Microbial nickel proteins

Natural Product Reports

Volumn 27, Issue 5, 2010, Pages 681-694

  Kaluarachchi, Harini ^a   Chan Chung, Kim C ^a   Zamble, Deborah B ^a  

^a UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL PROTEIN; NICKEL;

BACTERIUM; CHEMICAL STRUCTURE; ENZYMOLOGY; METABOLISM; MOLECULAR GENETICS; REVIEW; SEQUENCE HOMOLOGY;

BACTERIA; BACTERIAL PROTEINS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NICKEL; SEQUENCE HOMOLOGY, AMINO ACID;

EID: 77951989616     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b906688h     Document Type: Review

References (136)

1. J. C. Fontecilla-Camps Struct. Bonding 1998 91 1 30
2. J. Gerendás J. C. Polacco S. K. Freyermuth B. Sattelmacher J. Plant Nutr. Soil Sci. 1999 162 241 256
3. Y. Li D. B. Zamble Chem. Rev. 2009 109 4617 4643
4. S. W. Ragsdale J. Biol. Chem. 2009 284 18571 18575
5. P. Bauerfeind R. Garner B. E. Dunn H. L. Mobley Gut 1997 40 25 30
6. R. J. Maier S. L. Benoit S. Seshadri BioMetals 2007 20 655 664
7. S. W. Ragsdale J. Inorg. Biochem. 2007 101 1657 1666
8. B. T. A. Muyssen K. V. Brix D. K. DeForest C. R. Janssen Environ. Rev. 2004 12 113 131
9. T. M. Nieminen, L. Ukonmaanaho, N. Rausch and W. Shotyk, in Metal Ions in Life Sciences, ed., A. Sigel, H. Sigel, and, R. K. O. Sigel, John Wiley and Sons, 2007, vol. 2, pp. 1-29
10. J. Kuchar R. P. Hausinger Chem. Rev. 2004 104 509 525
11. A. Rodrigue A. Chanal K. Beck M. Muller L. F. Wu J. Biol. Chem. 1999 274 13223 13228
12. K. Stingl K. Schauer C. Ecobichon A. Labigne P. Lenormand J. C. Rousselle A. Namane H. de Reuse Mol. Cell. Proteomics 2008 7 2429 2441
13. D. R. Scott E. A. Marcus Y. Wen S. Singh J. Feng G. Sachs J. Bacteriol. 2010 192 94 103
14. E. L. Benanti P. T. Chivers J. Bacteriol. 2009 191 2405 2408
15. J. L. Rowe G. L. Starnes P. T. Chivers J. Bacteriol. 2005 187 6317 6323
16. P. M. Vignais B. Billoud Chem. Rev. 2007 107 4206 4272
17. L. Casalot M. Rousset Trends Microbiol. 2001 9 228 237
18. J. H. Cummings G. T. Macfarlane J. Appl. Bacteriol. 1991 70 443 459
19. J. W. Olson R. J. Maier Science 2002 298 1788 1790
20. R. J. Maier Biochem. Soc. Trans. 2005 33 83 85
21. J. C. Fontecilla-Camps A. Volbeda C. Cavazza Y. Nicolet Chem. Rev. 2007 107 4273 4303
22. A. Volbeda J. C. Fontecilla-Camps Dalton Trans. 2003 4030 4038
23. A. Böck P. W. King M. Blokesch M. C. Posewitz Adv. Microb. Physiol. 2006 51 1 71
24. M. R. Leach D. B. Zamble Curr. Opin. Chem. Biol. 2007 11 159 165
25. A. Jacobi R. Rossmann A. Bock Arch. Microbiol. 1992 158 444 451
26. G. Winter T. Buhrke O. Lenz A. K. Jones M. Forgber B. Friedrich FEBS Lett. 2005 579 4292 4296
27. S. Löscher I. Zebger L. K. Andersen P. Hildebrandt W. Meyer-Klaucke M. Haumann FEBS Lett. 2005 579 4287 4291
28. T. Maier A. Böck Biochemistry 1996 35 10089 10093
29. R. Rossmann M. Sauter F. Lottspeich A. Bock Eur. J. Biochem. 1994 220 377 384
30. L. Forzi G. Sawers BioMetals 2007 20 565 578
31. N. Drapal A. Bock Biochemistry 1998 37 2941 2948
32. A. Magalon A. Bock J. Biol. Chem. 2000 275 21114 21120
33. A. Magalon A. Bock FEBS Lett. 2000 473 254 258
34. R. Rossmann T. Maier F. Lottspeich A. Bock Eur. J. Biochem. 1995 227 545 550
35. F. Yang W. Hu H. Xu C. Li B. Xia C. Jin J. Biol. Chem. 2007 282 3856 3863
36. T. Kumarevel T. Tanaka Y. Bessho A. Shinkai S. Yokoyama Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009 389 310 314
37. E. Theodoratou R. Huber A. Bock Biochem. Soc. Trans. 2005 33 108 111
38. J. W. Olson N. S. Mehta R. J. Maier Mol. Microbiol. 2001 39 176 182
39. M. Hube M. Blokesch A. Bock J. Bacteriol. 2002 184 3879 3885
40. M. Blokesch M. Rohrmoser S. Rode A. Bock J. Bacteriol. 2004 186 2603 2611
41. C. Fu R. J. Maier Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 1994 1184 135 138
42. W. Xia H. Li K. H. Sze H. Sun J. Am. Chem. Soc. 2009 131 10031 10040
43. R. Gamsjaeger C. K. Liew F. E. Loughlin M. Crossley J. P. Mackay Trends Biochem. Sci. 2007 32 63 70
44. A. Atanassova D. B. Zamble J. Bacteriol. 2005 187 4689 4697
45. D. C. Kennedy R. W. Herbst J. S. Iwig P. T. Chivers M. J. Maroney J. Am. Chem. Soc. 2007 129 16 17
46. S. Watanabe T. Arai R. Matsumi H. Atomi T. Imanaka K. Miki J. Mol. Biol. 2009 394
47. N. Mehta J. W. Olson R. J. Maier J. Bacteriol. 2003 185 726 734
48. T. Maier F. Lottspeich A. Bock Eur. J. Biochem. 1995 230 133 138
49. L. Rey J. Imperial J. M. Palacios T. Ruiz-Argueso J. Bacteriol. 1994 176 6066 6073
50. J. W. Olson R. J. Maier J. Bacteriol. 2000 182 1702 1705
51. N. Mehta S. Benoit R. J. Maier Microb. Pathog. 2003 35 229 234
52. T. Maier A. Jacobi M. Sauter A. Bock J. Bacteriol. 1993 175 630 635
53. C. Fu J. W. Olson R. J. Maier Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1995 92 2333 2337
54. R. Gasper A. Scrima A. Wittinghofer J. Biol. Chem. 2006 281 27492 27502
55. M. R. Leach S. Sandal H. Sun D. B. Zamble Biochemistry 2005 44 12229 12238
56. K. C. Chan Chung L. Cao A. V. Dias I. J. Pickering G. N. George D. B. Zamble J. Am. Chem. Soc. 2008 130 14056 14057
57. A. V. Dias C. M. Mulvihill M. R. Leach I. J. Pickering G. N. George D. B. Zamble Biochemistry 2008 47 11981 11991
58. J. W. Olson C. Fu R. J. Maier Mol. Microbiol. 1997 24 119 128
59. T. Eitinger M. A. Mandrand-Berthelot Arch. Microbiol. 2000 173 1 9
60. C. Wulfing J. Lombardero A. Pluckthun J. Biol. Chem. 1994 269 2895 2901
61. W. D. Roof S. M. Horne K. D. Young R. Young J. Biol. Chem. 1994 269 2902 2910
62. J. W. Zhang G. Butland J. F. Greenblatt A. Emili D. B. Zamble J. Biol. Chem. 2005 280 4360 4366
63. T. A. Knappe B. Eckert P. Schaarschmidt C. Scholz F. X. Schmid J. Mol. Biol. 2007 368 1458 1468
64. C. Scholz B. Eckert F. Hagn P. Schaarschmidt J. Balbach F. X. Schmid Biochemistry 2006 45 20 33
65. U. Weininger C. Haupt K. Schweimer W. Graubner M. Kovermann T. Bruser C. Scholz P. Schaarschmidt G. Zoldak F. X. Schmid J. Balbach J. Mol. Biol. 2009 387 295 305
66. L. Martino Y. He K. L. Hands-Taylor E. R. Valentine G. Kelly C. Giancola M. R. Conte FEBS J. 2009 276 4529 4544
67. J. W. Zhang M. R. Leach D. B. Zamble J. Bacteriol. 2007 189 7942 7944
68. F. Erdmann and G. Fischer, in Metal Ions in Life Sciences, ed., A. Sigel, H. Sigel, and, R. K. O. Sigel, John Wiley and Sons, 2007, vol. 2, pp. 501-518
69. H. Kaluarachchi D. E. K. Sutherland A. Young I. J. Pickering M. J. Stillman D. B. Zamble J. Am. Chem. Soc. 2009 131 18489 18500
70. M. R. Leach J. W. Zhang D. B. Zamble J. Biol. Chem. 2007 282 16177 16186
71. S. Hottenrott T. Schumann A. Pluckthun G. Fischer J. U. Rahfeld J. Biol. Chem. 1997 272 15697 15701
72. S. Ciurli, in Metal Ions in Life Sciences, ed., A. Sigel, H. Sigel, and, R. K. O. Sigel, John Wiley and Sons, 2007, vol. 2, pp. 241-278
73. E. L. Carter N. Flugga J. L. Boer S. B. Mulrooney R. P. Hausinger Metallomics 2009 1 207 221
74. R. A. Burne Y. Y. M. Chen Microbes Infect. 2000 2 533 542
75. E. Jabri P. A. Karplus Biochemistry 1996 35 10616 10626
76. N. C. Ha S. T. Oh J. Y. Sung K. A. Cha M. H. Lee B. H. Oh Nat. Struct. Biol. 2001 8 505 509
77. S. Suerbaum J. M. Thiberge I. Kansau R. L. Ferrero A. Labigne Mol. Microbiol. 1994 14 959 974
78. I. Kansau F. Guillain J. M. Thiberge A. Labigne Mol. Microbiol. 1996 22 1013 1023
79. S. Quiroz-Valenzuela S. C. K. Sukuru R. P. Hausinger L. A. Kuhn W. T. Heller Arch. Biochem. Biophys. 2008 480 51 57
80. Z. Chang J. Kuchar R. P. Hausinger J. Biol. Chem. 2004 279 15305 15313
81. I. S. Park R. P. Hausinger Science 1995 267 1156 1158
82. I. S. Park M. B. Carr R. P. Hausinger Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994 91 3233 3237
83. M. B. Moncrief R. P. Hausinger J. Bacteriol. 1996 178 5417 5421
84. I. S. Park R. P. Hausinger J. Bacteriol. 1995 177 1947 1951
85. A. Soriano R. P. Hausinger Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 11140 11144
86. A. Soriano G. J. Colpas R. P. Hausinger Biochemistry 2000 39 12435 12440
87. S. B. Mulrooney R. P. Hausinger FEMS Microbiol. Rev. 2003 27 239 261
88. T. G. Brayman R. P. Hausinger J. Bacteriol. 1996 178 5410 5416
89. B. Sriwanthana M. D. Island D. Maneval H. L. T. Mobley J. Bacteriol. 1994 176 6836 6841
90. S. L. Benoit N. Mehta M. V. Weinberg C. Maier R. J. Maier Microbiology 2007 153 1474 1482
91. S. L. Benoit A. L. Zbell R. J. Maier Microbiology 2007 153 3748 3756
92. P. Voland D. L. Weeks E. A. Marcus C. Prinz G. Sachs D. Scott Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 2003 284 G96 G106
93. J. C. Rain L. Selig H. De Reuse V. Battaglia C. Reverdy S. Simon G. Lenzen F. Petel J. Wojcik V. Schachter Y. Chemama A. Labigne P. Legrain Nature 2001 409 211 215
94. M. H. Lee H. S. Pankratz S. Wang R. A. Scott M. G. Finnegan M. K. Johnson J. A. Ippolito D. W. Christianson R. P. Hausinger Protein Sci. 1993 2 1042 1052
95. G. J. Colpas R. P. Hausinger J. Biol. Chem. 2000 275 10731 10737
96. N. E. Grossoehme S. B. Mulrooney R. P. Hausinger D. E. Wilcox Biochemistry 2007 46 10506 10516
97. G. J. Colpas T. G. Brayman J. McCracken M. A. Pressler G. T. Babcock L. J. Ming C. M. Colangelo R. A. Scott R. P. Hausinger JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 1998 3 150 160
98. H. K. Song S. B. Mulrooney R. Huber R. P. Hausinger J. Biol. Chem. 2001 276 49359 49364
99. S. B. Mulrooney S. K. Ward R. P. Hausinger J. Bacteriol. 2005 187 3581 3585
100. G. J. Colpas T. G. Brayman L. J. Ming R. P. Hausinger Biochemistry 1999 38 4078 4088
101. H. Remaut N. Safarov S. Ciurli J. Van Beeumen J. Biol. Chem. 2001 276 49365 49370
102. S. Ciurli N. Safarov S. Miletti A. Dikiy S. K. Christensen K. Kornetzky D. A. Bryant I. Vandenberghe B. Devreese B. Samyn H. Remaut J. van Beeumen J. Biol. Inorg. Chem. 2002 7 623 631
103. M. Stola F. Musiani S. Mangani P. Turano N. Safarov B. Zambelli S. Ciurli Biochemistry 2006 45 6495 6509
104. H. S. Won B. J. Lee J. Biochem. 2004 136 635 641
105. S. Benoit R. J. Maier J. Bacteriol. 2003 185 4787 4795
106. M. Bellucci B. Zambelli F. Musiani P. Turano S. Ciurli Biochem. J. 2009 422 91 100
107. F. Musiani B. Zambelli M. Stola S. Ciurli J. Inorg. Biochem. 2004 98 803 813
108. B. Zambelli P. Turano F. Musiani P. Neyroz S. Ciurli Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2009 74 222 239
109. B. Zambelli M. Stola F. Musiani K. De Vriendt B. Samyn B. Devreese J. Van Beeumen P. Turano A. Dikiy D. A. Bryant S. Ciurli J. Biol. Chem. 2005 280 4684 4695
110. B. Zambelli F. Musiani M. Savini P. Tucker S. Ciurli Biochemistry 2007 46 3171 3182
111. M. B. Moncrief R. P. Hausinger J. Bacteriol. 1997 179 4081 4086
112. C. E. Haas D. A. Rodionov J. Kropat D. Malasarn S. S. Merchant V. de Crecy-Lagard BMC Genomics 2009 10 470
113. S. Benoit N. Mehta G. Wang M. Gatlin R. J. Maier Microb. Pathog. 2004 36 153 157
114. C. L. Drennan T. I. Doukov S. W. Ragsdale JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2004 9 511 515
115. E. L. Hegg Acc. Chem. Res. 2004 37 775 783
116. H. K. Loke P. A. Lindahl J. Inorg. Biochem. 2003 93 33 40
117. C. L. Drennan J. Heo M. D. Sintchak E. Schreiter P. W. Ludden Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 11973 11978
118. H. Dobbek V. Svetlitchnyi L. Gremer R. Huber O. Meyer Science 2001 293 1281 1285
119. P. A. Lindahl Biochemistry 2002 41 2097 2105
120. W. B. Jeon S. W. Singer P. W. Ludden L. M. Rubio JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2005 10 903 912
121. R. K. Watt P. W. Ludden Cell. Mol. Life Sci. 1999 56 604 625
122. D. Bonam M. C. McKenna P. J. Stephens P. W. Ludden Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1988 85 31 35
123. R. L. Kerby P. W. Ludden G. P. Roberts J. Bacteriol. 1997 179 2259 2266
124. J. D. Fox R. L. Kerby G. P. Roberts P. W. Ludden J. Bacteriol. 1996 178 1515 1524
125. W. B. Jeon J. Cheng P. W. Ludden J. Biol. Chem. 2001 276 38602 38609
126. J. H. Jeoung T. Giese M. Grunwald H. Dobbek Biochemistry 2009 48 11505 11513
127. R. K. Watt P. W. Ludden J. Biol. Chem. 1998 273 10019 10025
128. P. Palumaa E. Eriste O. Njunkova L. Pokras H. Jornvall R. Sillard Biochemistry 2002 41 6158 6163
129. K. E. R. Duncan T. T. Ngu J. Chan M. T. Salgado M. E. Merrifield M. J. Stillman Exper. Biol. Med. 2006 231 1488 1499
130. S. Cun H. Li R. Ge M. C. Lin H. Sun J. Biol. Chem. 2008 283 15142 15151
131. K. Schauer C. Muller M. Carriere A. Labigne C. Cavazza H. De Reuse J. Bacteriol. 2010 192 1231 1237
132. J. V. Gilbert J. Ramakrishna F. W. Sunderman A. Wright A. G. Plaut Infect. Immun. 1995 63 2682 2688
133. Y. B. Zeng D. M. Zhang H. Y. Li H. Z. Sun JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2008 13 1121 1131
134. R. Ge R. M. Watt X. Sun J. A. Tanner Q. Y. He J. D. Huang H. Sun Biochem. J. 2006 393 285 293
135. S. Seshadri S. L. Benoit R. J. Maier J. Bacteriol. 2007 189 4120 4126
136. C. Notredame D. Higgins J. Heringa J. Mol. Biol. 2000 302 205 217