Systems biology evaluation of immune responses induced by human host defence peptide LL-37 in mononuclear cells

Molecular BioSystems

Volumn 5, Issue 5, 2009, Pages 483-496

  Mookherjee, Neeloffer ^a   Hamill, Pamela ^a   Gardy, Jennifer ^a   Blimkie, Darren ^b   Falsafi, Reza ^a   Chikatamarla, Avinash ^a   Arenillas, David J ^a   Doria, Silvana ^a   Kollmann, Tobias R ^b   Hancock, Robert E W ^a  

^a UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA   (Canada)

^b UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIMICROBIAL CATIONIC PEPTIDE; CAP18 LIPOPOLYSACCHARIDE BINDING PROTEIN; CAP18 LIPOPOLYSACCHARIDE-BINDING PROTEIN; TRANSCRIPTION FACTOR;

ARTICLE; BINDING SITE; CYTOLOGY; DENDRITIC CELL; DRUG EFFECT; EVALUATION; GENE EXPRESSION PROFILING; GENETICS; HUMAN; IMMUNOLOGY; METABOLISM; METHODOLOGY; MONOCYTE; MONONUCLEAR CELL; SIGNAL TRANSDUCTION; SYSTEMS BIOLOGY;

ANTIMICROBIAL CATIONIC PEPTIDES; BINDING SITES; DENDRITIC CELLS; GENE EXPRESSION PROFILING; HUMANS; LEUKOCYTES, MONONUCLEAR; MONOCYTES; SIGNAL TRANSDUCTION; SYSTEMS BIOLOGY; TRANSCRIPTION FACTORS;

EID: 65349122949     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b813787k     Document Type: Article

References (94)

1. R. E. W. Hancock R. Lehrer Trends Biotechnol. 1998 16 82 88
2. R. E. W. Hancock Lancet Infect. Dis. 2001 1 156 164
3. T. Ganz Nat. Rev. Immunol. 2003 3 710 720
4. D. M. Bowdish D. J. Davidson Y. E. Lau K. Lee M. G. Scott R. E. W. Hancock J. Leukocyte Biol. 2005 77 451 459
5. N. Mookherjee R. E. W. Hancock Cell. Mol. Life Sci. 2007 64 922 933
6. M. Zanetti J. Leukocyte Biol. 2004 75 39 48
7. G. H. Gudmundsson B. Agerberth J. Odeberg T. Bergman B. Olsson R. Salcedo Eur. J. Biochem. 1996 238 325 332
8. R. Bals X. Wang M. Zasloff J. M. Wilson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 9541 9546
9. I. Hosokawa Y. Hosokawa H. Komatsuzawa R. B. Goncalves N. Karimbux M. H. Napimoga M. Seki K. Ouhara M. Sugai M. A. Taubman T. Kawai Clin. Exp. Immunol. 2006 146 218 225
10. Y. J. Gordon L. C. Huang E. G. Romanowski K. A. Yates R. J. Proske A. M. McDermott Curr. Eye Res. 2005 30 385 394
11. G. Marchini S. Lindow H. Brismar B. Stabi V. Berggren A. K. Ulfgren S. Lonne-Rahm B. Agerberth G. H. Gudmundsson Br. J. Dermatol. 2002 147 1127 1134
12. F. Paulsen T. Pufe L. Conradi D. Varog M. Tsokos J. Papendieck W. Petersen J. Pathol. 2002 198 369 377
13. M. Murakami R. A. Dorschner L. J. Stern K. H. Lin R. L. Gallo Pediatr. Res. 2005 57 10 15
14. M. Murakami T. Ohtake R. A. Dorschner B. Schittek C. Garbe R. L. Gallo J. Invest. Dermatol. 2002 119 1090 1095
15. M. Murakami T. Ohtake R. A. Dorschner R. L. Gallo J. Dent. Res. 2002 81 845 850
16. B. Agerberth J. Grunewald E. Castanos-Velez B. Olsson H. Jornvall H. Wigzell A. Eklund G. H. Gudmundsson Am. J. Respir. Crit. Care Med. 1999 160 283 290
17. B. Agerberth J. Charo J. Werr B. Olsson F. Idali L. Lindbom R. Kiessling H. Jornvall H. Wigzell G. H. Gudmundsson Blood 2000 96 3086 3093
18. J. B. Cowland A. H. Johnsen N. Borregaard FEBS Lett. 1995 368 173 176
19. S. Schaller-Bals A. Schulze R. Bals Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2002 165 992 995
20. J. E. Kim B. J. Kim M. S. Jeong S. J. Seo M. N. Kim C. K. Hong B. I. Ro J. Korean Med. Sci. 2005 20 649 654
21. K. Putsep G. Carlsson H. G. Boman M. Andersson Lancet 2002 360 1144 1149
22. J. D. Heilborn M. F. Nilsson G. Kratz G. Weber O. Sorensen N. Borregaard M. Stahle-Backdahl J. Invest. Dermatol. 2003 120 379 389
23. P. Y. Ong T. Ohtake C. Brandt I. Strickland M. Boguniewicz T. Ganz R. L. Gallo D. Y. Leung New Engl. J. Med. 2002 347 1151 1160
24. S. M. Travis N. N. Anderson W. R. Forsyth C. Espiritu B. D. Conway E. P. Greenberg P. B. McCray R. I. Lehrer M. J. Welsh B. F. Tack Infect. Immun. 2000 68 2748 2755
25. J. Turner Y. Cho N. N. Dinh A. J. Waring R. I. Lehrer Antimicrob. Agents Chemother. 1998 42 2206 2214
26. O. Chertov D. F. Michiel L. Xu J. M. Wang K. Tani W. J. Murphy D. L. Longo D. D. Taub J. J. Oppenheim J. Biol. Chem. 1996 271 2935 2940
27. Y. De Q. Chen A. P. Schmidt G. M. Anderson J. M. Wang J. Wooters J. J. Oppenheim O. Chertov J. Exp. Med. 2000 192 1069 1074
28. F. Niyonsaba K. Iwabuchi A. Someya M. Hirata H. Matsuda H. Ogawa I. Nagaoka Immunology 2002 106 20 26
29. G. S. Tjabringa D. K. Ninaber J. W. Drijfhout K. F. Rabe P. S. Hiemstra Int. Arch. Allergy Immunol. 2006 140 103 112
30. G. S. Tjabringa J. Aarbiou D. K. Ninaber J. W. Drijfhout O. E. Sorensen N. Borregaard K. F. Rabe P. S. Hiemstra J. Immunol. 2003 171 6690 6696
31. M. H. Braff M. A. Hawkins A. Di Nardo B. Lopez-Garcia M. D. Howell C. Wong K. Lin J. E. Streib R. Dorschner D. Y. Leung R. L. Gallo J. Immunol. 2005 174 4271 4278
32. S. Zuyderduyn D. K. Ninaber P. S. Hiemstra K. F. Rabe J. Allergy Clin. Immunol. 2006 117 1328 1335
33. R. Koczulla G. Von Degenfeld C. Kupatt F. Krotz S. Zahler T. Gloe K. Issbrucker P. Unterberger M. Zaiou C. Lebherz A. Karl P. Raake A. Pfosser P. Boekstegers U. Welsch P. S. Hiemstra C. Vogelmeier R. L. Gallo M. Clauss R. Bals J. Clin. Invest. 2003 111 1665 1672
34. F. Niyonsaba A. Someya M. Hirata H. Ogawa I. Nagaoka Eur. J. Immunol. 2001 31 1066 1075
35. I. Nagaoka H. Tamura M. Hirata J. Immunol. 2006 176 3044 3052
36. D. J. Davidson A. J. Currie G. S. Reid D. M. Bowdish K. L. MacDonald R. C. Ma R. E. W. Hancock D. P. Speert J. Immunol. 2004 172 1146 1156
37. N. Mookherjee K. L. Brown D. M. Bowdish S. Doria R. Falsafi K. Hokamp F. M. Roche R. Mu G. H. Doho J. Pistolic J. P. Powers J. Bryan F. S. Brinkman R. E. W. Hancock J. Immunol. 2006 176 2455 2464
38. N. Mookherjee H. L. Wilson S. Doria Y. Popowych R. Falsafi J. J. Yu Y. Li S. Veatch F. M. Roche K. L. Brown F. S. Brinkman K. Hokamp A. Potter L. A. Babiuk P. J. Griebel R. E. W. Hancock J. Leukocyte Biol. 2006 80 1563 1574
39. J. Yu N. Mookherjee K. Wee D. M. Bowdish J. Pistolic Y. Li L. Rehaume R. E. W. Hancock J. Immunol. 2007 179 7684 7691
40. D. M. Bowdish D. J. Davidson D. P. Speert R. E. W. Hancock J. Immunol. 2004 172 3758 3765
41. H. Bosshart M. Heinzelmann Immunol. Lett. 2004 94 175 182
42. D. M. Bowdish D. J. Davidson R. E. W. Hancock Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2006 306 27 66
43. V. Pouillon R. Hascakova-Bartova B. Pajak E. Adam F. Bex V. Dewaste C. Van Lint O. Leo C. Erneux S. Schurmans Nat. Immunol. 2003 4 1136 1143
44. C. Chen M. Li H. Chai H. Yang W. E. Fisher Q. Yao World J. Surg. 2005 29 271 275
45. L. Chen X. Xie X. Zhang W. Jia J. Jian C. Song B. Jin Life Sci. 2003 73 2373 2382
46. C. Weber K. S. Weber C. Klier S. Gu R. Wank R. Horuk P. J. Nelson Blood 2001 97 1144 1146
47. B. Bieritz P. Spessotto A. Colombatti A. Jahn F. Prols A. Hartner Kidney Int. 2003 64 119 127
48. K. A. Kopciuk L. Briollais F. Demenais S. B. Bull BMC Genet. 2003 4 Suppl 1 S84
49. D. J. Lynn G. L. Winsor C. Chan N. Richard M. R. Laird A. Barsky J. L. Gardy F. M. Roche T. H. W. Chan N. Shah R. Lo M. Naseer J. Que M. Yau M. Acab D. Tulpan M. Whiteside A. Chikatamarla B. Mah T. M. Munzner K. Hokamp R. E. W. Hancock F. S. L. Brinkman Mol. Syst. Biol. 2008 4 218 226
50. P. Shannon A. Markiel O. Ozier N. S. Baliga J. T. Wang D. Ramage N. Amin B. Schwikowski T. Ideker Genome Res. 2003 13 2498 2504
51. Y. Miyamoto J. Yamauchi N. Mizuno H. Itoh J. Biol. Chem. 2004 279 34336 34342
52. J. A. Frost S. Xu M. R. Hutchison S. Marcus M. H. Cobb Mol. Cell. Biol. 1996 16 3707 3713
53. C. M. Lee D. Onesime C. D. Reddy N. Dhanasekaran E. P. Reddy Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 14189 14194
54. M. Kluppel J. L. Wrana Bioessays 2005 27 115 118
55. M. Zhang C. H. Lee D. D. Luo A. Krupa D. Fraser A. Phillips J. Biol. Chem. 2007 282 28639 28647
56. C. A. Ambler F. M. Watt Dev. Dyn. 2007 236 1595 1601
57. T. Takata F. Ishikawa Biochem. Biophys. Res. Commun. 2003 301 250 257
58. D. J. Jung H. S. Sung Y. W. Goo H. M. Lee O. K. Park S. Y. Jung J. Lim H. J. Kim S. K. Lee T. S. Kim J. W. Lee Y. C. Lee Mol. Cell. Biol. 2002 22 5203 5211
59. D. Yang O. Chertov J. J. Oppenheim J. Leukocyte Biol. 2001 69 691 697
60. K. A. Roebuck L. R. Carpenter V. Lakshminarayanan S. M. Page J. N. Moy L. L. Thomas J. Leukocyte Biol. 1999 65 291 298
61. S. J. Ho Sui J. R. Mortimer D. J. Arenillas J. Brumm C. J. Walsh B. P. Kennedy W. W. Wasserman Nucleic Acids Res. 2005 33 3154 3164
62. A. Sandelin W. Alkema P. Engstrom W. W. Wasserman B. Lenhard Nucleic Acids Res. 2004 32 D91 D94
63. V. Matys O. V. Kel-Margoulis E. Fricke I. Liebich S. Land A. Barre-Dirrie I. Reuter D. Chekmenev M. Krull K. Hornischer N. Voss P. Stegmaier B. Lewicki-Potapov H. Saxel A. E. Kel E. Wingender Nucleic Acids Res. 2006 34 D108 D110
64. Y. Ueda Y. Su A. Richmond Melanoma Res. 2007 17 91 103
65. K. L. Wright T. L. Moore B. J. Vilen A. M. Brown J. P. Ting J. Biol. Chem. 1995 270 20978 20986
66. J. Ye M. Cippitelli L. Dorman J. R. Ortaldo H. A. Young Mol. Cell. Biol. 1996 16 4744 4753
67. J. Ye X. Zhang Z. Dong Mol. Cell. Biol. 1996 16 157 167
68. K. Kandler R. Shaykhiev P. Kleemann F. Klescz M. Lohoff C. Vogelmeier R. Bals Int. Immunol. 2006 18 1729 1736
69. K. N. Couper D. G. Blount E. M. Riley J. Immunol. 2008 180 5771 5777
70. M. Tone M. J. Powell Y. Tone S. A. Thompson H. Waldmann J. Immunol. 2000 165 286 291
71. W. Ma W. Lim K. Gee S. Aucoin D. Nandan M. Kozlowski F. Diaz-Mitoma A. Kumar J. Biol. Chem. 2001 276 13664 13674
72. M. G. Scott E. Dullaghan N. Mookherjee N. Glavas M. Waldbrook A. Thompson A. Wang K. Lee S. Doria P. Hamill J. J. Yu Y. Li O. Donini M. M. Guarna B. B. Finlay J. R. North R. E. W. Hancock Nat. Biotechnol. 2007 25 465 472
73. R. Lande J. Gregorio V. Facchinetti B. Chatterjee Y. H. Wang B. Homey W. Cao Y. H. Wang B. Su F. O. Nestle T. Zal I. Mellman J. M. Schröder Y. J. Liu M. Gilliet Nature 2007 449 564 569
74. A. Fischer M. Gessler Nucleic Acids Res. 2007 35 4583 4596
75. H. Muniyappa K. C. Das Cell. Signalling 2008 20 675 683
76. P. Henklova R. Vrzal B. Papouskova P. Bednar P. Jancova E. Anzenbacherova J. Ulrichova P. Maurel P. Pavek Z. Dvorak Eur. J. Pharmacol. 2008 593 16 23
77. B. Schmeck K. Moog J. Zahlten V. van Laak P. D. N'Guessan B. Opitz S. Rosseau N. Suttorp S. Hippenstiel Respir. Res. 2006 7 98 106
78. S. F. Chou S. W. Chang J. L. Chuang Invest. Ophthalmol. Visual Sci. 2007 48 2009 2016
79. E. Hoffmann O. Dittrich-Breiholz H. Holtmann M. Kracht J. Leukocyte Biol. 2002 72 847 855
80. J. Yao N. Mackman T. S. Edgington S. T. Fan J. Biol. Chem. 1997 272 17795 17801
81. C. L. Newell A. B. Deisseroth G. Lopez-Berestein J. Leukocyte Biol. 1994 56 27 35
82. K. L. Rhoades S. H. Golub J. S. Economou J. Biol. Chem. 1992 267 22102 22107
83. K. L. Rhoades S. Cai S. H. Golub J. S. Economou Cell. Immunol. 1995 161 125 131
84. E. Y. Tsai J. Yie D. Thanos A. E. Goldfeld Mol. Cell. Biol. 1996 16 5232 5244
85. X. Zhang D. T. Odom S. H. Koo M. D. Conkright G. Canettieri J. Best H. Chen R. Jenner E. Herbolsheimer E. Jacobsen S. Kadam J. R. Ecker B. Emerson J. B. Hogenesch T. Unterman R. A. Young M. Montminy Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 4459 4464
86. X. Li P. E. Massa A. Hanidu G. W. Peet P. Aro A. Savitt S. Mische J. Li K. B. Marcu J. Biol. Chem. 2002 277 45129 45140
87. N. D. Perkins Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2007 8 49 62
88. G. Xiao A. B. Rabson W. Young G. Qing Z. Qu Cytokine Growth Factor Rev. 2006 17 281 293
89. Q. Li I. M. Verma Nat. Rev. Immunol. 2002 2 725 734
90. S. P. Perfetto D. Ambrozak R. Nguyen P. Chattopadhyay M. Roederer Nat. Protocols 2006 1 1522 1530
91. T. J. Hubbard B. L. Aken K. Beal B. Ballester M. Caccamo Y. Chen L. Clarke G. Coates F. Cunningham T. Cutts T. Down S. C. Dyer S. Fitzgerald J. Fernandez-Banet S. Graf S. Haider M. Hammond J. Herrero R. Holland K. Howe Nucleic Acids Res. 2007 35 D610 D617
92. F. M. Roche K. Hokamp M. Acab L. A. Babiuk R. E. W. Hancock F. S. L. Brinkman Nucleic Acids Res. 2004 32 W471 W474
93. B. Zhang D. Schmoyer S. Kirov J. Snoddy BMC Bioinformatics 2004 5 16
94. M. W. Pfaffl Nucleic Acids Res. 2001 29 e45