Synthesis of proteins with defined posttranslational modifications using the genetic noncanonical amino acid incorporation approach

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 1, 2011, Pages 38-47

  Liu, Wenshe R ^a   Wang, Yane Shih ^a   Wan, Wei ^a  

^a TEXAS A AND M UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACID; PROTEIN;

ANIMAL; BIOLOGICAL MODEL; CHEMISTRY; GENETICS; HUMAN; METABOLISM; PHYSIOLOGY; PROTEIN PROCESSING; REVIEW;

AMINO ACIDS; ANIMALS; HUMANS; MODELS, BIOLOGICAL; PROTEIN PROCESSING, POST-TRANSLATIONAL; PROTEINS;

EUKARYOTA;

EID: 78650155287     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0mb00216j     Document Type: Review

References (82)

1. C. T. Walsh, Posttranslational Modification of Proteins: Expanding Nature's Inventory, Roberts & Company Publishers, Englewood, CO, 2005
2. C. T. Walsh S. Garneau-Tsodikova G. J. Gatto, Jr. Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 7342 7372
3. J. Luo M. Li Y. Tang M. Laszkowska R. G. Roeder W. Gu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 2259 2264
4. M. Jansson S. T. Durant E. C. Cho S. Sheahan M. Edelmann B. Kessler N. B. La Thangue Nat. Cell Biol. 2008 10 1431 1439
5. J. A. Latham S. Y. Dent Nat. Struct. Mol. Biol. 2007 14 1017 1024
6. X. J. Yang E. Seto Mol. Cell 2008 31 449 461
7. W. Gu R. G. Roeder Cell (Cambridge, Mass.) 1997 90 595 606
8. B. Dastugue L. Tichonicky J. Kruh Biochimie 1972 54 1435 1441
9. L. Hicke Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2001 2 195 201
10. J. S. Thrower L. Hoffman M. Rechsteiner C. M. Pickart EMBO J. 2000 19 94 102
11. A. J. Hoffhines E. Damoc K. G. Bridges J. A. Leary K. L. Moore J. Biol. Chem. 2006 281 37877 37887
12. L. G. Puente L. A. Megeney Methods Mol. Biol. 2008 424 365 372
13. R. H. Goodman S. Smolik Genes Dev. 2000 14 1553 1577
14. N. A. Barlev L. Liu N. H. Chehab K. Mansfield K. G. Harris T. D. Halazonetis S. L. Berger Mol. Cell 2001 8 1243 1254
15. Y. Tang W. Zhao Y. Chen Y. Zhao W. Gu Cell (Cambridge, Mass.) 2008 133 612 626
16. M. D. Simon F. Chu L. R. Racki C. C. de la Cruz A. L. Burlingame B. Panning G. J. Narlikar K. M. Shokat Cell (Cambridge, Mass.) 2007 128 1003 1012
17. X. Lu M. D. Simon J. V. Chodaparambil J. C. Hansen K. M. Shokat K. Luger Nat. Struct. Mol. Biol. 2008 15 1122 1124
18. R. Huang M. A. Holbert M. K. Tarrant S. Curtet D. R. Colquhoun B. M. Dancy B. C. Dancy Y. Hwang Y. Tang K. Meeth R. Marmorstein R. N. Cole S. Khochbin P. A. Cole J. Am. Chem. Soc. 2010 132 9986 9987
19. P. E. Dawson T. W. Muir I. Clark-Lewis S. B. Kent Science 1994 266 776 779
20. R. K. McGinty J. Kim C. Chatterjee R. G. Roeder T. W. Muir Nature 2008 453 812 816
21. R. Furter Protein Sci. 1998 7 419 426
22. L. Wang A. Brock B. Herberich P. G. Schultz Science 2001 292 498 500
23. L. Wang P. G. Schultz Angew. Chem., Int. Ed. 2004 44 34 66
24. J. W. Chin T. A. Cropp J. C. Anderson M. Mukherji Z. Zhang P. G. Schultz Science 2003 301 964 967
25. G. Srinivasan C. M. James J. A. Krzycki Science 2002 296 1459 1462
26. S. Herring A. Ambrogelly C. R. Polycarpo D. Soll Nucleic Acids Res. 2007 35 1270 1278
27. C. C. Liu H. Choe M. Farzan V. V. Smider P. G. Schultz Biochemistry 2009 48 8891 8898
28. C. C. Liu P. G. Schultz Nat. Biotechnol. 2006 24 1436 1440
29. M. J. Stone S. Chuang X. Hou M. Shoham J. Z. Zhu Nat. Biotechnol. 2009 25 299 317
30. F. R. Bettelheim J. Am. Chem. Soc. 1954 76 2838 2839
31. K. A. Martin R. Wyatt M. Farzan H. Choe L. Marcon E. Desjardins J. Robinson J. Sodroski C. Gerard N. P. Gerard Science 1997 278 1470 1473
32. C. C. Huang S. N. Lam P. Acharya M. Tang S. H. Xiang S. S. Hussan R. L. Stanfield J. Robinson J. Sodroski I. A. Wilson R. Wyatt C. A. Bewley P. D. Kwong Science 2007 317 1930 1934
33. C. C. Huang M. Venturi S. Majeed M. J. Moore S. Phogat M. Y. Zhang D. S. Dimitrov W. A. Hendrickson J. Robinson J. Sodroski R. Wyatt H. Choe M. Farzan P. D. Kwong Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 2706 2711
34. H. Choe W. Li P. L. Wright N. Vasilieva M. Venturi C. C. Huang C. Grundner T. Dorfman M. B. Zwick L. Wang E. S. Rosenberg P. D. Kwong D. R. Burton J. E. Robinson J. G. Sodroski M. Farzan Cell (Cambridge, Mass.) 2003 114 161 170
35. T. Pouyani B. Seed Cell (Cambridge, Mass.) 1995 83 333 343
36. P. P. Wilkins K. L. Moore R. P. McEver R. D. Cummings J. Biol. Chem. 1995 270 22677 22680
37. T. Young L. L. Kiessling Angew. Chem., Int. Ed. 2002 41 3449 3451
38. C. C. Liu E. Brustad W. Liu P. G. Schultz J. Am. Chem. Soc. 2007 129 10648 10649
39. G. Manning D. B. Whyte R. Martinez T. Hunter S. Sudarsanam Science 2002 298 1912 1934
40. J. Xie L. Supekova P. G. Schultz ACS Chem. Biol. 2007 2 474 478
41. L. Tong T. C. Warren S. Lukas J. Schembri-King R. Betageri J. R. Proudfoot S. Jakes J. Biol. Chem. 1998 273 20238 20242
42. J. W. Chin S. W. Santoro A. B. Martin D. S. King L. Wang P. G. Schultz J. Am. Chem. Soc. 2002 124 9026 9027
43. A. Deiters T. A. Cropp M. Mukherji J. W. Chin J. C. Anderson P. G. Schultz J. Am. Chem. Soc. 2003 125 11782 11783
44. R. Serwa I. Wilkening G. Del Signore M. Muhlberg I. Claussnitzer C. Weise M. Gerrits C. P. Hackenberger Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 8234 8239
45. R. Radi Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 4003 4008
46. K. Yokoyama U. Uhlin J. Stubbe J. Am. Chem. Soc. 2010 132 8385 8397
47. F. J. Schopfer P. R. Baker B. A. Freeman Trends Biochem. Sci. 2003 28 646 654
48. M. Sokolovsky J. F. Riordan B. L. Vallee Biochemistry 1966 5 3582 3589
49. H. Neumann J. L. Hazen J. Weinstein R. A. Mehl J. W. Chin J. Am. Chem. Soc. 2008 130 4028 4033
50. V. A. Yakovlev A. S. Bayden P. R. Graves G. E. Kellogg R. B. Mikkelsen Biochemistry 2010 49 5331 5339
51. H. Neumann S. Y. Peak-Chew J. W. Chin Nat. Chem. Biol. 2008 4 232 234
52. H. Neumann S. M. Hancock R. Buning A. Routh L. Chapman J. Somers T. Owen-Hughes J. van Noort D. Rhodes J. W. Chin Mol. Cell 2009 36 153 163
53. M. Lammers H. Neumann J. W. Chin L. C. James Nat. Chem. Biol. 2010 6 331 337
54. Y. Huang W. K. Russell W. Wan P. J. Pai D. H. Russell W. Liu Mol. Biosyst. 2010 6 683 686
55. Y. Huang W. Wan W. K. Russell P. J. Pai Z. Wang D. H. Russell W. Liu Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010 20 878 880
56. V. G. Allfrey R. Faulkner A. E. Mirsky Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1964 51 786 794
57. P. Cheung P. Lau Mol. Endocrinol. 2005 19 563 573
58. S. Chuikov J. K. Kurash J. R. Wilson B. Xiao N. Justin G. S. Ivanov K. McKinney P. Tempst C. Prives S. J. Gamblin N. A. Barlev D. Reinberg Nature 2004 432 353 360
59. J. Huang L. Perez-Burgos B. J. Placek R. Sengupta M. Richter J. A. Dorsey S. Kubicek S. Opravil T. Jenuwein S. L. Berger Nature 2006 444 629 632
60. J. Huang R. Sengupta A. B. Espejo M. G. Lee J. A. Dorsey M. Richter S. Opravil R. Shiekhattar M. T. Bedford T. Jenuwein S. L. Berger Nature 2007 449 105 108
61. T. Masatsugu K. Yamamoto Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009 381 22 26
62. J. C. Nolz T. S. Gomez D. D. Billadeau Trends Cell Biol. 2005 15 514 517
63. S. D. Taverna H. Li A. J. Ruthenburg C. D. Allis D. J. Patel Nat. Struct. Mol. Biol. 2007 14 1025 1040
64. S. He D. Bauman J. S. Davis A. Loyola K. Nishioka J. L. Gronlund D. Reinberg F. Y. Meng N. Kelleher D. G. McCafferty Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 12033 12038
65. D. P. Nguyen M. M. Garcia Alai P. B. Kapadnis H. Neumann J. W. Chin J. Am. Chem. Soc. 2009 131 14194 14195
66. D. Groff P. R. Chen F. B. Peters P. G. Schultz Chembiochem 2010 11 1066 1068
67. Y. S. Wang B. Wu Z. Wang Y. Huang W. Wan W. K. Russell P. J. Pai Y. N. Moe D. H. Russell W. R. Liu Mol. Biosyst. 2010 6 1557 1560
68. H. W. Ai J. W. Lee P. G. Schultz Chem. Commun. 2010 46 5506 5508
69. J. Wang S. M. Schiller P. G. Schultz Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 6849 6851
70. J. Guo J. Wang J. S. Lee P. G. Schultz Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 6399 6401
71. V. Chau J. W. Tobias A. Bachmair D. Marriott D. J. Ecker D. K. Gonda A. Varshavsky Science 1989 243 1576 1583
72. V. Nagy I. Dikic Biol. Chem. 2010 391 163 169
73. W. Li Y. Ye Cell. Mol. Life Sci. 2008 65 2397 2406
74. C. Chatterjee R. K. McGinty J. P. Pellois T. W. Muir Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 2814 2818
75. C. Chatterjee R. K. McGinty B. Fierz T. W. Muir Nat. Chem. Biol. 2010 6 267 269
76. J. Chen Y. Ai J. Wang L. Haracska Z. Zhuang Nat. Chem. Biol. 2010 6 270 272
77. X. Li T. Fekner J. J. Ottesen M. K. Chan Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 9184 9187
78. S. Virdee Y. Ye D. P. Nguyen D. Komander J. W. Chin Nat. Chem. Biol. 2010 6 750 757
79. M. T. Bedford S. G. Clarke Mol. Cell 2009 33 1 13
80. M. Litt Y. Qiu S. Huang Biosci. Rep. 2009 29 131 141
81. W. Wan Y. Huang Z. Wang W. K. Russell P. J. Pai D. H. Russell W. R. Liu Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 3211 3214
82. H. Neumann K. Wang L. Davis M. Garcia-Alai J. W. Chin Nature 2010 464 441 444