-
3
-
-
0001981310
-
Mechanisms of phosphoryl transfer
-
Gandour, R. D, Ed, Plenum: New York
-
Benkovic, S. J.; Schray, K. J. Mechanisms of phosphoryl transfer. In Transition States of Biochemical Processes; Gandour, R. D., Ed.; Plenum: New York, 1978.
-
(1978)
Transition States of Biochemical Processes
-
-
Benkovic, S.J.1
Schray, K.J.2
-
10
-
-
33845470133
-
-
Buchwald, S. L.; Friedman, J. M.; Knowles, J. R. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 4911.
-
(1984)
J. Am. Chem. Soc
, vol.106
, pp. 4911
-
-
Buchwald, S.L.1
Friedman, J.M.2
Knowles, J.R.3
-
11
-
-
0000546527
-
-
Friedman, J. M.; Freeman, S.; Knowles, J. R. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 1268.
-
(1988)
J. Am. Chem. Soc
, vol.110
, pp. 1268
-
-
Friedman, J.M.1
Freeman, S.2
Knowles, J.R.3
-
18
-
-
0043023392
-
-
Valiev, M.; Kawai, R.; Adams. J. A.; Weare, J. H. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9926.
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc
, vol.125
, pp. 9926
-
-
Valiev, M.1
Kawai, R.2
Adams, J.A.3
Weare, J.H.4
-
19
-
-
1442324695
-
-
Shurki, A.; Warshel, A. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2004, 55, 1.
-
(2004)
Proteins: Struct., Funct., Genet
, vol.55
, pp. 1
-
-
Shurki, A.1
Warshel, A.2
-
20
-
-
13444303958
-
-
Cheng, Y.; Zhang, Y.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1553.
-
(2005)
Am. Chem. Soc
, vol.127
, pp. 1553
-
-
Cheng, Y.1
Zhang, Y.2
McCammon, J.A.J.3
-
21
-
-
23044445638
-
-
Grigorenko, B. L.; Nemukhin, A. V.; Topol, I. A.; Cachau, R. E.; Burt, S. K. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2005, 60, 495.
-
(2005)
Proteins: Struct., Funct., Genet
, vol.60
, pp. 495
-
-
Grigorenko, B.L.1
Nemukhin, A.V.2
Topol, I.A.3
Cachau, R.E.4
Burt, S.K.5
-
22
-
-
33845985649
-
-
Grigorenko, B. L.; Nemukhin, A. V.; Shadrina, M. S.; Topol, I. A.; Burt, S. K. Proteins: Struct., Funct. Genet. 2007, 66, 456.
-
(2007)
Proteins: Struct., Funct. Genet
, vol.66
, pp. 456
-
-
Grigorenko, B.L.1
Nemukhin, A.V.2
Shadrina, M.S.3
Topol, I.A.4
Burt, S.K.5
-
23
-
-
0023785036
-
-
Bowman, E.; McQueney, M.; Barry, R. J.: Dunaway-Mariano, D. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 5575.
-
(1988)
J. Am. Chem. Soc
, vol.110
, pp. 5575
-
-
Bowman, E.1
McQueney, M.2
Barry, R.J.3
Dunaway-Mariano, D.4
-
24
-
-
0024299578
-
-
Seidel, H. M.; Freeman, S.; Seto, H.; Knowles, J. R. Nature 1988, 335, 457.
-
(1988)
Nature
, vol.335
, pp. 457
-
-
Seidel, H.M.1
Freeman, S.2
Seto, H.3
Knowles, J.R.4
-
25
-
-
0025087285
-
-
Seidel, H. M.; Freeman, S.; Schwalbe, C. H.; Knowles, J. R. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 8149.
-
(1990)
J. Am. Chem. Soc
, vol.112
, pp. 8149
-
-
Seidel, H.M.1
Freeman, S.2
Schwalbe, C.H.3
Knowles, J.R.4
-
27
-
-
23144449292
-
-
Zulewski. R, Skolik, J. J, Eds, Elsevier: Amsterdam
-
Mastelerz, P. In Natural Products Chemistry; Zulewski. R., Skolik, J. J., Eds.; Elsevier: Amsterdam, 1984.
-
(1984)
Natural Products Chemistry
-
-
Mastelerz, P.1
-
28
-
-
33751499026
-
-
McQueney, M. S.; Lee, S.-L.; Swartz, W. H.; Ammon, H. L.; Mariano, P. S.; Dunaway-Mariano, D. J. Org. Chem. 1991, 56, 7121.
-
(1991)
J. Org. Chem
, vol.56
, pp. 7121
-
-
McQueney, M.S.1
Lee, S.-L.2
Swartz, W.H.3
Ammon, H.L.4
Mariano, P.S.5
Dunaway-Mariano, D.6
-
30
-
-
0032549018
-
-
Kim, A.; Kim, J.; Martin, B. M.; Dunaway-Mariano, D. J. Biol. Chem. 1998, 273, 4443.
-
(1998)
J. Biol. Chem
, vol.273
, pp. 4443
-
-
Kim, A.1
Kim, J.2
Martin, B.M.3
Dunaway-Mariano, D.4
-
31
-
-
0033607218
-
-
Jia, Y.; Lu, Z.; Huang, K.; Herzberg. O.; Dunaway-Mariano, D. Biochemistry 1999, 38, 14165.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 14165
-
-
Jia, Y.1
Lu, Z.2
Huang, K.3
Herzberg, O.4
Dunaway-Mariano, D.5
-
32
-
-
0001311584
-
-
Huang, K.; Li, Z.; Jia, Y.; Dunaway-Mariano, D.; Herzberg, O. Structure 1999, 7, 539.
-
(1999)
Structure
, vol.7
, pp. 539
-
-
Huang, K.1
Li, Z.2
Jia, Y.3
Dunaway-Mariano, D.4
Herzberg, O.5
-
33
-
-
0037154102
-
-
Herzberg, O.; Chen, C. C. H.; Liu, S.; Tempczyk, A.; Howard, A.; Wei, M.; Ye, D.; Dunaway-Mariano, D. Biochemistry 2002, 41, 780.
-
(2002)
Biochemistry
, vol.41
, pp. 780
-
-
Herzberg, O.1
Chen, C.C.H.2
Liu, S.3
Tempczyk, A.4
Howard, A.5
Wei, M.6
Ye, D.7
Dunaway-Mariano, D.8
-
34
-
-
0037072290
-
-
Liu, S.; Lu, Z.; Jia, Y.; Dunaway-Mariano, D.; Herzberg, O. Biochemistry 2002, 41, 10270.
-
(2002)
Biochemistry
, vol.41
, pp. 10270
-
-
Liu, S.1
Lu, Z.2
Jia, Y.3
Dunaway-Mariano, D.4
Herzberg, O.5
-
35
-
-
14344258111
-
-
Liu, S.; Lu, Z.; Han, Y.; Jia, Y.; Howard, A.; Dunaway-Mariano. D.; Herzberg, O. Biochemistry 2004, 43, 4447.
-
(2004)
Biochemistry
, vol.43
, pp. 4447
-
-
Liu, S.1
Lu, Z.2
Han, Y.3
Jia, Y.4
Howard, A.5
Dunaway-Mariano, D.6
Herzberg, O.7
-
37
-
-
0346726109
-
-
Garcia-Viloca, M.; Gao, J.; Karplus, M.; Truhlar, D. G. Science 1004, 303, 186.
-
Science
, vol.1004
, Issue.303
, pp. 186
-
-
Garcia-Viloca, M.1
Gao, J.2
Karplus, M.3
Truhlar, D.G.4
-
38
-
-
84961974252
-
-
Xu, D.; Guo, H.; Liu, Y.; York, D. M. J. Phys. Chem. 2005, B109, 13827.
-
(2005)
J. Phys. Chem
, vol.B109
, pp. 13827
-
-
Xu, D.1
Guo, H.2
Liu, Y.3
York, D.M.4
-
42
-
-
2942667708
-
-
Gregersen, B. A.; Lopez, X.; York, D. M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 7504.
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc
, vol.126
, pp. 7504
-
-
Gregersen, B.A.1
Lopez, X.2
York, D.M.3
-
43
-
-
33645665732
-
-
Grigorenko, B. L.; Rogov, A. V.; Nemukhin, A. V. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 4407.
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, pp. 4407
-
-
Grigorenko, B.L.1
Rogov, A.V.2
Nemukhin, A.V.3
-
44
-
-
34249318721
-
-
Zhang, L.; Xie, D.; Xu, D.; Guo, H. Chem. Commun. 2007, 1638.
-
(2007)
Chem. Commun
, pp. 1638
-
-
Zhang, L.1
Xie, D.2
Xu, D.3
Guo, H.4
-
45
-
-
84962367344
-
Methods and applications of combined quantum mechanical and molecular mechanical potentials
-
Lipkowitz, K. B, Boyd, D. B, Eds, VCH: New York
-
Gao, J. Methods and applications of combined quantum mechanical and molecular mechanical potentials. In Rev. Comput. Chem.; Lipkowitz, K. B., Boyd, D. B., Eds.; VCH: New York, 1996; Vol. 7, pp 119.
-
(1996)
Rev. Comput. Chem
, vol.7
, pp. 119
-
-
Gao, J.1
-
49
-
-
0000145441
-
-
Zhang, Y.; Liu, H.; Yang, W. J. Chem. Phys. 2000, 112, 3483.
-
(2000)
J. Chem. Phys
, vol.112
, pp. 3483
-
-
Zhang, Y.1
Liu, H.2
Yang, W.3
-
54
-
-
33646356998
-
-
Riccardi, D.; Schaefer, P.; Yang, Y.; Yu, H.; Ghosh, N.; Prat-Resina, X.; Konig, P.; Li, G.; Xu, D.; Guo, H.; Elstener, M.; Cui, Q. J. Phys. Chem. B2006, 110, 6458.
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, pp. 6458
-
-
Riccardi, D.1
Schaefer, P.2
Yang, Y.3
Yu, H.4
Ghosh, N.5
Prat-Resina, X.6
Konig, P.7
Li, G.8
Xu, D.9
Guo, H.10
Elstener, M.11
Cui, Q.12
-
55
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
-
(1983)
J. Chem. Phys
, vol.79
, pp. 926
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
56
-
-
0022068152
-
-
Brooks, C. L., III; Brunger, A.; Karplus, M. Biopolymers 1985, 24, 843.
-
(1985)
Biopolymers
, vol.24
, pp. 843
-
-
Brooks III, C.L.1
Brunger, A.2
Karplus, M.3
-
57
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187.
-
(1983)
J. Comput. Chem
, vol.4
, pp. 187
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
58
-
-
25444431620
-
-
Guest, M. F.; Bush, I. J.; van Dam, H. J. J.; Sherwood, P.; Thomas, J. M. H.; van Lenthe, J. H.; Havenith, R. W. A.; Kendrick, J. Mol. Phys. 2005, 103, 719.
-
Guest, M. F.; Bush, I. J.; van Dam, H. J. J.; Sherwood, P.; Thomas, J. M. H.; van Lenthe, J. H.; Havenith, R. W. A.; Kendrick, J. Mol. Phys. 2005, 103, 719.
-
-
-
-
59
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A. D., Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L., Jr.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E., Ill; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586.
-
MacKerell, A. D., Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L., Jr.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E., Ill; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586.
-
-
-
-
60
-
-
34247549227
-
-
Wang, L.; Yu, X.; Hu, P.; Broyde, S.; Zhang, Y. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4731.
-
(2007)
J. Am. Chem. Soc
, vol.129
, pp. 4731
-
-
Wang, L.1
Yu, X.2
Hu, P.3
Broyde, S.4
Zhang, Y.5
-
62
-
-
0000836702
-
-
Henchman, M.; Viggiano, A. A.; Paulson, J. F.; Freedman, A.; Wormhoudt, J. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 1453.
-
(1985)
J. Am. Chem. Soc
, vol.107
, pp. 1453
-
-
Henchman, M.1
Viggiano, A.A.2
Paulson, J.F.3
Freedman, A.4
Wormhoudt, J.5
-
64
-
-
0001460308
-
-
Ma, B.; Xie, Y.; Shen, M.; Schaefer. H. F., III. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 1943.
-
(1993)
J. Am. Chem. Soc
, vol.115
, pp. 1943
-
-
Ma, B.1
Xie, Y.2
Shen, M.3
Schaefer III, H.F.4
-
66
-
-
30544438081
-
-
Zhang, L.; Xie, D.: Xu, D.; Guo, H. J. Phys. Chem. 2005, A109, 11295.
-
(2005)
J. Phys. Chem
, vol.A109
, pp. 11295
-
-
Zhang, L.1
Xie, D.2
Xu, D.3
Guo, H.4
|