7511.
16. Rubtsov, I. V.; Wang, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 3384.
17. Park, J.; Ha, J.-H.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 2004, 121, 7281.
18. Hamm, P.; Hochstrasser, R. M. Structure and dynamics of proteins and peptides: femtosecond two-dimensional infrared spectroscopy. In Ultrafast Infrared and Raman Spectroscopy; Fayer, M. D., Ed.; Marcel Dekker, Inc.: New York, 2001; p 273.
19. Krimm, S.; Bandekar, J. Adv. Protein Chem. 1986, 38, 181.
20. Torii, H.; Tasumi, M. J. Chem. Phys. 1992, 96, 3379.
21. Wang, J.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 2004, 297, 195.
22. Torii, H.; Tasumi, M. J. Raman Spec. 1998, 29, 81.
23. Hamm, P.; Woutersen, S. Bull. Chem. Soc. Jpn. 2002, 75, 985.
24. Choi, J.-H.; Ham, S.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9132.
25. Moran, A.; Mukamel, S. Proc. Natl. Acad. Soc. U.S.A. 2004, 101, 506.
26. Huang, R.; Kubelka, J.; Barber-Armstrong, W.; Silva, R. A. G. D.; Decatur, S. M.; Keiderling, T. A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2346.
27. Watson, T. M.; Hirst, J. D. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 7858.
28. Bowman, J. M. Acc. Chem. Res. 1986, 19, 202.
29. Gregurick, S. K.; Liu, J. H. Y.; Brant, D. A.; Gerber, R. B. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 3476.
30. Yagi, K.; Taketsugu, T.; Hirao, K.; Gordon, M. S. J. Chem. Phys. 2000, 113, 1005.
31. Gregurick, S. K.; Chaban, G. M.; Gerber, R. B. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 8696.
32. Brauer, B.; Chaban, G. M.; Gerber, R. B. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2543.
33. Nielsen, H. H. Rev. Mod. Phys. 1951, 23, 90.
34. Califano, S. Vibrational states; John Wiley and Sons: London, 1976.
35. Clabo, J.; Allen, D.; Allen, W. D.; Remington, R. B.; Yamaguchi, Y.; Schaefer, I.; Henry, F. Chem. Phys. 1988, 123, 187.
36. Schneider, W.; Thiel, W. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 367.
37. Miller, W. H.; Hernandez, R.; Handy, N. C.; Jayatilaka, D.; Willetts, A. Chem. Phys. Lett. 1990, 172, 62.
38. Willetts, A.; Handy, N. C.; Green, W. H., Jr.; Jayatilaka, D. J. Phys. Chem. 1990, 94, 5608.
39. Yagi, K.; Hirao, K.; Taketsugu, T.; Schmidt, M. W.; Gordon, M. S. J. Chem. Phys. 2004, 121, 1383.
40. Boese, A. D.; Martin, J. M. L. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 3085.
41. Barone, V. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4146.
42. Carbonniere, P.; Barone, V. Chem. Phys. Lett. 2004, 399, 226.
43. Barone, V.; Festa, G.; Grandi, A.; Rega, N.; Sanna, N. Chem. Phys. Lett. 2004, 388, 279.
44. Martin, J. M. L.; Lee, T. J.; Taylor, P. R.; Francois, J.-P. J. Chem. Phys. 1995, 103, 2589.
45. Paizs, B.; Suhai, S. J. Comput. Chem. 1998, 19, 575.
46. Leach, A. R. Molecular Modelling: Principles and Applications; Prentice Hall: Harlow, U.K., 2000.
47. Rablen, P. R.; Lockman, J. W.; Jorgensen, W. L. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 3782.
48. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B.05; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
49. King, S.-T. J. Phys. Chem. 1971, 75, 405.
50. Ataka, S.; Takeuchi, H.; Tasumi, M. J. Mol. Struct. 1984, 113, 147.
51. Mirkin, N. G.; Krimm, S. THEOCHEM 1991, 256, 97.
52. Rubtsov, I. V.; Wang, J.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 5601.
53. Rubtsov, I. V.; Kumar, K.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 2005, 402, 439.
54. Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 7629.
55. Ham, S.; Cha, S.; Choi, J.-H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 1451.
56. Piryatinski, A.; Tretiak, S.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Raman Spectrosc. 2000, 31, 125.
57. Fang, C.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2005, in press.