Temporal metabonomic modeling of L-arginine-lnduced exocrine pancreatitis

Journal of Proteome Research

Volumn 7, Issue 10, 2008, Pages 4435-4445

  Bohus, Eszter ^a   Coen, Muireann ^b   Keun, Hector C ^b   Ebbels, Timothy M D ^b   Beckonert, Oiaf ^b   Lindon, John C ^b   Holmes, Elaine ^b   Noszal, Béla ^a   Nicholson, Jeremy K ^b  

^a SEMMELWEIS UNIVERSITY   (Hungary)

^b IMPERIAL COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

Cresols; Gu microbiota; L arginine; Metabonomics; NMR; Pancreatic toxicity; Pancreatitis; Pattern recognition; Surrogate biomarkers; Trajectory analysis

Indexed keywords

ARGININE; UREA; BIOLOGICAL MARKER;

AMINO ACID METABOLISM; ANIMAL EXPERIMENT; ANIMAL MODEL; ANIMAL TISSUE; ARTICLE; METABOLIC PARAMETERS; NONHUMAN; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PANCREAS FUNCTION; PANCREATITIS; PRIORITY JOURNAL; RAT; SPRAGUE DAWLEY RAT; TOXICOKINETICS; URINALYSIS; ANIMAL; BIOLOGICAL MODEL; BLOOD; CHEMICALLY INDUCED DISORDER; HUMAN; LIVER; MALE; METABOLISM; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PATHOLOGY; RANDOMIZATION; URINE;

ANIMALIA; RATTUS;

ANIMALS; ARGININE; BIOLOGICAL MARKERS; HUMANS; LIVER; MALE; METABOLISM; MODELS, BIOLOGICAL; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PANCREATITIS; RANDOM ALLOCATION; RATS; RATS, SPRAGUE-DAWLEY;

EID: 55949097069     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr800407j     Document Type: Article

References (44)

1. Nicholson, J. K.; Lindon, J. C.; Holmes, E. Xenobiotica 1999, 29, 1181-1189.
2. Nicholson, J. K.; Connelly, J.; Lindon, J. C; Holmes, E. Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 153-161.
3. Nicholls, A. W.; Holmes, E.; Lindon, J. C; Shockcor, J. P.; Farrant, R. D.; Haselden, J. N.; Damment, S. J.; Waterfield, C. J.; Nicholson, J. K. Chem. Res. Toxicol. 2001, 14, 975-987.
4. Coen, M.; Hong, Y. S.; Clayton, T. A.; Rohde, C. M.; Pearce, J. T.; Reily, M. D.; Robertson, D. G.; Holmes, E.; Lindon, J. C; Nicholson, J. K. J. Proteome Res. 2007, 6, 2711-2719.
5. Coen, M.; Holmes, E.; Lindon, J. C; Nicholson, J. K. Chem. Res. Toxicol. 2008, 21, 9-27.
6. Rakieten, N.; Rakieten, L. M.; Nadkarni, M. V. Cancer Chemother. Rep. 1963, 91.
7. Hegyi, P.; Rakonczay, Z.; Sari, R.; Gog, G; Lonovics, J.; Takacs, T.; Czako, L. World J. Gastroenterol 2004, 10, 2003-2009.
8. Lindon, J. C; Nicholson, J. K.; Holmes, E.; Antti, H.; Bollard, M. E.; Keun, H.; Beckonert, O.; Ebbels, T. M.; Reily, M. D.; Robertson, D.; Stevens, G. J.; Luke, P.; Breau, A. P.; Cantor, G. H.; Bible, R. H.; Niederhauser, U.; Senn, H.; Schlotterbeck, G.; Sidelmann, U. G.; Laursen, S. M.; Tymiak, A.; Car, B. D.; Lehman-McKeeman, L.; Colet, J. M.; Loukaci, A.; Thomas, C. Toxicol. Appl. Pharmacol. 2003, 187, 137-146.
9. Lindon, J. C.; Holmes, E.; Nicholson, J. K. Expert Rev. Mol. Diagn. 2004, 4, 189-199.
10. Mortishire-Smith, R. J.; Skiles, G. L.; Lawrence, J. W.; Spence, S.; Nicholls, A. W.; Johnson, B. A.; Nicholson, J. K. Chem. Res. Toxicol. 2004, 17, 165-173.
11. Dieterle, F.; Schlotterbeck, G.; Binder, M.; Ross, A.; Suter, L.; Senn, H. Chem. Res. Toxicol. 2007, 20, 1291-1299.
12. Nicholls, A. W.; Caddick, S.; Wilson, I. D.; Farrant, R. D.; Lindon, J. C; Nicholson, J. K. Biochem. Pharmacol. 1995, 49, 1155-1164.
13. Lindon, J. C; Keun, H. C; Ebbels, T. M.; Pearce, J. M.; Holmes, E.; Nicholson, J. K. Pharmacogenomics 2005, 6, 691-699.
14. Ebbels, T. M. D.; Keun, H. C; Beckonert, O. P.; Bollard, M. E.; Lindon, J. C; Holmes, E.; Nicholson, J. K. J. Proteome Res. 2007, 6, 4407-4422.
15. Lindon, J. C.; Nicholson, J. K.; Holmes, E.; Keun, H. C; Craig, A.; Pearce, J. T.; Bruce, S. J.; Hardy, N.; Sansone, S. A.; Antti, H.; Jonsson, P.; Daykin, C; Navarange, M.; Beger, R. D.; Verheij, E. R.; Amberg, A.; Baunsgaard, D.; Cantor, G. H.; Lehman-McKeeman, L.; Earll, M.; Wold, S.; Johansson, E.; Haselden, J. N.; Kramer, K.; Thomas, C; Lindberg, J.; Schuppe-Koistinen, I.; Wilson, I. D.; Reily, M. D.; Robertson, D. G.; Senn, H.; Krotzky, A.; Kochhar, S.; Powell, J.; van der Ouderaa, F.; Plumb, R.; Schaefer, H.; Spraul, M. Standard Metabolic Reporting Structures working group. Nat. Biotechnol. 2005, 23, 833-838.
16. Beckonert, O.; Keun, H. C; Ebbels, T. M.; Bundy, J.; Holmes, E.; Lindon, J. C; Nicholson, J. K. Nat. Protoc. 2007, 2, 2692-2703.
17. Morris, S. M. Am. J. Clin. Nutr. 2006, 83, 508S-512S.
18. Morris, S. M. J Nutr. 2007, 137, 1602S-1609S.
19. Wu, G.; Morris, S. M., Jr, Biochem. J. 1998, 336 (Pt 1), 1-17.
20. Czako, L.; Takacs, T.; Varga, I. S.; Tiszlavicz, L.; Hai, D. Q.; Hegyi, P.; Matkovics, B.; Lonovics, J. Dig. Dis. Sci. 1998, 43, 1770-1777.
21. Takacs, T.; Czako, L.; Morschl, E.; Laszlo, F.; Tiszlavicz, L.; Rakonczay, Z., Jr; Lonovics, J. Pancreas 2002, 25, 277-282.
22. Chan, Y. C. B. S.; Leung, P. S. Pancreas 2007, 34, 1-14.
23. Nicholson, J. K. Mol. Syst. Biol. 2006, 2, 52.
24. Clayton, T. A.; Lindon, J. C; Cloarec, O.; Antti, H.; Charuel, C; Hanton, G.; Provost, I. P.; Le Net, J. L.; Baker, D.; Walley, R. J.; Everett, J. R.; Nicholson, J. K. Nature 2006, 440, 1073-1077.
25. Li, H.; Ni, Y; Su, M.; Qiu, Y.; Zhou, M.; Qiu, M.; Zhao, A.; Zhao, L.; Jia, W. J. Proteome Res. 2007, 6, 1364-1370.
26. Nicholson, J. K.; Foxall, P. J.; Spraul, M.; Farrant, R. D.; Lindon, J. C. Anal. Chem. 1995, 67, 793-811.
27. Dieterle, F.; Ross, A.; Schlotterbeck, G.; Senn, H. Anal. Chem. 2006, 78, 4281-4290.
28. Trygg, J.; Holmes, E.; Lundstedt, T. J. Proteome Res. 2007, 6, 469- 479.
29. Cloarec, O.; Dumas, M. E.; Trygg, J.; Craig, A.; Barton, R. H.; Lindon, J. C; Nicholson, J. K.; Holmes, E. Anal. Chem. 2005, 77, 517-526.
30. Cloarec, O.; Dumas, M. E.; Craig, A.; Barton, R. H.; Trygg, J.; Hudson, J.; Blancher, C; Gauguier, D.; Lindon, J. C; Holmes, E.; Nicholson, J. Anal. Chem. 2005, 77, 1282-1289.
31. Simpson, D. P. Am. J. Physiol. 1983, 244, F223-34.
32. Hamm, L. L. Kidney Int. 1990, 38, 728-735.
33. Nicholson, J. K.; Wilson, I. D. Nat. Rev. Drug Discovery 2003, 2, 668-676.
34. Holmes, E.; Bonner, F. W.; Sweatman, B. C; Lindon, J. C; Beddell, C. R.; Rahr, E.; Nicholson, J. K. Mol. Pharmacol. 1992, 42, 922- 930.
35. Boger, R. H.; Bode-Boger, S. M. Anna. Rep. Pharmacol. Toxicol. 2001, 41, 79-99.
36. Donaldson, R. M. Am. J. Physiol. 1962, 202, 289-292.
37. Smith, E. A.; Macfarlane, G. T. J. Appl. Bacteriol. 1996, 81, 288- 302.
38. Xu, Z. R.; Hu, C. H.; Wang, M. Q. J. Gen. Appl. Microbiol. 2002, 48, 83-90.
39. Vanholder, R.; De Smet, R.; Lesaffer, G. Nephrol., Dial, Transplant. 1999, 14, 2813-2815.
40. Olah, A.; Belagyi, T.; Issekutz, A.; Gamal, M. E.; Bengmark, S. Br. J. Surg. 2002, 89, 1103-1107.
41. Mangiante, G.; Colucci, G.; Canepari, P.; Bassi, C; Nicoli, N.; Casaril, A.; Marinello, P.; Signoretto, C.; Bengmark, S. Dig. Surg. 2001, 18, 47-50.
42. Muftuoglu, M. A.; Isikgor, S.; Tosun, S.; Saglam, A. Eur. J. Clin. Nutr. 2006, 60, 464-468.
43. Bassi, C.; Mangiante, G.; Falconi, M.; Salvia, R.; Frigerio, I.; Pederzoli, P. J. Hepatobiliary Pancreatic Surg. 2001, 8, 211-215.
44. Besselink, M. G.; van Santvoort, H. C.: Buskens, E.; Boermeester, M. A.; van Goor, H.; Timmerman, H. M.; Nieuwenhuijs, V. B.; Bollen, T. L.; van Ramshorst, B.; Witteman, B. J.; Rosman, C.; Ploeg, R. J.; Boermeester, M. A.; Schaapherder, A. F.; Dejong, C. H.; Wahab, P. J.; van Laarhoven, C. J.; van der Harst, E.; van Eijck, C. H.; Cuesta, M. A.; Akkermans, L. M.; Gooszen, H. G. Dutch Acute Pancreatitis Study Group. Lancet 2008, 371, 651-659.